长链非编码RNA与淋巴瘤
类基因组中仅有1.5%~2.0%编码蛋白的基因得以稳定转录,而剩余的绝大多数RNA无编码蛋白的功能。长链非编码RNA(lncRNA)是一类异质性的非编码RNA,根据lncRNA的功能,可将其分为信号分子、诱饵分子、引导分子和骨架分子4类。人们以往仅将这些不具编码功能的RNA视为进化过程中产生的废料,而随着研究的不断深入,人们逐渐认识到编码蛋白的基因数量对于有机体复杂程度的影响远小于非编码转录子。越来越多的研究显示,lncRNA的近端启动子序列、外显子、内含子以及二级结构均高度保守,可以在表观遗传学、转录及转录后等多个层面调控基因的表达。图片来源于网络 淋巴瘤由于其复杂的发病机制、多样的临床表现以及患者的个体差异显著,使得淋巴瘤的诊治仍然是一项有待攻克的难题。近年来,越来越多的研究表明lncRNA的异常表达与多种人类疾病相关。本文我们就lncRNA在淋巴瘤中研究综述如下。 一、lncRNA与淋巴瘤的发生 近期Petri等......阅读全文
长链非编码RNA与淋巴瘤
类基因组中仅有1.5%~2.0%编码蛋白的基因得以稳定转录,而剩余的绝大多数RNA无编码蛋白的功能。长链非编码RNA(lncRNA)是一类异质性的非编码RNA,根据lncRNA的功能,可将其分为信号分子、诱饵分子、引导分子和骨架分子4类。人们以往仅将这些不具编码功能的RNA视为进化过程中产生的废
调控免疫的lncRNA
当过度活化或脱靶时,免疫系统中正常对抗感染的一些细胞会转而攻击个体自身的组织。这一过程会推动作为自身免疫性疾病组成部分的炎症。现在,来自纽约大学Langone医学中心的一项新研究揭示出了抑制这些机制的一种新方法,有可能会影响未来的药物设计。相关论文 发布在12月16日的《自然》(Natur
lncRNA研究策略与技术
研究背景:长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类不编码蛋白的RNA分子,长度在200 bp以上,起初被认为是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能;近期的研究表明lncRNA具有保守的二级结构,可以与蛋白、DNA和RNA相互作用,参与多种生物学过程的调控
lncRNA功能机制研究(二)
实验路线(1)LINC00346调控胃癌发展的上游机制结果:转录因子KLF5和MYC可与LINC00346启动子结合,并增强其表达a. 转录因子MYC、KLF5和 LINC00346的Oncoprint分析;b. 在含有或未含有胃癌KLF5/ MYC / LINC00346 SCNAs的转录因子
lncRNA功能机制研究(一)
文章导读LncRNA是长度大于200nt的长链非编码RNA,在调控不同的分子过程中发挥着重要作用。其主要功能不仅可以与功能蛋白结合,并在转录或转录后水平调控基因表达,而且lncRNA也可以作为诱饵,吸附miRNA,调节miRNA调控的靶基因表达。但是,目前关于lncRNA在胃癌中的表达谱和生物学功能
lncRNA甲基化如何研究?
lncRNA分子通过海绵机制结合microRNA发挥生物学功能,这个ceRNA机制已经让大家心生厌倦了。可大牛就是大牛,引入甲基化就能轻松的变废为宝,竟然能让lncRNA的ceRNA思路变得瞬间高大上发表10分以上的文章,你一定和小编我一样很好奇他是怎么做到的。RNA甲基化,作为最新的国自然热点受到
eLife:lncRNA调控癌症关键基因
Salk研究所的科学家们发现,一种长非编码RNA(lncRNA)是癌症发展过程中的一个关键基因开关。这项研究于四月二十九日发表在eLife杂志上,为相关癌症的治疗提供了一条新的途径。 研究人员将这种lncRNA命名为PACER(p50-associated COX-2 extragenic
lncRNA表达与RNA的延伸
LncRNA的火热研究已经有几年的时间了,关于lncRNA总归是有说不完的话题。目前对lncRNA的基础分析都已形成了一定的模式。然后,今年来lncRNA的相关文章依然如雨后春笋。 长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RN
lncRNA助力叶酸研究新成果
LncRNA研究发表的成果五花八门,然而借助于lncRNA芯片,挖掘其中的高通量数据,发表5分影响因子的文章,还是可行的。本研究是以叶酸处理肥胖模型为基础,让我们来看看到底怎么样就可以在《Cellular Physiology and Biochemistry》(IF=5.104)上发表。研究背
lncRNA的概念及形成过程
lncRNA,即Long non-coding RNA,你可以把它理解为不表达蛋白的mRNA。它的很多特征与mRNA很类似。比如,它与mRNA一样有启动子、有polyA尾巴、有不同剪接、有动态表达水平。除了不表达蛋白这一点以外,仅从核苷酸水平上来看,可以说它与mRNA并无实质分别。所以对于设计PC
如何快速查找LncRNA序列
查找LncRNA序列的网站有很多,包括Genebank,Ensembl,RefSeq,UCSC数据库等。今天,小编就给大家讲讲如何通过LncRNA ID号查找LncRNA的序列。 一.根据LncRNA来源数据库,进入相应链接。 1. Genebank:https://www.ncb
如何快速查找LncRNA序列?
