植生生态所揭示链霉菌抗生素生物合成调控的新机制
6月7日,国际微生物学权威期刊Molecular Microbiology在线发表了中科院上海生命科学研究院植生生态所姜卫红研究组的学术论文Differential regulation of antibiotic biosynthesis by DraR-K, a novel two-component system in Streptomyces coelicolor。该研究揭示了天蓝色链霉菌中新型双组分系统DraR-K参与抗生素生物合成差异调控的分子机制。 双组分系统(Two-component system,TCS)是生物体感受外界刺激,调节细胞生理代谢和行为的信号传导系统,由组氨酸激酶和应答调控蛋白组成。TCS广泛存在于微生物中,参与调控初级与次级代谢、形态分化、渗透压以及致病性等重要生理过程。链霉菌是自然界中最主要的抗生素产生菌,对其开展抗生素合成相关TCS的研究不仅有助于认识其复杂的调控网络,......阅读全文
链霉菌亮氨酰tRNA合成酶识别两类亮氨酸tRNA的分子机理
国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心/生物化学与细胞生物学研究所王恩多研究组的最新研究成果:LeuRS can leucylate type I and type II tRNALeus in Streptomyce
链霉菌抗生物素蛋白过氧化物酶连结法
SP(streptavidin-perosidase)法,即链霉菌抗生物素蛋白-过氧化物酶连结法。按标记物质的种类,如荧光染料、放射性同位素、酶(主要有辣根过氧化物酶和碱性磷酸酶)、铁蛋白、胶体金等,可分为免疫荧光法、放射免疫法、酶标法和免疫金银法等。按染色步骤可分为直接法(又称一步法)和间接法(二
微生物所:链霉菌聚酮类药物产量提升的高效策略
链霉菌以能够产生丰富的次级代谢产物而著称,这些次级代谢产物是微生物药物的重要来源。然而,链霉菌在长期的进化中获得合成次级代谢产物的能力,只是为了更好地生存(如与其它微生物竞争营养物质等资源),并不是生来就是人们理想的“药物生产工厂”。因此,要实现链霉菌为我所用的目标,就必须深入解析影响这些代谢产
硫肽类抗生素的生物合成机制研究取得进展
近日,中国科学院上海有机化学研究所生命有机化学国家重点实验室研究员刘文课题组对c型硫肽Sch40832核心二氢咪唑并哌啶结构的生物合成机制进行阐释,相关成果发表在《美国化学会志》上。 硫肽类抗生素是由微生物产生的核糖体肽类天然产物,大多具备良好的抗革兰氏阳性菌活性,在针对细菌耐药性研究方面得到
我国学者在长链α烯烃生物合成研究取得新进展
近日,我所合成生物学与生物催化创新特区研究组周雍进研究员与瑞典查尔姆斯理工大学Jens Nielsen教授合作,通过构建酵母细胞反应器,高效的合成出了长链α-烯烃。相关研究成果发表于合成生物学领域杂志《美国化学会—合成生物学》(ACS Synthetic Biology, 2018, DOI:
微生物所在链霉菌启动子元件和内参基因研究中获进展
链霉菌是重要的抗生素产生菌,对链霉菌进行代谢工程和合成生物学改造需要大量不同强度的启动子元件。然而,前期链霉菌只有一个组成型启动子ermEp* 被广泛应用。中国科学院微生物研究所杨克迁课题组在2013年开发了活性明显高于ermEp* 的强启动子kasOp*(Appl. Environ. Micr
反转录合成单链-cDNA-实验
试剂、试剂盒 RNART主体混合液仪器、耗材 薄壁PCR管离心管热循环仪实验步骤 一、材料1.核酸和寡核苷酸来自方案2的RNA为每个单独的H-T11M引物,分别配制RT主体混合液蒸馏水 28.2ul5XRT缓冲液
反转录合成单链-cDNA-实验
试剂、试剂盒 RNA RT主体混合液 仪器、耗材 薄壁PCR管 离心管 热循环仪
反转录合成单链-cDNA-实验
