水稻ⅡB型拓扑异构酶OsSpo11基因的cDNA克隆、表达谱分析及其可变剪接的检测

Spo11基因是减数分裂双链断裂(DSBs) 与分裂重组的初始化基因, 在基因组进化方面具有重要作用。通过改进的Nest - PCR方法, 从水稻愈伤组织中克隆到了水稻DNA拓扑异构酶OsSpo11基因的cDNA片段。克隆测序与表达研究表明, OsSpo11基因是水稻ⅡB型拓扑异构酶A亚基基因, 在水稻不同组织中具有低丰度表达、组织特异性、可诱导性以及前体RNA剪接的可变性等特点。可变剪接异构体的发现, 使OsSpo11基因在DNA代谢、发育、遗传重组等过程中的生物学功能表现出一定的复杂性, 其功能和生物学意义有待进一步研究。点击这里进入下载页面:进入下载页面......阅读全文

DNA拓扑异构酶(DNA-topoisomerase)的相关介绍

  为催化DNA拓扑学异构体相互转变的酶之总称。催化DNA链断开和结合的偶联反应,为了分析体外反应机制,用环状DNA为底物。在闭环状双链DNA的拓扑学转变中,要暂时的将DNA的一个链或两个链切断,根据异构体化的方式而分为二个型。切断一个链而改变拓扑结构的称为Ⅰ型拓扑异构酶(top -oisomera

DNA拓扑异构酶的功能介绍

中文名DNA拓扑异构酶外文名DNA topoisomerase性    质生物类    别酶功    能实现DNA超螺旋的转型定义DNA拓扑异构酶为催化DNA拓扑学异构体相互转变的酶之总称。催化DNA链断开和结合的偶联反应,为了分析体外反应机制,用环状DNA为底物。

DNA拓扑异构酶的相关介绍

  DNA拓扑异构酶能催化的反应很多,这里只能作简单叙述。DNA拓扑异构酶I对单链DNA的亲和力要比双链高得多,这正是它识别负超螺旋DNA的分子基础,因为负超螺旋DNA常常会有一定程度的单链区。负超螺旋越高,DNA拓扑异构酶I作用越快。现已知道,生物体内负超螺旋稳定在5%左右,低了不行,高了也不行。

Ⅰ型DNA拓扑异构酶的功能介绍

中文名称Ⅰ型DNA拓扑异构酶英文名称DNA topoisomeraseⅠ定  义编号:EC 5.99.1.2。在双链结构中使其中一条链暂时断裂,断裂时不依赖于ATP,负责使超螺旋松弛的酶。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),酶(二级学科)

Ⅱ型DNA拓扑异构酶的功能介绍

中文名称Ⅱ型DNA拓扑异构酶英文名称DNA topoisomeraseⅡ定  义编号:EC 5.99.1.3。使双链结构的两条链均暂时断裂,断裂时依赖于ATP,是将松弛、闭环DNA转变为超螺旋形式的酶。包括DNA促旋酶。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),酶(二级学科)

DNA拓扑异构酶的基本信息

DNA拓扑异构酶为催化DNA拓扑学异构体相互转变的酶之总称。催化DNA链断开和结合的偶联反应,为了分析体外反应机制,用环状DNA为底物。

Ⅱ型DNA拓扑异构酶的基本信息

中文名称Ⅱ型DNA拓扑异构酶英文名称DNA topoisomeraseⅡ定  义编号:EC 5.99.1.3。使双链结构的两条链均暂时断裂,断裂时依赖于ATP,是将松弛、闭环DNA转变为超螺旋形式的酶。包括DNA促旋酶。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),酶(二级学科)

DNA拓扑异构酶的基本信息介绍

  在闭环状双链DNA的拓扑学转变中,要暂时的将DNA的一个链或两个链切断,根据异构体化的方式而分为二个型。切断一个链而改变拓扑结构的称为Ⅰ型拓扑异构酶(top -oisomeraseⅠ),通过切断二个链来进行的称为Ⅱ型拓扑异构酶(topoisomeraseⅡ)。属于Ⅰ型的拓扑异构酶,有大肠杆菌的ω

Ⅰ型DNA拓扑异构酶的基本信息

中文名称Ⅰ型DNA拓扑异构酶英文名称DNA topoisomeraseⅠ定  义编号:EC 5.99.1.2。在双链结构中使其中一条链暂时断裂,断裂时不依赖于ATP,负责使超螺旋松弛的酶。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),酶(二级学科)

DNA拓扑异构酶催化反应的相关介绍

  很多,其反应本质是先切断DNA的磷酸二脂键,改变DNA的链环数之后再连接之,兼具DNA内切酶和DNA连接酶的功能.然而它们并不能连接事先已经存在的断裂DNA,也就是说,其断裂反应与连接反应是相互耦联的。拓扑异构酶(包括Ⅰ型和II型)都可以用符号转化模型进行解释  除了DNA拓扑异构酶可以产生异构

