Science:重大突破!揭示piRNA建立安全系统保护基因组机制
数以千计的具有不同核苷酸序列的短RNA分子起着安全卫士的作用,能够识别和沉默侵入基因组的企图,比如病毒或被称为转座子的寄生元件插入到宿主基因组中的DNA。 这些不同的小RNA分子,被称为与Piwi蛋白相互作用的RNA(Piwi-interacting RNA, piRNA),是由各种动物(如从昆虫、线虫到小鼠和人类等哺乳动物)产生的。在一项新的研究中,来自芝加哥大学的研究人员描述了piRNA如何发现外源基因序列并让它们沉默。他们还展示了内源性的或着说“自我”的基因如何避免接受这种额外的检测。相关研究结果发表在2018年2月2日的Science期刊上,论文标题为“The piRNA targeting rules and the resistance to piRNA silencing in endogenous genes”。图片来自Jordan Brown, UChicago 论文通信作者、芝加哥大学分子遗传学与细胞......阅读全文
一种全新的酶可对抗寄生的基因组TE序列
科学家们发现了一种名为 PUCH 的酶,它对于阻止寄生 DNA 序列在我们基因组中的传播至关重要。 这一发现可以让我们深入了解我们的身体如何识别和对抗内部威胁(如基因组寄生虫)和外部威胁(如病毒和细菌)。 德国美因茨分子生物学研究所 (IMB) 的 René Ketting 教授团队与奥地利维
长链非编码RNA测序服务助力揭开lncRNA神秘面纱
2012年12月18日,华大基因科技服务有限公司(简称“华大科技”)在国内推出长链非编码RNA测序(lncRNA-Seq)服务。该技术突破了常规研究方法效率低、研究范围受限的瓶颈,可一次性获得样本中几乎全部的lncRNA序列,不仅可以对已知lncRNA进行定量分析,还可对 novel lnc
小干扰RNA转录后基因沉默的介绍
siRNA诱导的转录后基因沉默始于RNA诱导的沉默复合物(RISC)的组装。该复合物通过切割编码靶基因的mRNA分子来沉默某些基因表达。为了开始该过程,两条siRNA链中的一条(引导链)将被装载到RISC中,而另一条链即过客链被降解。某些Dicer酶可能负责将引导链加载到RISC中。然后,siR
Cell杂志最受关注十篇文章(12月)
Cell创刊于1976年,现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一,并陆续发行了十几种姊妹刊,在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。 Cell以发表具有重要意义的原创性科研报告为主,许多生命科学领域最重要的发现都发表在Cell上。本月《Cell》前十名下载论文为: 1. Hall
中国科大揭示小RNA表观修饰新机制
日前,中国科学技术大学教授光寿红课题组研究揭示小RNA介导组蛋白3 赖氨酸27 的三甲基修饰机制,研究成果发表在近期的Current Biology 上,中国科大生命科学学院博士生毛慧和朱成明为论文的共同第一作者。 小RNA介导染色体修饰在植物和酵母中有着广泛的研究,然而在动物中小RNA指导的
动物所发现一类高度富集于成熟精子的新型小分子RNA
成熟精子中RNA的发现让科学家意识到精子不仅仅是运输父源DNA的载体。过去的研究已证实,成熟精子所携带的一些miRNA能够影响早期胚胎发育及后代的性状。然而,目前尚不清楚成熟精子中是否还携带除miRNA之外其他种类的小RNA;对各种小RNA的生成及在成熟精子中的富集过程也知之甚少。
2019中国生命科学20大进展榜单出炉-除了颜宁还有谁?
