基于质谱技术蛋白质定量方法的研究进展

朱金蕾1 张锴1*何锡文1 张玉奎1,2 1南开大学化学学院,天津市卫津路94号,300071 2中国科学院大连化学物理研究所,辽宁省大连市中山路457号,116023 摘要 质谱技术已经成为目前蛋白质鉴定的重要工具。定量分析细胞内蛋白质组的动态变化,是当前研究蛋白质功能、揭示细胞生物机理、寻找疾病蛋白标记物和药物靶标的迫切需要。本文综述了基于质谱技术蛋白质定量的策略、方法和应用等方面近年来的进展,评述了几种蛋白质质谱定量方法的特点和应用潜力。 关键词 质谱,蛋白质组学,定量,同位素标记 1 引 言 细胞内蛋白质组丰度的动态变化对各种生命过程有重要影响,当前蛋白质组的定量分析研究已经引起广泛关注,这为分析化学带来了新的挑战和机遇,基于质谱的蛋白质分析技术也从蛋白质组的鉴定发展到定量蛋白质组学(quantitative ......阅读全文

蛋白质组学研究的完整解决方案

人体内真正发挥作用的是蛋白质,蛋白质扮演着构筑生命大厦的“砖块”角色,随着破译生命密码的人类基因组计划进入尾声,一个以蛋白质和药物基因学为研究重点的后基因组时代已经拉开序幕,蛋白质将是今后的重点研究方向之一。然而,蛋白质的分离和鉴定非常费时,目前测定蛋白质的技术远远落后于破译基因组的工具,最好的实验

复旦大学发表蛋白质组学新技术

  复旦大学现代色谱分离分析实验室的研究人员设计出一种基于芯片的二维液相色谱系统,可在质谱分析之前去除血浆样品中的高丰度蛋白。这项成果于近日发表在《Analytical Chemistry》上。  对于血浆样品的质谱分析,一个重大挑战是高丰度蛋白往往占据了主要信号,而掩盖了人们感兴趣的低丰度蛋白的信

华盈视角:蛋白质组学——质谱技术

蛋白质作为功能的直接执行者,在生物医学领域中有着重要意义,检测蛋白质表达、修饰、互作等有助于我们理解生命机体的各类机制和活动规律,为疾病的治疗、诊断,药物的开发、优化等提供有力的支持。质谱技术作为检测蛋白质组学的主流技术,有必要了解其核心原理,才能更好的服务于科学问题的解决。1.质谱的原理: 质谱是

蛋白质组学揭示油菜卷叶机理(二)

     图4. 差异表达蛋白的COG注释分析                              图5. 差异表达蛋白的KEGG富集分析5. 为了进一步对这些差异蛋白的功能进行分类分析,作者进行了功能富集分析。通过对差异蛋白的富集分析结果发现,这些发生上调的蛋白能够改善Bndcl1株的光合性

实质等同性(蛋白质组学)实验(一)

实验材料 ESI-MSMALDI - MS试剂、试剂盒 提取缓冲液仪器、耗材 SDS- 聚丙烯酰胺凝胶电泳实验步骤 众所周知,在实验室内和实验室间难以保证双向聚丙烯酰胺凝胶电泳的重复性。在我们实验室,强制性地要求严格遵守标准操作程序(sop ) , 以确保不同的操作者可以获得可重复的分离结果。小

当蛋白质组遇上AI,加速的是什么

临床质谱局部图  西湖欧米供图使用压力循环技术处理微量组织样品。  西湖欧米供图西湖欧米愿景图  西湖欧米供图一个普通人做一次血液全蛋白质组的质谱检测,能获得哪些有意义或有趣的信息?谁会成为蛋白组领域的23andMe(DNA鉴定公司)?去年7月人类蛋白质组98.5%的蛋白质结构被AlphaFold破

蛋白质组学揭示油菜卷叶机理(一)

题目:Histological, Physiological, and Comparative Proteomic Analyses Provide Insights into Leaf Rolling in Brassica napus期刊:Journal of Proteome Research

中国将加速实施“人类蛋白质组计划”

贺福初院士:中国将加速实施“人类蛋白质组计划”  正在悉尼出席第9届国际蛋白质组学大会(HUPO)的中国科学院院士、中国人类蛋白质组组织(CNHUPO)主席贺福初9月21日在悉尼举行的新闻发布会上表示,中国将加速实施“人类蛋白质组计划”。  身为中国军事医学科

