减少测序错误，你做对了么？
不论是哪种测序平台，在测序过程中都不可避免地存在一些错误。Illumina的低成本高通量测序技术已经在许多领域得到了广泛应用，不过人们还不了解其系统性错误对测序数据的影响。 英国格拉斯哥大学的研究人员在16S rRNA扩增子测序的基础上，全面分析了Illumina台式测序仪的错误模式。他们由此找到了消除错误的有效策略，将这一测序平台的主要错误减少了93%。这项研究发表在前不久的Nucleic Acids Research杂志上。 “Illumina测序与454测序的方法完全不同，我们已经知道454测序时错误是如何产生的，但对Illumina的系统性错误还并不了解，”领导这项研究的Melanie Schirmer说。“鉴定小变异（比如病毒株或者菌株之间的突变）需要从背景中找出真正的遗传学变化。我们希望能够更好的理解测序时产生的系统性错误和偏差，尽量将其去除以便获得更加真实的信息。” Schirmer及其同事用两台Illu......阅读全文
减少测序错误，你做对了么？
不论是哪种测序平台，在测序过程中都不可避免地存在一些错误。Illumina的低成本高通量测序技术已经在许多领域得到了广泛应用，不过人们还不了解其系统性错误对测序数据的影响。 英国格拉斯哥大学的研究人员在16S rRNA扩增子测序的基础上，全面分析了Illumina台式测序仪的错误模式。他们由此
减少测序错误，你做对了么？
不论是哪种测序平台，在测序过程中都不可避免地存在一些错误。Illumina的低成本高通量测序技术已经在许多领域得到了广泛应用，不过人们还不了解其系统性错误对测序数据的影响。 英国格拉斯哥大学的研究人员在16S rRNA扩增子测序的基础上，全面分析了Illumina台式测序仪的错误模式。他们由此
新DNA测序技术追踪单个癌细胞的基因错误
一种新的DNA测序技术可以让科学家追踪单个癌细胞的基因错误。这是史上第一次科学家们能够重建肿瘤的生命史，并了解细胞DNA中的一个错误是如何导致肿瘤无法控制的生长的。这项新技术将帮助医生了解特定癌症是如何演变的，并为每位患者量身定制治疗方案，使其更有效、更成功。 我们是由数十亿个细胞组成的，它们
Science：震惊！公共数据库存在非常高的测序错误
在一项新的研究中，来自新英格兰生物学实验室公司（New England Biolabs Inc., 简称NEB）的一个研究团队发现储存在公共数据库中的DNA测序样品具有比期待中更高的低频突变错误率（low-frequency mutation error rate）。他们描述了他们如何开发出一种
遗传错误修正技术使得测序精准度大幅度提高
DNA聚合酶将DNA复制成相同的新链DNA，逆转录酶将RNA复制成DNA，与DNA聚合酶不同，大多数逆转录酶属于古老进化起源的单一蛋白家族，这些酶本身很容易出现错误，因为它们缺乏一个校对区域（3′- 5′核酸外切酶），由于没有校对功能，RNA复制产物中的错误无法被检测到。因而30亿年来，人
观点：国人不要再在三代测序仪上犯同样错误了！
作者：天津南开大学生命科学学院 高山 华大基因购入首台单分子测序仪PacBio RS II。看到这个消息，华大进入单分子领域太晚了。 我刚到美国的时候，2011年看好这技术，2012年开始写第一本中文手册，后面就想到中国会大肆购买，然后2013年写标书，2014年基金评审被毙。 其实当时就
－Biotechniques：如何降低下一代测序1％的碱基错误识别？
为什么复杂疾病的全基因组关联研究都是失败的？ 下一代测序带来的误差，使得我们很难检测到罕见变异，而这些罕见变异在癌症等疾病中发挥着重要的作用。 在Biotechniques最近的一篇新闻中，Janelle Weaver报道了科学家们在描绘这些误差以及开发策略提高精度方面所取得的进步。 美国
三代基因测序融资频爆错误率、成本高制约商用
二代测序还未唱罢，三代测序就已登台。 上周，北京希望组宣布完成由经纬中国和赛富投资领投、清科创投跟投的近亿元人民币A轮融资。12月12日，英国公司Oxford Nanopore Technologies宣布在最近一轮融资中获得了1亿英镑（合计1.26亿美元）融资。 12月13日，第三代基因测
