PacBio三代单分子测序获表观遗传研究新发现
来自福建农林大学海峡联合研究院林学中心等处的研究人员发表了题为“Comprehensive profiling of rhizome-associated alternative splicing and alternative polyadenylation in moso bamboo (Phyllostachys edulis)”的文章，采用PacBio第三代单分子测序，并结合RNA-seq和PAS-seq (polyadenylation site sequencing)，全面解析了选择性拼接和选择性多聚腺苷酸化在毛竹地下茎组织生长发育中的调控。 这一研究成果公布在植物学权威期刊The Plant Journal杂志上，通讯作者为福建农林大学马留银副教授与顾连峰教授，第一作者为王涛涛、王汇源及蔡大伟。 毛竹是生长最快的植物之一，福建是毛竹的主要产区，研究其快速生长机制具有重要的理论意义和实际应用价值。毛竹地下茎系......阅读全文
PacBio三代单分子测序获表观遗传研究新发现
来自福建农林大学海峡联合研究院林学中心等处的研究人员发表了题为“Comprehensive profiling of rhizome-associated alternative splicing and alternative polyadenylation in moso bamboo (P
毛竹：探秘地球的前世今生
地球是人类居住的唯一场所，为人类提供了生活必需的粮食、水、能源和矿产资源，同时也给人类带来了诸如火山、地震、海啸等灾难。人类如同向往太空一样，对地球的深部充满着好奇。 地球科学是一门古老而又年轻的科学，自人类在地球上诞生、繁衍和发展以来，就对自己赖以生存的地球进行了不倦的探索。从地球的起源到
科技助力，浙江安吉百万亩毛竹林变成“绿色银行”
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502831.shtm浙江安吉是我国著名的竹乡，竹林总面积超百万亩，每年的竹业总产值达数百亿，曾经以全国1.8%的立竹量，创造了全国20%的竹业总产值。随着我国经济社会的转型升级，曾经依靠卖竹子就能发家致富
地空学院毛竹教授当选美国矿物学会会士
近日，美国矿物学会(Mineralogical Society of America, MSA)主席Mickey E. Gunter教授致信地空学院毛竹教授，祝贺她当选为美国矿物学会会士(MSA Fellow)。 美国矿物学会是全球最具影响力的地学学术组织之一，创立于1919年，今年正值美国矿
PacBio单分子测序最新科研动态
DNA基因测序技术从上世纪70年代起，历经三代技术后，目前已发展成为一项相对成熟的生物产业。测序技术的应用也扩展到了生物、医学、制药、健康、农林、园艺、花卉、环保、法医等许多领域，并成为一项与我们衣食住行密切相关的高技术产业。据最新统计，2012年全球基因测序市场的产值已超过百亿，按最近几年增长速度
PacBio推出小而强大的测序系统
之前，人们一直在猜测Pacific Biosciences可能会推出小型的单分子测序仪，但PacBio从未给出肯定的答复。而在2015年9月的最后一天，PacBio给了人们一个惊喜，突然宣布推出Sequel测序系统。Sequel系统保留了SMRT技术的优点，与现有的PacBio RS II系统相
罗氏联手PacBio打造NGS诊断产品
美国Pacific Biosciences公司周三宣布与罗氏诊断签订一项协议，以PacBio的SMRT技术为基础开发诊断产品。包括前期、里程碑和供应付款在内，罗氏将向PacBio支付7500万美元。 罗氏选择了PacBio公司的SMRT技术 去年，罗氏曾向 Illumina发起收
PacBio单分子测序最新科研动态
DNA基因测序技术从上世纪70年代起，历经三代技术后，目前已发展成为一项相对成熟的生物产业。测序技术的应用也扩展到了生物、医学、制药、健康、农林、园艺、花卉、环保、法医等许多领域，并成为一项与我们衣食住行密切相关的高技术产业。据最新统计，2012年全球基因测序市场的产值已超过百亿，按最近几年增长
PacBio助力感染菌株基因组重测序