经过1500位左右的读者投票,最后iNature编辑部得到了2019年中国生命科学领域20大进展,其中结构有2项,植物3项,生物机理研究4项,新方法/技术/动物模型6项,生物医学5项。 结构:颜宁团队Cav通道结构,这些结构为未来针对Cav通道病的药物发现奠定了基础; 中科院生物物理所饶子和
刘默芳施惠娟发表Cell文章-发现人Piwi基因突变致男性不育
国际著名学术期刊《细胞》(Cell)于5月26日在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所刘默芳研究组与上海市计划生育科学研究所施惠娟研究组合作的最新研究成果“Ubiquitination-deficient Mutations in Human Piwi Cause Male Infert
Cell:小分子RNA的大作用
所有有性繁殖多细胞生物体都依赖于卵子来支持早期的生命。加州大学圣地亚哥医学院及Ludwig癌症研究所的研究人员利用微小线虫作为模型,更好地了解了卵子仅借助于已存在的物质实现胚胎发育的机制。发表在3月24日《细胞》(Cell)杂志上的这项研究,揭示出了小分子RNA(Small RNAs)和辅助蛋白
科学家发现富集于成熟精子的新型小分子RNA
近日,中科院动物研究所段恩奎、韩春生和周琪三个实验室联合发现了一类大量存在于成熟精子中、源于tRNA的小分子RNA。相关研究成果日前发表于《细胞研究》。 成熟精子中RNA的发现让科学家意识到精子不仅仅是运输父源DNA的载体。过去的研究已证实,成熟精子所携带的一些miRNA能够影响早期胚胎发
科研人员在蜘蛛中发现大量新型内源性病毒
节肢动物是地球种类最丰富的动物类群,包括昆虫、甲壳类动物、鲎、蝎子、蜘蛛等。NALDVs是一类以杆状病毒为代表的主要感染节肢动物的大DNA病毒。已有研究表明,NALDVs可在宿主基因组中发生广泛整合并形成非逆转录内源性病毒元件。目前,科研人员尚未在蜘蛛中发现相关病毒或非逆转录内源性病毒元件。近日,中
研究人员提出小核糖体RNA新概念
中科院上海生科院营养科学研究所翟琦巍研究组在一项研究中,提出了小核糖体RNA (srRNA)这一新概念,并初步发现srRNA和糖尿病存在相关性并具有生物学功能。相关成果近日在线发表在美国《公共科学图书馆—综合》(PLOS ONE)杂志上。 据介绍,近年来,小RNA的研究发展迅猛,各
华裔牛人Cell子刊小RNA突破性新发现
来自耶鲁大学的一个研究小组发现,称作piRNAs的特化RNAs引导表观遗传因子到达果蝇整个基因组的许多位点,在那里这些开关发挥作用关闭或开启了基因。这一研究发布在近期的《发育细胞》(Developmental Cell)杂志上。 如果基因组是生命的蓝图,那么编排我们如何组装和发挥功能机
揭示登革热媒介白纹伊蚊环状RNA的功能和机制
近日,南方医科大学公共卫生学院/热带医学研究所教授顾金保团队研究揭示了登革热媒介白纹伊蚊circRNA(circular RNA,环状RNA)的功能和机制。相关研究论文发表于PLoS Pathogens。白纹伊蚊是一种传播疾病的蚊子,它是多种病毒的媒介。白纹伊蚊是登革病毒主要的传播媒介,其种群在全球
不同类型的RNA的功能和分布汇总
不同类型的RNA的功能和分布名称功能存在信使RNA(mRNA)翻译模板。所有的生物转移RNA(tRNA)携带氨基酸,参与翻译。所有的生物核糖体RNA(rRNA)核糖体组分,参与翻译。所有的生物核小RNA(snRNA)参与真核细胞核mRNA前体的剪接。真核生物核仁小RNA(snoRNA)参与古菌和真
NGS文库制备的方法比较
近年来,新一代测序(NGS)技术的应用日益广泛。随着测序技术的不断改进,制备核酸和构建NGS文库的方法也在改进。对于各种文库制备方法,我们该如何选择?近日,美国斯克里普斯研究所的研究人员在《Biotechniques》上发表文章,比较了各种文库制备策略。 总的来说,在NGS分析之前,制备R
带你走进神秘的长链非编码RNA
长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子,它们并不编码蛋白,而是以RNA的形式在多种层面上(表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等)调控基因的表达水平。lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”,是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能。然而,近年来的研究
不同类型的RNA的功能和分布
不同类型的RNA的功能和分布名称功能存在信使RNA(mRNA)翻译模板。所有的生物转移RNA(tRNA)携带氨基酸,参与翻译。所有的生物核糖体RNA(rRNA)核糖体组分,参与翻译。所有的生物核小RNA(snRNA)参与真核细胞核mRNA前体的剪接。真核生物核仁小RNA(snoRNA)参与古菌和真核
