Science:绘制“垃圾DNA”的新技术

在很长一段时间内被认作是“垃圾DNA”,我们现在知道了基因间的一些区域也执行着至关重要的功能。这些DNA区域突变可以严重损害人类的发育,有可能在生命后期导致一些严重的疾病。然而直到现在,都难以寻找调控DNA区域。 德国慕尼黑工业大学计算生物学教授Julien Gagneur,马克斯普朗克生物物理化学研究所(MPI) 的Patrick Cramer教授领导科学家们,现在开发出了一种方法来寻找活化和控制基因的调控DNA区域。 我们DNA中的基因包含着详细的蛋白质装配指令,这些蛋白质“工人”执行和控制着我们细胞中几乎所有的过程。为了确保每种蛋白都在适当的时间及我们身体的正确部位完成任务,对应基因的活性必须受到严格控制。基因间的DNA调控区域接管了这一功能,充当了复杂的控制机器。 马克斯普朗克生物物理化学研究所所长Patrick Cramer教授解释说:“一些DNA调控区域对于人类发育、组织保护和免疫应答等至关重要。此外,它们......阅读全文

植物基因组DNA及总RNA提取技术1

幼嫩组织的细胞处于旺盛的分裂阶段,核较大而胞质较少,核酸浓度高,且内含物少、次生代谢产物少,蛋白质及多糖类物质相对较少,在SDS或 CTAB物质存在时,经机械研磨,使细胞破裂并释放出内含物,提取的DNA、RNA的产量高,纯度好。 提取DNA所用的提取液、吸头、离心管等需要高压灭菌以灭活DNase。R

​DNA损伤修复信号通路DPYD基因的临床解释

该基因编码的蛋白是嘧啶分解代谢酶,是尿嘧啶和胸腺嘧啶分解代谢途径的起始和限速因子。该基因突变导致二氢嘧啶脱氢酶缺乏,嘧啶代谢错误与胸腺嘧啶尿嘧啶尿有关,癌症患者接受5-氟尿嘧啶化疗后毒性增加。两个编码不同亚型的转录变体已经被发现。

​DNA损伤修复信号通路MUTYH基因的临床解释

该基因编码一种参与dna氧化损伤修复的dna糖苷酶。这种酶在腺嘌呤与鸟嘌呤、胞嘧啶或8-氧-7,8-二氢鸟嘌呤(一种主要的氧化损伤的DNA损伤)不适当配对的部位从DNA主干上切除腺嘌呤碱。蛋白质定位于细胞核和线粒体。这种基因产物被认为通过在氧化损伤后引入单链断裂而在细胞凋亡信号中发挥作用。该基因突变

方法三:酵母菌基因组DNA的提取

方法三:酵母菌基因组DNA的提取一:仪器:同方法一二:试剂:SE缓冲液(1M山梨醇,0.1MEDTA pH7.5);溶菌酶(50mg/ml);20%PVP;蛋白酶K缓冲液(10mM Tris pH7.6  0.5% SDS 1mM EDTA);其余同前三:操作 1.5ml  对数生长期细菌细胞   

以硅膜为基础分离基因组-DNA-实验

硅化学法已成为从小鼠尾剪取物、动物组织和组织培养细胞等样品中纯化高质量基因组 DNA 的方法之一。Wizard SV 基因组 DNA 纯化体系是利用一个充有固相硅的滤膜来纯化 基因组 DNA 的。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒PBSNa2 HP04KH2P

​DNA损伤修复信号通路PRKDC基因的临床解释

该基因编码dna依赖性蛋白激酶(dna-pk)的催化亚单位。与ku70/ku80异二聚体蛋白共同参与dna双链断裂修复和重组。编码的蛋白质是PI3/PI4激酶家族的成员。

德研究发现与DNA双链断裂修复相关基因

  德国研究人员在寻找参与修复脱氧核糖核酸(DNA)双链断裂的基因方面获得进展。研究小组在人类细胞中找到61个位点,并发现了此前未知的与DNA双链断裂修复有关的基因。该研究结果将显著加速DNA修复基因的继续搜寻,并带来新的医疗应用可能。相关研究成果发表在6月29日的《公共科学图书馆·生物学》杂志上。

关于真核生物的基因调控—DNA重排的介绍

  改变基因组中有关基因顺序结构的基因调控方式。哺乳动物的免疫球蛋白的可变区与恒定区的顺序分别由不同的基因片段编码。它们处于同一染色体上但是相距较远,中间还有一些编码连接区的DNA顺序。在产生抗体的浆细胞成熟过程中,这三个序列通过染色体重排而成为一个完整的转录单位。由于可变区基因片段为数众多,而且不

