Cell同期发表中国学者两项重要结构生物学成果

中国科学院生物物理研究所和清华大学的两支研究组分别在Cell上发表重要成果,报道了高致病性嗜肺军团菌(Legionella pneumophila)的新型泛素化酶SidE与ubiquitin和配体的多个复合物的高分辨率晶体结构,以及人源核酸内切酶Dicer蛋白的全长高分辨率结构。 第一篇文章中,研究人员过大量的尝试,成功获得了SidE在其两步催化反应中,与ubiquitin及其配体的高分辨率晶体结构。SidE的apo结构表明,mART结构域和PDE结构域的催化口袋互相远离并朝向不同的方向,提示这两个结构域的催化过程是相互独立的;同时这两个结构域又通过一段保守的基序紧密结合,当丧失这种相互作用时,两个结构域的活性都受到了影响。mART结构域与ubiquitin及辅因子NAD的复合物结构显示,mART结构域利用其表面的一个高度保守区域参与结合ubiquitin,而这个互作界面非常靠近mART的催化中心;ubiquitin的C末......阅读全文

RNAi常见问题及问答(FAQs)

有关Stealth™ RNAi的问题什么是Stealth™ RNAi?Stealth™ RNAi是RNAi化学的新一代产品。Stealth™ RNAi分子是经过ZL化学修饰的、钝末端、双链25聚体(25mer)。这些化学修饰专门用来消除诱导的细胞应激反应。它也使Stealth™ RNAi比标准的si

Low-Loss-Sapphire-Windows-for-High-Power-Microwave-Transmission(八)

Strength Prediction. Large deflection theory solves for the deflection of a disk as a function of loading and boundary condition. Stress is a deri

RNAi有哪些高效性

RNAi的高效性:dsRNA在Dicer作用下形成siRNA,siRNA解链与RISC形成复合物,这些RISC可专一性地与靶向的mRNA特异性结合。siRNA也有可能不与RISC结合,而是通过解链直接靶向结合mRNA。根据RISC结合位点或单链siRNA结合位点在RdRP作用下可形成新的dsRNA,

Fate-Mapping-Axolotl-Embryos-in-Early-Gastrulation

BackgroundSince different amphibians execute gastrulation in different ways, the study of amphibian gastrulation has been complex. A popular method us

朱健康院士Cell-Research发布表观遗传新发现

  来自中国科学院上海植物逆境生物学研究中心、美国普渡大学的研究人员,在拟南芥中揭示出了Dicer非依赖性的RNA介导的DNA甲基化机制(RdDM)。这一重要的研究发现发布在12月8日的《细胞研究》(Cell Research)杂志上。  中国科学院上海植物逆境生物学研究中心主任朱健康(Jian-K

Exposing-gels-and-plates-containing-radioactive-samples-to-Xray-film

Although most people use the PhosphorImager for western blots, kinase assays and methionine-labeled samples, X-ray film remains the best way to expose

SCIENCE-ADVANCES:单细胞Western揭秘胚胎发育异质性

  近日,美国加利福尼亚大学伯克利分校的科学家,利用单细胞Western技术在期刊SCIENCE ADVANCES(IF:12.804)发表文章:Assessing heterogeneity among single embryos and single blastomeres using ope

Cell子刊新发现:microRNA加工影响长寿

  Joslin糖尿病中心的科学家在研究衰老和疾病的过程中,发现脂肪组织的microRNA加工对衰老和抵抗力有着重要影响。这一发现有望帮助人们开发增强抵抗力、延长寿命和改善代谢情况的新药物。该研究发表在Cell Metabolism杂志的网络版中。   近年来,人们越来越清晰的认识到脂肪细胞a

SCIENCE-ADVANCES:单细胞Western揭秘胚胎发育异质性

  近日,美国加利福尼亚大学伯克利分校的科学家,利用单细胞Western技术在期刊SCIENCE ADVANCES(IF:12.804)发表文章:Assessing heterogeneity among single embryos and single blastomeres using ope

SCIENCE-ADVANCES:单细胞Western揭秘胚胎发育异质性

近日,美国加利福尼亚大学伯克利分校的科学家,利用单细胞Western技术在期刊SCIENCE ADVANCES(IF:12.804)发表文章:Assessing heterogeneity among single embryos and single blastomeres using ope

Biosynthesis-of-Glycine-and-Serine

Intermediates in energy production pathways such as glycolysis and the Kreb's cycle are commonly the starting point for the biosynthesis of amino

厦门大学生科院教授JCI发文:癌转移新机制

  来自厦门大学生科院,细胞应激生物学国家重点实验室的研究人员发表了题为“Geminin facilitates FoxO3 deacetylation to promote breast cancer cell metastasis”的文章,揭示FoxO3是乳腺癌转移的重要抑制分子,阐明了gemi

miRNA和siRNA的基本介绍及区别

1998年,Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术:通过dsRNA诱导特异基因的沉默,即所谓RNAi。2000年,Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs,mall temporal RNAs)。RNA干涉(RNAi)在实验室中是

miRNA和siRNA简介及区别

1998年,Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术:通过dsRNA诱导特异基因的沉默,即所谓RNAi。2000年,Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs,mall temporal RNAs)。RNA干涉(RNAi)在实验室