可以DNA结合的酶拓扑异构酶和解旋酶

拓扑异构酶和解旋酶: 拓扑异构酶是具有活性核酸酶和连接酶的酶。这些酶能够改变DNA的拓扑特性。它们中的一些通过切割DNA螺旋并允许其旋转,降低其超螺旋程度,然后通过连接酶将两端连接。另一方面,其它拓扑异构酶能够在连接断裂的DNA链之前,切断螺旋,并允许第二个螺旋通过断裂部位。拓扑异构酶是许多涉及DN

解析DNA拓扑异构酶核心结构揭示DNA穿链新机制

生物物理所解析DNA拓扑异构酶核心结构揭示DNA穿链新机制成果入选Faculty of 1000 BiologyGyrase B’三维结构(左)及结构域运动(右)  近日,中科院生物物理研究所王大成课题组与毕利军课题组合作在Nucleic Acids Research杂志上发表的题为

抗癌药物对ⅡDNA拓扑异构酶作用的实验

实验方法原理DNA拓扑异构酶在DNA形成环状和超螺旋结构中起重要作用。另一方面在DNA超螺旋结构的松懈、DNA单、双链的断裂以至再连接的过程均有赖于该酶的参与,从而使DNA的复制或重组成为可能,关于抗癌药如烃化剂和非烃化剂,其中许多是以DNA拓扑异构酶为靶点使之形成可断裂的DNA蛋白复合物从而引起D

抗癌药物对ⅡDNA拓扑异构酶作用的实验

实验方法原理 DNA拓扑异构酶在DNA形成环状和超螺旋结构中起重要作用。另一方面在DNA超螺旋结构的松懈、DNA单、双链的断裂以至再连接的过程均有赖于该酶的参与,从而使DNA的复制或重组成为可能,关于抗癌药如烃化剂和非烃化剂,其中许多是以DNA拓扑异构酶为靶点使之形成可断裂的DNA蛋白复合物从而引起

种子DNA提取仪研究水稻

   过去,生物技术还不成熟,比如要想提取种子的DNA就比较难,得到的DNA不纯,含杂质较多。而现在随着种子DNA提取仪的应用就能很快完成实验。该仪器又叫中通量组织研磨仪,是实验室中常用的样品制备工具,通过它研磨得到的样品就能提取较高纯度的DNA。在很多种子检验中都会用到它。   随着水稻研究的深入

DNA螺旋与拓扑异构酶相互作用的新发现

  一个荷兰人领导的国际性研究组在分子水平上破解了自然释放DNA中积累起来的扭曲张力的机制。来自Delft理工大学、Ecole Normale Superieure和Sloan-Kettering研究所的研究人员将他们的发现公布在3月31日的《自然》杂志上,并成为这一期杂志的封面。  IB型拓扑异构

非洲猪瘟病毒DNA拓扑异构酶催化机制研究获新进展

中国科学院生物物理研究所饶子和院士研究组首次阐明非洲猪瘟病毒编码的全长II型DNA拓扑异构酶的基本机制,为减轻非洲猪瘟病毒的影响提供了潜在的干预策略。相关论文于5月30日发表在《自然-通讯》。非洲猪瘟是一种威胁全球养猪业的急性、烈性传染病,至今仍缺少安全有效的上市疫苗与药物。非洲猪瘟病毒是唯一一种编

非洲猪瘟病毒DNA拓扑异构酶催化机制研究获新进展

中国科学院生物物理研究所饶子和院士研究组首次阐明非洲猪瘟病毒编码的全长II型DNA拓扑异构酶的基本机制,为减轻非洲猪瘟病毒的影响提供了潜在的干预策略。相关论文于5月30日发表在《自然-通讯》。非洲猪瘟是一种威胁全球养猪业的急性、烈性传染病,至今仍缺少安全有效的上市疫苗与药物。非洲猪瘟病毒是唯一一种编

拓扑异构酶的用途

  DNA的结构转换和解析  Ⅱ型拓扑异构酶  Ⅱ型拓扑异构酶巧妙地执行了打开DNA双螺旋的过程。它将DNA的一个双螺旋结构切开,并让另一个螺旋从缺口处穿过,在此之后一个双螺旋便被打开。这里显示的图片是由两个蛋白构建的:这个编号为1bgw的蛋白具有拓扑异构酶的下半部分结构,另外一个编号为1eil的蛋

拓扑异构酶的分类

  可分为两类一类叫拓扑异构酶I,一类叫拓扑异构酶II。拓扑异构酶I催化DNA链的断裂和重新连接,每次只作用于一条链,即催化瞬时的单链的断裂和连接,它们不需要能量辅因子如ATP或NAD。E.coliDNA拓扑异构酶I又称ω蛋白,大白鼠肝DNA拓扑异构酶I又称切刻-封闭酶(nicking-closin

