新“分子时钟”预测癌症更近一步
日前,中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所与英国伦敦大学学院的研究人员在《基因组生物学》杂志上合作发表的一项最新研究成果表明,生命周期中细胞分裂导致的DNA分子变异积累可被用于癌症发生风险的预测。 组织细胞的分裂速度与该组织的癌症发生风险高度相关。研究人员利用计算建模方法设计了一个“分子时钟”,并利用它对个体特定组织生命周期中细胞分裂的次数进行估算。他们同时针对一种只在DNA特定序列上发生的修饰,即DNA甲基化修饰,设计出变异的“有丝分裂时钟”运行节律。 研究表明,基因组特定位点的DNA甲基化会随着个体生理年龄的增加而积累,这一发现表明可利用这一“分子时钟”对个体年龄进行精确预测。然而,同一个体中不同器官组织虽然具有相同的生理年龄,但却具有不同的癌症发生风险,因此该基于DNA甲基化的早期“时钟”无法用于癌症发生的风险预测。 由计算生物学所研究员、英国伦敦大学学院教授Andrew Teschendorff领导的研......阅读全文
可控制癌症基因开关的分子首次合成
为了阻止肿瘤生长蔓延,科学家们不断从各个途径不懈努力。美国科学促进会、英国《自然》杂志网站近日报道,美国达那·法博癌症研究所一个国际联合研究小组研制了一种分子,能让控制癌症的基因指令失效,从根本上抑制了癌症肿瘤的生长。 新研究演示了一种蛋白质能向癌症基因发出“停止”和“开始
Oncotarget:小分子阻断癌症扩散的大作用
最近,研究者们发现一类调控基因表达的小分子或许对于保护机体避免癌症的发生具有关键的作用。 作者在人源肺癌细胞中发现低剂量的microRNA,miR-125a-5p,伴随着高水平的蛋白质TIMP-1的表达,而后者在晚期肺癌患者中十分常见。 相反地,当研究者们下调了这些癌细胞中TIMP-1分子的
Nature重要成果:绘制癌症的全面分子图谱
根据一项获得美国国立卫生研究院(NIH)支持的新研究发现一种乳腺癌亚型与难治性高分级浆液性卵巢癌具有许多共同的遗传特征。研究结果表明两种癌症具有相似的分子起源,这可能推动比较乳腺癌和卵巢癌亚型的治疗学数据。 研究人员利用癌症基因组图谱(TCGA)生成的部分数据,根据来自825名乳腺癌患者样
Nature重要成果:绘制癌症的全面分子图谱
根据一项获得美国国立卫生研究院(NIH)支持的新研究发现一种乳腺癌亚型与难治性高分级浆液性卵巢癌具有许多共同的遗传特征。研究结果表明两种癌症具有相似的分子起源,这可能推动比较乳腺癌和卵巢癌亚型的治疗学数据。 研究人员利用癌症基因组图谱(TCGA)生成的部分数据,根据来自825名乳腺癌患者样本的综合
一种采用无线遥控修改时钟数据的LED时钟显示屏设计
led时钟显示屏的长时间使用,会产生一定的累加误差,故使用一段时间需进行校正,但大屏幕时钟显示器,通常悬挂在较高处,时间的调整与修改需工作人员爬到高处进行操作,既不方便,又不安全,如何完善电路结构,设计出安全、实用的遥控电路是很多电子爱好者一直关注的问题。本系统设计了一种采用无线遥控修改
光学时钟“升天”助力精准导航
科学家们对于精准时间的追求从未停止,目前世界上最准的时钟当属光学时钟。虽然早有研究人员提出将光学时钟应用到卫星上,以提升卫星定位的准确程度,但如何保持光学时钟在太空中与地球上一样稳定发挥,一直是争论的焦点。 1小时由60分钟组成,1分钟由60秒组成,那么1秒钟有多长?它是时钟上秒针的一格,也
高性能时钟芯片研究取得进展
5.5G/6G无线通信技术的迭代演进及下一代串行接口向更高传输速率突破,对毫米波本振时钟抖动性能提出了更严苛的要求。亚采样锁相环凭借其高鉴相增益的优势,成为低抖动时钟芯片的主流解决方案,但仍面临挑战。中国科学院微电子研究所与清华大学合作,提出双边沿乒乓亚采样锁相环架构。该架构同时利用参考时钟的上升沿
高性能时钟芯片研究取得进展
5.5G/6G无线通信技术的迭代演进及下一代串行接口向更高传输速率突破,对毫米波本振时钟抖动性能提出了更严苛的要求。亚采样锁相环凭借其高鉴相增益的优势,成为低抖动时钟芯片的主流解决方案,但仍面临挑战。中国科学院微电子研究所与清华大学合作,提出双边沿乒乓亚采样锁相环架构。该架构同时利用参考时钟的上升沿
美国团队找到细胞内“时钟”
