青岛能源所在植物miRNA合成调控领域取得进展

在不同的生长发育阶段和受到外界生物、非生物胁迫时,生物体需要精细地调控基因的表达水平。近年来,microRNA (miRNA)在基因精细调控中的作用越来越被重视。miRNA在真核生物中普遍存在,是21-24个核苷酸的非编码小RNA分子, 通过负调控mRNA靶基因的转录后表达水平影响动植物的生长发育和疾病发生等多种生物学过程。在植物中,miRNA 参与调控器官的形态建成、生长发育、种子大小和生物产量、以及抵御外界生物(如病、虫等)和非生物(如干旱、温度、盐碱、贫瘠等)胁迫。研究调控miRNA合成代谢的分子机制,对于改善农作物以及能源植物的产量品质和环境适应性具有非常重要的生物学意义。然而植物miRNA是如何产生的,以及在不同的环境条件下如何精细调控基因的表达水平并不十分清楚。 近年来,调控miRNA合成的研究已成为小RNA领域的一个研究热点,许多重要的调控因子相继得以鉴定。miRNA首先由MIR基因利用RNA 聚合酶2转录......阅读全文

高通量快速验证miRNA靶基因

尽管现在人们可以越来越准确地预测microRNA的沉默效果,但还是需要高通量而且准确的直接验证技术来验证microRNA的沉默效果。microRNA 这个在生物科学史上具有重要意义的小分子,在2008年又一次成为了世人瞩目的焦点。microRNA通过与目标mRNA的3’UTR区域结合来阻止其翻译

miRNA-mimics-miRNA-inhibitor

miRNA mimics 是模拟生物体 内源的miRNAs,运用化学合成的方法合成,能增强内源性miRNA的功能。miRNA inhibitor 是化学修饰的专门针对细胞中特异的靶miRNA的抑制剂。近年来人工合成的miRNA(artificial miRNA,amiRNA)已经成功应用于沉默预期靶

如何预测和鉴定miRNA的靶基因

免疫沉淀当然,确定miRNA与mRNA之间的互作,我们还有更直接的方法,那就是从实验上寻找物理相互作用。我们可以利用RNA诱导沉默复合物(RISC)中的Argonaut(AGO)蛋白的抗体进行免疫共沉淀(co-IP)。目前更先进的方法是通过紫外线照射以交联复合物,然后开展深度测序以鉴定发现的RNA,

miRNA海绵—长效抑制miRNA

miRNA海绵随着研究的深入,已知miRNA的数量与日俱增,目前Sanger miRBase数据库中收录的人miRNA已达721条。不过,大部分miRNA的功能仍是未知数。在基因功能研究中,最有效的方法是阻止特定基因的功能,然后了解其后果。miRNA同样如此。然而,相比之下,miRNA的功能研究要困

miRNA海绵—长效抑制miRNA

随着研究的深入,已知miRNA的数量与日俱增,目前Sanger miRBase数据库中收录的人miRNA已达721条。不过,大部分miRNA的功能仍是未知数。在基因功能研究中,最有效的方法是阻止特定基因的功能,然后了解其后果。miRNA同样如此。然而,相比之下,miRNA的功能研究要困难得多。为什么

miRNA研究

一、miRNA研究的基本问题和研究方法二、miRNA研究的综合解决方案1. miRNA微阵列芯片服务Agilent miRNA 芯片(21.0) Affymetrix miRNA 4.0 芯片2. miRNA测序服务  miRNA-seq文库构建流程  miRNA测序数据分析流程3. miRNA R

