我国完成首个鱼类基因组测序项目

记者8月5日从深圳华大基因研究院获悉,中国水产科学研究院黄海水产研究所和深圳华大基因研究院已联合完成半滑舌鳎全基因组测序和组装,绘制了半滑舌鳎全基因组序列图谱。这是我国完成的第一个鱼类基因组测序项目和全基因组序列图谱,使半滑舌鳎成为世界上第一个测定了全基因组序列的鲽形目鱼类。 据了解,半滑舌鳎(Cynoglossussemiliaevis)是我国特有的名贵经济海水鱼类,俗名鳎米鱼,属于鲽形目、鳎亚目、舌鳎科、舌鳎属。由于其味道鲜美、肉质细嫩、营养丰富,深受广大消费者欢迎,其市场价值极高。 去年12月,中国水产科学研究院黄海水产研究所陈松林研究员和深圳华大基因研究院王俊博士联合启动了半滑舌鳎全基因组测序和基因图谱绘制研究项目。该项目采用新一代测序技术。 半滑舌鳎全基因组测序产生的海量基因序列和巨大遗传信息数据库将为揭示半滑舌鳎性别决定等重要性状的遗传基础提供可能,同时还为半滑舌鳎良种培育、病害防治和健康养殖提供......阅读全文

我国完成首个鱼类基因组测序项目

  记者8月5日从深圳华大基因研究院获悉,中国水产科学研究院黄海水产研究所和深圳华大基因研究院已联合完成半滑舌鳎全基因组测序和组装,绘制了半滑舌鳎全基因组序列图谱。这是我国完成的第一个鱼类基因组测序项目和全基因组序列图谱,使半滑舌鳎成为世界上第一个测定了全基因组序列的鲽形目鱼类。  据了解

我国在鱼类性别调控机制研究方面取得重大突破

  中国水产科学研究院黄海水产研究所联合深圳华大基因研究院、德国维尔茨堡大学、法国农业科学研究院和新加坡国立大学等单位组建的国际合作研究团队,在半滑舌鳎性染色体起源和性别决定机制研究方面取得突破性进展。近日,国际生物学领域顶级期刊Nature Genetics(《自然.遗传》)在线发表了相关研究

海水鲆鲽鱼类基因组编辑技术取得突破性进展

  记者近日从黄海水产研究所了解到,该所鱼类种质资源与分子育种科研团队在海水鲆鲽鱼类基因组编辑技术研究上取得突破性进展。研究论文“Genome editing reveals dmrt1 as an essential male sex-determining gene in Chinese ton

基因组育种技术翻开海水鱼类育种新篇章

  目前,解决好渔业发展和生态环境保护之间的矛盾是当务之急,国家大力控制海洋捕捞的同时,促进了海洋鱼类养殖业的快速发展,这个产业在未来相当一段时间内有着广阔的发展空间和前景。  瞄准产业需求、用科技造福人类是中国水产科学研究院水产生物技术领域首席科学家、黄海水产研究所(以下简称:黄海所)研究员陈松林

中国学者最新Nature-Genetics文章:破译又一关键基因组

  生物通报道:来自中国水产科学研究院黄海水产研究所等处的研究人员发表了题为“The genome and transcriptome of Japanese flounder provide insights into flatfish asymmetry”的文章,破译了日本牙鲆(Japanese

邵长伟:以基因技术作锄,誓将沧海变“良田”

他参与绘制了我国第一个鱼类(半滑舌鳎)基因组精细图谱(国际上首个比目鱼基因组图谱),解析了半滑舌鳎发生性逆转的表观调控机制;他主导建成我国保存量最大的海洋渔业生物基因资源库,搭建了种质资源精准鉴定与评价平台;他主持了全国第一次水产养殖种质资源黄渤海区调查项目…… 他是中国水产科学研究院黄海水产研

“基于全基因组信息的鱼类遗传选育”课题取得丰硕成果

  我国拥有300多万平方千米的蓝色国土,海洋空间资源、水体资源和生物资源蕴藏量巨大,具有广阔的开发潜力。“十二五”期间,863计划现代农业技术领域设置了“海水养殖种子工程”重大项目以支持我国海水养殖业科研和产业发展。为适应迅猛发展的基因组学发展趋势,抢占基因组选择育种战略制高点,项目设置了“基于全

科学家绘制褐牙鲆全基因组精细图谱

  近日,中国水产研究院黄海水产研究所研究员陈松林领导的研究组与上海海洋大学、德国维尔茨堡大学、葡萄牙阿尔加夫大学、深圳华大基因研究院等单位合作,破译了褐牙鲆全基因组序列,通过与半滑舌鳎全基因组比较分析,初步揭示了比目鱼变态发育的分子机制。该研究成果发表于《自然—遗传学》。  通过与半滑舌鳎全基因组

