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1月21日《自然》杂志精选

多种视网膜神经节细胞类型 视网膜神经节细胞(RGCs)从视网膜向大脑传递视觉信息。有多少种类型的RGC以及它们应怎样分类是长期未能解决的问题。Thomas Euler及同事通过双光子钙成像来记录小鼠一小块神经节细胞层中超过1.1万个细胞对刺激的反应,并对所获得的数据进行 “无监督聚类”分析。结果显示,小鼠视网膜包含超过30个截然不同的RGC功能类型,其中包括几个以前没有被描述过的类型。这个数字大大超过了当前的估计,也表明RGCs的功能多样性比以前所认为的要大。 复发肿瘤的治疗 试图开发小儿成神经管细胞瘤定向治疗方法的研究工作,不可避免地是用以前没有接受过治疗的病例或动物模型进行的,而当肿瘤复发时对新药进行的临床测试则涉及以前做过手术切除、化疗和放疗的患者。尚不清楚复发肿瘤与在诊断时发现的肿瘤在生物上和遗传上是否是相似的。Michael Taylor 及同事建立并确认了一个关于复发性成神经管细胞瘤的 “人化”小鼠模型,并......阅读全文

选择重组蛋白表达的合适方法

重组蛋白是研究生物学过程的重要工具。需要使用表达系统来对其进行制备。合适表达系统的选择取决于重组蛋白的特性、重组蛋白的预期应用以及该系统能否生产足够量的蛋白质。作者: 伯吉斯等,主译:陈薇,本实验来自「蛋白质纯化指南」实验步骤一、引言选 择 合 适 醜 组 蛋 白 表 达 方 法 对 于 能 否 及

选择重组蛋白表达的合适方法

实验步骤 一、引言 选 择 合 适 醜 组 蛋 白 表 达 方 法 对 于 能 否 及 时 获 取 所 需 数 量 和 质 量 的 重z组蛋白非常关键。选 择 了 错 误 的表达宿主可 能 导 致 蛋 白 质错 误 折 叠 或

果蝇细胞中发现五种主要染色质类型

该发现构成了描述表观基因组的新框架荷兰科学家在果蝇细胞中发现五种主要染色质类型  转录活性常染色质与受阻遏异染色质的染色质传统分类曾是一个有用的模型,但它应该进行升级,以适应人们日益增加的有关染色质功能域的知识。一项在果蝇中对与蛋白质有关的53种染色质进行的大规模综合性全基

用于外源蛋白质生产的细菌表达系统

细菌表达系统有各种各样的载体和宿主菌可供选择,大部分工程菌的增殖时间短, 不仅便于快速评价实验结果,而且降低了技术和设备无菌要求的严格性。经过简单的调整, 许多在实验室规模下具有的这些内在优点在大规模的自动生产过程中也具有 。实验步骤一、使用大肠杆菌生产外源蛋白有越来越多的细菌表达系统可用于外源蛋白

Nature 表观遗传学进展将遗传学、环境与疾病联系了起来!

  21世纪,表观遗传学的研究得到了快速发展,同时其产生了让研究人员感兴趣和憧憬的东西,当然了,这其中也存在一些大肆宣传的成分,本文中,我们回顾了表观遗传学在过去几十年里是如何演变的,同时分析了近年来改变科学家们对生物学理解的一些研究进展;我们讨论了表观遗传学和DNA序列改变之间的相互作用,以及表观

用于外源蛋白质生产的细菌表达系统

            实验方法原理 实验步骤 一、使用大肠杆菌生产外源蛋白 有越来越多的细菌表达系统可用于外源蛋白的生产。影

Cell Research:一类全新植物异染色质蛋白

  研究人员发现一类植物特有的新型组蛋白甲基化阅读器ADCP1,并确定其为动物HP1(Heterochromatin Protein 1,异染色质蛋白1)功能同源蛋白,揭示出其在植物异染色质维持和转座子元件沉默中的作用,彰显了不同生命界中表观机制的复杂性和保守性。  2018年11月13日,清华-北

染色质免疫沉淀技术的应用

随着人类基因组测序工作的基本完成,功能基因组学逐渐成为研究的热点。而基因表达的调控又是功能基因组学的一个重要研究领域,要想提供蛋白因子直接调控的证据,需要直接检测蛋白质-DNA的相互作用,而染色质免疫沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)就是一种研

染色质,解锁癌症表观遗传学的钥匙

  表观遗传学指基因序列不变化的前提下,基因表达发生了可遗传的变化,包括DNA甲基化、染色质改型、基因沉默、RNA编辑、组蛋白修饰(甲基化、乙酰化、磷酸化等)等。其中,染色质改型调控基因表达的过程,涉及多种导致DNA和组蛋白组成变化、染色质构象变化的蛋白质。  众多研究已经证明,染色体畸变和染色质异