实质等同性(蛋白质组学)实验(二)

3.2 等电聚焦(IEF)各种长度(如 7 cm、13 cm、18 cm、24 cm ) 和不同 pH 范围的固定化 pH 梯度 ( IPG ) 胶条可供使用。IPG 胶条常在 20℃ 下(温度低于 20℃ 可导致尿素结晶)于适量水化液中水化过夜(16 h ) 。这可在溶胀托盘 ( re-s

张玉奎院士:蛋白质组学深度覆盖

  分析测试百科网讯 2016年9月23日-26日,由中国仪器仪表学会原子光谱专业委员会主办,武汉大学化学与分子科学学院承办的第四届全国原子光谱及相关技术学术会议在武汉大学召开。中科院大连化物所的张玉奎院士在闭幕当天的大会报告上作题为《蛋白质组学深度覆盖》的精彩报告。中科院大连化物所 张玉奎院士  

骨组织的蛋白质组学研究成果

    邹汉法近年来广泛开展了蛋白质组学和多肽组学新技术新方法的研究,近两年来相关研究成果已在Mol.  Cel.  Proteomics(IF  9.876),Angew.  Chem.  Int.  Ed.(IF  9.596),Nucleic  Acids  Research(IF  7.

李春波博士:差异蛋白质组学研究的利器

  2013年12月8日,第四十期质谱沙龙活动在北京朝阳医院顺利举办,来自北京师范大学、北京朝阳医院、中科院微生物所、空军总医院的百余名专家学者齐聚一堂共同参加了此次沙龙活动。AB SCIEX公司市场部 李春波

首个大豆全景定量蛋白质组图谱发布

近日,中国农业科学院生物技术研究所联合多家单位,绘制出大豆全景定量蛋白质组图谱,揭示了RNA甲基化在调控大豆蛋白表达量中的作用,并利用蛋白质组数据挖掘出调控大豆发育的新表观因子MTBa。相关研究成果发表在《细胞—基因组学》(Cell Genomics)上大豆基因组数据尽管可以提供大量信息,但不足以阐

Agilent在HUPO上推出复杂蛋白质组标准

安捷伦科技在第八届HUPO会议上推出新的复杂蛋白质组标准   9月28日,安捷伦科技公司在第八届HUPO会议上推出新的复杂蛋白质组标准,对于蛋白质生物标志物发现的研究者来说,这个标准可创造性地帮助他们通过基于质谱工作流的认证来进行蛋白质鉴定。这是对基于质谱的蛋白质组工作流进行资质测试的最先进的标准

张丽华:蛋白质组样品预处理方法

  2014年8月26日,第十三届全国青年分析测试学术报告会在陕西西安南洋大酒店隆重开幕。本届全国青年分析测试学术报告会由中国分析测试协会青年学术委员会举办,西安交通大学电子材料研究所承办,来自全国各地的分析测试学界代表近200人参加了此次报告会。来自中科院大连化学物理研究所的张丽华研究员

我国蛋白质组学研究取得系列成果

  由中国科学院院士贺福初领衔的北京蛋白质组研究中心/蛋白质组学国家重点实验室,在国际学术刊物《分子与细胞蛋白质组学》(Molecular & Cellular Proteomics,MCP)2009年第三期上,同时发表了《亨廷顿疾病患者脑脊液的脑特异性蛋白含量下调》等3篇研究论文。3篇论文在该刊同

BBC:人类首张蛋白质组草图绘制完成

  一个德国的团队和一个美国印度联合团队将他们的蛋白组图谱发表在了《自然》杂志上,他们的结果在公共网站上也可搜索到。Figure 1蛋白(绿色)由中间的RNA(粉色)分子翻译所得,RNA则由我们的基因复制所得  他们首次试图建立起关乎每一个人的蛋白质数据库。这些结果基于我们对基因组的了解-

磷酸化蛋白质组学研究获进展

中科院大连化物所生物技术部1809组封顺、叶明亮、邹汉法等人关于新型金属离子固定化亲和色谱固定相应用于磷酸化蛋白质组学的研究成果(Immobilized Zirconium Ion Affinity Chromatography for Specific Enrichment of Phosphop

定量蛋白质组表达谱分析技术iTRAQ/TMT

  iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技术是分别由美国AB Sciex公司和Thermo公司研发的多肽体外标记定量技术。这两种技术采用2-10种稳定同位素标签,通过特异性 标记多肽的

定量蛋白质组表达谱分析技术——iTRAQ/TMT

iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技术是分别由美国AB Sciex公司和Thermo公司研发的多肽体外标记定量技术。这两种技术采用2-10种稳定同位素标签,通过特异性 标

蛋白质组学哪些技术需要进行重复实验?

