基于质谱技术蛋白质定量方法的研究进展
朱金蕾1 张锴1*何锡文1 张玉奎1,2 1南开大学化学学院，天津市卫津路94号，300071 2中国科学院大连化学物理研究所，辽宁省大连市中山路457号，116023 摘要 质谱技术已经成为目前蛋白质鉴定的重要工具。定量分析细胞内蛋白质组的动态变化，是当前研究蛋白质功能、揭示细胞生物机理、寻找疾病蛋白标记物和药物靶标的迫切需要。本文综述了基于质谱技术蛋白质定量的策略、方法和应用等方面近年来的进展，评述了几种蛋白质质谱定量方法的特点和应用潜力。 关键词 质谱，蛋白质组学，定量，同位素标记 1 引 言 细胞内蛋白质组丰度的动态变化对各种生命过程有重要影响，当前蛋白质组的定量分析研究已经引起广泛关注，这为分析化学带来了新的挑战和机遇，基于质谱的蛋白质分析技术也从蛋白质组的鉴定发展到定量蛋白质组学(quantitative ......阅读全文
蛋白质组学研究系列仪器及软件
人体内真正发挥作用的是蛋白质，蛋白质扮演着构筑生命大厦的“砖块”角色，随着破译生命密码的人类基因组计划进入尾声，一个以蛋白质和药物基因学为研究重点的后基因组时代已经拉开序幕，蛋白质将是今后的重点研究方向之一。然而，蛋白质的分离和鉴定非常费时，目前测定蛋白质的技术远远落后于破译基因组的工具，最好的实验
Nature方法：发布蛋白质组检测新技术
在Fred Hutchinson癌症研究中心癌症蛋白质组学专家Amanda Paulovich博士领导下，一个国际科学家研究小组证实了大规模、标准化蛋白质检测的可行性，这是验证疾病生物标志物和药物靶点的必要条件。 这项在线发表在12月8日《自然方法》(Nature Methods)
简述蛋白质组的主要功能
蛋白质组学集中于动态描述基因调节，对基因表达的蛋白质水平进行定量的测定，鉴定疾病、药物对生命过程的影响，以及解释基因表达调控的机制. 作为一门科学，蛋白质组研究并非从零开始，它是已有20多年历史的蛋白质(多肽)谱和基因产物图谱技术的一种延伸. 多肽图谱依靠双向电泳(Two-dimensional
蛋白质组学技术分析方法及概括
1 蛋白质组学概述“蛋白质组”一词的英文是Proteome，它是proteins 和genome 两个词的组合，意思是proteins expressed by a genome，即为基因组表达的蛋白质[1]。蛋白质组的概念是1994 年由Wilkins首先提出，并首次在1995 年7月的“Elec
外泌体及其蛋白质组学研究
外泌体是什么？ 外泌体（Exosome），是一种能被大多数细胞分泌的微小膜泡，具有脂质双层膜结构，直径大约40-200 nm。外泌体存在于体液中，包括血液、唾液、尿液和母乳等，不同组织来源的外泌体在内容物组成和功能方面存在差异，这种差异受到细胞外基质和微环境的动态调控。越来越多的证据表明，宿主
Cell重要成果：绘制凋亡蛋白质组图谱
斯克里普斯研究所的科学家们同时绘制出了细胞中两种最重要的蛋白质修饰类型的图谱，揭示了在凋亡这一重要细胞过程中它们之间广泛的协同作用。相关论文发表在7月20日的《细胞》(Cell)杂志上。 磷酸化(Phosphorylation)和蛋白质水解(proteolysis)几乎总是被独立开展研究。
定量蛋白质组学的优势有哪些？
质谱方法比抗体方法更先进的一个原因，就是已经开发出了一种新的定向分析技术，比生产一个新的抗体要快得多，并大大减少了检测特异性方面的问题（抗体方法存在交叉反应的问题）。 虽然抗体方法在低丰度蛋白的检测方面更加灵敏，但是质谱技术的一个明显优势就是能在单个实验中检测多种蛋白，比如说，系统生物学研究人
蛋白质组数据的多元分析实验
仪器、耗材 扫描仪图像分析软件Excel 程序多元数据分析的软件实验步骤 用 Progenesis、Excel 和 The Unscrambler 对 2D 凝胶进行多元分析。3.1 确定研究方案后建立蛋白的 2D 凝胶在本章节中不再阐述，但要确定染色方法以便进行凝胶的定量分析（见注释 1 )。3
Science重要成果：蛋白质组绘图新技术
为了更清楚地了解细胞内正在发生的事件，科学家们需要知道数以千计蛋白质和其他分子的定位。麻省理工学院的化学家们现在开发了一项新技术，可以标记细胞某一特定区域中所有的蛋白质，从而更准确地绘制这些蛋白质的图像。 领导这一研究的是著名华裔女科学家、化学副教授Alice Ting，她曾
