两位华人教授最新Cell介绍新技术胚胎干细胞中的核小体
高等生物的细胞核负责储存基因组DNA,这些DNA环绕着由四种组蛋白组成的八聚体,形成碟状的核小体结构。核小体的组织影响了基因活性,因此也是科学家们关注的研究领域之一。近日,来自美国西北大学的研究人员的研究人员介绍了一种新研发的化学生物学方法,为研究哺乳动物细胞中核小体如何介导基因调控提供了一个宝贵的资源。这一研究成果在线公布在11月23日的Cell杂志上,领导这一研究的分别是西北大学分子生物学系的王孝忠(Xiaozhong Wang,音译)教授与西北大学统计学系的王吉平(Ji-Ping Wang,音译)教授。在我们的细胞中,DNA被折叠成数百万个小数据包,就像一根线上的珠子,使我们2米长的线性基因基因组,能够纳入一个直径只有约0.01毫米的细胞核中。然而,这些分子珠子,称为核小体,使DNA变得“不可读”。 因此,它们需要暂时无家可归,让基因被复制(转录)到用来制造蛋白质的信息中,解析这些结构组装对基因转录的影响,具有重要意义。在......阅读全文
两位华人教授最新Cell介绍新技术-胚胎干细胞中的核小体
高等生物的细胞核负责储存基因组DNA,这些DNA环绕着由四种组蛋白组成的八聚体,形成碟状的核小体结构。核小体的组织影响了基因活性,因此也是科学家们关注的研究领域之一。 近日,来自美国西北大学的研究人员的研究人员介绍了一种新研发的化学生物学方法,为研究哺乳动物细胞中核小体如何介导基因调控提供了一
两位华人教授最新Cell介绍新技术-胚胎干细胞中的核小体
高等生物的细胞核负责储存基因组DNA,这些DNA环绕着由四种组蛋白组成的八聚体,形成碟状的核小体结构。核小体的组织影响了基因活性,因此也是科学家们关注的研究领域之一。近日,来自美国西北大学的研究人员的研究人员介绍了一种新研发的化学生物学方法,为研究哺乳动物细胞中核小体如何介导基因调控提供了一个宝贵的
NatureCell两大顶级杂志获表观遗传研究突破
来自美国宾州大学与西北大学的两个研究组,近期分别在Nature和Cell这两大顶级期刊上发表文章,分别取得了表观遗传学核小体研究方面的突破性进展,这两项的关键点都来自其重要的研究新技术――宾州大学的研究人员发展了超高分辨率ChIP-exo技术,而西北大学的研究人员则研发了一种基于改造后组蛋白的化
为什么有些基因高表达?
在我们的细胞中,DNA被折叠成数百万个小数据包,就像一根线上的珠子,使我们2米长的线性基因基因组,能够纳入一个直径只有约0.01毫米的细胞核中。然而,这些分子珠子,称为核小体,使DNA变得“不可读”。 因此,它们需要暂时无家可归,让基因被复制(转录)到用来制造蛋白质的信息中。细胞如何确保适当的接
华人科学家Nature公布核小体分布图
来自美国西北大学分子生物学系,统计系等处的研究人员发表了题为“A map of nucleosome positions in yeast at base-pair resolution”的文章,通过建立了一种新方法,在全基因组范围内分析核小体分布的位置,这将有助于揭示体内与转录相关的核
华东师范大学Nature子刊发布表观遗传重要成果
来自华东师范大学、中科院生物物理研究所等机构的研究人员,提供了令人信服的证据证实H3K9甲基化促进了哺乳动物中的DNA维持性甲基化,但并非是其必要条件。研究结果发布在8月24日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。 华东师范大学的翁杰敏(Jiemin Wong)教
中山大学贺雄雷PNAS新文章
中山大学生命科学学院贺雄雷教授带领的研究小组日前在国际顶尖学术期刊PNAS上发表论文证实在进化过程中哺乳动物X染色体基因表达减少,从而驳斥了Ohno提出的性染色体与常染色体间的剂量补偿假说。 性别的产生是生物进化的重要事件。哺乳动物的性别是由性染色体决定,因此关于性染色体的起源与演化是生物
南方医科大颜光玗教授Nature揭示基因表达调控机制
由来自法国巴黎-萨克雷大学、中国南方医科大学、美国宾夕法尼亚州立大学等机构的科学家组成的一个国际研究小组,揭示出了一些特殊的酶重塑细胞核中极其凝缩的遗传物质,由此控制哪些基因获得利用的机制。这一研究发现发布在1月27日的《自然》(Nature)杂志上。 中国南方医科大学的颜光玗(Kuangyu
顶级科学家张毅Cell发布重要成果