查找LncRNA序列的网站有很多,包括Genebank,Ensembl,RefSeq,UCSC数据库等。今天,小编就给大家讲讲如何通过LncRNA ID号查找LncRNA的序列。一.根据LncRNA来源数据库,进入相应链接。 Genebank:https://www.ncbi.nlm.nih.gov
LncRNA芯片应用于胃癌研究
上海交通大学附属仁济医院房静远教授主要从事消化系统肿瘤发生的分子机制、早期诊断和分子治疗等相关研究。近期,该课题组应用美国Arraystar公司的lncRNA芯片分析了胃癌组织的lncRNAs表达情况,筛选到可预测胃癌发生的分子标志物GClnc1,并且阐明了GClnc1在胃癌的发生和发展中是如何发挥
LncRNA芯片应用于胃癌研究
研究背景 在全世界分范围内,每年因肝癌死亡的病例超过50万人,是主要的致死恶性肿瘤之一。在过去的十年中,随着影像学的进步以及健康体检的普及,越来越多的肝癌病人在患病早期被发现。但由于肝脏捐赠者的短缺,外科肝脏切除术仍然是治疗早期肝癌病人的最主要方法。目前对于术后患者缺乏准确
Nature重要发现:调控免疫的lncRNA
当过度活化或脱靶时,免疫系统中正常对抗感染的一些细胞会转而攻击个体自身的组织。这一过 程会推动作为自身免疫性疾病组成部分的炎症。现在,来自纽约大学Langone医学中心的一项新研究揭示出了抑制这些机制的一种新方法,有可能会影响未来 的药物设计。相关论文发布在12月16日的《自然》(Nature)
国际知名学者综述:LncRNA分类
美国St. Laurent Institute的Philipp Kapranov教授,是基因组学与系统生物学领域具有重要国际影响的专家,长期从事系统生物学和基因组功能方面的研究,其发现人类基因组能够产生大量的有功能作用的非编码RNA,在概念层次上重新定义了“基因”,这一发现被Science选为最
Cell重要发现:调控免疫的lncRNA
由麻省大学医学院Katherine A. Fitzgerald领导的研究小组证实,一种长链非编码RNA lincRNA-EPS发挥转录刹车作用限制了炎症。这一重要的研究发现发布在6月16日的《细胞》(Cell)杂志上。 细胞类型特异性的调控回路以复杂、动态和短暂调节的方式控制着基因表达。了解这
新机制:lncRNA可调控小麦开花
冬小麦开花需要长时间低温环境的诱导,该过程称之为春化作用。这一过程受到外部环境因子和植物内在发育状态的双重复杂精准的调控。冬小麦不同品种的春化特性与其产量直接相关。在六倍体小麦中,TaVRN1是受低温诱导、可加速开花转换的关键调控因子。然而,目前对于在春化过程中TaVRN1逐步激活的分子机制尚不
华裔学者Cell发表lncRNA研究的利器
长非编码RNA(lncRNA)是长达两百个核苷酸以上的转录本,绝大多数位于细胞核内。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质,但它们在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性,这说明lncRNA具有重要的生物学意义。在测序技术的帮助下,人们已经发现了数千种lncRNA,但这些lncRNA的生物学功能依然
长链非编码-RNA(lncRNA)研究策略
长链非编码 RNA(long noncoding RNA,lncRNA)指的是转录本长度在 200-100000 nt 之间的 RNA 分子,它们不编码蛋白,位于细胞核或胞质内,具有保守的二级结构。研究显示,lncRNA 并非以前所认识的那样没有功能,它可与蛋白质、DNA 和 RNA 相互作
lncRNA逆转录的引物如何设计
