韩斌NatGenetics发文探讨重要研究进展
来自中科院上海生命科学研究院植物生理生态研究所韩斌研究员，以及黄学辉博士在最新一期(7月)Nature Genetics杂志上发表题为“A crop of maize variants”点评文章，探讨了近期关于不同玉米品种的大规模重测序，以及比较基因组分析的三项重要研究进展。 玉米是世界主要农作物之一，在很多国家被广为种植。玉米原产于中美洲，是一种喜温作物，生长期较长，需水量比高梁、谷子、大豆等旱粮作物要高，又分布很广，美国是世界上最大的玉米生产国，每年约出产2亿吨玉米，占世界总产量的40%以上。中国玉米产量居第二、巴西第三位。 作为一种重要的农作物，很早之前，科学家就希望能绘制出这种植物的基因组图谱，2009年终于成功测序得出了玉米基因组的草图。但草图的完成并不代表我们对于这种古老的农作物有了全面的认识，还需要更深入的探索。在这篇文章中，研究人员就对玉米基因组进行了迄今为止最全面的遗传学分析。 在第一......阅读全文
全球农作物多样性基金会启动全球野生种子搜寻
挪威是斯瓦尔巴德全球种子库的所在地 一个收集全世界主粮作物（包括玉米、水稻、小麦和马铃薯）的野生亲缘物种的种子的国际项目已经收到了第一笔资助。 12月10日挪威承诺为该项目提供5000万美元，预计它将用10年完成。挪威的位于北极地区的斯瓦尔巴德群岛是全世界最大的种子库的所在地。
Nature：用单细胞基因组探索多样性
宏基因组研究极大地提高了我们对于细菌以及古细菌多样性的理解。然而，环境宏基因组数据往往不容许个别物种的基因组组装，因此，大多数完整的基因组序列来自于培养的微生物。如今，两个新的大规模研究利用单细胞基因组，直接从未培养的环境样本中恢复了细菌和古细菌基因组。 Rinke等人利用荧光活化性细胞分
王道文委员：促进农作物基因组编辑育种成果转化
“虽然目前有多种育种方法可用于品种选育，但基因组编辑已成为国际上品种创新研发的新一代热点技术。”日前，全国政协委员、中科院遗传与发育生物学所研究员王道文向《中国科学报》记者介绍，与其他方法相比，基因组编辑直接改良农艺性状控制基因，具有精准、高效、省时、省力等特点，因此该技术的优化与应
王道文委员：促进农作物基因组编辑育种成果转化
“虽然目前有多种育种方法可用于品种选育，但基因组编辑已成为国际上品种创新研发的新一代热点技术。”日前，全国政协委员、中科院遗传与发育生物学所研究员王道文向《中国科学报》记者介绍，与其他方法相比，基因组编辑直接改良农艺性状控制基因，具有精准、高效、省时、省力等特点，因此该技术的优化与应用已成为美欧
基因组多样性和祖源信息数据库
11月3日，中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）计算生物学研究所徐书华课题组的研究成果，以PGG.Population: a database for understanding genomic diversity and genetic ancestry of human popul
Cell：全基因组测序揭示人类遗传多样性
遗传的历史就书写在现代非洲人的DNA中，但还需要一些调查工作来对其进行注释。在即将出现在8月3号《细胞》(Cell)杂志封面上的一篇报道中，宾夕法尼亚大学的遗传学家们和他们的同事对分属三个不同狩猎者(hunter-gatherer)群体的15个非洲人的完全测序基因组进行了分析，并破解了一些必定涉
多样性增加281％，人类肠道菌群基因组图谱公布！
近两年来，以免疫检查点为药物靶点的免疫检查点抑制剂治疗癌症受到越来越多科研工作者的青睐。但是临床研究结果表明，许多癌症患者因接受免疫药物治疗而出现不同程度的免疫相关不良反应，最终出现不得不提前终止治疗的情况。 而寄居在人体内的肠道菌群可以影响免疫检查点抑制剂治疗癌症，能够极大地改善患者对该疗法
我国专家首绘蝎子基因组图谱－揭开多样性面纱
由武汉大学领衔，与上海生物信息技术研究中心合作，近日完成了对马氏正钳蝎(Mesobuthus martensii)的基因组测序，预测了32016个蛋白质编码基因，在国际上第一个揭示了蝎子(scorpion)这一种独特的节肢动物适应模式。 专家表示，马氏正钳蝎基因组的解析揭开了蝎毒素多样
质体基因组多样性演化，提供土壤碳动态新视角