拓扑异构酶的简介

  DNA拓扑异构酶是存在于细胞核内的一类酶,他们能够催化DNA链的断裂和结合,从而控制DNA的拓扑状态,拓扑异构酶参与了超螺旋结构模板的调节。哺乳动物中主要存在两种拓扑异构酶。DNA拓扑异构酶I通过形成短暂的单链裂解-结合循环,催化DNA复制的拓扑异构状态的变化;相反,拓扑异构酶II通过引起瞬间双

研究揭示水稻基因组-“垃圾-DNA”-的真相

  对于动植物的 DNA 来说,仅有不到 5% 能够翻译成蛋白质,进行生命活动。而大部分 DNA 转录成 RNA 之后,便不再继续翻译,这些非编码 RNA 一度被认为是转录中的 “噪音”“暗物质”, 甚至有人认为这是 “垃圾 DNA”。  近十年来,随着探索未知的技术的进步,这些所谓 “垃圾 DNA

科学家编辑水稻DNA防御病原体

  外媒称,细菌性枯萎病袭击着东南亚和西非的稻田。这是一种被研究得非常透彻的作物疾病,它常常被用作研究微生物与其寄主植物间相互作用的一个模型系统。这种病原体被称为水稻黄单胞菌水稻致病变种,简称Xoo,它通过劫持一些外排糖的水稻基因来维持生存。研究人员已研究出如何编辑水稻的基因组以阻止这种劫持行为。 

植物叶片样品(水稻、黄瓜、苜蓿等)研磨提取-DNA

实验样品:新鲜植物叶片(水稻、黄瓜、苜蓿等)实验仪器:鼎昊源TL2010S中通量组织研磨仪TL2010S 中通量组织研磨仪,可编程,操作简单,适用各种样品,避免交叉污染,提高实验数据重复性。 配合独有的冷冻操作配件,方便组织核酸提取。 同样的研磨效果省时、省力将您从繁杂手工研磨中解脱出来,100 多

研究者首次发现“驯化”的水稻“外来DNA”

  转座子是一种可以改变自身基因组位置的DNA序列,其通过转座事件改变细胞遗传特性和基因组大小。转座子通常被认为是外来DNA,“寄生”于宿主基因组中,但它们也可以在基因组中被“驯化”,并进化出有益于宿主的新功能。迄今为止,大多数驯化转座子都在哺乳动物中发现,只有少数转座子驯化在植物中被报道。在农作物

水稻总DNA的快速少量抽提CTAB法

DNA分子是分子生物学研究的基本材料,依不同的实验目的可采取不同的抽提方法获取数量和质量不等的 DNA 。 实验目的:了解植物  DNA 抽提的主要方法,掌握 CTAB 法快速抽提水稻 DNA 。 实验材料及试剂: 水稻  叶片,1.5 × CTAB ,氯仿 / 异戊醇 (24:1) ,

研究揭示水稻基因组“垃圾DNA”的真相

  对于动植物的DNA来说,仅有不到5%能够翻译成蛋白质,进行生命活动。而大部分DNA转录成RNA之后,便不再继续翻译,这些非编码RNA一度被认为是转录中的“噪音”“暗物质”, 甚至有人认为这是“垃圾DNA”。  近十年来,随着探索未知的技术的进步,这些所谓“垃圾DNA”的重要性才开始为人们所了解。

拓扑异构酶的临床应用

  这些药物包括阿霉素(adriamycin)、放线霉素D(actinomycinD)、道诺梅素(daunomycin)、VP-16、VM-26(替尼泊苷teniposide或者表鬼臼毒素(epipodophyllotoxin)。相对来说,无论是临床,还是处在试验阶段的,作为哺乳动物异构酶II型毒素

简述拓扑异构酶的作用

  是使超级螺旋松弛。所谓超级螺旋是DNA中张力积聚的形式。拓扑异构酶抑制成分是重要抗肿瘤药物,被认为通过稳定拓扑异构酶与DNA之间所形成的一种共价复合物来发挥作用,后者又为DNA复制机制设置了一障碍。科学家对以拓扑异构酶为作用目标的药物的药效起源仍不是很了解。由于该药物的作用而造成的正向DNA超级

拓扑异构酶的用途介绍

  DNA的结构转换和解析  Ⅱ型拓扑异构酶巧妙地执行了打开DNA双螺旋的过程。它将DNA的一个双螺旋结构切开,并让另一个螺旋从缺口处穿过,在此之后一个双螺旋便被打开。由两个蛋白构建的:这个编号为1bgw的蛋白具有拓扑异构酶的下半部分结构,另外一个编号为1eil的蛋白来自于一个旋转酶的结构域,它与拓