来自波士顿儿童医院、美国国立卫生研究院的研究人员揭示出了,小鼠着床前发育过程中的染色质调控景观。这项重要的研究工作发布在6月2日的《细胞》(Cell)杂志上。 著名华人科学家张毅(Yi Zhang)教授是这篇论文的通讯作者。几年前,汤姆森科技信息集团旗下《科学观察》(Science Watch
西南大学研究人员发现调控寿命新基因
科技日报讯 (记者雍黎)记者9月9日从西南大学获悉,该校资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室教授代方银团队发现了调控寿命的新基因OSER1,并在家蚕、线虫、果蝇等多物种中进行研究,揭示了其调控机制。作为长寿基因FOXO(叉头框蛋白O)的靶基因,OSER1对寿命的影响得到人类受试者研究结果支持。相关论
Cell综述:染色质和转录动力学
组蛋白能帮助古细菌和真核生物维持其基因组的紧凑性和稳定性,形成类似核小体之类的结构也能调控DNA结合转录调控元件,以及顺式调控DNA元件的作用方式。不同类型的蛋白,比如ATP依赖性重塑酶能促进组蛋白与转录因子之间的动态竞争,从而调控染色质的组装,结合以及编辑。 5月14日最新一期Cell杂志发
任兵教授Cell子刊解读染色质结构域
高等生物的细胞核负责储存基因组DNA,这些DNA环绕着由四种组蛋白组成的八聚体,形成碟状的核小体结构。基因组DNA以这样的形式包装成为染色质,使DNA受到良好的保护。 所有控制基因转录的调控蛋白,都要结合在DNA上起作用。而染色质的3D结构会随着细胞生活周期而变化,调节调控因子所能接触到的基因。
克隆基因的表达(expression-of-cloned-gene)3
(3)原核生物的基因组基本上是单倍体,而真核基因组是二倍体。(4)如前所述,细菌多数基因按功能相关成串排列,组成操纵元的基因表达调控的单元,共同开启或关闭,转录出多顺反子(polycistron)的mRNA;真核生物则是一个结构基因转录生成一条mRNA,即mRNA是单顺反子(monocistron)
出人意料的非编码RNA调控
为了将六英尺多的DNA塞进细胞核里,细胞将基因组紧紧缠绕在组蛋白核心上形成核小体,并最终将其包装成紧密的染色质。DNA转录的时候需要打开核小体,而胚胎干细胞的染色质重塑复合体esBAF可以做到这一点。它不仅会打开需要转录的DNA,还暴露了促进转录的启动子和增强子。 基因组测序研究最近显示,增强
外源基因在真核细胞中的表达系统
1. 真核生物表达的优越性和必要性① 真核生物具有转录后加工系统,可识别并删除基因中的内含子,剪切加工为成熟mRNA.②具备完善的翻译后加工系统,可进行糖基化、乙酰化等修饰,使蛋白形成正确的天然构型,因而真核生物表达系统产生的蛋白更接近天然状态,有利于其功能、生物活性的研究。③某些真核细胞可将基因表
Science:结构上揭示核小体依赖性的cGAS抑制机制
在一项新的研究中,来自美国北卡罗来纳大学教堂山分校的研究人员首次确定了先天免疫系统中一种名为cGAS的关键DNA感应蛋白与核小体结合在一起时的高分辨率结构,其中核小体是细胞核内最重要的DNA包装单位。相关研究结果于2020年9月10日在线发表在Science期刊上,论文标题为“Structura
Naure揭示失活X染色体惊人发现
马萨诸塞大学医学院、居里研究院和斯坦福大学的科学家们,详细地查看了磁性哺乳动物失活X染色体紧密包装的小结构——巴尔氏小体(Barr body)的内部,并开发出了一个模型系统,其有可能成为了解染色体结构和基因表达的一个重要工具。 长期以来人们都认为失活的X染色体是一种相当无组织的紧密结构,但发表
分子生物学家连发Cell,Nature文章-破解基因组奥秘
来自宾州大学的分子生物学教授Frank Pugh主要从事真核细胞基因组中转录调控机制方面的研究,近期其研究组接连发表文章,分别解析了基因组中相同类型位置上编码和非编码RNA的起始点,以及利用一种新技术,破解了两种染色体重构因子在基因组范围内的组织调控方式。 在真核细胞中,ATP依赖的染
复旦大学Science最新发文:揭示+1核小体调控转录起始机制
作为基因表达调控的核心,转录起始过程发生在基因启动子区,通过染色质重塑复合物剔除核小体暴露出启动子, 允许转录起始复合物(preinitiation complex,PIC)的组装,在中介体(Mediator)的帮助下组装成PIC-Mediator转录起始超级复合物。我院徐彦辉团队在2020和2
