中国科大揭示小RNA表观修饰新机制

日前,中国科学技术大学教授光寿红课题组研究揭示小RNA介导组蛋白3 赖氨酸27 的三甲基修饰机制,研究成果发表在近期的Current Biology 上,中国科大生命科学学院博士生毛慧和朱成明为论文的共同第一作者。 小RNA介导染色体修饰在植物和酵母中有着广泛的研究,然而在动物中小RNA指导的序列特异性染色体修饰机制研究的却并不清楚。该课题组利用模式生物秀丽隐杆线虫进一步揭示了小RNA介导H3K27me3修饰和维持的分子机制。研究发现外源性的RNA干扰可以在小RNA的靶标位点特异性地诱导H3K27me3并且这一过程依赖于细胞核内RNA干扰Nrde通路。外源性RNA干扰诱导产生的H3K27me3可以维持多代,内源性产生的siRNA同样可以诱导产生依赖于Nrde通路的H3K27me3修饰。piRNA和WAGO-1结合的siRNA可以介导产生依赖于NRDE-2的H3K27me3,然而CSR-1结合的内源性siRNA却并不能介导H......阅读全文

RNA加工修饰

中文名RNA加工修饰所属领域生物学定义RNA加工修饰,主要加工方式是切断和碱基修饰,真核生物tRNA前体一般无生物学特性,需要进行加工修饰。

RNA介导的基因沉默实验

实验材料 pGEM-T 载体DNA 模板试剂、试剂盒 dNTP 混合物DNA 聚合酶(Sigma) 及配套缓冲液限制酶仪器、耗材 PCR 纯化试剂盒或柱子实验步骤 一、筛选目的基因片段的参数1. 序列( 1 ) 构建一个指定的 RNA 沉默载体首先要进行生物信息学分析。根据目的基因对应的已知 c

RNA介导的基因沉默实验

实验材料pGEM-T 载体                                                                  DNA 模板                                                          试剂、试剂盒d

RNA介导的基因沉默实验

实验材料pGEM-T 载体DNA 模板试剂、试剂盒dNTP 混合物DNA 聚合酶(Sigma) 及配套缓冲液限制酶仪器、耗材PCR 纯化试剂盒或柱子实验步骤一、筛选目的基因片段的参数1. 序列( 1 ) 构建一个指定的 RNA 沉默载体首先要进行生物信息学分析。根据目的基因对应的已知 cDNA 序列

筛选或验证RNA修饰直接靶点,研究RNA修饰靶基因的调控...

筛选或验证RNA修饰直接靶点,研究RNA修饰靶基因的调控机制技术简介用体外转录法标记生物素RNA探针,然后与胞浆蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合,从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后,通过Western Blot检测特定的RNA结合蛋白是否与R

RNA修饰相关酶PCR芯片

应用场景:通过关键酶/蛋白的RNA表达变化,确定样品表型与特定RNA 修饰的联系 优势:预制的PCR板,覆盖68个针对不同RNA修饰的Writers/Erasers/Readers基因。精心优化的引物Tm值均一,并经过了严格的预实验验证,无须摸索引物设计和测试。工业化生产的高度均一的PCR

RNA足迹和修饰干扰分析实验

RNA 足迹和修饰干扰分析(RNA footprinting and modification interference analysis)是用来研究 RNA 与蛋白质相互作用的技术。RNA 测序及其结构分析的原理是 RNA 足迹试验的理论基础,它们都是建立在变性、半变性或自然条件下采用碱基特异性

Cell综述:RNA修饰的新作用

  迄今为止,科学家们已经发现了上百种RNA修饰类型,但是其中大多数在mRNA和调控非编码RNAs中还是很罕见的。近期的一些研究发现指出,这些修饰中有至少有一些含量丰富,且保守性强。本期Cell杂志以此为中心,介绍了两种RNA修饰方式的分子机制,和生物学功能。  这两种RNA修饰方式分别是N6-甲基

RNA足迹和修饰干扰分析实验

实验方法原理 RNA 足迹和修饰干扰分析(RNA footprinting and modification interference analysis)是用来研究 RNA 与蛋白质相互作用的技术。RNA 测序及其结构分析的原理是 RNA 足迹试验的理论基础,它们都是建立在变性、半变性或

RNA足迹和修饰干扰分析实验

            实验方法原理 RNA 足迹和修饰干扰分析(RNA footprinting and modification interference analysis)是用来研究 RNA 与蛋白质相互作用的技术。RNA 测序及其结构分析的原理是 RNA

何川教授新发Nature综述:mRNA修饰介导的基因调控

  在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以调控基因的表达,并由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现,mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。  N6-methyladenosine(m6A)是真

RNA表观修饰居然能够影响天然免疫

   DDX46是RNA解旋酶DDX家族成员,对于细胞核内mRNA前体的剪接具有重要的调控作用。《Nature Immunology》杂志8月29日发表了中国医学科学院院长、中国工程院院士曹雪涛研究团队的论文,揭示了RNA解旋酶DDX46通过结合RNA去甲基化酶ALKBH改变细胞核内RNA修饰的新方

RNA表观修饰能够影响天然免疫研究

前言       DDX46是RNA解旋酶DDX家族成员,对于细胞核内mRNA前体的剪接具有重要的调控作用。《Nature Immunology》杂志8月29日发表了中国医学科学院院长、中国工程院院士曹雪涛研究团队的论文,揭示了RNA解旋酶DDX46通过结合RNA去甲基化酶ALKBH改变细胞

m5C-RNA修饰靶基因验证

技术简介 RIP(RNA Immunoprecipitation)是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络的有力工具。这种技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,然后经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行分析。RIP-Seq将RIP技