目前,记录细胞祖先的分子钟突变太慢,无法测量成体组织中细胞更新的短时间尺度动态。近日,美国南加州大学的研究团队在《Nature Biotechnology》发表了题为“Fluctuating methylation clocks for cell lineage tracing at high te
“认知时钟”——大脑健康的测量工具
你的大脑和你的实际年龄相比有多大?根据发表在《阿尔茨海默氏症》杂志上的研究结果,拉什大学医学中心的研究人员开发的一种新的大脑健康测量方法,可能为识别有记忆和思维问题风险的个体提供了一种新的方法;痴呆症:6月1日发表在阿尔茨海默病协会杂志上。 研究人员称之为“认知时钟”,该工具是一种基于认知表现
Cell新文章:机体衰老的“时钟”
人体有一个内部生物钟,密切对应着24小时光暗循环周期,人类的作息模式很大程度上就是由生物钟支配。这一生物钟还可以控制机体的其他功能,例如代谢和体温调节。 动物研究发现,当昼夜节律紊乱之时,就会出现诸如肥胖等健康问题和糖尿病等代谢疾病。针对夜班人员展开的研究,也揭示他们的糖尿病易感性增高。
细胞内“突变时钟”能告诉你何时会得癌
滴答,滴答。我们老得有多快?我们是否会得癌?答案或许可以由人体几乎每个细胞内都有的两个“突变时钟”来告诉我们。英国科学家的这一发现将有助于深入了解癌症的起因,掌握如何健康老去的秘诀。而如果能让这些“时钟”走慢点,就有可能改变癌症的进程,甚至延缓衰老。 人体中有些基因突变似乎以恒定的速度在逐年累
新型分子标记物可稳定预测帕金森病治疗结果
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/6/481002.shtm 6 月15日,《临床研究杂志》在线发表中科院脑科学与智能技术卓越创新中心(神经科学研究所)、上海脑科学与类脑研究中心研究员陈跃军团队的最新成果。研究人员解析了中脑多巴胺能神经分化
Advanced-Science:-深度学习方法预测分子激发光谱
芬兰阿尔托大学Patrick Rinke教授及其合作者一起提出了用于预测分子激发光谱的深度学习方法。 以132k有机分子的电子态密度为例,训练和评估了三种不同的神经网络结构:多层感知器(MLP),卷积神经网络(CNN)和深张量神经网络(DTNN)。 神经网络的输入是每个分子中原子的坐标和电荷。
Advanced-Science:-深度学习方法预测分子激发光谱
芬兰阿尔托大学Patrick Rinke教授及其合作者一起提出了用于预测分子激发光谱的深度学习方法。 以132k有机分子的电子态密度为例,训练和评估了三种不同的神经网络结构:多层感知器(MLP),卷积神经网络(CNN)和深张量神经网络(DTNN)。 神经网络的输入是每个分子中原子的坐标和电荷。
营养与健康所通过量化表观遗传时钟的随机成分阐明表观遗传时钟本质
近日,中国科学院上海营养与健康研究所Andrew E. Teschendorff研究组在《自然-衰老》(Nature Aging)上,发表了题为Quantifying the stochastic component of epigenetic aging的研究论文。该研究论证了表观遗传时钟的重要组
活体肿瘤中的装置可更好地预测癌症对药物的反应
直接在体内及在活肿瘤组织中测试多种抗癌药的两种装置为个性化治疗铺设了道路。这些装置是由两个不同小组研发的;通过将实验室进展用于病人,在启动全身性抗癌治疗前,它们有可能指导选择对病人最有效的疗法。通过用很小剂量测试候选药物功效,在让病人没有副作用的情况下,它们还可能帮助加速药物研发。癌症病人经受无
液体活检能够预测前列腺癌症患者的耐药性
97名患者的相关研究结果近日发表在了《Science Translational Medicine》上,研究人员发现,在开始使用abiraterone之前,没有AR基因改变的患者的生存期和无进展期相比较于具有AR基因突变的患者,或者具有AR基因拷贝数增加的患者,显著增加。此外,他们还鉴定了与药物
首个可预测数学模型诞生!癌症患者如何响应免疫疗法?
免疫疗法作为一种风头正盛的 ,尽管响应持久、能治疗的癌症类型广泛,但真正能响应它的患者群体是有限的。因此,科学家们一直在寻找能预测“哪些患者能够响应免疫检查点抑制剂(如PD-1/PD-L1抗体)”的方法。 简单来说,免疫检查点抑制剂是借助人体的免疫系统来识别和摧毁肿瘤细胞。这类新型抗癌疗法的临
癌症患者如何响应免疫疗法?首个可预测数学模型诞生!
