6月21日《自然》杂志精选
肿瘤对芳香酶抑制剂的反应 Elaine Mardis及其同事利用全基因组测序方法来了解来自用“芳香酶抑制剂新辅助疗法”治疗过的“雌激素受体阳性”（ER+）乳腺癌患者的组织样本的突变情况。他们识别出几个与疾病相关的突变，这些突变与肿瘤细胞组织学、增殖速度和对治疗的反应有特定关联性。这样的信息有可能被用来确定哪些患者会受益于芳香酶抑制剂疗法。药物不良反应的预测 药物的不良反应会限制本来有效的药物的临床使用，也是新药在临床试验中失败的最大原因。药物经常与一个以上的蛋白目标发生相互作用，数百种这样的蛋白已被与临床上所用治疗方法的副作用联系了起来。这项大规模计算研究预测了656种药物对已被与药物不良反应联系起来的73种蛋白目标的活性。在所测试的1042个预测结果中，大约一半被证实。其中一个预测是，肚子疼（合成雌激素“氯烯雌醚”的一个已知的副作用）是通过对COX-1的抑制介导的，这种抑制的临床相关性在“全人血小......阅读全文
1000多个案例记载，为何有些癌症会自然消失？
很难相信一些癌症会奇迹般地自动消失，但这种情况确实发生了，而且根据文献记载，已有1000个肿瘤自然消退的案例。那么，为什么会发生这种情况？能否用它来造福癌症患者？ 最早记录癌症自然消退的文献出现在13世纪末，一位骨肉瘤患者在严重的细菌感染后肿瘤自发消失。在19世纪后期，美国纽约市外科医生威廉•
《自然》：2种疟疾寄生虫基因组序列测定
疟疾裂殖子 一个由美英等国科学家组成的国际研究小组近日测定了两种致命疟疾寄生虫的基因组序列。这两种疟疾寄生虫分别名为Plasmodium knowlesi和Plasmodium vivax，其中P. knowlesi最近被认为是感染人类的一个主要疟疾病原体，而P. vivax则会致人极度虚弱，
“基因组编辑核酸酶”当选《自然》年度研究方法
《自然—方法学》视频介绍“基因组编辑核酸酶” 《自然》杂志子刊《自然—方法学》在最新一期推出了2011年度研究方法专刊，评选出了本年度研究方法——基因组编辑核酸酶（Gene-editing nucleases）。专刊包括社论、新闻特写、评论、视频等内容；同时，还评出其他8个值得关注的研
草莓基因组研究取得成果－|《自然遗传学》
《自然-遗传学》本周在线发表的一篇论文Origin and evolution of the octoploid strawberry genome报告了一个几近完整的草莓参照基因组。该基因组为了解这一广受欢迎的水果的起源和演化历史提供了新见解。八倍体草莓的演化史。Edger et al. 八
－Nature：基因组复制或为解析癌症进化提供线索
有机体细胞中的基因组拷贝数越多，细胞或越易于从生长和适应中获益。近日，一篇刊登于国际杂志Nature上的研究论文中，来自克瑞顿大学（Creighton University）的研究人员通过对酵母菌的研究发现，多倍体或许可以极大地帮助细胞去适应周围的环境，多倍体即有机体细胞中的基因组拷贝数超过2倍
梁晗：从癌症基因组中寻找性别差异
如果有一种软件能告诉你今后患上癌症的可能性是多少，而其中判断的因素之一就是你的性别是男还是女，你会相信吗？可能大部分人都会摇头：怎么可能性别影响如此之大。但越来越多的研究表明，性别在癌症中起着不可忽视的作用。 来自美国德州大学MD安德森癌症中心的一项研究通过调查13种癌症类型，在分子水平上认识
关于癌症全基因组－我们有了全新的认识
今日，最新一期《自然》杂志如约上线，而登上封面的“癌症全基因组”则是本期的主题：在本期《自然》杂志上，一共发表了6篇相关的论文。而在Nature Genetics、Nature Biotechnology、以及Nature Communications等子刊上，也有系列论文发表。 那么，是什么
全基因组测序是癌症诊断的强有力工具
一位没有明显癌症家族史的妇女却罹患了早发性乳腺癌和卵巢癌，以及与治疗有关的急性髓细胞样白血病。研究人员对这名妇女进行了全基因组测序，所用的是从该患者的皮肤和骨髓中获取的DNA。在许多被怀疑患癌症可能性增加了的病人中，常规性的候选基因测试（如BRCA1 和 BRCA2突变检测）无法显示出有用的
Science：应为广泛的癌症基因组测试提供医保覆盖