近日，中科院植物研究所研究员杨元合团队以青藏高原高寒草原生态系统为研究对象，依托野外长期氮添加控制实验平台，结合18O-DNA标记、高通量测序等技术揭示了氮添加影响土壤微生物CUE的新机制。相关研究成果发表于《全球变化生物学》。工业革命以来，化石燃料燃烧和农业化肥使用等人类活动导致大气氮沉降增加。持
“水稻等主要农作物功能基因组研究”重大项目取得进展
3月24-25日，“十二五”国家863计划现代农业技术领域“水稻等主要农作物功能基因组研究”重大项目交流会在海南陵水召开。来自中国科学院、中国农业科学院、华中农业大学、中国农业大学、浙江大学、上海交通大学等全国18所大专院校、科研院所的课题骨干和专家共计40余人参加此次交流会。农村中心相关人员参
大豆基因组重测序表明:野生大豆遗传多样性更高
“中原有菽，庶民采之。”五千年前，华夏始祖将野生大豆驯化，变成今天的“五谷”之一。而今，一项被称为“大豆回家”的基因组研究计划在其故乡中国取得突破。 11月15日，由香港中文大学、华大基因研究院、农业部基因组重点实验室、中国农业科学院等单位合作完成的《31个大豆基因组重测序揭示遗传多样性和
蝴蝶基因组大小进化进展－发现表型多样性进化遗传基础
蝴蝶因其丰富的形态多样性，自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一，近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型，已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。 中国科学院昆明动物研究所科研团队在2015年完成所有蝴蝶模式种金凤蝶及其
Illumina与PacBio测序数据帮助质体基因组多样性演化机制
近日，中科院植物研究所研究员张宪春、副研究员向巧萍等揭示了自养维管植物中目前已知最特异的质体基因组。相关研究成果发表于《植物学报》。近年来质体基因组研究揭示了复杂多样的结构和序列变异，对教科书上经典的四分体结构提出了挑战。质体基因组多样性演化的机制常被笼统地诉诸于DNA修复系统可能存在缺陷。科研人员
科学家完成90个鹰嘴豆基因组测序
1月28日，《自然—生物技术》杂志在线发表了国际鹰嘴豆基因组测序协作组(ICGSC)90个鹰嘴豆基因组测序及分析的成果。该协作组由来自10个国家、23个研究机构的49名科学家组成，深圳华大基因研究院也参与了该项研究。 据了解，鹰嘴豆是全球第二大豆类作物，营养价值高、耐旱性强，主要集中在热带
2012国际热带生物多样性及基因组学研讨会开幕
6月4日，“2012国际热带生物多样性及基因组学专题研讨会”（Workshop on Tropical Biodiversity and Genomics at Xishuangbanna Tropical Botanical Garden）在中国科学院西双版纳热带植物园举行。会议
上海生科院发布基因组多样性和祖源信息数据库
该研究分析了涵盖全球范围107个国家的356个人类族群的基因组多样性和祖源信息，并发布了开放获取的专门数据库——PGG.Population（群体基因组学·族群）。PGG.Population是迄今唯一在基因组水平专门解析人类族群遗传关系和祖源信息的公开数据库，也是目前收集族群数量最大的群体基
农作物“癌症”有救了
近年来，随着我国在节能温室中栽培瓜类、茄果类、豆类等蔬菜的面积不断增加，重要土传病害连年发生，素有植物“癌症”之称的植物青枯病和枯萎病是危害最大、损失最重、分布最广的世界性土传病害，作物一旦发病便回天乏力。 如今，被认定染上这类“绝症”的植物，迎来了被治愈的新希望。中国热带农业科学院分析测试中
韩斌NatGenetics发文探讨重要研究进展
来自中科院上海生命科学研究院植物生理生态研究所韩斌研究员，以及黄学辉博士在最新一期(7月)Nature Genetics杂志上发表题为“A crop of maize variants”点评文章，探讨了近期关于不同玉米品种的大规模重测序，以及比较基因组分析的三项重要研究进展。 玉米是世
基因组研究让水稻育种走向精准设计
由中国主导的国际间科研大协作项目“3000份水稻基因组研究”26日结出硕果——北京时间当日凌晨1时，国际顶级学术期刊《自然》正式发表《3010份亚洲栽培稻基因组研究》。该研究针对水稻起源、分类和驯化规律进行了深入探讨，揭示了亚洲栽培稻的起源和群体基因组变异结构，剖析了水稻核心种质资源的基因组遗传