定量蛋白质组学的技术发展
以质谱为基础的定向蛋白质组学研究领域的发展历程并不短，早在上个世纪70年，三重四极杆质谱仪就已经出现，并在80年代首次在发表的文章中，证明可以被用来检测肽段。 过去几年间，更广泛的范围内定向质谱技术的应用迅速攀升，而且新方法，新工具，新资源和新一代方法，也令更多研究领域的科学家们能利用到这项技
ThermoFisher推出Proteome－Discoverer蛋白质组学软件
Thermo Fisher推出Proteome Discoverer：前沿蛋白质组学研究的突破性生物软件 质量信息学平台提供了强大的分析、开放和灵活架构，易于使用的界面 2008年5月30日，圣何塞，服务科学，世界领先的赛默飞世尔科技公司，今天宣布将在ASMS 2008（第56届美国质谱大会）上
探索蛋白质组学新境界——第一届AI蛋白质组学技术研讨会召开
2023年11月17日，上海易算生物科技有限公司与复旦大学生物医学研究院联合举办第一届AI蛋白质组学技术研讨会-暨易算生物第一代易肽蛋白质组学质谱前处理机器人发布研讨会。研讨会邀请了多位业内专家、学者，分享临床蛋白质组学大队列研究最新进展。易算生物同时为参会专家老师介绍第一代易肽蛋白质组学质谱前
直接RNA测序、串联质谱法揭示新冠转录组和蛋白质组特征
此前，南开大学高山、阮吉寿等在中国预印本ChinaXiv网站发表论文，称新冠病毒S蛋白可能存在Furin蛋白酶切位点。近日，发表在预印本网站bioRxiv上的一篇论文使用直接RNA测序和串联质谱法表明了SARS-CoV-2的转录组和蛋白质组的特征，揭示了细胞通道在去除了疑似Furin 蛋白酶切位点的
CASMS分论坛：相互作用组学和结构蛋白质组学前沿
分析测试百科网讯 美国东部时间2021年8月9日-13日，首届美国华人质谱学会（CASMS）学术研讨会暨展览会在Gather.Town隆重举行。8月11日的“Frontiers in Interactomics and Structural Proteomics” （相互作用组学和结构蛋白质组学
逐次修正基因组法：有效提高非模式生物蛋白质组鉴定...
逐次修正基因组法：有效提高非模式生物蛋白质组鉴定的新策略随着高通量测序技术的不断崛起，全基因组测序也逐步普及。越来越多的物种基因组予以公布。目前，主要有两种获得研究物种参考基因组的策略：de novo 基因组拼接和基于mapping算法的基因组序列修正，mapping是指将所有测序读段通过序列比对定
复旦杨芃原组等开发精准糖蛋白质组新分析方法
BioArt按：糖基化是最复杂的蛋白后修饰之一，具有多种重要的生物学功能。与其他蛋白后修饰相比，糖基化更为复杂，分析难度很大。目前已有的糖基化分析方法有明显的局限性：大部分方法仅能分析糖链或糖基化位点等不完整的糖基化信息，而基于糖肽的位点特异性分析方法则存在通量低，假阳性率高，数据质量难以评测等
【网络研讨会】蛋白质组学/脂质组学研究进展
自从精准医学概念提出以来，组学研究一直都是全球最热的研究领域，其技术在临床医学、生物医药和食品安全等领域都占据十分重要的作用。2016年初，中国发起了精准医学研究专项课题，目标在2017年至2019年构建重大疾病的预防诊断和治疗大数据平台，推动一批精准治疗药物和分子检测产品进入国家医保目录。同时
中科院Nature开源性刊物发表蛋白质研究新技术
来自中科院大连化学物理研究所的研究人员开发一种新型的同位素标记策略，可对6种不同的蛋白质样品进行可靠标记并进行同时定量。并证实这一策略适用于高通量检测蛋白质周转(turnover)动态。这一研究成果发表在国际著名刊物Nature旗下开源性刊物Scientific Reports上。 中
非同位素标记探针的酶法检测
实验材料 探针试剂、试剂盒 PBS链亲和素HRPODAB双氧水甘油二氨基联苯胺仪器、耗材 盖玻片水浴锅实验步骤 1. 以生物素酰化探针与载玻片上样品杂交并洗片（“荧光原位杂交实验”基本方案1~6步）。2. 由1×SSC中取出玻片，尽可能吸去残留玻片上的缓冲液，但不要使玻片干涸。加200 μl 封
颉伟组分析卵子向胚胎转换过程中转录组、翻译组、蛋白质组关系
