Cell推出免费综述特辑：癌症的72变
阿 癌症一直被认为是一种逃离正常状态的急速增长疾病，其细胞的生长已经发生了变化。然而尽管这么多年来，科学家们已经发现了这种疾病会随着时间的推进，出现新的突变，但是近期基因组测序研究，以及单细胞分辨率技术却帮助我们解决了癌症是如何变化发展这一谜题。 Biological and Therapeutic Impact of Intratumor Heterogeneity in Cancer Evolution Perspective Nicholas McGranahan, Charles Swanton Cancer Cell 推荐理由：免疫治疗为个体化癌症治疗带来了许多希望，但这一方法要取得成功，需要考虑到肿瘤的变化过程。两位学者在一篇综述中探讨了整合肿瘤异质性信息与治疗方案发展带来的挑战。大家可以从这篇综述中了解到基因组稳定性如何影响癌症发展，以及这对于药物研发意味着什么。 Lessons from the C......阅读全文
癌症突变符合趋同进化理论－为后续治疗提供新思路
胶质母细胞瘤是一种目前无法治愈的脑肿瘤，是一种致命的脑癌，其背后有100多种蛋白质突变，然而由斯德哥尔摩KTH皇家理工学院的Laura Orellana领导的研究小组发现了这些突变的共同之处。这项新研究可能导致对各种癌症的更有效的治疗。 这项研究揭示了表皮生长因子受体(EGFR)基因与胶质母细
数字PCR技术精确检测癌症基因组扩增
来自斯坦福大学以及Bio-Rad的研究人员证实，数字PCR系统能够精确测定长期存放的癌组织样本中的癌症基因组扩增。该研究成果发表在《Translational Medicine》杂志上。 某些拷贝数变异(如基因组扩增)可能导致特定癌基因的过表达，推动癌症发展。靶定扩增的癌基因有望实现癌
Nature：癌症基因组分析的新浪潮
肺癌与乳腺癌不一样，与胰腺癌也不一样，然而根据发表在《自然遗传学》(Nature Genetics)的两项最新研究表明在分子水平上它们具有许多相同之处。同日，Nature网站对这一研究成果进行了即时新闻报道 这项“泛癌症”研究针对12种不同类型的肿瘤3000多个基因组进行了分析，寻找跨
Nature：癌症基因组分析的新浪潮
肺癌与乳腺癌不一样，与胰腺癌也不一样，然而根据发表在《自然遗传学》(Nature Genetics)的两项最新研究表明在分子水平上它们具有许多相同之处。同日，Nature网站对这一研究成果进行了即时新闻报道 这项“泛癌症”研究针对12种不同类型的肿瘤3000多个基因组进行了分析，寻找跨
大象为啥不生癌症？秘密在基因组里
今年的诺贝尔化学奖让我们对DNA损伤修复的研究有了一些认识，知道DNA损伤非常容易发生，但是生物进化获得了能修复这些损伤的系统。尽管如此，在多细胞生物大量DNA损伤和修复过程中，仍然无法完全避免出现DNA发生突变的后果，这些突变大多数情况下容易带来肿瘤等恶劣后果。 如果所有细胞都存在类似的DN
大型研究为癌症基因组分析奠定基础
12月9日，国际癌症基因组协会（ICGC）在著名的《Nature Communications》杂志，发表了一篇令人瞠目的文章，它为即将到来的癌症基因组学研究时代，奠定了基础。该项目，是由Centro Nacional de Analisis Genómico (CNAG-CRG)和German
证实基因组测序成功鉴定癌症相关突变
最近，UT西南医学中心的癌症研究人员表明，全基因组测序可以用来确定患者遗传性癌症的风险，这可能会促进癌症的预防、诊断和护理。 这项研究首次采用全基因组测序来评估258名癌症患者的基因组，以提高癌症诱发突变的诊断能力。相关研究结果发表在12月份的国际期刊《EBioMedicine》。 UT西南
大规模癌症基因组研究发表《Nature》文章
髓母细胞瘤是儿童最常见的恶性脑瘤。大多数患者年龄在16岁以下。主要有4个亚组：Wnt、Sonic Hedgehog (SHH)、3组和4组。这些亚群由不同基因变化驱动，起始于不同细胞，常常表现出不同临床状况。Wnt组中，约95%患者可以成为长期存活者，3组患者只有50%。目前，尚无针对3组和4组
Nature：全基因组测序重新定义癌症之王基因组突变蓝图
