Cell同期发表中国学者两项重要结构生物学成果
中国科学院生物物理研究所和清华大学的两支研究组分别在Cell上发表重要成果,报道了高致病性嗜肺军团菌(Legionella pneumophila)的新型泛素化酶SidE与ubiquitin和配体的多个复合物的高分辨率晶体结构,以及人源核酸内切酶Dicer蛋白的全长高分辨率结构。 第一篇文章中,研究人员过大量的尝试,成功获得了SidE在其两步催化反应中,与ubiquitin及其配体的高分辨率晶体结构。SidE的apo结构表明,mART结构域和PDE结构域的催化口袋互相远离并朝向不同的方向,提示这两个结构域的催化过程是相互独立的;同时这两个结构域又通过一段保守的基序紧密结合,当丧失这种相互作用时,两个结构域的活性都受到了影响。mART结构域与ubiquitin及辅因子NAD的复合物结构显示,mART结构域利用其表面的一个高度保守区域参与结合ubiquitin,而这个互作界面非常靠近mART的催化中心;ubiquitin的C末......阅读全文
Dicer-Pathway
The degradation of endogenous mRNA in a sequence-specific manner can be induced by dsRNA [RNA interfernce (RNAi)], antisense transcription, or viral i
什么是Dicer(DCR)?
Dicer(DCR):是RNAase Ⅲ家族中的一员,主要切割dsRNA或者茎环结构的RNA前体成为小RNAs分子。对应地,我们将这种小RNAs分子命名为siRNAs和miRNA。Dicer有着较多的结构域,最先在果蝇中发现,并且在不同的生物体上表现出很高的保守性
关于Dicer酶的简介
在研究RNA干扰机制的过程中,Bernstein等从已经发生RNA干扰的果蝇S2细胞中纯化了一种核酸酶Dicer,从中分离出21~23个碱基对的dsRNA片段。说明该核酸酶具有序列特异性,它能降解与dsRNA具有同源序列的mRNA。研究表明Dicer是来自果蝇RNA干扰必须的RNaseIII型蛋
关于Dicer酶的基本介绍
该酶是一种核糖核酸内切酶,属于RNase III家族中特异识别双链RNA的一员,它能以一种ATP依赖的方式逐步切割由外源导入或者由转基因,病毒感染等各种方式引入的双链RNA,切割将RNA降解为21-23bp的双链RNAs(dsRNAs),每个片段的3’端都有2个碱基突出。
RNA干扰相关知识Dicer(DCR)
Dicer(DCR):是RNAase Ⅲ家族中的一员,主要切割dsRNA或者茎环结构的RNA前体成为小RNAs分子。对应地,我们将这种小RNAs分子命名为siRNAs和miRNA。Dicer有着较多的结构域,最先在果蝇中发现,并且在不同的生物体上表现出很高的保守性。
简述Dicer酶的作用机制
Dicer的作用机制Bernstein认为分二步: 第一步:Dicer结合到dsRNA,dsRNA被加工成许多短片段,每个片段约22nt。 第二步:22nt的siRNA通过PAZ与含有PAZ的Argonaute蛋白结合,而RNase与后者形成多个亚单元的复合物,这样使得22ntsiRNA特异
Dicer酶结构及作用原理
1、Dicer酶在RNA干扰研究中会用到Dicer酶,Dicer酶是RNaseIII型家族中的蛋白酶,可特异识别dsRNA,它可以切割以各种方式进入到细胞内的dsRNA,将其切割成19-21bp大小的短RNAs。Dicer是来自果蝇RNA干扰必须的RNaseIII型蛋白。Dicer酶是RNase I
Cell同期发表中国学者两项重要结构生物学成果
中国科学院生物物理研究所和清华大学的两支研究组分别在Cell上发表重要成果,报道了高致病性嗜肺军团菌(Legionella pneumophila)的新型泛素化酶SidE与ubiquitin和配体的多个复合物的高分辨率晶体结构,以及人源核酸内切酶Dicer蛋白的全长高分辨率结构。 第一篇文章中
DICER1基因的定义和作用