cDNA 合成反应的体积,依赖于所用的锚定-任意引物组合的数目。下面提供的方案,适用于 24 个引物组合和两个样品。对于更多的样品和/或更多的引物组合,调整相应主体混合液的体积。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒RNART主体混合液仪器、耗材薄壁PCR管离心管
链霉菌(放线菌)超声破碎条件是什么
放线菌属于原核生物系统进化树上的(G+C)摩尔百分含量(mol%)高的革兰氏阳性菌分枝类群,它虽然具有原核生物特有的分子生物学特性,但在其不同类群中,细胞壁的化学组分变化很大。 在做大肠杆菌超声时,采用的是400W,破碎5s停5s的方法,效果不错,但是用在链霉菌上,由于细胞壁组成差异一般没什么效果。
上海有机所林可酰胺类抗生素生物合成研究获进展
继2015年在《自然》上报道了两个小分子硫醇参与的林可霉素生物合成机制后,近期,中国科学院上海有机化学研究所刘文团队通过进一步研究阐明了林可酰胺类抗生素的后期关键生物合成途径(J. Am. Chem. Soc., 2016,138, 6348-6351)。 林可酰胺类抗生素(lincosami
硫肽类抗生素的生物合成机制研究方面获得进展
黄素依赖的加氧酶(Flavin-dependent oxygenase)是一类以黄素腺嘌呤二核苷酸或黄素单核苷酸为辅酶的氧化还原酶,在生命过程的各个阶段参与各种与氧化还原相关的生化反应。近日,中国科学院上海有机化学研究所生命有机化学国家重点实验室研究员刘文课题组和金属有机国家重点实验室研究员郭寅
氨基糖苷的概述
氨基糖苷类抗生素(Aminoglycosides)是由 氨基糖与氨基环醇通过氧桥连接而成的苷类抗生素。有来自 链霉菌的 链霉素等、来自 小单孢菌的 庆大霉素等天然氨基糖苷类,还有 阿米卡星等半合成氨基糖苷类。 虽然大多数抑制微生物蛋白质合成的抗生素为抑菌药,但氨基糖苷类抗生素却可起到杀菌作用,
氨基糖苷类抗生素的介绍
氨基糖苷类抗生素(Aminoglycosides)是由氨基糖与氨基环醇通过氧桥连接而成的苷类抗生素。有来自链霉菌的链霉素等、来自小单孢菌的庆大霉素等天然氨基糖苷类,还有阿米卡星等半合成氨基糖苷类。 虽然大多数抑制微生物蛋白质合成的抗生素为抑菌药,但氨基糖苷类抗生素却可起到杀菌作用,属静止期杀菌
氨基糖苷的简介
氨基糖苷类抗生素(Aminoglycosides)是由 氨基糖与氨基环醇通过氧桥连接而成的苷类抗生素。有来自 链霉菌的 链霉素等、来自 小单孢菌的 庆大霉素等天然氨基糖苷类,还有 阿米卡星等半合成氨基糖苷类。 虽然大多数抑制微生物蛋白质合成的抗生素为抑菌药,但氨基糖苷类抗生素却可起到杀菌作用,
氨基糖苷类抗生素的介绍
氨基糖苷类抗生素(Aminoglycosides)是由氨基糖与氨基环醇通过氧桥连接而成的苷类抗生素。有来自链霉菌的链霉素等、来自小单孢菌的庆大霉素等天然氨基糖苷类,还有阿米卡星等半合成氨基糖苷类。 虽然大多数抑制微生物蛋白质合成的抗生素为抑菌药,但氨基糖苷类抗生素却可起到杀菌作用,属静止期杀菌
中科院大连化物所长链α烯烃生物合成研究取得新进展
近日,大连化物所合成生物学与生物催化创新研究团队周雍进研究员与瑞典查尔姆斯理工大学Jens Nielsen教授合作,通过构建酵母细胞反应器,高效的合成出了长链α-烯烃。相关研究成果发表于合成生物学领域杂志《美国化学会—合成生物学》上。 长链(C12―C20)α-烯烃(long-chain
新机理实现天然产物药物合成效率与产量双突破
链霉菌是生产天然产物药物的重要细胞工厂,超过2/3的抗生素来源于链霉菌。近日,中国农业科学院植物保护研究所微生物天然产物农药创新任务在《国际生物大分子杂志》(International Journal of Biological Macromolecules)上发表研究论文。该研究鉴定了一个保守的全
基于液滴微流控的链霉菌高通量筛选技术平台面世
链霉菌是重要的工业微生物,可以生产蛋白、小分子药物等高附加值产品。工业生产中,常用随机诱变手段产生大量的链霉菌突变库,但缺乏与之相适配的高通量筛选手段用以获得目标突变株。已报道的基于流式细胞分选的方法只能对链霉菌的原生质体或孢子进行筛选,由于抗生素等次级代谢产物多产生于菌丝发酵的平台期,因而原生
蓝色链霉菌中筛选出活性基因簇