从全血中纯化基因组-DNA-实验方法

            试剂、试剂盒 乙醇 异丙醇 RNA 酶 A 全血 仪器、耗材 琼脂糖凝胶电泳

诺赛基因DNA检测室获ISO17025认证

  近日,北京诺赛基因组研究中心有限公司DNA检测实验室收到中国合格评定国家认可委员会(英文缩写为:CNAS)下发的检测实验室认可证书。这表明,一个人员素质高、管理规范化、技术规范化的高标准的DNA检测实验室正在诺赛基因逐步建立起来。  作为中国最大的以基因组学为基础的生物科技公司之一,诺

​DNA损伤修复信号通路-FANCI基因的临床解释

fanconi贫血互补组(fanc)目前包括fanca、fancb、fancc、fancd1(也称为brca2)、fancd2、fance、fancf、fancg、fanci、fancj(也称为brip1)、fancl、fancm和fancn(也称为palb2)。先前定义的组fanch与fanca相

癌基因的关键——染色体外环状DNA(eccDNA)

实验方法:环状DNA-seq, RNA-seq(云序生物提供以上服务)1. ecDNA是环状结构为了了解ecDNA的结构,作者通过环状DNA-seq(云序生物提供以上服务)方法研究了三种人类癌细胞系和来自于TCGA的临床肿瘤样品。通过这种方法检测到了GBM39细胞中的圆形扩增子游离于染色体之外,并且

提取的基因组DNA有降解如何解决

选取的材料不新鲜或反复冻融,采集材料后未及时处理或未低温保存:陈旧血液或不新鲜的材料中,细胞凋亡导致DNA降解,或者低温保存的样品经反复冻融导致细胞破碎,内源性核酸酶降解DNA,因此应该选用新鲜的材料样品,不能及时处理则低温保存,运输过程中应该使用干冰: 1 ) 未能有效的抑制内源性核酸酶的作用

动物基因组DNA-的分离纯化实验——盐溶法

本实验目的是掌握盐溶法大量制备动物基因组DNA 的基本原理和方法,根据核糖核蛋白与脱氧核糖核蛋白在一定浓度的氯化钠溶液中的溶解度不同进行分离, 然后用蛋白质变性沉淀剂去除蛋白,使核酸释放出来, 再利用核酸不溶于乙醇的性质将核酸析出, 达到分离提纯的目的。实验方法原理根据核糖核蛋白与脱氧核糖核蛋白在一

DNA分析系统:基因甲基化研究的最佳工具

甲基化研究对于基因的 调控和肿瘤的发生有非常密切的关系。在一般正常的细胞中,基因调控区CpG岛处于非甲基化的状态。而当细胞发生癌变后,这些CG区域往往呈现甲基化状态。英国医学刊物《the Lancet》报道奥地利因斯布鲁克医学院的专家们早就可以通过检测大便中DNA的甲基化变化,把健康人的大便

从全血中纯化基因组-DNA-实验方法

试剂、试剂盒 乙醇异丙醇RNA 酶 A全血仪器、耗材 琼脂糖凝胶电泳离心管Wizard 基因组 DNA 纯化试剂盒实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂乙醇,70%,室温异丙醇, 室温RNA 酶 A将 RNA 酶 A 溶解于 DNA 再水合液中至终浓度为 4 mg/ml, 煮沸 10min 以去

DNA修饰ARID1A类型的基因信号通路介绍

该基因编码Swi/Snf家族的一个成员,其成员具有螺旋酶和ATP酶活性,并被认为通过改变这些基因周围的染色质结构来调节某些基因的转录。编码蛋白是大型ATP依赖染色质重塑复合物snf/swi的一部分,这是染色质抑制的基因转录激活所必需的。它至少有两个保守域,对其功能可能很重要。首先,它有一个DNA结合

海洋不同生境总基因组DNA的提取

实验概要本实验采用NaI/玻璃粉方法、溶菌酶与蛋白酶K/离心吸附柱方法以及试剂盒PowerSoil  DNA Isolation Kit (MO BIO  Laboratories,Inc.)三种方法对海洋岸边土壤、海水以及沉积物三种样品进行DNA抽提。为比较不同方法的抽提效果,采用分光光度计对DN

用-PCR-控制基因组-DNA-文库的质量实验

在该方案中,用限制性内切酶的混合物处理人类基因组 DNA(内切酶混合物的识别位点为 4bp),产生大概 50〜500bp 的片段。最终使用这一类型的表达文库,是通过利用表型的和生化的筛选方法,分离编码功能多肽或蛋白片段的基因片段。用KlenowDNA 聚合酶处理后,基因组 DNA 片段成为平末端,然

从全血中纯化基因组-DNA-实验方法

用于从全血(10 ml) 中分离基因组 DNA 的 Wizard 基因组 DNA 纯化试剂盒建立在一个四步程序基础上的。纯化程序的第一步包括血红细胞的裂解、可溶部分的弃除,随后是白细胞及其细胞核的裂解。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒乙醇异丙醇RNA 酶 A