Andrew Kasarskis博士是Icahn基因中心遗传与基因组中心的副主任。他目前领导着一些专攻治疗和诊断的合作项目，而他自己的研究也主要在病原体检测，药物基因组学，睡眠与遗传的关系几个方面展开。在加入西奈山之前，他曾经就职于PacBio，Sage Bionetworks和Merck。他有
PacBio完成大型基因组测序项目
什么叫PacBio技术应用到大型基因组测序项目中会大打折扣，在哪个环节大打折扣?提出这个问题的读者几乎都是抱有同样的心态，尽管大多数读者都基本认同了，如果为了得到Finishing Genome，那么PacBio无论技术和成本，理论上都是最低的，但即使这样，客观成本还是高的吓人，而假如将就D
PacBio如何获得又长又准确的reads
Pacific Biosciences公司近日以单分子环形一致性测序（CCS）为基础开发出一种方案，能够在Sequel测序平台上生成高度准确的长reads。这种方法有望克服短读长测序的读长不足以及长读长测序的准确性有限的问题。 这篇题为“Highly-accurate long-read se
中国科大地空学院毛竹教授当选美国矿物学会会士
近日，美国矿物学会(Mineralogical Society of America, MSA)主席Mickey E. Gunter教授致信地空学院毛竹教授，祝贺她当选为美国矿物学会会士(MSA Fellow)。 美国矿物学会是全球最具影响力的地学学术组织之一，创立于1919年，今年正值美国矿
中国科大地空学院毛竹教授当选美国矿物学会会士
近日，美国矿物学会(Mineralogical Society of America, MSA)主席Mickey E. Gunter教授致信地空学院毛竹教授，祝贺她当选为美国矿物学会会士(MSA Fellow)。 美国矿物学会是全球最具影响力的地学学术组织之一，创立于1919年，今年正值美国矿
PacBio推出首款检测DNA碱基修饰的软件
美国第三代测序公司Pacific Biosciences近日宣布推出一个独特的解决方案，可利用PacBio® RS测序仪检测与表观遗传学调控和DNA损伤相关的DNA碱基修饰。 DNA碱基修饰(如甲基化)在多个生物进程中扮演了重要角色，包括生长和衰老、免疫、细菌致病性以及疾病发展。Pac
PacBio第三季度仪器销售强劲
美国Pacific Biosciences公司在上周宣布，其第三季度的收入同比增长178%，环比增长81%。 这家单分子测序技术公司今年Q3的营业收入达到2060万美元，而去年Q3为740万美元，今年Q2为1140万美元。这也超过了华尔街预计的1720万美元。 在这一季度，产品收入为680万
PacBio全新Sequel－II系统助力入侵物种的鉴定
对于美国葡萄园和苹果园的园主来说，斑衣蜡蝉（spotted lanternfly）简直是噩梦一般的存在。这种贪婪的食客吸食葡萄、苹果等70多种植物的汁液。若任其蔓延，将会造成数百亿美元的损失。 不过好消息是，美国农业部的科学家近日已利用PacBio新推出的Sequel II测序系统，对一只田间
研究发现大气氮沉降提高我国毛竹林生态系统固碳能力
近日，由浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室教授宋新章领衔的一项研究成果发表在《科学进展》杂志上。该研究首次系统揭示了大气氮沉降对毛竹林净碳汇效益的影响特征和作用机制。 据介绍，氮是植物生长所必需的重要元素。由于人类工农业生产活动的快速发展造成的大气氮沉降量激增，已成为全球环境变化
鱼和熊掌兼得，PacBio获得高度准确的长reads
如今，人类基因组的测序已经达到群体规模，但仍需要结合不同的测序技术（短读长和长读长），才能覆盖各种类型的遗传变异。这无疑增加了测序项目的成本和复杂度。为此，Pacific Biosciences公司的研究人员开发出一种方案，能够在Sequel测序平台上产生高度准确的长reads。 如今，人类基
PacBio首次确认一种疾病大片段缺失突变
二代测序为生命科学研究带来了翻天覆地的变化，但是越来越多研究表明这种短读长测序 (short-read sequencing, SRS)虽然高通量，成本低，然而对于串联重复序列、高GC/AT序列、高度多态性区域、高度同源区域以及大片段结构变异的检测能力非常有限，难以全方位的捕捉基因组的变化。据估
土壤养分速测仪分析竹林土壤与竹笋产量的关系