荷兰格罗宁根大学的研究人员利用基因挖掘法从蓝色链霉菌中发现了一组活性基因簇,通过该基因簇可制造出无耐药性的新型抗生素,该研究有望为链霉菌的药用开发提供一条新思路。相关研究发表在最新一期《微生物学》杂志上。 链霉菌是生活在土壤中的一种常见细菌,其家族包含多种细菌。不同于其他细
新研究构建深海链霉菌来源的高效底盘细胞
近日,中国科学院南海海洋研究所研究员马俊英团队构建了南海深海来源的链霉菌高效异源表达底盘细胞。相关研究以底封面论文的形式发表于ACS Synthetic Biology。硕士研究生杨志杰(现为丹麦技术大学博士生)为该论文第一作者,马俊英研究员、鞠建华研究员为共同通讯作者。 链霉菌次级代谢产物在生
科学家解析链霉菌高产菌株高效绿色构建
华东理工大学生物工程学院生物反应器工程国家重点实验室张立新教授与中国科学院微生物研究所王为善研究员、中国农业科学院植物保护研究所向文胜研究员等合作,在链霉菌胞内三酰甘油(TAGs)降解机理研究中取得突破性进展。相关研究成果以长篇论文形式在线于《自然—生物技术》。 该论文国际审稿人评价:这是70
关于弗氏链霉菌的产品特性及特点介绍
1、本品是一种安全高效的微生物菌剂,制作工艺精湛,作用机理更加全面,纯度高,喷酒在作物叶片上,可在楂物根、茎、叶快速生长繁衍,分泌各种抗革兰氏阳性、阴性细菌作用的活性物质,能够排斥、阻断、抑制病菌的侵入。本品作用方式复杂,包括化学作用、抗生作用和寄生作用; 2、本品分泌多种植物必须生长酶,是普
放线菌的代表属链霉菌属的介绍
链霉菌属(Streptomyces)共约1000多种,其中包括和很多不同的种别和变种。它们具有发育良好的菌丝体,菌丝体分枝,无隔膜,直径约0.4~1微米,长短不一,多核。菌丝体有营养菌丝、气生菌丝和孢子丝之分,孢子丝再形成分生孢子。孢子丝和孢子的形态因种而异,这是链霉菌属分种的主要识别性状之一。
体外转录合成单链RNA探针
实验方法原理 制备特异性的单链 RNA 探针不仅比 DNA 探针更容易,在杂交反应中一般也比具相同比活性的 DNA 探针产生更强的信号,这可能是由于含有 RNA 的杂合链固有的更高稳定性的缘故(Casey and Davidson 197
RLMRACE法合成双链cDNA
实验概要掌握合成双链cDNA的RLM-RACE技术,可构建高质量的cDNA文库。主要试剂1. 酶类及分子量标准 1) 高保真酶Easy-A high fidelity cloning enzyme,Merck公司Stratagene系列; 2) Taq DNA Polymerase,上海申
双链DNA探针随机引物合成法
随机引物合成双链探针是使寡核苷酸引物与DNA模板结合,在Klenow酶的作用下,合成DNA探针。合成产物的大小、产量、比活性依赖于反应中模板、引物、dNTP和酶的量。通常,产物平均长度为400-600个核苷酸。利用随机引物进行反应的优点是:(1)Klenow片段没有5'→3'外切
体外转录合成单链RNA探针
实验方法原理 制备特异性的单链 RNA 探针不仅比 DNA 探针更容易,在杂交反应中一般也比具相同比活性的 DNA 探针产生更强的信号,这可能是由于含有 RNA 的杂合链固有的更高稳定性的缘故(Casey and Davidson 1977)。虽然 DNA 探针仍普遍地应用于 Norther
关于cDNA第一链的合成介绍
所有合成cDNA第一条链的方法都要用依赖于RNA的DNA聚合酶(反转录酶)来催化反应,主要有两个关键因素,一个是mRNA模板,另一个是反转录酶 [3] 。商品化反转录酶有从禽类成髓细胞瘤病毒纯化到的禽类成髓细胞病毒(AMV)逆转录酶和从表达克隆化的Moloney鼠白血病病毒反转录酶基因的大肠杆菌
cDNA第一链的合成的方法
所有合成cDNA第一条链的方法都要用依赖于RNA的DNA聚合酶(反转录酶)来催化反应,主要有两个关键因素,一个是mRNA模板,另一个是反转录酶 。商品化反转录酶有从禽类成髓细胞瘤病毒纯化到的禽类成髓细胞病毒(AMV)逆转录酶和从表达克隆化的Moloney鼠白血病病毒反转录酶基因的大肠杆菌中分离到的鼠