Label free需要进行三次重复,而iTRAQ、TMT一般建议客户做3次实验重复,如果实验方案后期设计了大量的验证实验如WB或ELISA等,最好做也能做两次重复;如果不进行重复实验后期的验证实验也少,在后期发表文章的时候结果可能会受到一些审稿人的质疑,从而影响文章的发表,特别是一些高分杂志较

质谱在蛋白质组学中的应用实验

实验材料 冷冻干燥样品试剂、试剂盒 校准标准品基质溶液甲醇仪器、耗材 MALDI 质谱仪MALDI 板实验步骤 1.吸取 0.5ul 的基质溶液,加到 MALDI-MS 分析所用的金属样品板上的样品孔中(为了准确起见,请使用2ul 的移液器)。2.在基质干燥之前,迅速加入 0.5ul 的标准品或样品

蛋白质组研究中的样品分离和分析

利用蛋白质的等电点和分子量通过双向凝胶电泳的方法将各种蛋白质区分开来是一种很有效的手段。它在蛋白质组分离技术中起到了关键作用。如何提高双向凝胶电泳的分离容量、灵敏度和分辨率以及对蛋白质差异表达的准确检测是双向凝胶电泳技术发展的关键问题。国外的主要趋势有第一维电泳采用窄pH梯度胶分离以及开发与双向凝胶

最新抗衰老靶点:控制蛋白质组代谢

  “蛋白质合成对细胞来说是一个极耗能的过程,当细胞投入宝贵资源生产蛋白时,其他重要功能很可能就会被忽视。我们的工作表明,正常和异常老化的一个驱动器会加速蛋白质周转(protein turnover),”文章通讯作者、Salk研究所首席科学官和副总裁Martin Hetzer说道。  注:Water

蛋白质组学实用分析技术一览

分析其实也属于技术的一部分,且在蛋白质组学研究中显得尤为重要,因为蛋白质组学研究提供的数据是生物学上最庞大的,而且蛋白质组比基因组具有更大的复杂性,因此蛋白质组信息学更有挑战性。今天小编先抛砖引玉地介绍几个常用的分析方法和软件。蛋白质定性分析蛋白质定性分析通常是指利用质谱法进行蛋白质鉴定和序列分析。

质谱在蛋白质组学中的应用实验

方案1 蛋白质和多肽 MALDI-MS 分析的一般方法 方案2 反相微型层析柱的制备实验 方案3 固定化酶微型层析柱的制备 方案4 用于蛋白质组分析的微毛细管 HPLC 色谱及 ESI —体化装置的制备和使用 方案5 利用 Nano-LC

定量定性蛋白质组学新工具亮相ASMS

赛默飞世尔科技在ASMS 2010展示定量定性蛋白质组学工具   美国犹他州盐湖城(2010年5月25日)– 全球服务科学领域的领导者赛默飞世尔科技,今日公布了其在蛋白质组学工具方面的重大进步,并表示这些进步将推动定量和定性蛋白质组学研究取得突破性的进展。这些新产品与赛默飞世尔科技其它的试剂和耗材

蛋白质组学几种定量方法的案例解读

   上期分享的蛋白组学内容,是不是有些小伙伴还绕在云里雾里呀?这次,小编用实例说话,帮您梳理清楚。   一、Label-free定量    Label-free定量,顾名思义就是不需要对比较样本做特定标记处理,只需要比较特定肽段/蛋白在不同样品间的色谱质谱响应信号便可得到样品间蛋白表达量的变化

Orbitrap在植物蛋白质组领域的应用

蛋白质组学技术已经成为植物科学研究中重要的工具,以Orbitrap为代表的高分辨质谱技术已在植物蛋白质研究领域产生重要的科研成果,发表在Nature Plant,Plant Cell 等核心期刊上。 利用Orbitrap质谱可针对植物样本描绘细胞和亚细胞蛋白定位,以及追踪蛋白之间的相互作用,鉴定不同