林金星教授Cell子刊文章：TALEN技术构建有效诱导新系统
中国科学院植物研究所，北京林业大学等处的研究人员发表了题为“An Effective and Inducible System of TAL Effector-Mediated Transcriptional Repression in Arabidopsis”的文章，利用TALEN技术建立了过表达和诱导表达2套系统，通过瞬时和稳定表达针对靶基因序列设计的TALEs，表明TALE可对拟南芥中的靶基因转录产生不同程度的抑制作用。这一研究成果公布在国际学术期刊Molecular Plant上，文章的通讯作者是中科院植物所特聘研究员、北京林业大学林金星教授，第一作者为植物研究所邓馨研究组博士研究生林森和赵媛媛。转录激活因子样效应物TALE（transcription activator-like effector）最早被发现于黄单胞菌中，能够在病原菌感染宿主植物的过程中精确靶向作用于植物防御的相关基因，影响靶基因的表达，从而干预植物的......阅读全文
Nat－Biotechnol：高彩霞团队开发植物基因组引导编辑技术
许多遗传和育种研究表明，点突变和插入/缺失（插入和缺失, indel）可以改变农作物的优良性状。尽管核酸酶启动的同源介导修复（homology-directed repair, HDR）可以产生这种变化，但它受到效率低的限制。碱基编辑器是用于进行碱基转换的强大工具，但不能用于进行碱基颠换、插入或
中国科学院植物研究所在活化石植物分子进化速率研究获新进展
活化石是指起源古老，呈孑遗分布，并保留祖先形态特征的现存生物。这类生物通常有较低的分类多样性和孤立的系统位置，且通常濒临灭绝或者亟需保护。然而，目前对活化石，特别是植物活化石的分子进化和和生态特性仍知之甚少。 中国科学院植物研究所王伟研究组以起源于白垩纪的活化石植物——领春木科（Euptele
华大基因再发PNAS文章
作为基因组测序领域的排头兵，近期深圳华大基因研究院与中科院系统，以及韩国，美国等处的科学家合作，发表了题为“Insights into salt tolerance from the genome of Thellungiella salsuginea(《小盐芥基因组研究揭示其耐逆奥妙》
遗传发育所等联合研究建立植物基因组引导编辑技术体系
基因组编辑技术可以定向修饰植物基因组，从而大大加速植物育种的进程，是实现作物精准育种的重要技术突破。然而，作物的许多重要农艺性状是由基因组中的单个或少数核苷酸的改变或突变造成的。基于CRISPR/Cas系统的基因组编辑，可利用外源修复模板通过同源重组介导的修复方式（HDR）实现目标基因特定核苷酸
植物所发现植物细胞器基因组新的演化模式
质体和线粒体是内共生起源的细胞器，在高等植物中有不同的遗传特征，相较于动态复杂的线粒体基因组，质体基因组的结构和序列更保守。在基部维管植物石松类卷柏科植物中，这两种细胞器基因组表现出相似的特征，但是造成二者趋同演化的机制尚不清楚。 中国科学院植物研究所研究员张宪春研究组从事石松类和蕨类植物的
小盐芥全基因测定拉开耐盐植物研究序幕
小盐芥是一种生长在盐碱地的植物，开着芝麻粒儿大小的白色花儿，既没牡丹的华丽，也无荷花的清香，很难入普通人的法眼。但最近几年，它却得到了生物学家的垂青，成为全球近百个生物实验室竞相研究的对象。悄无声息中，这种普通的野草俨然已成为一朵盛开的奇葩。 7月9日，它登上了《美国科学院院刊》(PNAS
植物所在植物转座子进化方面取得进展
转座子（Transposable elements，TEs）是较多生物基因组中主要的组成部分（在玉米中可达到80%以上）。与单碱基变异相比，转座子序列长、突变速率快，可更快速地产生大效应的突变。转座子能够通过多种机制影响基因的功能和生物的表型。尽管已有较多关于转座子的研究，但尚不清楚转座子对生物
TALE蛋白研究与应用获新进展
中国科学院植物研究所林金星团队在TALE（transcription activator-like effector）蛋白研究与应用中取得新进展，为植物的基因表达调控提供了新方法和新思路。有关研究成果日前发表在国际著名植物学期刊《Molecular Plant》上。 该研究以模式植物拟南芥为研
经5年攻关,朱健康研究组在CRISPR领域取得重大进展,
