蒙古高原四个特色物种全基因组序列图谱绘制完成
内蒙古农业大学和深圳华大基因研究院8月9日在呼和浩特市联合宣布,蒙古羊、蒙古牛、蒙古马和阿拉善双峰驼全基因组序列图谱绘制完成。这是我国科学家首次独立完成蒙古高原物种全基因组序列图谱,标志着我国地方畜种研究进入基因组水平。 蒙古羊、蒙古牛、蒙古马、阿拉善双峰驼是我国古老的原始品种和畜牧业的主要基础品种,我国育成的众多地方品种均有这些品种的血液。这些古老品种经过长期的自然和人工选择,形成了抗寒、耐热、耐旱、耐粗饲、生长发育快、畜产品品种优、抗病力强等特点,成为种质创新和新品种培育的重要资源。 蒙古高原4个特色物种全基因组序列图谱将有助于揭示其特殊生理机能的分子基础,通过对其基因组的研究,利用4个特色物种全基因组结构和特征,充分发掘其经济性状的分子基础,发挥特色物种的各种遗传潜力,具有重要的科研价值,对于提高其生产性能,加快优良品种的培育和改良,提高生产能力,提高农业现代化水平,提升自治区畜牧业竞争力都具有重要现实意......阅读全文
突破耐药基因组测序缺陷-靶向测序对抗耐药菌新契机
自以抗生素为代表的抗菌剂问世以来,细菌对人类健康的危害得到了极大的控制。然而进入21世纪后,情况好似走入了另一个极端——由于抗生素滥用所致的耐药菌的出现以及广泛传播。这是由于在药物的选择压力下,敏感菌株被抑制或杀灭,天然耐药或获得性耐药菌株则继续生存、繁殖和克隆传播,导致细菌的耐药性增高。 细
科区与华大基因科技有限公司签订合作协议
5月6日,科尔沁区政府与深圳华大基因科技有限公司签订合作协议。华大基因将在医学、农业、制药、精准扶贫等方面为科尔沁区提供科技平台、技术平台、教育平台支撑。 华大基因是全球最大的基因组学研究中心,其数据中心、产业孵化中心、测序能力及基因组信息分析能力位居世界第一,在全世界基因测序上贡献率近50%
OPGEN全基因组图谱应用系列——鞭虫全基因组测序
鞭虫是一种常见的土壤传播寄生虫,地理分布广,感染率高,寄生于人体盲肠,导致人体慢性感染,对人类危害巨大。鞭虫的全基因组测序研究由著名的桑格研究院(Wellcome Trust Sanger Institute)完成,发表在世界顶级期刊《Nature Genetics》上。该研究通过对2种不同
法国拟建高速基因组测序分析平台
法国总理菲利普17日在巴黎宣布,法国在法兰西岛大区(又称“巴黎大区”)和中部奥弗涅—罗讷—阿尔卑斯大区启动建设两个高速基因组测序分析平台,以推动法国基因组相关研究的发展。 法国政府去年6月提出“法国基因组医学2025”计划,这两个基因组测序分析平台的建设就隶属该计划,预计将于2018年正式开始
科学家完成柑橘基因组测序
美国佛罗里达大学研究人员带领的一个国际研究小组日前完成了对甜橙和克莱门氏小柑橘(为柑橘与酸柑杂交的品种)树的基因测序工作,并公布了相关基因图谱,这在柑橘属果树中尚属首次。 研究人员称,该基因图谱的公布将有助于科学家找到新方法来对抗包括柑橘黄龙病(又称黄枯病、青果病,对柑橘危
《自然》封面:大熊猫基因组测序
由深圳华大基因研究院发起,中国科学院昆明动物研究所、中国科学院动物研究所、成都大熊猫繁育研究基地和中国保护大熊猫研究中心参与的合作研究成果《大熊猫基因组测序和组装》,1月21日以封面故事形式在国际权威杂志《自然》上发表。 在国家林业局、深圳市政府、深圳市盐田区政府及相关企业的支持下,“
我国率先完成枣树全基因组测序
在科技部“十一五”和“十二五”科技支撑计划项目的持续资助下,河北农业大学刘孟军教授研究团队在世界上率先完成了枣树的高质量全基因组测序,组装出总长4.38亿个碱基的枣基因组序列,达估测基因组的98.6%,使枣树成为世界鼠李科植物(近千种)和我国干果树种中第一个完成基因组测序的物种。 相关论文
中药材“甘草”基因组测序完成
科技日报东京10月27日电 (记者陈超)日本理化学研究所、千叶大学、高知大学和大阪大学等组成的一个研究小组宣布,他们对中药材“甘草”进行了全基因组测序,成功取得了推测的全部基因94.5%的基因信息。 甘草是一种豆科植物,广泛应用于各种中药中,是重要的中药原料。它具有改善肝功能、治疗消化性溃疡
Nature新闻:基因组测序追踪超级病菌