SiMSenSeq：DNA测序错误率降至万分之一
加拿大多伦多安大略癌症研究所（OICR）的研究员与国际合作者发明了一种技术，提高了重要癌症检测的敏感度。 最近发表在Nature Protocols杂志上的文章描述了提高DNA测序的敏感度的改进方法。该方法被称为SiMSen-Seq，可以帮助检测癌症复发，以更快的速度改善病人的预后。 聚合酶
新技术修正30亿年来的遗传错误，大大提高测序精度
DNA聚合酶将DNA复制成相同的新链DNA，逆转录酶将RNA复制成DNA，与DNA聚合酶不同，大多数逆转录酶属于古老进化起源的单一蛋白家族，这些酶本身很容易出现错误，因为它们缺乏一个校对区域（3′ -5′核酸外切酶），由于没有校对功能，RNA复制产物中的错误无法被检测到。因而30亿年来，人体RN
SiMSenSeq：DNA测序错误率降至万分之一
生物通报道：加拿大多伦多安大略癌症研究所（OICR）的研究员与国际合作者发明了一种技术，提高了重要癌症检测的敏感度。 最近发表在Nature Protocols杂志上的文章描述了提高DNA测序的敏感度的改进方法。该方法被称为SiMSen-Seq，可以帮助检测癌症复发，以更快的速度改善病人的预后
基因测序未来研究方向
研究人员对基因测序数据的需求越来越大。Eric Green、Edward Rubin和Maynard Olson三位科学家对未来40年基因测序技术的应用进行了展望。四十年前，也就是1997年前，两篇论文首次报道了确定DNA片段中化学碱基顺序的简易方法。在此之前，分子生物学家们只能检测DNA片段，而不
复制错误的概念
中文名称复制错误英文名称replication error定 义DNA复制过程中核苷酸配对发生错误的现象。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
研究发现人们错误地认为抗生素是无害的
分析测试百科网讯 一项关于药物中使用抗生素决策的新研究发现，抗生素无害的错误观念非常普遍，特别是在患者中。临床医生和患者都受到“为什么不采取风险”的一般概念的影响（“WNTAR”），认为服用抗生素有潜在的益处和非常小的风险，而实际上对个体而言存在特定的缺点并为整个社会。 来自乔治华盛顿大学，疾
首个古代非洲人基因组研究出现错误
近日，论文作者发布了一份报告，就他们在去年10月发表于《科学》杂志的论文中出现的错误作出了解释。该论文描述的是一名在4500年前来自埃塞俄比亚的男性的基因组。这也是来自非洲的首个完整的古代人类基因组。这名男性被命名为“莫塔洞穴”，即他的遗骸被发现的地方。 尽管最早的人类离开非洲是在约10万年
PNAS：新测序方法助力癌症研究
在去年圣诞节期间的加拿大落基山脉冰攀之旅中，两位来自华盛顿大学的年轻研究人员：Michael Schmitt和Jesse Salk突发奇想，谈到了一个简单但功能强大，可用于检测癌细胞，获得更好结果的新方法――如果他们能降低DNA测序中的错误率，那么就可以更好的检测出这些细胞中的变异，这种改进
tRF测序应用于Biomarker研究
南京医科大学第一附属医院肿瘤科副主任医师殷咏梅教授长期从事消化道肿瘤和乳腺肿瘤的内科治疗，近来，其实验室利用tRF&tiRNA测序，发现在曲妥单抗敏感和耐受的乳腺癌细胞中，tRNA来源的小非编码RNA分子tRF&tiRNA表达差异显著。其中tRF-30-JZOYJE22RR33和tRF-27-ZDX
近期基因测序研究领域新成果！
本文中，小编整理了多篇研究报道，共同聚焦科学家们在测序研究领域取得的新成就，与大家一起学习！图片来源：Nature 【1】Nature：中国科学家使用单细胞测序来揭示人类胚胎植入的秘密 doi：10.1038/s41586-019-1500-0 近日，中国多家机构的一个研究团队利用单细胞测
DNA测序技术的研究与发展
70年代末，WalterGilbert发明化学法、FrederickSanger发明双脱氧终止法手动测序，同位素标记80年代中期，出现自动测序仪（应用双脱氧终止法原理）、荧光代替同位素，计算机图象识别90年代中期，测序仪重大改进、集束化的毛细管电泳代替凝胶电泳2001年完成人类基因组框架图