2018年5月17日，朱健康研究组在Nature Communications在线发表了题为“CRISPR/Cas9-mediated gene targeting in Arabidopsis using sequential transformation”的研究论文，该论文报道了拟南芥中基因
多样化C－to－T植物碱基编辑器被开发
近日，电子科技大学张勇教授、马里兰大学YiPing Qi博士、扬州大学张韬教授课题组合作于《Plant Biotechnology Journal》发表了题名《Improved plant cytosine base editors with high editing activity, pur
植物生物学研究数据库
实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plant
增强子转录在小麦基因表达调控中的作用获揭示
广州大学分子遗传与进化创新研究中心董志诚团队与复旦大学、中国科学院分子植物科学卓越创新中心张一婧团队合作，首次报道了植物中的增强子转录，初步阐释了增强子转录在小麦基因表达调控中的作用。相关研究近日发表于《基因组生物学》（Genome Biology）。 增强子是一种40
增强子转录在小麦基因表达调控中的作用获揭示
广州大学分子遗传与进化创新研究中心董志诚团队与复旦大学、中国科学院分子植物科学卓越创新中心张一婧团队合作，首次报道了植物中的增强子转录，初步阐释了增强子转录在小麦基因表达调控中的作用。相关研究近日发表于《基因组生物学》（Genome Biology）。 增强子是一种40
中国农业大学Nature子刊发表基因组研究新成果
来自中国农业大学、浙江省农业科学院等10多家机构的研究人员，成功绘制出了稻曲病菌（Ustilaginoidea virens）基因组序列草图，从基因组学角度提供了一些关于稻曲病菌进化、活体营养（biotrophy）分子机制以及致病机制的新见解。相关成果发表在5月20日的《自然通讯》（Nature
中国学者Nature－Biotechnology发文：植物基因CT单碱基新系统
来自中科院遗传与发育生物学研究所的研究人员发表了题为“Efficient C-to-T base editing in plants using a fusion of nCas9 and human APOBEC3A”，在前期研究基础上利用Cas9变体(nCas9-D10A)融合人类胞嘧啶脱
遗传发育所在植物着丝粒研究中取进展
基因组测序及解析以及新技术的广泛应用，让人们得以继续探索着丝粒和端粒等染色体上高度重复区域在生命活动中的新功能。植物着丝粒含有丰富的重复序列，如串联重复序列（Satellite）和反转座子（Retrotransposon），参与基因组空间构象和细胞分裂等重要的生物学功能。然而不同物种双着丝粒染色
2019年，中国“大农业”里那些高科技
今年，我国“大农业”科研领域又诞生了诸多令人惊奇的发现，每一条都与我们息息相关。它们涵盖了观赏农业、林业、作物、医学等各个领域，包括睡莲、玉米、硅藻等进展。为了展现这些成就，本报特此就我国农业科学家今年发表的大部分重要论文进行梳理，以飨读者。野生玉米大刍草、SK、现代玉米自交系ZHENG58的
研究揭示植物中DNA半甲基化稳态维持的机制
DNA甲基化是一种常见的表观遗传修饰，其在基因表达调控中起着重要作用。在哺乳动物中，DNA甲基化主要发生在“胞嘧啶-鸟嘌呤”（CG）位点的胞嘧啶上。CG双链上两个胞嘧啶的甲基化状态通常一致，完全甲基化或非甲基化。这种对称的甲基化状态会在DNA复制过程中转化为不对称的“半甲基化”状态，再由DNA甲基转
Nature子刊等多篇研究论文解析种子表观遗传调控
生物通报道：种子休眠与萌发是植物由生殖生长过渡到营养生长的重要发育转变进程，涉及大量基因的激活或者沉默。一些研究发现这个过程中，组蛋白修饰介导的表观遗传基因转录调控可能发挥了重要作用，但是具体分子机制尚不完全清楚。 来自中国科学院植物研究所的刘永秀研究员一直从事表观遗传和植物激素调控种子休眠和
水稻基因组编辑工具盒再添新成员