该基因编码一种蛋白质,其氨基端含有一个dexh盒,羧基端含有一个RNA基序。编码蛋白作为一种核糖核酸酶发挥作用,由RNA干扰和小时态RNA(strna)途径产生抑制基因表达的活性小RNA成分。选择性剪接导致多个转录变体。
Dicer(DCR)蛋白的概念和应用特点
Dicer(DCR):是RNAase Ⅲ家族中的一员,主要切割dsRNA或者茎环结构的RNA前体成为小RNAs分子。对应地,我们将这种小RNAs分子命名为siRNAs和miRNA。Dicer有着较多的结构域,最先在果蝇中发现,并且在不同的生物体上表现出很高的保守性。
中美联合揭示SidE同ubiquitin及其配体互作方式和催化机制
2018年5月3日,Cell杂志在线发表了高璞课题组与纽约大学合作的研究论文“Structural Insights into Non-canonical Ubiquitination Catalyzed by SidE”。该工作解析了来源于高致病性嗜肺军团菌(Legionella pneumo
DICER1基因编码功能及结构描述
该基因编码一种蛋白质,其氨基端含有一个dexh盒,羧基端含有一个RNA基序。编码蛋白作为一种核糖核酸酶发挥作用,由RNA干扰和小时态RNA(strna)途径产生抑制基因表达的活性小RNA成分。选择性剪接导致多个转录变体。This gene encodes a protein possessing a
与DNA白修饰相关因子介绍DICER1
该基因编码一种蛋白质,其氨基端含有一个dexh盒,羧基端含有一个RNA基序。编码蛋白作为一种核糖核酸酶发挥作用,由RNA干扰和小时态RNA(strna)途径产生抑制基因表达的活性小RNA成分。选择性剪接导致多个转录变体。This gene encodes a protein possessing a
DICER1基因突变与药物因子介绍
该基因编码一种蛋白质,其氨基端含有一个dexh盒,羧基端含有一个RNA基序。编码蛋白作为一种核糖核酸酶发挥作用,由RNA干扰和小时态RNA(strna)途径产生抑制基因表达的活性小RNA成分。选择性剪接导致多个转录变体。This gene encodes a protein possessing a
与肺癌相关的DICER1基因编码功能描述
该基因编码一种蛋白质,其氨基端含有一个dexh盒,羧基端含有一个RNA基序。编码蛋白作为一种核糖核酸酶发挥作用,由RNA干扰和小时态RNA(strna)途径产生抑制基因表达的活性小RNA成分。选择性剪接导致多个转录变体。This gene encodes a protein possessing a
DICER1与癌症相关的基因编码功能描述
该基因编码一种蛋白质,其氨基端含有一个dexh盒,羧基端含有一个RNA基序。编码蛋白作为一种核糖核酸酶发挥作用,由RNA干扰和小时态RNA(strna)途径产生抑制基因表达的活性小RNA成分。选择性剪接导致多个转录变体。This gene encodes a protein possessing a
Science:从结构上揭示Dicer屠杀病毒新机制
当病毒感染人体细胞时,这些细胞就面临一个难题:它们如何能够在不伤害自己的情况下摧毁病毒?在一项新的研究中,来自美国犹他大学的研究人员通过可视化观察到将病毒的遗传物质切割成碎片的一种微小的细胞机器而找到了答案。他们的研究展示了这种细胞机器如何检测这些入侵的病毒,并对它们进行加工以便让它们遭受破坏,
肺癌相关的DICER1基因突变类型及临床解释
该基因编码一种蛋白质,其氨基端含有一个dexh盒,羧基端含有一个RNA基序。编码蛋白作为一种核糖核酸酶发挥作用,由RNA干扰和小时态RNA(strna)途径产生抑制基因表达的活性小RNA成分。选择性剪接导致多个转录变体。
DNA修饰DICER1类型的基因信号通路介绍
该基因编码一种蛋白质,其氨基端含有一个dexh盒,羧基端含有一个RNA基序。编码蛋白作为一种核糖核酸酶发挥作用,由RNA干扰和小时态RNA(strna)途径产生抑制基因表达的活性小RNA成分。选择性剪接导致多个转录变体。
果蝇Dicer2结合双链RNA加工生成siRNA的分子机制