近日，一项发表于国际著名杂志Nature上的研究论文中，来自英国和澳大利亚的研究人员对100位胰腺癌患者癌症组织的基因组进行了深入分析，结果发现了4种不同的亚型，这或许可以帮助后期开发治疗胰腺癌患者的新型疗法。文章中研究人员利用全基因组测序技术揭示了肿瘤基因组结构性改变的光谱模式，该技术可以帮助
武汉植物园发现桃基因组转座元件的进化机制
桃原产于我国，驯化和栽培历史超过三千年，桃花形态和颜色多样，集中在早春时节开放，成为春季主要的观赏景观之一，自2千多年前成书的《诗经》开始，一直是历代诗人反复歌咏的对象。而桃的果实风味鲜美、营养丰富，深受人们喜爱。桃自交亲和且基因组很小（230Mb左右），但品种间的表型差异相当丰富。 中国科学
中国热科院揭示香蕉亚基因组进化及功能分化规律
近日，中国热科院生物所联合华大基因、法国农业研究国际合作中心、国际生物多样性中心、美国罗格斯大学、中国热科院海口实验站等11家单位，绘制了双单倍体香蕉野生种Pisang Klutuk Wulung（BB基因组）的精细基因组图谱，揭示了香蕉A、B基因组的分化，二倍化进程中A、B基因组的特点、多倍体
研究揭示冰清绢蝶基因组进化与群体演化历史
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514612.shtm生物进化和地球环境演变之间的关系，特别是生物进化和环境适应的分子生物学机制是地球-生命系统研究领域的核心科学问题。近日，安徽师范大学生命科学学院教授郝家胜课题组与中国科学院南京地质古
猿类基因组测序为人类进化研究提供“里程碑”视角
经过20多年的努力，科研人员成功地对6种现存猿类的基因组进行了完整测序，为研究人类进化提供了近距离视角，这被英国《自然》杂志称为“遗传学的一个里程碑”。 123名来自多个国家和地区的科研人员组成的团队9日在《自然》发表了这项研究结果，预计将有助猿类保护，并增进科学家对人类进化的理解。 基因组
绿潮藻叶绿体基因组进化机理研究取得新进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503670.shtm石莼属海藻是一类具有重要生态功能和开发潜力的经济海藻，同时也是一类可以暴发性生长导致绿潮灾害的大型绿藻，在全球范围内广泛分布。近日，中国科学院海洋研究所海洋生态环境基因组学团队围绕石莼
迄今最大哺乳动物基因组库为进化提供新见解
当21世纪初，小鼠、人类、大鼠和黑猩猩的完整基因组首次发表后，遗传学家通过比较基因序列为了解哺乳动物进化打开了大门。为什么一些哺乳动物嗅觉特别灵敏？为什么有些哺乳动物要冬眠？为什么一些哺乳动物的大脑发更大？20年后的今天，由美国麻省理工学院、哈佛大学等单位的科学家牵头的大型国际研究项目——“Zoon
酸浆属果实进化发育基因组变异机制研究新进展
茄科酸浆属（Physalis）宿存花萼在受精后随浆果发育迅速膨大，形成“中国灯笼”或膨大花萼综合征（ICS）这一创新形态，包裹浆果。然而，酸浆属果实形态、生化特性及其起源背后的遗传基础有待探究。 中国科学院植物研究所研究员贺超英研究组等合作完成了毛酸浆（Physalis pubescens s
扬子鳄基因组有助揭开鳄鱼生存与进化之谜
来自浙江大学、深圳华大基因研究院等单位的研究人员对濒危物种——扬子鳄进行了全基因组测序及分析，最新研究成果于2013年8月6日在《细胞研究》(Cell Research)杂志发表。扬子鳄基因组为全球首个公开并发表的鳄鱼基因组。在本研究中，科研人员对扬子鳄长时间潜水行为的遗传学机制、进化以及性
研究从基因组水平揭示食肉目染色体进化规律
染色体进化是物种形成和演化的重要驱动因素。具有显著核型差异的食肉目动物为染色体进化研究提供了很好的研究素材。虽然前人通过比较染色体涂色法建立了食肉目内许多物种的染色体比较图谱，但这些研究的分辨率比较低，尚没有深入到精细的核苷酸水平，也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物种间的共线性区块、染色体重排以
首个白蚁基因组破译完成－促进社会性昆虫进化研究
白蚁的蚁王具有长久的生殖能力，与蚁后拥有同等的特殊地位，其他社会性昆虫却没有王。因此，白蚁是研究社会性进化重要的昆虫。近日，《自然·通讯》在线发表的文章中，中、美、德等国科学家宣布完成了首个白蚁(内华达古白蚁)基因组测序和分析，在揭示白蚁复杂社会性的分子基础方面获新发现。 白蚁与蚂蚁和蜜蜂一样