研究人员通过基因组测序最终了解了去年困扰英国剑桥一家新生儿特护病房达数月之久的超级细菌疫情。他们将这一案例报告在11月14日的《柳叶刀传染病》(Lancet Infectious Disease)杂志上,标志着首次科学家们通过测序病原体基因组积极控制了一场持续爆发的疫情。 在两天内Ro
当宏基因组遇上单细胞测序
日前,科学家们通过宏基因组测序和单细胞测序鉴定了一类新细菌。 16S rRNA基因序列的保守性和普遍性,使其成为了微生物检测和分类鉴定的强有力工具。这种方法为科学家们揭示了微生物群体的高度复杂性,但它还是有所遗漏。美国能源部联合基因组研究所上周的一次会议上,研究者人员向人们展示了在四个温泉样本
个人基因组测序预测能力遭质疑
一项新的研究给全基因组测序对每个人都很有用的说法泼了一盆冷水。图片来源:N.J. Roberts等,《科学—转化医学》 “每个人都将拥有自己的基因组序列,并且可以将这些信息装在一个U盘中”——生物医学家曾这样给我们描绘一幅美妙的蓝图,当脱氧核糖核酸(DNA)测序变得很廉价时,这一
近期最受关注的基因组测序研究
想象一下有人递给你一杯奶昔,要你鉴别出里面所有的东西。或许你能够辨别出有一点点的草莓或是酸奶的味道。但总体上它的味道就像是无法分辨的成分构成的混成品。 现在再想象一下,这杯奶昔是由来自大脑的2万个碾碎了的细胞所组成。你可以通过测试来确定样本中有什么分子,这就是科学家们现在所做的事情。这当然会提
近期最热门的基因组测序成果
生物通报道:The scientist杂志对近期最热门的一些基因组测序成果进行了盘点,包括濒临灭绝的几维鸟和极其聪明的章鱼。 种属:甜瓜(Cucumis melo) 西班牙和意大利的研究团队在Molecular Biology and Evolution杂志上率先发布了七个甜瓜品种的基因组分
个人基因组测序收费将大幅降价
新华社伦敦2月9日电针对个人的基因组测序服务刚出现时,测序费用高达上百万美元,普通人望尘莫及。不过,美国一家公司计划从今年6月开始,推出低价个人基因组测序业务,顾客只需支付5000美元,就可向这家公司预约基因组测序服务。 据英国《新科学家》杂志网站报道,这家名为“完全基因组”的公司位于美国
-Science:宏基因组学测序技术
宏基因组学技术(Metagenomic approaches)正快速拓宽我们对微生物代谢能力(microbial metabolic potential)的认识。 长期以来,对微生物(microorganism)功能开展的研究主要依赖的都是以在实验室里培养的单一物种(individua
我国完成首个鱼类基因组测序项目
记者8月5日从深圳华大基因研究院获悉,中国水产科学研究院黄海水产研究所和深圳华大基因研究院已联合完成半滑舌鳎全基因组测序和组装,绘制了半滑舌鳎全基因组序列图谱。这是我国完成的第一个鱼类基因组测序项目和全基因组序列图谱,使半滑舌鳎成为世界上第一个测定了全基因组序列的鲽形目鱼类。 据了解
中药材“甘草”基因组测序完成
日本理化学研究所、千叶大学、高知大学和大阪大学等组成的一个研究小组宣布,他们对中药材“甘草”进行了全基因组测序,成功取得了推测的全部基因94.5%的基因信息。 甘草是一种豆科植物,广泛应用于各种中药中,是重要的中药原料。它具有改善肝功能、治疗消化性溃疡、抗炎症及止疼止咳等多种功效。甘草根部富含
Nature:实时、便携式基因组测序
埃博拉病毒(EBOV)感染人类会引起致命的出血热,发病率和病死率极高。2014年这种病毒在西非造成了严重的疫情,死亡人数已经超过11,000人。今年一月份,就在人们以为这场疫情正式结束之际,塞拉利昂又出现了新的病例。 本期Nature杂志发表的一项新研究展示了便携式基因组测序仪在这次疫情中起到
PacBio助力感染菌株基因组重测序
Andrew Kasarskis博士是Icahn基因中心遗传与基因组中心的副主任。他目前领导着一些专攻治疗和诊断的合作项目,而他自己的研究也主要在病原体检测,药物基因组学,睡眠与遗传的关系几个方面展开。在加入西奈山之前,他曾经就职于PacBio,Sage Bionetworks和Merck。他有
Nature-Methods发布基因组测序新工具