目前发现的大多数lncRNA都带有poly(A),可以通过Oligo(dT)、随机引物进行反转录扩增合成cDNA
lncRNA在农业领域的研究成果
miRNA的好Homie,非编码RNA界的NewStar --没想到在农业上大展身手啦 你没看错!不是标题党。说到miRNA的好Homie,非编码RNA界的NewStar,想必聪明博学的你就已经猜到了是lncRNA。今天大阅哥要给大家挖一挖lncRNA在农业上的研究进展。为了写这篇主题
上海交大LncRNA研究刊登国际期刊
长非编码RNA(lncRNA)不编码蛋白质,最初被认为是基因组“暗物质”的一部分。最近,有研究表明,lncRNAs在染色质修饰复合物的招募过程中发挥作用,并能影响基因的表达。然而,是否lncRNAs以类似的方式在癌症中发挥作用,尚不明确。延伸阅读:中美学者JBC解析lncRNA在EMT中的作用。
亲本lncRNA-MISSEN调控水稻胚乳的发育
胚乳是水稻的重要组成成分,是水稻种子的主要食用部分。因此,胚乳的发育情况直接影响稻米的产量和品质。长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度超过200nt的非编码RNA,其数量众多,在植物生长的各个环节发挥重要功能;然而其在胚乳发育调控过程中的作用机制未见报道。 近日,中山大学生命科学学院陈
Cell:“垃圾”基因也可致癌
在过去几年里,科学家们在长非编码RNA功能研究方面取得了显著进展,lncRNA作为多种生物学过程的重要调控因子,目前已经发现其在多种疾病过程如癌症的发展过程中具有重要作用。 近日,来自美国哈佛大学医学院的研究人员在著名国际学术期刊cell在线发表了他们的最新研究进展,他们发现lncRNA的一个
套细胞淋巴瘤-or-弥漫大B细胞淋巴瘤?
2016年8月24日苏州大学附属第二医院的张宏老师在全国形态学诊断学术交流群分享了一例少见的淋巴瘤病例,引起群内专家老师热烈讨论。现将病例精华整理成章,方便大家学习和收藏。 张宏-苏州大学附属第二医院:在不参考病史和细胞形态的情况下,仅凭流式图,各位老师考虑什么疾病? 石淙-宁
lncRNA反向遗传学研究的典型案例
研究背景长链非编码RNA(Long noncoding RNA,lncRNA)普遍被认为是一类不能编码蛋白的长链RNA。由于其序列较长,所以可以有较大的潜力形成多种复杂构象,从而通过不同生物学途径发挥其作用。此外,由于其不具备蛋白编码能力,因此此类RNA也主要由其碱基序列形成的高级结构来执行生物
四川农大BMC发表lncRNA新成果
在过去的几年里,长非编码RNAs(lncRNAs)已经得以广泛研究。有研究已在小鼠、大鼠和人类中鉴定了大量的lncRNAs,其中一些已被证明在肌肉发育和生成过程中起着重要的作用。然而,对于覆盖家畜骨骼肌所有发育阶段的lncRNAs的特性,报道还较少。 8月22日,四川农业大学动物科技学院的研究
Cell子刊:挑战传统理论的lncRNA
几乎整个人类基因组都会转录成RNA,但只有一部分RNA被用于蛋白质生产。大多数RNA(非编码转录组)的功能还是未知的,长非编码RNA(lncRNA)就是其中之一。 德国亥姆霍兹慕尼黑中心(Helmholtz Zentrum München)的研究人员发现,一种lncRNA(称为PARTICLE
lncRNA在农业领域的研究成果(三)
【结论】①通过lncRNA测序,在上万条白菜中候选的lncRNA中挑出了1,300余条与花粉授粉相关的lncRNAs。分析结果显示一部分lncRNA在花蕾到授粉受精整个发育过程中持续表达,其余的部分为阶段、部位特异性表达。lncRNA在白菜不同发育阶段花蕾种的表达呈现出较明显的差异,在V级花蕾中特异