中国学者Cell-Res揭示新型组蛋白伴侣分子
来自中国医学科学院北京协和医学院、北京生命科学研究所、中科院生物物理研究所的研究人员报告称,他们鉴别出了一个哺乳动物H2A.Z特异性的伴侣蛋白Anp32e。这一研究发现在线发表在3月11日的《细胞研究》(Cell Research)杂志上。 北京生命科学研究所的朱冰(Bing Zhu)
弥补ChIPseq缺陷的新工具
来自美国麻省大学医学院的研究人员开发出了一项新技术,可以提供真核生物基因组的详细三维(3-D)图像,这有可能帮助科学家们解答一些有关染色质结构的关键问题。在发表于《细胞》(Cell)杂志上的研究论文中,这一称作为Micro-C的新技术使得研究人员能够以核小体分辨率来分析染色体折叠,填补了以往一些
Cell发布突破性基因组研究技术
来自美国麻省大学医学院的研究人员开发出了一项新技术,可以提供真核生物基因组的详细三维(3-D)图像,这有可能帮助科学家们解答一些有关染色质结构的关键问题。在发表于《细胞》(Cell)杂志上的研究论文中,这一称作为Micro-C的新技术使得研究人员能够以核小体分辨率来分析染色体折叠,填补了以往一些
Cell发布突破性染色质检测技术
来自美国麻省大学医学院的研究人员开发出了一项新技术,可以提供真核生物基因组的详细三维(3-D)图像,这有可能帮助科学家们解答一些有关染色质结构的关键问题。在发表于《细胞》(Cell)杂志上的研究论文中,这一称作为Micro-C的新技术使得研究人员能够以核小体分辨率来分析染色体折叠,填补了以往一些
北大,中科院最新Nature子刊揭示miRNA的新调控作用
生物通报道:中科院遗传与发育生物学研究所,北京大学生科院的研究人员发现了一个单子叶植物所特有的、受RSV侵染抑制的水稻负调控抗病因子miR528,这项研究揭示了miR528及其调控的靶基因在水稻与病毒相互作用过程中的抗病机制。 这一研究成果公布在Nature Plants杂志上,文章的通讯作者
顶级科学家张毅Nature子刊发表最新成果
高等生物的基因组DNA储存在细胞核中,这些DNA环绕着由四种组蛋白组成的八聚体,形成碟状的核小体结构。基因组DNA以这样的形式包装成为染色质,使DNA受到良好的保护。 这种核小体包装不仅有助于储存遗传信息,也涉及了细胞内的多种调控,尤其是各种以DNA为模板的过程。核小体在细胞中是否还有其他的功
2013值得关注的技术:NOMeSeq
DNA甲基化和核小体的分布组装共同调控着基因表达的表观遗传因素,解析这两个关键的过程对于了解遗传机制,以及疾病致病机理具有重要意义。 精确追踪这两个过程的传统方法主要依赖于对基因组中DNA甲基化,核小体占位(nucleosome occupancy),以及核小体定位过程的分步成像。但是
研究发现不同组蛋白酰化修饰的功能差异
北京时间5月30日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所罗小舟课题组和北京大学刘涛课题组、刘小云课题组的合作成果发表于国际著名学术期刊《德国应用化学》,研究团队基于基因密码子扩展技术,创造了含共翻译修饰(Co-Translational modification, CTM)核小体的酿酒酵母菌
Cell新发现颠覆表观遗传传统认知
来自美国托马斯杰斐逊大学的一个研究团队获得了关于组蛋白修饰作用相反的证据。在一项果蝇胚胎研究中,他们发现亲代的甲基化组蛋白并没有转移给子代DNA。相反,在DNA复制后,由新合成的未修饰组蛋白组装成了新的核小体。相关论文发布在8月23日的《细胞》(Cell)杂志上。 托马斯杰斐逊大学生物化学
原来年纪大了,连血液中的游离DNA片段都会改变!
我们知道,随着年纪的增长,人类的面部会出现皱纹、身体功能下降。而来自布朗大学分子生物学研究所Nicola Neretti教授领导的研究小组发现,年纪大了,连血液中的DNA都会发生改变。这些漂浮在血液中的DNA片段称为Cell-free DNA,即cfDNA,他们与年龄和健康密切相关。研究人员表
任兵教授PNAS发表重要测序技术
高等生物的细胞核负责储存基因组DNA,这些DNA环绕着组蛋白形成碟状的核小体结构。基因组DNA以这样的形式包装成为染色质,使DNA受到良好的保护。染色质结构对于DNA转录、复制和修复非常关键,决定着基因的表达和细胞的生理状态。人们通常使用核酸酶MNase和DNase I进行染色质结构分析,但在某