LCMS/MS检测整体RNA修饰水平

核酸修饰概要 : DNA/RNA 修饰是表观遗传修饰的重要层面,指的是在 DNA、RNA 碱基 A\T\G\C\U 及核糖上的各种修饰。目前己发现的 DNA 修饰有十几种,而 RNA修饰有 100 多种,其中甲基化修饰占大部分,目前研究也较为普遍,并且可能具有重要生物调控作用。 实

前核糖体-RNA-(prerRNA)-介导技术

2022年1月4日,西湖大学俞晓春团队在Cell Research 在线发表题为“Pre-ribosomal RNA reorganizes DNA damage repair factors in nucleus during meiotic prophase and DNA damage res

中国科大揭示小RNA表观修饰新机制

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基于深度学习的RNA多类型修饰解析算法

中国科学院动物研究所研究员赵方庆团队开发基于纳米孔RNA直接测序技术与深度学习策略的RNA修饰图谱解析算法ORCA。相关研究发表于《自然-通讯》。基于深度学习的RNA修饰系统识别与注释模型  论文作者供图RNA修饰对RNA的剪接加工、出核转运、以及RNA的稳定性和翻译效率有着重要的调控作用。但现有研

纳米介导双链RNA可防治番茄潜叶蛾

近日,针对新发重大入侵害虫番茄潜叶蛾,中国农业科学院植物保护研究所农业入侵生物预防与监控创新团队研发了纳米介导双链RNA的应用体系,为后续利用RNA干扰技术防治番茄潜叶蛾奠定了基础。纳米载体递送dsRNA防控番茄潜叶蛾示意图。中国农科院供图番茄潜叶蛾是世界检疫性害虫,主要以幼虫潜食危害番茄、马铃薯等

RNA修饰过程中重要化学步骤揭示

  项新的研究揭示了为一些RNA添加化学标签的重要细胞修饰过程中的化学步骤。这一过程被干扰可能会导致人类患神经元疾病、糖尿病和癌症。由美国宾夕法尼亚州立大学化学家领导的一个研究小组已经对一种促进细菌RNA修饰的蛋白质进行了成像,从而重建这一过程。相关论文15日发表在《自然》杂志上。  转运RNA(t

拟南芥RNA核糖甲基化修饰研究方面获进展

  3月30日,中国科学院生物物理研究所研究员叶克穷课题组、北京大学现代农学院博士王玉秋和中科院遗传与发育研究所研究员李家洋课题组合作在Nucleic Acids Research上发表了题为Profiling of RNA ribose methylation in Arabidopsis tha

Nature:线粒体中的RNA修饰能促进癌症的扩散

肿瘤细胞在转移过程中会消耗远超正常细胞需要的能量,德国癌症研究中心的研究团队发现了与能量代谢相关的新型癌细胞转移的促进因素,相关成果在《Nature》发表,论文的标题为:Mitochondrial RNA modifications shape metabolic plasticity in met

Nature:线粒体中的RNA修饰能促进癌症的扩散

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揭示RNA-m6A修饰调控抗肿瘤免疫机制

  免疫治疗是对抗肿瘤的前沿阵地,其治疗成功的关键是引发针对肿瘤抗原的自发性T细胞反应。许多病人的免疫系统无法有效识别肿瘤抗原,难以引发持续性的T细胞应答并清除肿瘤。研究免疫系统识别肿瘤抗原的分子机制有望发现新型药物靶点,提高免疫治疗效果。  中国科学院北京基因组研究所韩大力团队与清华大学徐萌团队、

2019年云序RNA甲基化修饰领域文章汇总

  感恩有你,一路同行!2019年末,云序生物携全体员工对一直以来关心和支持公司发展的广大新老客户致以最诚挚的问候!光阴如梭,一年转瞬又将成为历史,新的一年意味着新的起点、新的机遇、新的挑战,决心再接再厉,更上一层楼。回首即将过去的2019,云序生物不断创新,硕果累累;展望2020,任重道远却信心倍

写入教科书!RNA表观修饰居然能够影响天然免疫

   DDX46是RNA解旋酶DDX家族成员,对于细胞核内mRNA前体的剪接具有重要的调控作用。《Nature Immunology》杂志8月29日发表了中国医学科学院院长、中国工程院院士曹雪涛研究团队的论文,揭示了RNA解旋酶DDX46通过结合RNA去甲基化酶ALKBH改变细胞核内RNA修饰的新方

植物RNA修饰将成为新一代作物改良靶标

  近日,上海交通大学生命科学技术学院副教授姜博晨课题组在《生物技术通报(英文)》(aBIOTECH)发表了综述论文。文章系统梳理了植物m6A调控的最新研究进展以及利用m6A修饰进行作物改良的潜在应用策略。  RNA表观修饰是指发生在RNA分子上的化学修饰,广泛存在于动物、植物、真菌等真核生物。N6

一种修饰RNA疗法更有助治疗心力衰竭

  与传统的提供较长时间蛋白表达的传统DNA投递方法相比,一种采用修饰RNA的治疗方法通过限制治疗蛋白表达数日的方式在患有心力衰竭小鼠身上具有更优秀的表现。本周发表在《自然—生物技术》上的这项研究表明,修饰RNA或许能为通过激活内在干细胞以修复受损组织的治疗方案提供一种有用的工具。    Kenne

植物RNA修饰将成为新一代作物改良靶标

近日,上海交通大学生命科学技术学院副教授姜博晨课题组在《生物技术通报(英文)》(aBIOTECH)发表了综述论文。文章系统梳理了植物m6A调控的最新研究进展以及利用m6A修饰进行作物改良的潜在应用策略。RNA表观修饰是指发生在RNA分子上的化学修饰,广泛存在于动物、植物、真菌等真核生物。N6-甲基腺