近几年,以免疫检查点抑制剂为代表的免疫疗法的成功,几乎颠覆了癌症治疗,且取得了一系列进展。近期,首个能够预测“癌症患者如何响应免疫疗法”的数学模型诞生!相关成果发表在顶级期刊Nature杂志上。 图片来源:网络 免疫疗法作为一种风头正盛的癌症新疗法,尽管响应持久、能治疗的癌症类型广泛
《自然》:可控制癌症基因开关的分子首次合成
为了阻止肿瘤生长蔓延,科学家们不断从各个途径不懈努力。美国科学促进会、英国《自然》杂志网站近日报道,美国达那·法博癌症研究所一个国际联合研究小组研制了一种分子,能让控制癌症的基因指令失效,从根本上抑制了癌症肿瘤的生长。 新研究演示了一种蛋白质能向癌症基因发出“停止”和“开始”命令,这
PNAS:端粒延长分子,可作为癌症治疗靶点
万事万物,皆有始有终,对细胞而言,也是如此。在正常人类细胞中,位于染色体末端的端粒会随细胞分裂而不断缩短,当端粒缩短到一个极限后,细胞就会停止分裂,这就是著名的“海弗里克极限”。 然而,凡事皆有例外,与正常细胞不同,癌细胞可以无限分裂,其中一个重要原因在于癌细胞的端粒酶活性高,可以修复端粒,从
上海交大研究发现蛋白分子可预测糖尿病发生
最近,上海交通大学附属第六人民医院、上海市糖尿病研究所贾伟平教授带领的课题组发现了2型糖尿病预测新标记物――Ficolin-3。相关研究成果近期发表在国际著名期刊《分子细胞生物》杂志(《JMCB》),为糖尿病临床防治提供了科学依据。 糖尿病在全球呈流行趋势,2011年全世界糖尿病患病人数已
JACS-帅志刚邵久书-理论预测分子发光效率
理论预测分子的荧光效率对于设计有机发光材料、分子开关和生物检测分子等研究有重要意义。分子的发光效率由激发态的辐射与无辐射衰变过程竞争决定。辐射过程可以通过著名的爱因斯坦自发辐射与受激辐射关系确定,但无辐射过程的计算一直是理论化学的难点,也是预测有机发光材料效率的关键因素。传统的理论一般都假定激发态和
鼻咽癌肿瘤微环境分子分型预测有新模型
日前,一项由广东医科大学附属医院、暨南大学附属第一医院及河北医科大学第一医院学者共同完成的研究成果《基于MRI影像组学预测局部晚期鼻咽癌CAⅨ-CD8分子分型》在《数字医学与健康》杂志优先出版。该研究旨在通过MRI影像组学探索局部晚期鼻咽癌治疗前肿瘤微环境中碳酸酐酶Ⅸ(CAⅨ)-CD8的变化。
AI从超1亿个分子中预测强力抗生素
一项开创性的机器学习方法已经从1亿多个分子中识别出了强大的新型抗生素,包括一种可以对付多种细菌的分子--包括肺结核和被认为无法治愈的菌株。 研究人员表示,这种名为halicin的抗生素是第一个被人工智能发现的抗生素。尽管人工智能以前曾被用于协助抗生素发现过程的某些部分,但他们表示,这是人工智能
科学家利用生物分子模拟预测代谢酶新功能
近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员李国辉团队与中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员杨巍维团队、广州大学教授王雄军、复旦大学附属中山医院教授李全林等合作,揭示了代谢酶果糖1,6-二磷酸酶1(FBP1)能够行使蛋白磷酸酶的功能,并证明了FBP1介导的IκBα去磷酸化在结直肠癌发生中起到关键
癌症转移关键分子与心血管疾病分子是同一个
癌症是人体细胞不受控制的生长,导致肿瘤的形成,由细胞基因组的突变积累引发。为了成为恶性的、转移性的癌症,肿瘤细胞经历了一系列的转变,包括身体的免疫系统和肿瘤之间的相互作用。然而,这一过程中的许多机制细节仍不清楚,这使得癌症的预防和治疗非常困难。然而,越来越多的证据表明,在肿瘤进展到转移的过程中,血管
细胞“死亡时钟”告诉你何时患癌
一项日前发表于《自然—遗传学》杂志的研究表明,人们衰老得有多快以及是否会患上癌症,或许已被在人体几乎每个细胞中都会出现的两个“时钟”预先决定。 这些“时钟”的每一个“嘀嗒”声都是一个DNA突变,而它们会在你的一生中以不变的速率累积。此项发现将为人们提供关于癌症起源的更深入了解,并且有助于洞悉健
女性衰老的时钟有望被“拨慢”
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505690.shtm 科技日报记者 张佳星 7月28日,《细胞》旗下《医学》(Med)杂志在线发表了我国学者关于女性衰老规律、变化表现等的最新研究,首次系统揭示了中国女性衰老过程中激素水平、免疫能