科学家绘制褐牙鲆全基因组精细图谱

  近日,中国水产研究院黄海水产研究所研究员陈松林领导的研究组与上海海洋大学、德国维尔茨堡大学、葡萄牙阿尔加夫大学、深圳华大基因研究院等单位合作,破译了褐牙鲆全基因组序列,通过与半滑舌鳎全基因组比较分析,初步揭示了比目鱼变态发育的分子机制。该研究成果发表于《自然—遗传学》。  通过与半滑舌鳎全基因组

中国科学家破译大黄鱼全基因组测序

  由浙江海洋学院院长吴常文领衔,上海交通大学、复旦大学等机构科学家参加的研究团队最近联合破译了大黄鱼全基因组测序,构建了大黄鱼基因组图谱,并成功解析其先天免疫系统基因组特征。日前,该研究成果发表在《自然》杂志上。这是继半滑舌鳎之后,我国公布的第二个海水鱼类的基因组图谱,也是世界上第一个石首科鱼类基

自然子刊综览

  《自然—神经科学》   神经胶质细胞变化影响小鼠社会性行为   在小鼠早期发育过程中出现的缺陷包括神经元之间额外连接的移除等,都与小鼠社会性行为的改变有关。《自然—神经科学》发表的这项研究结论或有助于社交性行为的神经生物学研究,并让我们加深对自闭症或强迫症的社会性缺陷方面的了解。   发育

解开花鲈的基因密码

  “破译鱼类基因组序列,完成其基因组精细图谱的绘制意义重大,可以为开展鱼类重要经济性状的遗传解析、基因组选择育种以及良种培育提供基因组资源和技术支撑,使鱼类遗传育种研究进入一个全新的阶段。”中国水产科学研究院黄海水产研究所(以下简称黄海所)研究员陈松林在接受采访时表示。花鲈基因家族分析 陈松林供图

我国科学家发布大黄鱼全基因组图谱

  由浙江海洋学院、上海交通大学、复旦大学等高校研究机构联合破译的大黄鱼全基因组图谱,日前在世界权威期刊——《自然》周刊发表。这是继半滑舌鳎之后,我国公布的第二个海水鱼类的基因组图谱,也是世界上第一个石首科鱼类基因组图谱,标志着我国海洋生物学的研究真正进入基因组时代。   自1985年大黄鱼人工养殖

中国突破活鱼“无水”运输技术

  鱼儿离不开水,这是一个常识。然而,山东一项科学技术的突破却实现了活鱼的无水运输,使更远距离的人们能够品尝到更加鲜活的水产品。   记者近日在位于济南东郊的一处水产品温控蓄养实验室了解到,通过采取冰温、气调等措施,可以使在山东蓬莱养殖的大菱鲆、昌邑的半滑舌鳎等水产品,在深睡眠、浅呼吸的生存状态下

黄海所多项成果获2021年度海洋科学技术奖

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/4/477889.shtm 4月19日,中国海洋学会公布了2021年度海洋科学技术奖及海洋优秀科技图书获奖项目。2021年度海洋科学技术奖获奖项目共43项,其中特等奖3项、一等奖14项、二等奖26项;海洋优

我国绘制完成世界首个鹅全基因组序列图谱

  6月3日,深圳华大基因研究院和浙江省农业科学院、象山县浙东白鹅研究所联合召开新闻发布会,宣布“鹅全基因组序列图谱绘制完成”。这是我国独立研究完成的全世界首个鹅全基因组序列图谱,这一研究成果对于揭示家鹅繁殖、抗逆、生长、肉质、羽色等性状的遗传基础,鹅的驯化、不同鹅种的生物学分类、中国家鹅

863计划“动物分子与细胞工程育种技术”课题完成验收

  我国作为养殖大国,长期重视动物遗传育种科技创新。在科技部门长期支持的基础上,“十二五”863计划现代农业技术领域专门设置了动物分子与细胞工程育种技术主题。截止2015年底,2011年和2012年分批启动的“海水养殖种子工程”重大项目下属14个课题,“动物分子与细胞工程育种技术研究”主题项目下属7

解析真骨鱼类基因组解析鱼类恒温起源之谜

  在脊椎动物的进化过程中,温度对生命体的生理活动具有重要的调节作用。陆地上的鸟类和哺乳类能够适应各种生境,其恒温能力功不可没。相比陆生环境,水生环境的生物获得恒温能力更为艰难,它们必须面对水体高比热,热量易丢失的挑战。然而,根据观测,至少有40种鱼类克服了这些困难,具备类似于哺乳动物和鸟类的恒温能