十月十七日Nature Methods杂志发表的一项研究显示,新测序技术与新算法的结合可以为人们揭示复杂基因组的详细信息。加州大学戴维斯分校和Pacific Biosciences公司的研究人员的FALCON-Unzip算法能够将长读取测序数据装配成高度准确、连续和正确定相的二倍体基因组。 随
近期最热门的基因组测序成果
大千世界无奇不有,这都是进化的功劳。大航海时代,科学家们扬帆远航去探索大自然的神奇造化。如今,科学家们正在测序技术的帮助下进一步揭示生命的奥秘。The scientist杂志对近期最热门的一些基因组测序成果进行了盘点,华大基因参与的两项测序研究格外引人瞩目。 种属:长颈鹿和okapi 基因组
PacBio完成大型基因组测序项目
什么叫PacBio技术应用到大型基因组测序项目中会大打折扣,在哪个环节大打折扣?提出这个问题的读者几乎都是抱有同样的心态,尽管大多数读者都基本认同了,如果为了得到Finishing Genome,那么PacBio无论技术和成本,理论上都是最低的,但即使这样,客观成本还是高的吓人,而假如将就D
埃博拉基因组测序发布重要发现
来自巴斯德研究所(Institut Pasteur)、法国国家科学研究中心和悉尼大学的科学家们,通过对在几内亚流行的埃博拉病毒株进行基因组测序,追踪了病毒的传播,并监测了这一国家的病毒进化情况。 研究揭示出有三种不同的病毒变种在几内亚,尤其是首都的城市区域和附近的市镇同时传播,研究人员在发表
The-scientists盘点最热门的基因组测序
The scientist杂志对近期最热门的一些基因组测序成果进行了盘点,以飨读者。 一种新病毒 种属:果蝠疱疹病毒(FBAHV1) 基因组:149,459bp 日本北海道大学的研究团队测序了一种新病毒的基因组序列,并将结果发表在六月十八日的Journal of Virology杂志上。
Cell新文章:癌症全基因组测序
根据华盛顿大学医学院的一项新研究,具有吸烟史的肺癌患者相比于不吸烟的肺癌患者肿瘤中的遗传突变要多10倍。这一研究在线发表在9月13日的《细胞》(Cell)杂志上。 论文的资深作者、华盛顿大学基因组研究所主任Richard K. Wilson 说:“吸烟者基因组具有比不吸烟的肺癌患者基因
简述全基因组测序的技术路线
全基因组测序的技术路线:提取基因组DNA,然后随机打断,电泳回收所需长度的DNA片段(0.2~5Kb),加上接头, 进行DNA簇(Cluster)制备,最后利用Paired-End(Solexa)或者Mate-Pair(SOLiD)的方法对插入片段进行测序。然后对测得的序列组装成Contig,通
关于全基因组测序的内容介绍
1998年,克莱格·凡特的塞雷拉基因组公司成立,而且宣布将在2001年完成测序工作。随后国际团队也将完成工作的期限提前。2000年6月26日,塞雷拉公司的代表凡特,以及国际合作团队的代表弗朗西斯·柯林斯(Francis Collins),在美国总统柯林顿的陪同下发表演说,宣布人类基因组的概要已经
我国率先完成菊花全基因组测序
中国中医科学院中药研究所和安利植物研发中心对外发布消息称,由他们共同发起的科研团队,在菊花全基因组计划获重大进展的同时,还完成了重要的药用菊花品种——杭白菊的全长转录组遗传信息发掘。此举使我国成为世界上首次完成菊属植物菊花全基因组测序的国家。 据了解,菊属植物染色体结构复杂,包含从2n=18到
华大基因发布基因组测序新成果
来自深圳华大基因研究院的研究人员,对4种代表性的弹涂鱼(mudskippers)进行了基因组测序,由此阐明了两栖鱼类适应陆地生活环境的分子机制。相关研究论文发布于12月2日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。 深圳华大基因研究院的石琼(Qiong Shi)研究员
印度实施大规模基因组测序计划
据4月19日《印度教徒报》消息,印度将实施一项涉及1万人的基因组测序项目,以便进一步开展相关疾病防治研究。 2003年人类基因组首次被测序,开启了将个体特定基因与疾病相关联的新途径。包括囊性纤维病、珠蛋白生成障碍性贫血等在内的近万种疾病与单个基因故障有关。同时基因还可能对特定药物具有不同敏感性