RNAi术语表

RNAi GlossaryDicer - Dicer is a member of the RNase III family of nucleases that specifically cleave double-stranded RNAs. Dicer processes long dsRNA

AGO2基因编码功能及结构描述

该基因编码Argonaute家族的一个成员,在RNA干扰中起作用。编码的蛋白质是高度碱性的,包含一个PAZ结构域和一个PIWI结构域它可能与dicer1相互作用,在短干扰RNA介导的基因沉默中发挥作用已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。[由RefSeq提供,2009年9月]This gene e

AGO2基因突变与药物因子介绍

该基因编码Argonaute家族的一个成员,在RNA干扰中起作用。编码的蛋白质是高度碱性的,包含一个PAZ结构域和一个PIWI结构域它可能与dicer1相互作用,在短干扰RNA介导的基因沉默中发挥作用已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。[由RefSeq提供,2009年9月]This gene e

中山大学等开发RNA编辑新工具

  CRISPR-Cas9系统使用一段引导RNA(其与Cas9蛋白结合起来才能发挥作用)来靶定一段DNA,并裂解双链DNA。这一现象提出了一个问题:由一个Dicer结合RNA元件和一段反义RNA组成的一种人造小RNA(asRNA,是否也能用来诱导Dicer处理和降解一段特定的RNA呢?  为此,5月

Dorsal-Root-Ganglion-Neuron-Culture-from-Adult-Rats

DescriptionProcedure for culturing and maintaining Dorsal Root Ganglion (DRG) neurons from adult rats. ProcedurePreparing Culture Surface- Collagen co

Colony-PCR

Colony PCR is useful in determining whether or not a specific colony on a plate has a sequence you desire. Primers for the specific sequence should be

Observation-of-living-and-plasticembedded-chick-embryos

The development of chick embryos has been studied since Aristotle. It is one of the most intensely studied organisms. One reason for this is that ther

electrophoresis-of-DNA

Agarose Gel Electroporesis of DNA Making the gel: 1.  Place casting platform with well former sideways in gel stand where you wish to  pour 

RNA干涉实验——采用RNaseⅢ制备siRNA分子实验

实验方法原理首先在体外以长为 200~1000 bp 的 cDNA 为模板转录合成正义与反义的单链 RNA 分子,然后通过退火形成长的 dsRNA 分子,再用Diccr 核酸酶进行切割得到 siRNA 分子的混合物,通过纯化去除没有被切割的双链 RNA 分子和 DNA 模板以后,siRNA 分子就可

关于基因表达的机制非编码RNA的成熟的介绍

  多数生物体中的非编码基因(ncRNA)被转录为需要进一步加工的前体。核糖体RNA(rRNA)通常被转录为含有一个或多个rRNA的前体rRNA,前体rRNA后来在特定位点被大约150种不同的snoRNA切割和修饰。转移RNA(tRNA)的5'和3'端序列分别被RNase P和tRN

简述非编码RNA的成熟

  多数生物体中的非编码基因(ncRNA)被转录为需要进一步加工的前体。核糖体RNA(rRNA)通常被转录为含有一个或多个rRNA的前体rRNA,前体rRNA后来在特定位点被大约150种不同的snoRNA切割和修饰。转移RNA(tRNA)的5'和3'端序列分别被RNase P和tRN

Realspace-and-realtime-dynamics-of-CRISPRCas9-visualized-by-...(三)

Fig. 4Structural rearrangement of the HNH domain. a, b HS-AFM images of the HNH domain in the high-height (a) and low-height (b) states. The mean ce

合成孔径雷达原理(一)

Theory of Synthetic Aperture Radar合成孔径雷达原理Electromagnetic TheoryUnlike optical and infrared imaging sensors which are inherently passive, meaning

Shellless-cultures-of-chick-embryos

This experiment allows you to observe the development of a chick embryo outside its shell. Cultured chicks are also more accessible for manipulation.

用siRNA或其生物合成前体RNAi诱导

  通过转染外源siRNA进行的基因敲低通常是不令人满意的,因为该效应仅是短暂的,特别是在快速分裂的细胞中。这可以通过产生siRNA的表达载体来克服。修饰siRNA序列以在两条链之间引入短环。得到的转录物是短发夹RNA(shRNA),其可以通过Dicer以其通常的方式加工成功能性siRNA。典型的转

基因干扰技术的基本特征

①RNAi是转录后水平的基因沉默机制;②RNAi具有很高的特异性,只降解与之序列相应的单个内源基因的mRNA;③RNAi抑制基因表达具有很高的效率,表型可以达到缺失突变体表型的程度,而且相对很少量的dsRNA分子(数量远远少于内源mRNA的数量)就能完全抑制相应基因的表达,是以催化放大的方式进行的;