毛竹笋用竹林因为其经济效益高，周期短等特点，已经成为毛竹林经营的主要方式之一。毛 竹林每年春季都出春笋，在实际生产中必须考虑使竹林地充分培育优质竹材、减少退笋量。分析比较不同土壤养分条件下毛竹和竹笋的生长情况，确定最适宜竹林生 长的土壤肥力，为发展竹产业、营造毛竹林提供基础数据,对促进林业和地方经济
Illumina斥资12亿美元收购PacBio－加速基因测序行业整合
2018年11月1日，Illumina公司宣布收购Pacific Biosciences公司。Illumina将以后者每股8美元的价格以全现金交易的形式收购该公司。这一价格比Pacific Biosciences在2018年10月31日市场收盘时的30个交易日成交量加权平均股价溢价71%，按完全
PacBio－Q3收入下降，但仪器安装创新高
Pacific Biosciences公司在上周四收市后宣布，其第三季度的收入同比下降33%，因为去年第三季度收到了罗氏的1000万美元里程碑付款，而今年没有。这家单分子测序公司第三季度的总收入为1390万美元，低于华尔街预计的1580万美元。 在今年第三季度，PacBio的产品收入（包括仪
继英国之后，Illumina收购PacBio再受美国监管机构反对
当地时间2019年12月17日，美国联邦贸易委员会（Federal Trade Commission，FTC）宣布已授权采取行动，以阻止Illumina提出的以12亿美元收购PacBio的交易。 FTC在一份尚未公开的行政申诉中表示，Illumina试图通过“合并作为新生竞争威胁的PacBio
国际大合作，竹子快速生长的生物学机制
竹子是世界上生长速度最快的植物之一，如毛竹(Phyllostachys edulis)生长速度最快时每天可达114.5厘米。竹子为何有如此快的生长速度，其生物学机制如何？一直是植物学界科研人员颇感兴趣但仍不清楚的科学问题。 近日，南京林业大学竹类研究所教授魏强课题组联合美国康奈尔大学、国际竹藤中
中科院、国家林业局Nature子刊发布测序新草图
来自国家林业局、中科院上海生命科学研究院的研究人员成功地绘制出了速生非木材森林物种毛竹(moso bamboo)的基因组草图，从而为研究和遗传改良毛竹提供了一个宝贵的资源。相关成果发布在2月24日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。 国家林业局的江泽慧(Zeh
PacBio测序有望掀起下一场遗传诊断的革命
从一代到二代再到三代，近年来测序技术的发展势不可挡。单分子测序也逐渐表现出它的优势，在测序舞台上发挥着举足轻重的作用。近日，比利时鲁汶大学和瑞典乌普萨拉大学的研究人员在《Nucleic Acids Research》发表综述文章，介绍了PacBio SMRT测序技术在临床中的应用。 文章简单回
PacBio单分子测序揭示丹参叶绿体DNA修饰的相互作用
2014年6月10日，中科院药用植物研究所（IMPLAD）刘昶团队在《PLOS ONE》杂志上发表了利用PacBio测序技术揭示丹参（Salvia miltiorrhiza）叶绿体DNA修饰之间复杂相互作用的相关文章，该文章报道了丹参叶绿体中编码及非编码RNA的表达情况。这也是国内PacBio第
英机构提议阻止Illumina收购PacBio－维护测序市场公平竞争
大约一年前，美国基因测序巨头Illumina宣布了其20年发展史上最大的一笔交易，一时震惊了整个基因测序行业。 2018年11月，Illumina与英国三代测序上游制造商PacBio宣布签署了一项收购协议，Illumina将斥资12亿美元以全现金交易形式收购PacBio，将长读长测序技术收入囊
PacBio－RS－II测序仪革新HLA检测分型技术[创新技巧]
PacBio RS II测序系统一经推出，其长读长、单分子碱基分辨率及无GC偏好性的特征即受到广大研究者的推崇，尤其是在HLA检测分型领域，国际上权威HLA检测分型机构相继引进PacBio RS II测序技术进行相关服务或试剂盒的研发，推起了PacBio在HLA研究应用领域的高潮。His
2022年PacBio营收1.28亿美元，继续专注长度条测序
Pacific Biosciences近日发布2022年财政报告，由于用户等待该公司最新的 Revio 长读长测序仪导致其他测序仪器需求下降，其 2022 年第四季度收入同比下降 24%。2022年收入1.28亿美元，较上年1.31亿降低1.7%；净亏损3.14亿美元。第四季度概况 第四季度总