美国前国家癌症研究所主任Harold Varmus和密歇根大学法学院教授Rebecca Eisenberg在Science期刊上发表一篇政策论坛论文，主张让癌症患者更好地使用基因组测试。他们建议政府和私人支付者（保险公司）更好地利用数据库和登记处来确定基因组测试是否能够用于癌症患者的个人化治疗。
梁晗：从癌症基因组中寻找性别差异
如果有一种软件能告诉你今后患上癌症的可能性是多少，而其中判断的因素之一就是你的性别是男还是女，你会相信吗？可能大部分人都会摇头：怎么可能性别影响如此之大。但越来越多的研究表明，性别在癌症中起着不可忽视的作用。 来自美国德州大学MD安德森癌症中心的一项研究通过调查13种癌症类型，在分子水平上认
Nature里程碑成果：解析21种癌症基因组
针对21种癌症类型开展大规模分析，一项里程碑式的研究揭示癌症突变的世界远比以前认为的要大得多。通过分析数以千计的患者肿瘤基因组，由Broad研究所领导的一个研究小组发现了许多的新癌症基因，将与这些癌症相关联的已知基因目录扩增了25%。此外，这项研究表明还有许多重要的癌基因有待发现。这项研究工作为
震惊！全基因组测序还能这样用在癌症治疗上？
近年来，随着全基因组测序所需时间和成本的降低，个体化治疗将造福更多的癌症患者。近日发表于《Nature Medicine》的一项研究表明，开发新的机器学习算法对肿瘤全基因组序列信息进行分析，有助于预测患者的预后，帮助患者选择最佳的治疗方案。 全基因组测序（Whole-genome seque
Nature发布大规模癌症表观基因组研究成果
科学家们鉴别出了有可能生成第4亚型髓母细胞瘤的细胞。新研究发现为这种最常见的脑肿瘤亚型开发出更有效的靶向疗法清除了一个障碍。他们的研究结果发布在1月27日的《自然》（Nature）杂志上。 圣犹大儿童研究医院发育神经生物学系的Paul Northcott，德国癌症研究中心(DKFZ)的Stef
梁晗：从癌症基因组中寻找性别差异
如果有一种软件能告诉你今后患上癌症的可能性是多少，而其中判断的因素之一就是你的性别是男还是女，你会相信吗？可能大部分人都会摇头：怎么可能性别影响如此之大。但越来越多的研究表明，性别在癌症中起着不可忽视的作用。 来自美国德州大学MD安德森癌症中心的一项研究通过调查13种癌症类型，在分子水平上认识
《科学》：基因组大规模筛选新技术助力癌症研究
3000种基因经初次筛选后，大约24个符合要求 多年来生物学家一直在搜寻癌细胞的弱点，以期找到对付癌症的线索。美国科学家近日研究出了一种基因组大规模筛选技术，有望提供一种强大的经济有效的方法以挑选出对付癌症的新药靶。相关论文发表在2月1日的《科学》（Science）上。 2005年，美国国立卫
美印药物基因组学与癌症基因组学检测商业化
美国Companiondx实验室拟与健康信息技术服务商Enable Healthcare合作，向医生推广药物基因组学检测；印度癌症医学公司HCG宣布建立一个新的肿瘤基因中心，旨在下代测序技术能够帮助定位肿瘤，从而提高化疗和放疗的效率和响应率 美国药物基因组学检测商业化 Companiondx实验
自然通讯：有可能减缓癌症扩散的新发现
最近，通过对一个“小分子”库（50,000多个小分子）进行搜索，研究人员已经确定了一种候选分子可抑制癌细胞在全身的扩散。相关研究结果发表在2014年11月12日的《自然通讯》（Nature Communications）杂志，这种分子可靶定一种以前被认为“无成药性的（undruggable）”（
《自然》子刊综述：“癌症之王”难对付－免疫疗法怎么突破
胰腺导管腺癌（pancreatic ductal adenocarcinoma，PDA）是所有实体瘤中，致死率最高的癌症类型之一，这也让它得到了“癌症之王”的称号。目前原发性胰腺癌患者的5年生存率只有7.5%，与上世纪50年代的1%相比，只提高了6.5%。落后于绝大多数其它癌症类型生存率的改善幅
《自然—生物技术》：美教授“自绘”个人基因组图谱
斯蒂芬·夸克(Stephen Quake) 一台机器、3个人、5万美元，美国斯坦福大学教授斯蒂芬·夸克(Stephen Quake)最近用“自绘”个人基因组图谱的经历说明，这项“游戏”已不再是谁也玩不起的了。 斯坦福大学8月10日发表声明说，夸克在两名同事的帮助下，利用一台冰箱大
《自然—方法学》发表媲美基因组测序速度的组装算法。