中国完成海带等7种海洋生物全基因组测序

  中国科学家10月30日在青岛首次披露了海带、栉孔扇贝和南美白对虾全基因组测序的部分成果,至此中国已完成7种大型海洋生物的全基因组测序,为改良这些海洋生物品质、提高产量奠定了科学基础。   中国的海洋生物基因组学研究虽然起步较晚,但现在一些研究成果已达到国际前沿水准。目前,人类完成全基因组测序的

基因组测序

如果楼主指的是人类基因组计划,那时用的方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的

解码“基因组学之父”桑格:测序,测序,测序

  “桑格当之无愧地被称为‘基因组学之父’,他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础,彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展。”、   有一天,65岁的英国生物化学家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的试验,转身走出实验室,宣布自己正式退休。那一年是1983

PNAS:甜瓜基因组测序

  甜瓜在世界范围具有很高的经济价值,日前西班牙的九个研究中心通力合作,利用罗氏454平台完成了甜瓜基因组的测序。除了甜瓜的全基因组,科学家还得到了 7个特定甜瓜品种的基因组,文章发表在Proceedings of the National Academy杂志上。   联合国粮农组织2009年

基因组测序仪简介

  基因组测序仪是一种用于生物学领域的分析仪器,于2012年12月19日启用。  技术指标  个体化基因组测序仪主机/ION TORRENT主机。  主要功能  样品处理、快速的运行时间以分析单个或多个样品 支持多重文库,从而实现最大的效率和经济性 可在必要时禁用个别测序通道,以节约试剂用量。

认识泛基因组测序

什么是泛基因组?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因组概念(pangenome,pan源自希腊语‘παν’,全部的意思),泛基因组即某一物种全部基因的总称。2009 年,Li等人首次采用新全基因组组装方法对多个人类个体基因组进行拼接,发现了个体独有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“

关于全基因组测序的测序指标介绍

  一、全基因组测序的测序指标— 深度  测序深度(Sequencing depth)是指测序得到的碱基总量(bp)与基因组大小的比值,它是评价测序量的指标之一。测序深度与基因组覆盖度之间是一个正相关的关系,测序带来的错误率或假阳性结果会随着测序深度的提升而下降。测序的个体,如果采用的是双末端或Ma

大菱鲆溶酶体整合膜蛋白2(LIMP2)的鉴定及功能初步...

免疫系统是由先天免疫系统和适应性免疫系统组成的保护机体免受外界病原体侵害的系统。硬骨鱼类生活在病原菌丰富的水环境中,广泛接触多种病原菌,先天免疫系统在硬骨鱼类中发挥着更为重要的作用。吞噬作用是先天性免疫应答的重要机制之一,它通过吞噬细胞吸收病原体,降解摄入的病原体,激活免疫应答。这一进展始于模式识别

大菱鲆溶酶体整合膜蛋白2(LIMP2)的鉴定初步分析

  免疫系统是由先天免疫系统和适应性免疫系统组成的保护机体免受外界病原体侵害的系统。硬骨鱼类生活在病原菌丰富的水环境中,广泛接触多种病原菌,先天免疫系统在硬骨鱼类中发挥着更为重要的作用。吞噬作用是先天性免疫应答的重要机制之一,它通过吞噬细胞吸收病原体,降解摄入的病原体,激活免疫应答。这一进展始于模式

高原鱼类进化与功能基因组学科组

  青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii),隶属于鲤科裂腹鱼亚科,是国家二级保护动物,仅分布于典型高原咸水湖泊—青海湖中,是维持青海湖“水-鸟-鱼”生态链稳定的核心物种。青海湖裸鲤是鲤科鱼类中唯一一种适应青海湖高盐碱水环境的自然群体,是研究高原鱼类适应进化的良好素材。青海湖裸鲤

454测序用于美洲奶牛种牛基因组测序项目

  一只名为Pawnee Farm Arlinda Chief的种牛和它的儿子Walkway Chief Mark大约有60000个后代,其后代是牛奶生产的主力。最近一项研究中1,科学家通过454全基因组测序,掌握了他们的基因组中控制重要性状的基因,包括抗病能力、牛奶产量,这些性状已通过北美的当

盘点最新基因组测序成果

  the scientist杂志发表文章盘点了几项最新的基因组测序成果以飨读者:  种属:非洲腔棘鱼(Latimeria chalumnae)  基因组:~2.86 billion bp  人们曾经认为腔棘鱼早在七千万年前就已灭绝,直到1938年一只腔棘鱼在南非海岸被渔民捕获。这种鱼看上去跟三亿年