生命起始于卵子和精子的结合，终末分化的配子在受精后重编程为具有全能性的胚胎。然而，卵子发育晚期至合子基因组激活之前，基因组一直处于转录沉默状态。在此阶段发生的诸如卵子减数分裂、母源RNA去除和合子基因组转录激活等重要生物学事件都高度依赖于转录后调控。颉伟实验室前期研究表明，人和小鼠卵母细胞向胚胎
第七届中国蛋白质组学大会暨第三届国际蛋白质组学论坛
第七届中国蛋白质组学大会暨第三届国际蛋白质组学论坛将于2011年4月14-18日在浙江杭州市第一世界大酒店召开。贝克曼库尔特公司将参加此次会议，介绍超高灵敏度的毛细管电泳质谱联用新技术。展位号A10。期待您的光临。 会议连接http://61.50.138.116/bprchy/cn/
顽拗性植物组织的蛋白质组学研究（苯酚法提取蛋白质）
实验材料植物组织试剂、试剂盒苯酚提取缓冲液沉淀液等电聚焦缓冲液仪器、耗材低温粉碎机实验步骤3.1 蛋白质提取( 1 ) 新鲜植物组织在液氮中冷冻，然后在自动低温粉碎机中预先冷却的钢杯中将材料研磨成细碎的粉末（见注释 4) 。( 2 ) 在一个 15 ml 的离心管（falcon tube) 中加入
顽拗性植物组织的蛋白质组学研究（苯酚法提取蛋白质）
1. 前言提取蛋白质是蛋白质组学研究的第一步。植物组织的蛋白质含量较低，并且存在多种非蛋白质成分，如细胞壁及贮藏多糖、脂质和酚类化合物，使蛋白质的提取难度增大 。植物蛋白质的可溶性与它们的细胞内定位关系密切，传统的蛋白质提取方法是用水合缓冲液、去垢剂或直接沉淀法 [1] 。除了普遍使用的 TCA
顽拗性植物组织的蛋白质组学研究（苯酚法提取蛋白质...
顽拗性植物组织的蛋白质组学研究（苯酚法提取蛋白质）实验实验材料 植物组织试剂、试剂盒 苯酚提取缓冲液沉淀液等电聚焦缓冲液仪器、耗材 低温粉碎机实验步骤 3.1 蛋白质提取( 1 ) 新鲜植物组织在液氮中冷冻，然后在自动低温粉碎机中预先冷却的钢杯中将材料研磨成细碎的粉末（见注释 4) 。( 2 ) 在
首张人类蛋白质组测序草图绘成
据物理学家组织网19日报道，在人类基因组图谱（人类生命的基因“蓝图”）发布20年后，国际人类蛋白质组组织宣布，他们绘制出了人类蛋白质组首张测序草图，有望帮助科学家更好地理解生命并治疗疾病。 研究发表于最新一期《自然·通讯》杂志。研究成员之一、加拿大英属哥伦比亚大学血液研究中心的克里斯托弗·奥威尔
合作：心血管蛋白质组学研究团体
赛默飞世尔科技(Thermo Fisher Scientific Inc)，世界领先的科学服务商，于2008年1月30日宣布与心血管蛋白质组学研究组织（Vascular Proteomics Group）达成合作，后者将配置强劲的Thermo Scientific LTQ Orbitrap XL™高
Science发布蛋白质组研究重大成果
学家们在新研究中揭示了人类巨细胞病毒(HCMV)令人惊讶的、复杂蛋白质编码能力，该发现是朝着了解感染过程中这一病毒操控人类细胞的机制所迈出的重要的第一步。20多年前研究人员首次对HCMV基因组进行了测序，现在他们又对这一常见病原体的蛋白质组(proteome，整套的表达蛋白)进行了研究。
创建精准N糖蛋白质组学分析方法
《pGlyco2.0：基于综合质控和一步质谱法的精准N糖蛋白质组学糖肽分析方法》（pGlyco 2.0 enables precision N-glycoproteomics with comprehensive quality control and one-step mass s
蛋白质组学牛人Science发表新文章
在每一次细胞分裂过程中，都有超过33亿的基因组DNA碱基对要被精确地复制及分离到子细胞中。而当DNA模板受到损害，复制机器停滞不前之时会发生什么呢？ 为了解答这一问题，来自马克斯普朗克生物化学研究所Matthias Mann研究小组的科学家，与哥本哈根大学和哈佛医学院等处的同事们，分析了在遭遇
华盈视角：蛋白质组学——质谱技术
蛋白质作为功能的直接执行者，在生物医学领域中有着重要意义，检测蛋白质表达、修饰、互作等有助于我们理解生命机体的各类机制和活动规律，为疾病的治疗、诊断，药物的开发、优化等提供有力的支持。质谱技术作为检测蛋白质组学的主流技术，有必要了解其核心原理，才能更好的服务于科学问题的解决。1.质谱的原理： 质谱是