外源基因在真核细胞中的表达系统

1. 真核生物表达的优越性和必要性① 真核生物具有转录后加工系统,可识别并删除基因中的内含子,剪切加工为成熟mRNA.②具备完善的翻译后加工系统,可进行糖基化、乙酰化等修饰,使蛋白形成正确的天然构型,因而真核生物表达系统产生的蛋白更接近天然状态,有利于其功能、生物活性的研究。③某些真核细胞可将基因表

Nature:真核生物细胞核中染色质分离新机制

  在细胞核中基因组的活性部分与它的非活性部分在空间上分隔开来对于基因表达控制至关重要。在一项新的研究中,来自德国慕尼黑大学、美国麻省理工学院和马萨诸塞大学医学院的研究人员揭示了这种分离的主要机制,并颠覆了我们对细胞核的认识。相关研究结果近期发表在Nature期刊上,论文标题为“Heterochro

克隆基因的表达(expression of cloned gene)-3

(3)原核生物的基因组基本上是单倍体,而真核基因组是二倍体。(4)如前所述,细菌多数基因按功能相关成串排列,组成操纵元的基因表达调控的单元,共同开启或关闭,转录出多顺反子(polycistron)的mRNA;真核生物则是一个结构基因转录生成一条mRNA,即mRNA是单顺反子(monocistron)

杆状病毒-昆虫细胞表达系统

实验步骤 一、杆状病毒表达载体 最简单的经典杆状病毒表达载体是一个重组的杆状病毒,其基因组含有一段外源核酸序列,通常为编码目标蛋白质的dDNA,在多角体蛋白启动子控制下进行转录。这个嵌合的基因由多角体蛋白启动子和外源蛋白编码序列组成

裴端卿、刘兴国EMBO最新发现重编程新型因子

  来自中科院广州生物医药与健康研究院的研究人员发现染色质松散因子Gadd45a能显著提高重编程效率,这一发现不仅揭示了重编程早期的异染色质变化规律,筛选到新型因子,还建立了筛选染色质松散因子的平台,能广泛应用于细胞命运转换中。  这一研究成果公布在EMBO Reports杂志在线版上,领导这一研究

深度剖析基因组自我调节的新型分子机制

  近日,两篇刊登在国际杂志Molecular Cell上的研究报告中,来自加州理工学院等机构的科学家们通过研究揭示了基因组自我调节的分子机制。生物体的基因组中包含了每个细胞和组织发育和发挥正常功能所需要的所有信息,当被写入DNA后,每个基因都会进行信息编码,包括帮助确定组织形状的结构蛋白、催化生命

选择重组蛋白表达的合适方法(三)

五、哺 乳 动 物 细 胞以前通常认为哺乳动物表达方法是重组蛋白表达效率最低的方法。然 而 ,最近的研究进展已经极大地提高了哺乳动物细胞系的表达水平(详 见 第 15章)。例如, 有报道称利用稳定转染的中国仓鼠卵巢(Chinese hamster ovary,C H O )细胞,重组抗体的表

超高分辨直接观测基因表达的染色质时空调控

  生命科学的一个基本问题是在个体发育中,单个细胞如何分化成各种类型的组织细胞。这个过程高度依赖于基因表达的精确时空调控,而这种细胞特异基因表达与染色质的调控密切相关。比如,不同的顺式调控原件增强子能够在不同细胞中选择性地激活目标基因。每个基因经常由分布在千碱基(kb)甚至兆碱基(Mb)以外的多个增

染色质提取试剂盒的原理

染色质(Chromatin)最早是1879年Flemming提出的用以描述核中染色后强烈着色的物质。现在认为染色质是细胞间期细胞核内能被碱性染料染色的物质。染色质的基本化学成分为脱氧核糖核酸核蛋白,它是由DNA、组蛋白、非组蛋白和少量RNA组成的复合物。染色质是真核生物基因组DNA存在的主要形式。因

体内甲醛交联及染色质免疫沉淀--研究DNA和蛋白质作用

染色质由真核基因组包装而成,它参与了转录、复制、重组、修复等许多以DNA一蛋白质相互作用为基础的生化过程。研究者感兴趣的是这些过程涉及到哪些特异的基因或DNA序列,有哪些蛋白质参与。尽管有许多人对染色质进行分类,就像Holde将其分为转录活性或非活性位点,但染色质构本身是动态的,并且DNA与非组蛋白