据中国农科院最新消息，该院植物保护研究所周焕斌课题组、周雪平课题组和四川大学生命科学学院林宏辉课题组合作开发了一系列基于Cas9-NG的各种水稻基因组定点编辑工具，并成功用于水稻单基因敲除、多基因敲除、单碱基编辑（碱基对G·C和A·T的互换）以及靶基因转录激活调控。该成果对于水稻基因功能解析和
遗传发育所利用CRISPRCas系统对植物进行定点基因组编辑
CRISPR-Cas系统是继锌指核酸酶(ZFNs)和TALEN核酸酶之后的另一个可精确定点编辑基因组DNA的新技术，具有设计构建简单快速等优点。目前已在人类细胞系、斑马鱼、小鼠、果蝇和酵母等多个物种中利用，但CRISPR-Cas系统能否在植物中使用尚无报道。 中国科学院遗传与发育生物学研究
研究揭示模式植物适应高海拔环境机制
青藏高原具有低温、强风和强辐射等极端环境特点，是全球生物多样性的热点地区。模式植物拟南芥在全球广泛分布。西藏地区自然分布的拟南芥为探讨植物如何适应极端环境提供了理想材料。中国科学院植物研究所研究员郭亚龙与徐永超团队，联合北京大学教授顾红雅，聚焦青藏高原海拔约4000米的拟南芥自然群体材料，将其与海拔
简化人类细胞基因编辑的新方法
用RNA指导的CRISPR-Cas9系统的动物和植物基因组工程，正在改变着生物学。与其他基因工程工具相比，这种技术更容易使用，并且更有效，因此，在其发现后的短短几年内，就已经被广泛应用于世界各地的实验室，也成为编辑人类多能干细胞、人类胚胎干细胞基因组最常用的技术。1月6日，Cell子刊《Cell
喷一喷就能“改造”植物
近日，日本理化学研究所可持续资源科学中心的研究人员开发了一种无需改变作物基因组就能提高作物质量的新方法。相关论文发表于《美国化学会志—纳米》。 基因编辑技术的发展允许人们直接改变植物基因组，获得所需要的作物品种，但需花费大量时间和经费。由该机构的Masaki Odahara领导的研究小组开发的
上海交大张大兵Cell子刊：新基因从何而来？
来自上海交通大学、马克斯普朗克分子植物生理学研究所以及莱斯特大学的研究人员报告称，他们在拟南芥和水稻中追溯了一些蛋白质编码基因的起源，基于研究发现他们提出了一个进化模型来解释一些新基因从雄性生殖细胞中出现的机制。这项研究发表在6月1日Cell出版社旗下的《分子植物》（Molecular Plan
PacBio三代单分子测序获表观遗传研究新发现
来自福建农林大学海峡联合研究院林学中心等处的研究人员发表了题为“Comprehensive profiling of rhizome-associated alternative splicing and alternative polyadenylation in moso bamboo (P
我国学者揭示SUVH家族的CHG位点甲基化序列分子基础
8月28日，《美国国家科学院院刊》（PNAS）杂志在线发表了中国科学院分子植物卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心杜嘉木研究组和美国加州大学洛杉矶分校Steven Jacobsen研究组合作完成的题为Mechanistic insights into plant SUVH
北京大学Cell－Res基因编辑研究新成果
来自北京大学的研究人员报告称，他们利用一种RNA导向的Cas9核酸酶在哺乳动物细胞和斑马鱼胚胎中有效实现了位点特异性基因编辑。相关论文“Genome editing with RNA-guided Cas9 nuclease in Zebrafish embryos”发表在3月26日的《细胞
水稻基因组编辑工具盒再添新成员
近日，中国农业科学院植物保护研究所周焕斌课题组、周雪平课题组和四川大学生命科学学院林宏辉课题组合作开发了一系列基于Cas9-NG的各种水稻基因组定点编辑工具，并成功用于水稻单基因敲除、多基因敲除、单碱基编辑（碱基对G·C和A·T的互换）以及靶基因转录激活调控。相关研究成果在线发表于《分子植物》（
植物多组学数据驱动的上下游调控因子挖掘平台发布
9月8日，The Plant Journal 期刊在线发表中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张一婧研究组搭建的挖掘植物基因及基因组位点上下游调控因子的网络平台，论文题为Plant Regulomics: A Data‐driven Interface for Retrievi