细菌基因组DNA提取试剂使用说明(一)

细菌基因组DNA提取试剂使用说明书◆ 产品说明基于硅胶柱纯化方式。试剂中的溶菌酶消化去除细菌的细胞壁,革兰氏阳性细菌还可加入玻璃珠涡旋破壁,在裂解液和蛋白酶作用下裂解消化,DNA释放到裂解液中。加入乙醇后,转移至吸附柱中过滤,DNA被吸附至吸附柱的膜上,而蛋白质则被去除。吸附柱经Buffer G

​DNA损伤修复信号通路FANCM基因的临床解释

fanconi贫血互补组(fanc)目前包括fanca、fancb、fancc、fancd1(也称为brca2)、fancd2、fance、fancf、fancg、fanci、fancj(也称为brip1)、fancl、fancm和fancn(也称为palb2)。先前定义的组fanch与fanca相

植物基因组DNA及总RNA提取技术2

(二)植物总RNA提取 (1)65°C水浴中预热15 mL CTAB提取液。 (2)液氮中研磨2~3 g新鲜或-70°C冷冻的材料。 (3)转移样品至有CTAB提取液的离心管中,立即激烈涡旋30s,短时放回 65°C水浴中(4~5 min)。 (4)加入等体积的氯仿/异戊醇并涡旋混合,10000 r

​DNA损伤修复信号通路TYMS基因的临床解释

胸苷酸合成酶利用5,10-亚甲基四氢叶酸(亚甲基四氢叶酸)作为辅因子催化脱氧尿苷酸甲基化为脱氧胸苷酸。此功能维持DNA复制和修复的关键DTMP(胸腺嘧啶-5-一磷酸素)池。这种酶作为肿瘤化疗药物的靶点一直备受关注。它被认为是5-氟尿嘧啶、5-氟尿嘧啶-2-原脱氧尿苷和一些叶酸类似物的主要作用部位。该

Sci-Rep:DNA快速分离术让基因检测更快捷

  日本名古屋大学研究人员日前宣布,他们开发出了只需数秒就能分离脱氧核糖核酸(DNA)的新技术,这让超高速解析DNA信息成为可能,有望实现即时基因检测。  DNA是承载着生命信息的物质,在细胞内以双螺旋链的形式存在,对其进行分离、解析是一件非常繁琐耗时的工作。分离DNA需要根据DNA链的长短使用不同

​DNA损伤修复信号通路-XPC基因的临床解释

该基因编码的蛋白是xpc复合物的关键组成部分,在全球基因组核苷酸切除修复(ner)的早期步骤中起着重要作用。编码的蛋白质对于损伤感知和dna结合很重要,并且显示出对单链dna的偏好。该基因或其他一些内质网成分的突变可导致色素性干皮病,一种罕见的常染色体隐性遗传疾病,其特征是随着癌症的早期发展,对阳光

关于目的基因组DNA片段的制备的介绍

  按照常规方法从作为供体的生物细胞中分离纯化其染色体DNA,在一般条件下,由于分离纯化操作中的物理剪切作用,制备出的染色体DNA片段平均大小在10~-200kb左右。然后将染色体DNA用下列方法切成片段,以便与载体分子进行体外重组 [1]。  (1)机械切割。供体染色体DNA可用机械方法(如超声波

细菌基因组DNA快速提取试剂使用说明

细菌基因组DNA快速提取试剂◆ 产品说明核酸抽取系列是检测试剂配套使用的DNA/RNA提取系列产品。本产品为细菌基因组DNA快速提取试剂,采用独特的溶解系统,可快速地从样品中制备DNA。提取过程中无需使用有毒的酚氯仿,也无需进行耗时的醇类沉淀,整个过程只需10-15分钟。◆ 产品组成 071011M

基因影响“生物钟”-早起或晚起由DNA决定

  你喜欢早起还是晚起呢?这个选择与年龄有关,但是更多与基因有关。瑞士《神经学前沿》杂志刊登的一项研究介绍了这其中的原因。  据西班牙《阿贝赛报》网站5月18日报道,研究人员以果蝇检测基因变化对一个人早起或晚起习惯的影响程度。果蝇的“生物钟”与人类非常相似,在对它们的基因组进行研究之后,研究人员找到

新DNA测序技术追踪单个癌细胞的基因错误

  一种新的DNA测序技术可以让科学家追踪单个癌细胞的基因错误。这是史上第一次科学家们能够重建肿瘤的生命史,并了解细胞DNA中的一个错误是如何导致肿瘤无法控制的生长的。这项新技术将帮助医生了解特定癌症是如何演变的,并为每位患者量身定制治疗方案,使其更有效、更成功。  我们是由数十亿个细胞组成的,它们