RNA干扰(RNAi)是许多真核生物中一种保守的RNA沉默机制, 小干扰RNA是RNA干扰的关键组成部分。在小RNA的加工过程中,Dicer家族蛋白起到了重要的作用,它们发挥作用的过程中常需要双链结合蛋白(dsRBP)作为辅因子来帮助它们发挥功能。在果蝇中,siRNA的产生是由ATP依赖型的Dice
Cell|重大进展,清华北大联合中心王宏伟首次揭示人类Dicer
Cell|重大进展,清华-北大联合中心王宏伟首次揭示人类Dicer及其与Pre-miRNA底物复合物的冷冻电镜结构 iNature:2018年4月26日,清华北大联合生命科学研究中心王宏伟课题组等人在Cell 上在线发表了题为“Cryo-EM Structure of Human Dicer a
揭示哺乳动物干细胞利用抗病毒Dicer抵御多种RNA病毒入侵
在一项新的研究中,来自英国弗朗西斯-克里克研究所的研究人员发现了一种以前认为随着哺乳动物的进化而消失的重要机制有助于保护哺乳动物的干细胞免受SARS-CoV-2和寨卡病毒等RNA病毒的侵害。他们认为,这一发现有朝一日可能在开发新的抗病毒治疗方法中得到利用。相关研究结果发表在2021年7月9日的S
近物所揭示细胞辐射应激调控新机制
中科院近代物理研究所空间辐射生物研究室的科研人员研究表观遗传学在重离子等离子射线诱导的细胞辐射应激中的作用时,发现了由microRNA参与调控的辐射应激新机制。 Dicer作为microRNA(miRNA)成熟过程中的关键因子,在miRNA的调控网络中发挥至关重要的作用。大量研究表明,Di
清华大学王宏伟研究组Cell发表首发性成果
RNA干扰(RNAi, RNA interference)是敲低一个基因表达的最为常用的一种手段。内源性引起RNA干扰的小RNA主要是微小RNA (miRNA)。 到目前为止,人体内已经发现多达1800种微小RNA,越来越多的文献报道认为很多肿瘤的发生发展、转移等行为与微小RNA的异常表达密切相
清华大学《Cell》文章:解决多个技术难题,终发首发性成果
清华大学生命学院再次发表了一最新结构生物学成果:首次报道了人源核酸内切酶Dicer蛋白的全长高分辨率结构,同时还报道了人源核酸内切酶Dicer蛋白结合一种小RNA前体pre-let-7底物的两种不同结构状态。 这一研究成果公布在Cell杂志上,文章通讯作者为清华大学生命学院、清华-北大生命科学
我国科学家解析小RNA的生物合成机制
小RNA是真核生物中重要的基因调控分子,在生长发育、基因沉默、抵御病毒等动植物的各类生理过程中起着至关重要的作用。小RNA的生物合成中,Dicer家族核酸内切酶选择性识别小RNA前体,切割RNA至特定长度,并选择性地将一条链递呈给下游AGO蛋白从而介导下游基因沉默。Dicer如何起到“分子尺”和
我国科学家解析小RNA的生物合成机制
小RNA是真核生物中重要的基因调控分子,在生长发育、基因沉默、抵御病毒等动植物的各类生理过程中起着至关重要的作用。小RNA的生物合成中,Dicer家族核酸内切酶选择性识别小RNA前体,切割RNA至特定长度,并选择性地将一条链递呈给下游AGO蛋白从而介导下游基因沉默。Dicer如何起到“分子尺”和
肌肉细胞与脂肪细胞是如何协同工作的
为什么进行运动训练会使我们更健康?*,运动可以增强胰岛素敏感性,改善我们的新陈代谢,进而提高运动表现。但是,尚未完全了解这种适应的生物学机制。发表在《 PNAS》杂志上的新研究表明,部分解释取决于骨骼肌和脂肪组织如何相互交流。这项研究由哥本哈根大学诺和诺德基金会基础代谢研究中心(CBMR)的CBMR
郑丙莲小组在植物miRNA领域重要进展
MicroRNA (miRNA) 是一类由内源基因编码的长度约为21-24个核苷酸的非编码RNA分子,它们通过调控基因表达参与动植物中众多的生长发育和疾病发生。miRNA的产生在动植物中非常保守,已知miRNA由具有颈环结构的初级转录本经过Dicer复合物的切割产生的。近年来围绕Dicer复合
RNAi相关的名词解释[英文]
Argonaute - A family of proteins containing multiple domains and involved in RNA interference (RNAi). Argonatue is the main component of RNAi effector