蛋白质糖基化修饰在生命体中的作用

  治疗性重组蛋白或单克隆抗体是影响细胞、组织、器官乃至生命的外源性重组蛋白,在细胞内成熟过程中几乎均会发生蛋白质糖基化修饰,而糖基化修饰的质和量的差异,可能会影响相关重组蛋白表达水平、结构及功能。重组蛋白表达服务可以帮助研发人员研发高效、高质量的蛋白质。在生物体中50%以上的蛋白质存在糖基化现象,

研究发现染色质装配因子1具有重要表观遗传调控作用

  中国科学院生物物理研究所焦仁杰研究员课题组最新研究发现,染色质装配因子 1(chromatin assembly factor 1, CAF-1)对异染色质区域的基因表达发挥十分重要的表观遗传调控作用。他们的成果已被细胞生物学研究领域的专业期刊J. Cell Sci.接受发表。

北京大学Cell子刊探究明星抑癌基因新功能

  来自北京大学、康奈尔大学Weill医学院的研究人员在新研究中证实,PTEN通过与组蛋白H1相互作用控制了染色质凝聚,这一研究发现发表在9月4日的《Cell Reports》杂志上。  北京大学基础医学院的尹玉新(Yuxin Yin)教授以及康奈尔大学Weill医学院的Wen H. Shen是这篇

组蛋白研究进展速览!

  本文中,小编盘点了多篇研究报告,共同解析科学家们在组蛋白研究上取得的新成就,与大家一起学习!图片来源:Daniel N. Weinberg et al,doi:10.1038/s41586-019-1534-3  【1】Nature:揭示组蛋白标记H3K36me2招募DNMT3A并影响基因间DN

RNA-蛋白互作揭示视网膜母细胞瘤发生的染色体构象调控

   上海交通大学医学院附属第九人民医院范先群教授主攻眼部肿瘤和眼眶外科,在基础研究和临床治疗方面取得突出成就。其带领的眼肿瘤团队利用ChIRP-MS技术(一种研究RNA-蛋白相互作用的技术手段)结合RNA-seq、ChIP等一系列体内体外实验对视网膜母细胞瘤新的作用机制进行了深入研究。研究发现肿瘤

染色质免疫沉淀(ChIP)技术的难点及应用-1

序言随着人类基因组测序工作的基本完成,功能基因组学的研究逐渐成为研究的热点。而基因表达的调控又是功能基因组学的一个重要研究领域。研究某个蛋白因子的调控功能,可以通过对蛋白活性(激活或抑制其活性),蛋白数量(过表达Overexpression或基因缺陷型Knockout), 以及蛋白功能(功能缺陷

Cell | 染色质激活或抑制状态决定了核小体分离的差异性

  染色质结构通过促进或抑制该结构的转录可以控制基因组的功能和细胞身份认定。这些染色质结构中存在特定的组蛋白翻译后修饰(posttranslational modifications,PTMs),它们与特定转录状态相关,并可促进抑制性染色体结构的形成,影响基因的表达【1】。  为了在细胞分裂时依然保

那些打破人们传统认知的重磅级研究成果!

  随着科学家们研究的不断深入,总会有一些意想不到的研究成果,本文中,小编就对那些打破人们传统认知的重磅级研究成果进行整理,分享给大家!  【1】Sci Adv:打破传统认知!适度的压力或会让你更加长寿!  doi:10.1126/sciadv.aav1165  一种称之为染色质结构缺陷的描述或染色

原位分子杂交和免疫组化SP法对PTEN的检测

原位分子杂交和免疫组化SP法对PTEN的检测 【摘要]目的:研究原位分子杂交和免疫组化sP法检测PTEN mRNA及其蛋白在HCC中的表述隋况。方法:56例肝细胞肝癌组织、17例肝硬化组织手术切除标本,经40g/L福尔马林固定,4 m厚连续切片,HE染色,病理诊断证实。结果:HCC组织中,

Science:梳理患儿肿瘤细胞的基因组寻求答案

  组蛋白翻译后修饰方式出现异常,以及组蛋白修饰位置出现异常都会导致肿瘤发生。   高通量DNA测序技术的快速扩张让我们能够以前所未有的速度和精细度对人体疾病展开遗传学分析,尤其是对罕见的小儿疾病进行全基因组测序(whole-genome sequencing)更是有助于我们对儿童发育,以及多

研究发现压力如何影响机体健康

  本文中,小编整理了多篇研究成果,共同解读压力如何影响机体健康,分享给大家!  图片来源:intelligentinsurer.com  【1】Nature:早期压力可有助于延长寿命  doi:10.1038/s41586-019-1814-y  一项发表在Nature杂志上的最新研究发现,年轻时