我国科学家揭示香蕉亚基因组进化和功能分歧
2019年7月15号，中国热带农业科学院热带生物技术研究所金志强、胡伟研究团队于Nature Plants在线发表了题为Musa balbisiana genome reveals subgenome evolution and functional divergence的研究论文。该研究报告了
Science：癌症基因组中的突变“热点”不一定会推动癌症
Science一篇文章描述了DNA单链如何以所谓的"发夹"结构折叠起来，对许多癌症中表达的基因编辑酶的突变高度敏感。但是，这些突变"热点"中的许多发生在与癌症完全无关的基因中，包括基因组的许多非编码区域。图片来源：Science MGH癌症中心的Dr.Michael Lawrence说："一个
研究称彻底消灭癌症或并无益处－可能危及人类进化
据科学日报报道，发表在《美国国家科学院院刊》上的一篇文章反驳了常见的“变异积累”肿瘤发生模型，而支持了另一种依赖进化压力对细胞群产生作用的模型。本质上来说，这篇文章陈述了健康组织的生态系统会让健康细胞胜出癌症变异；但是当组织生态系统因为衰老、抽烟或者其它压力因素而发生改变时，具有癌症变异的细胞
全球癌症基因组图谱计划又一研究突破
最近，发表在国际杂志the New England Journal of Medicine上的一篇研究论文中，来自从事癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas）研究计划的科学家通过进行研究，对第二种常见类型的肾癌的两种类型进行了分子特性的分析，并且对这种常见类型的肾癌进行了
《Cell》：如何根据癌症基因组图谱分析肿瘤
时至今日，这一计划已经取得了许多成果，最新Cell杂志公布了泛癌症图谱（Pan-Cancer Atlas），这也是癌症基因组图谱（TCGA）的收官项目，同期Cell杂志介绍了根据癌症基因组图谱分类的肿瘤类型列表，以及相关的一些主要发现（每种肿瘤类型的标记论文）。 生物通报道：2005年美国国立
癌症研究人员联手汇集肿瘤基因组数据
研究人员希望，数据分享将为利用诸如这些脑部腺癌细胞等肿瘤的基因组信息带来更好的方法。 这是为大型癌症研究中心的很多病人提供的最新希望：“让我们测序你的肿瘤，或许我们能将其同击败这种恶性疾病的药物匹配。”不过，现实是基因组分析仍然仅为癌症病人提供了一小部分帮助。“我们多半时候不知道如何处理这些
－【Cell综述】从癌症基因组到精准肿瘤学
迅速发展的基因组技术让有限的肿瘤活检材料获得更广泛的分子分析,从而促进更广泛地实施个性化癌症治疗。以基因组为基础通过不同肿瘤的患者分类化目前还不太可能取代在解决临床需要时对组织来源的考虑，包括开发和实施新的合理目标的肿瘤疗法。 1是否要再分类 在本综述的讨论中考虑以基因组为基础的病人分类,要
全基因组测序有望改善癌症预防与诊断
美国德州大学（UT）西南医学中心研究人员证明，全基因组测序可识别病人患遗传性癌症的风险，有望改善癌症的预防、诊断和护理。这项研究首次用全基因组测序评估了258个癌症病人的基因组，提高了诊断出有癌变倾向的基因变异的能力。相关论文在线发表于最近的《E生物医学》杂志上。 “全基因组测序是一种新的基因
－“10,000个癌症基因组计划”宣告完成
旨在绘制出1万个肿瘤基因组景观图谱的美国重大科研项目——“癌症基因组图集”（The Cancer Genome Atlas，TCGA）计划已正式宣告结束。这一于2006年启动，耗资1亿美元的研究项目现在是国际肿瘤基因组协作组(International Cancer Genome Consort
研究揭示植物基因组倍性变化和适应性进化机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/518047.shtm
基因组所小内含子进化机制研究获得新进展
插入删除数目和比值 近日，在中国科学院北京基因组研究所副所长、中国科学院基因组科学与信息重点实验室主任于军研究员的指导下，该重点实验室博士生王大鹏通过对人类千人基因组计划数据的比较分析，进一步证实了两种DNA组分特殊效应在人类基因组中的存在，使该研究组延续十几年的小内含子基本功能和