10年前，Illumina基因组测序技术进入市场时，前所未有的庞大数据量淘汰了较早开发的测序分析工具。 历史总是重演。如今，第三代测序技术已经达到低成本群体测序规模的临界点。 12月10日，《自然—方法学》在线发表了第一个能够跟上基因组测序产生速度的组装算法。 论文作者、中国农业科学院农业
《自然》：中美科学家联合绘出番木瓜基因组草图
记者从南开大学了解到，中美科学家在世界上首次绘制完成一株转基因经济作物的全基因组图谱。这篇名为《转基因热带水果植物——番木瓜的基因组草图》的成果发表在4月24日出版的国际权威科学杂志《自然》上。 这项转基因经济作物的全基因组图谱研究成果，对农作物育种、农业生产和人类对转基因植物的认识具有极其重要的意
首个山羊基因组图谱在《自然•生物技术》杂志发表
2012年12月24日，由中国科学院昆明动物研究所、深圳华大基因研究院等单位合作完成的首个山羊全基因组图谱在《自然•生物技术》(Nature Biotechnology)杂志在线发表。本研究采用新一代测序技术(NGS)与全基因组酶切图谱(Whole-genome mapping)技术相结
Nature：基因组错误折叠或提供新的癌症研究思路
近日，发表在Nature杂志上的一篇研究论文中，来自麻省总医院和博德研究所的科学家揭示了隐藏在癌症背后的一种新型生物学机制，文章中，通过对携带异柠檬酸脱氢酶基因（IDH）突变的脑瘤进行研究，研究者揭开了指导基因组自身折叠指令的罕见改变，这些指令改变可以靶向作用基因组的关键部分—绝缘子，绝缘子可以
Nature：基因组研究让两类癌症合而为一
根据癌症基因组图谱(TCGA)计划一项针对结肠与直肠癌组织样本的大型研究，尽管解剖位置不同分别起源于结肠或直肠，结肠和直肠组织的基因组改变模式是相同的，这使得研究人员得出结论可将这两种癌症类型合而为一。 在多种类型的基因组分析中，结肠癌与直肠癌的结果几乎是难以区分的。最初，TCGA研究网络
美大规模评估癌症病人临床和基因组数据
英国《自然·遗传学》杂志1月15日在线发表的一项大型研究称，美国癌症中心展开了大规模癌症晚期患者临床数据和基因组数据评估，结果显示癌细胞的突变水平与患者接受检查点抑制剂治疗后的存活率相关。该研究意味着这一现象普遍存在于众多类型的癌症中，或有助于预测哪些患者将对这种免疫疗法应答良好。 人们一直致
基因组学大牛Science发布癌症重大成果
Whitehead研究所的科学家们发现，称作为“隔绝邻域”的环状染色质结构遭到破坏可以激活能够推动侵袭性肿瘤生长的癌基因。这一研究发现对于癌症诊断及治疗均具有重大的意义。相关论文发布在《科学》(science)杂志上。 领导这一研究的是Whitehead生物医学研究所的Richard A Yo
EBioMedicine：全基因组测序高效识别癌症相关基因突变
UT西南医学中心癌症研究人员已经证明，全基因组测序可用于识别癌症的遗传性风险，其可以潜在地改善癌症的预防，诊断和治疗。 这是首次研究使用了全基因组测序以评估一系列258癌症患者的基因组，诊断其癌症倾向性突变情况。这项研究发表在杂志EBioMedicine上。全基因组测序是新的基因工具，能够确定
NIH－340万美元资助癌症基因组图谱研究计划
美国国立卫生研究院于当地时间7月2日宣布，决定对八个单位（或个人）进行为期两年、总值340万美元的资助，以支持癌症基因组图谱研究计划（Cancer Genome Atlas pilot program）。 癌症基因组图谱计划是美国国立癌症研究所和美国国家人类基因组研究的合作项目，于2005年晚期，
癌症免疫疗法“新星”冉冉升起－工程自然杀伤细胞初显威力
被称为“抗癌斗士”的CAR T细胞近年来证明了自己的威力。3种使用T细胞治疗淋巴瘤或白血病的疗法已获得美国食品药品监督管理局（FDA）的批准。而且，目前已有数百项试验将其用于治疗其他恶性肿瘤，包括实体肿瘤。但这些细胞可能很快就会有同伴了。研究人员已经为其他免疫“卫士”——自然杀伤细胞和巨噬细胞—
三篇《自然》！为提高癌症免疫疗法效果提供了新角度
顶尖学术期刊《自然》上周同时上线三篇论文，为提高癌症免疫疗法效果提供了新角度。 来自法国国家健康与医学研究院（INSERM）、美国德克萨斯大学安德森癌症中心（MD Anderson Cancer Center）、瑞典隆德大学（Lund University）的三项独立研究，让免疫系统中的一个关