新疆重新确定主要农作物范围－甜菜列入非主要农作物范围
从自治区农业厅获悉：近日，自治区农业厅重新确定了新疆主要农作物，包括稻、小麦、玉米、棉花、大豆、油菜、马铃薯、向日葵、甜瓜。而甜菜和西瓜不再列入自治区主要农作物范围。 据介绍，《种子法》出台后，我区根据新疆农业生产的需要和种植业结构调整的情况，先后几次调整新疆主要农作物范围。其中，自治区农
植物多样性能预测昆虫多样性
日前，应用宏条形码技术，中科院昆明动物研究所研究员俞维理课题组对“植物多样性精确预测昆虫多样性”的重要结论进行了验证和扩展。 昆虫具有宿主特异性，因此植物多样性应该能够预测昆虫多样性，但是已有的研究并不支持该结论；直到Basset 等人在一个热带森林里进行前所未有的全面采样，并结合复杂的统计模
水生所揭示鲤科鱼类基因组加倍促进血氧系统表型多样性
生物的生存、繁殖、以及分布或多或少都受到环境氧的影响。生物的正常有氧代谢有赖于保持氧的需求（代谢）和供应（储存和传递）的平衡关系。而实现这一平衡关系主要依靠生物体内特异的血氧传递系统。血氧系统的多样化不仅体现了物种在生理上的多样性，也从侧面反映了物种对环境的适应能力。在进化史上，基因组加倍是生物
生科院发布首个全球人群基因组多样性和祖源信息数据库
11月3日，中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）计算生物学研究所徐书华课题组的研究成果，以PGG.Population: a database for understanding genomic diversity and genetic ancestry of human popula
农作物病害检测仪
植物病害快速诊断仪 一、概述： 细 菌、真菌和病毒是引起农作物病害的主要原因。这些病害微生物一般通过茎、叶、根系，果实等侵染植物，大部分病害在染病初期虽然较易防治，但一般不易被人察 觉，病害一旦发生，防治不仅困难而且效果较差，致使农作物减产，甚至绝收。如何在病害发病初期检测和及时防治
农作物病害检测仪
细菌、真菌和病毒是引起农作物病害的主要原因。这些病害微生物一般通过茎、叶、根系，果实等侵染植物，大部分病害在染病初期虽然较易防治，但一般不易被人察觉，病害一旦发生，防治不仅困难而且效果较差，致使农作物减产，甚至绝收。如何在病害发病初期检测和及时防治，对防治病害的发生尤为重要。 植物病害的检测是一种
光谱技术监测农作物健康
农田里的作物长势好不好，营养够不够，要不要施肥，只要打开手机APP，就可轻松知晓。5月11日，在第40期江苏青年科学沙龙上，南京农业大学姚霞教授介绍了“基于光谱的作物生长无损监测与定量诊断技术研究”，她表示，当前基于光谱的农作物生长监测技术日趋成熟，并开始应用于实际农业生产中，成为农民种地的好帮
硫酸对农作物有害吗
硫酸特别是是浓硫酸对农作物是有害的，使土壤失去中和能力，影响微生物的活性，土壤如果PH值过低，大部分植物是无法继续生长的,它们会因强酸而导致死亡。但事物总是一分为二的，碱性的土壤就需要酸性的化学物质去中和，才能适合农作物的生长。
多种养殖哺乳动物携带的病毒基因组遗传多样性被解码
复旦大学公共卫生学院教授粟硕团队与中国科学院微生物研究所研究员毕玉海等合作者，揭示了多种哺乳动物宏基因组数据中的病毒基因组组成、生态学特征与潜在跨物种传播风险，为构建“人-动物-环境”一体化、多维度新发传染病预测预警体系奠定了重要数据基础。9月4日，相关研究发表于《自然》。21世纪以来，人类多次经历
遗传多样性缺失导致少量人种被忽略－基因组学应包容性
一个来自被忽略人种的研究 几十年来，Néstor Ruiz Hernández一直在争取认可。他在墨西哥南部太平洋沿岸的一个小镇长大。在那里，他和其他许多人都是十六世纪被人贩子从非洲贩运到墨西哥的奴隶的后代。他们认为自己是Afromexican，但该组织并未被墨西哥政府正式承认为少数族裔群体。
东亚家猪与其野生祖先之间的大规模回交史
驯化通常被看作是少数野生个体被人类隔离圈养，经过代代培育而形成家养物种的过程。在这个过程中，由于奠基者效应，可以预期到家养物种的遗传多样性与其野生祖先相比会有所降低，这点已经在大豆、玉米等农作物中被证实，然而人们对家养动物这方面却知之甚少，究其原因，主要是大部分家养动物的野生祖先现