不同类型的RNA的功能和分布
不同类型的RNA的功能和分布名称功能存在信使RNA(mRNA)翻译模板。所有的生物转移RNA(tRNA)携带氨基酸,参与翻译。所有的生物核糖体RNA(rRNA)核糖体组分,参与翻译。所有的生物核小RNA(snRNA)参与真核细胞核mRNA前体的剪接。真核生物核仁小RNA(snoRNA)参与古菌和真核
不同类型的RNA的功能和分布
不同类型的RNA的功能和分布名称功能存在信使RNA(mRNA)翻译模板。所有的生物转移RNA(tRNA)携带氨基酸,参与翻译。所有的生物核糖体RNA(rRNA)核糖体组分,参与翻译。所有的生物核小RNA(snRNA)参与真核细胞核mRNA前体的剪接。真核生物核仁小RNA(snoRNA)参与古菌和真核
科学家测序动物界最大基因组
据最新一期《自然》杂志报道,德国康斯坦茨大学和维尔茨堡大学领导的国际研究团队,对动物界最大基因组的拥有者——肺鱼进行了基因组测序。肺鱼基因组约为人类基因组大小的30倍。测序数据有望揭示当今陆地脊椎动物的鱼类祖先如何成功登陆的奥秘。泥盆纪时期(约4.2亿至3.6亿年前),一种具有强健胸鳍和肺的肉鳍鱼类
RNA实验方案和应用(一)
RNA是具有多种不同的功能的生物大分子。信使RNA(mRNA)是DNA转录得到的,用做蛋白质合成的模板。蛋白质的合成是由核糖体完成的,核糖体由核糖体RNA(rRNA)和蛋白质组成。用于蛋白合成的氨基酸,是通过转运RNA(tRNA)输送到核糖体上的。RNA分子也是参与RNA转运过程的核糖蛋白的一部分。
不同类型的RNA的功能和分布
名称功能存在信使RNA(mRNA)翻译模板。所有的生物转移RNA(tRNA)携带氨基酸,参与翻译。所有的生物核糖体RNA(rRNA)核糖体组分,参与翻译。所有的生物核小RNA(snRNA)参与真核细胞核mRNA前体的剪接。真核生物核仁小RNA(snoRNA)参与古菌和真核生物rRNA前体的后加工。真
不同类型的RNA的功能和分布情况
不同类型的RNA的功能和分布名称功能存在信使RNA(mRNA)翻译模板。所有的生物转移RNA(tRNA)携带氨基酸,参与翻译。所有的生物核糖体RNA(rRNA)核糖体组分,参与翻译。所有的生物核小RNA(snRNA)参与真核细胞核mRNA前体的剪接。真核生物核仁小RNA(snoRNA)参与古菌和真核
中科院Nature子刊表观遗传新成果
来自中国科学院动物研究所、北京大学的研究人员在新研究中,解析了小鼠精子发生过程中5-羟甲基胞嘧(5-hydroxymethylcytosine,5hmC)的动态机制,相关论文“Dynamics of 5-hydroxymethylcytosine during mouse spermatog
男性生育基因的发现照亮了精子成功之路
来自爱丁堡大学和其他地方的科学家发现了一种新的基因,它作为一对基因的一部分来保护男性的生育能力。了解这两个基因如何协同工作可以解释一些严重的男性不育病例的基础。研究结果的全部细节发表在本周《分子细胞》杂志上一篇题为“ C19ORF84 连接 piRNA 和 DNA 甲基化机制以保护哺乳动物种系”的论
营养所发现小鼠肝脏小RNA存在多种修饰并和糖尿病相关
近日,Analytical Chemistry在线发表了中科院上海生命科学研究院营养科学研究所翟琦巍研究组的最新研究进展:A high-throughput quantitative approach reveals more small RNA modifications in mou
中国科技大学Cell子刊发表RNA研究新成果
生物体内存在大量不编码蛋白质的非编码RNA,它们广泛参与了关键性细胞功能的调控。近年来人们发现,非编码RNA出现异常与许多重要的疾病有关,了解这些RNA有助于更好的理解和治疗相关疾病。 小干扰RNA(siRNA)是一种广为人知的非编码RNA,能够调控细胞核中的基因表达。siRNA介导的染色质修
“消炎”这件事,并不简单!
“这项研究促使我们提出了一个新理论,即免疫应答空间调节之‘定位原则’,” Chavakis说。“换句话说,负责维持身体平衡的分子,稳态分子,可以根据其所在位置执行不同调节功能。” piRNA、lncRNA、miRNA及mRNA的作用网络调控神经胶质瘤的增殖和侵袭 炎症与许多健康状况有关,从关
科学家测序动物界最大基因组
科技日报北京8月15日电(记者张佳欣)据最新一期《自然》杂志报道,德国康斯坦茨大学和维尔茨堡大学领导的国际研究团队,对动物界最大基因组的拥有者——肺鱼进行了基因组测序。肺鱼基因组约为人类基因组大小的30倍。测序数据有望揭示当今陆地脊椎动物的鱼类祖先如何成功登陆的奥秘。泥盆纪时期(约4.2亿至3.6亿