细胞系交叉污染或错误鉴定对研究是否有影响
细胞系交叉污染或错误鉴定对研究有影响。使用错误的细胞系或者是被污染的细胞系做研究，只会造成时间，金钱和精力的损失，以及造成实验结果的不一致和不可重复。因此如果用被污染或错误的细胞系做研究，在发表文章或做进一步研究时极有可能需要用正确的细胞再重复实验。
美国研究人员：错误的时间进食或有损记忆力
你有没有吃夜宵的习惯？有的话或许要小心了，因为研究显示，这种习惯不仅可能导致血糖升高，还可能削减记忆力。 美国加利福尼亚大学洛杉矶分校研究人员在“e生活”网站（eLIFE）发表论文写道，他们用老鼠做实验，让一部分老鼠正常作息，即白天睡觉、晚上进食，其余老鼠则相反，白天喂食。所有老鼠都在一个专
美国研究人员：错误的时间进食或有损记忆力
你有没有吃夜宵的习惯？有的话或许要小心了，因为研究显示，这种习惯不仅可能导致血糖升高，还可能削减记忆力。 美国加利福尼亚大学洛杉矶分校研究人员在“e生活”网站（eLIFE）发表论文写道，他们用老鼠做实验，让一部分老鼠正常作息，即白天睡觉、晚上进食，其余老鼠则相反，白天喂食。
Nature：基因组错误折叠或提供新的癌症研究思路
近日，发表在Nature杂志上的一篇研究论文中，来自麻省总医院和博德研究所的科学家揭示了隐藏在癌症背后的一种新型生物学机制，文章中，通过对携带异柠檬酸脱氢酶基因（IDH）突变的脑瘤进行研究，研究者揭开了指导基因组自身折叠指令的罕见改变，这些指令改变可以靶向作用基因组的关键部分—绝缘子，绝缘子可以
研究发现细胞衰老可能与基因表达错误率上升有关
美国研究人员最新发现，细胞内部基因表达的错误率越来越高，无法正常合成蛋白质，可能是细胞停止分裂、陷入衰老状态的原因。 这项成果由美国国家老龄问题研究所等机构的人员取得，有望为研发抗衰老药物提供新靶点，相关论文发表在新一期英国《自然·老化》杂志上。 在基因表达的过程中，脱氧核糖核酸（DNA）序
研究发现细胞衰老可能与基因表达错误率上升有关
美国研究人员最新发现，细胞内部基因表达的错误率越来越高，无法正常合成蛋白质，可能是细胞停止分裂、陷入衰老状态的原因。 这项成果由美国国家老龄问题研究所等机构的人员取得，有望为研发抗衰老药物提供新靶点，相关论文发表在新一期英国《自然·老化》杂志上。 在基因表达的过程中，脱氧核糖核酸（DNA）序
检验标本取样错误举例
1.溶血和凝血。太常见了，不说也罢。 2.静脉采血不当至血液淤滞。这样血浆中的水和无机小分子会扩散到组织间隙中，致使血浆大分子成分和血细胞浓缩，其中血清Ca常与蛋白复络合，因此Ca也可以偏高。 3.处理方式不当。对于不同的项目，根据不同的特点，在采血时要考虑更恰当的处理，这点国内做得都不太好。
血型报告错误原因探析
正确的ABO血型鉴定，是临床安全的关键。而错误血型的一旦输入，则直接危及患者的生命。笔者回顾性分析多年工作中所观察的32例造成ABO血型定型错误的原因与结果，现报告如下。 1 血型报告错误的原因 1.1 血型测定的错误 血型检测时因患者红细胞悬液浓度过低或离心时间太短(未做反定型检测)，
细胞化学词汇复制错误
中文名称：复制错误英文名称：replication error定 义：DNA复制过程中核苷酸配对发生错误的现象。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
服用毓婷常见的错误
毓婷紧急避孕药的上市，既弥补了我国常规避孕措施所不及的缺陷，也为广大育龄女性提供了一种方便有效的应急措施。但是，由于部分服药者对毓婷及紧急避孕知识了解不足，出现了一些错误的服药方法，从而直接影响了毓婷的药效，导致紧急避孕失败。 一、 服药期间未禁同房 毓婷紧急避孕药首次服药与第二次服
移液器操作的常见错误
，装吸头。在移液器使用频繁的实验室里，常常可以听到敲击吸头的声音此起彼伏，颇有为枯燥的实验室生活增添点音乐的味道。走进细看，原来是使用者怕吸头不能装紧，在吸头装到移液器上之后，在吸头盒里再敲击几次，希望通过这种冲击力来保证移液的密封性。那这种操作错在哪里呢？其一，在撞击的作用下，吸头可能会变形而影响