研究人员利用基因编辑技术靶向miRNA基因改良大豆抗病性

大豆作为粮食与经济作物,在田间生产常受多种病害侵袭,导致其产量损失。microRNA是植物基因表达调控的核心分子,通过介导靶基因沉默及phasiRNA生成,在生长发育与抗病应答中发挥作用。其中,miR2118家族作为保守的phasiRNA触发器,在单子叶作物中功能已证实,但大豆中生物学功能尚未明确。

miRNA--克隆实验

实验方法原理 在细胞中表达的 RNA 除了我们所熟悉的 mRNA 以外,还有大量不编码蛋白质的非编码 RNA(noncoding RNA,ncRNA),非编码 RNA 在细胞中起着非常重要的作用,如 rRNA 和 tRNA 维持着基因的表达,还有一部分则起着调控基因表达的作用。实验材料 寡核

miRNA克隆实验

            实验方法原理 在细胞中表达的 RNA 除了我们所熟悉的 mRNA 以外,还有大量不编码蛋白质的非编码 RNA(noncoding RNA,ncRNA),非编码 RNA 在细胞中起着非常重要的作用,如 rRNA 和 tRNA 维持着基因

miRNA克隆实验

在细胞中表达的 RNA 除了我们所熟悉的 mRNA 以外,还有大量不编码蛋白质的非编码 RNA(noncoding RNA,ncRNA),非编码 RNA 在细胞中起着非常重要的作用,如 rRNA 和 tRNA 维持着基因的表达,还有一部分则起着调控基因表达的作用。本实验来源「RNA 实验指导手册」主

Nature发布miRNA重要发现:脂肪细胞的miRNA信号

  脂肪细胞并不简单,Joslin糖尿病中心的科学家发现这种细胞并不只是静静的待在我们身体中,而且能释放出激素和其它信号蛋白,影响多种组织,其中一种竟然是miRNA。利用脂肪细胞研发基因治疗方法,也许能用于治疗肝脏或其它器官的代谢疾病,还有癌症等。  这一研究成果公布在2月15日的Nature杂志上

MicroRNA(miRNA)的概念

MicroRNA(miRNA):是含有茎环结构的miRNA前体,经过Dicer加工之后的一类非编码的小RNA分子(~21-23个核苷酸)。MiRNA,以及miRISCs(RNA-蛋白质复合物)在动物和植物中广泛表达。因之具有破坏目标特异性基因的转录产物或者诱导翻译抑制的功能,miRNA被认为在调控发

miRNA的qPCR检测

测序技术的引入促使miRNA研究领域进入快速发展阶段,然而qPCR仍是验证测序数据的重要标准。本文将为您介绍使用qPCR进行miRNA分析的基本要点,希望能帮助新人快速入门。什么是miRNA?miRNA是一类小的非编码RNA,能够与RNA诱导沉默复合物(RISC)结合,通过作用于mRNA,进而介导转

mirna-pcr电泳多久

一般是根据PCR产物大小和所用电压来决定时间的吧一般溴酚蓝跑到胶的1/3处就可以了。电压大,就时间短,第一次跑,还是在边上观察着点吧,分子小,时间不长的。

如何设计miRNA-mimics

miRNA mimic能模拟细胞中内源性成熟miRNA的高水平表达,以增强内源性miRNA的调控作用,是miRNA功能研究的一大利器。miRNA mimic是一种简单高效的miRNA研究工具,只需用转染试剂包裹即可转染进入细胞,无需构建载体的繁琐操作,无需病毒防护方面的担忧,用转染对照即可观察其转染

人类基因组“primiRNA”剪切位点图谱绘制

  人体的基因表达是一个复杂的过程,那么多的基因不可能都总是持续表达。指挥基因表达的功臣之中就包括几种RNA分子。MicroRNA(miRNA)是一类真核生物内源性的小分子单链RNA,它是一种古老的、生死攸关的基因调节因素,30-60%的哺乳动物蛋白质编码基因都受miRNA的调控(主要是基因沉默调控

miRNA-qPCR-Detection-Primer-Set(miRNA检测试剂盒)实验说明

一、概述1、介绍microRNA(miRNA)是一类有大约22 个核苷酸组成的非编码小分子RNA,其广泛存在于真核生物中。miRNA 在个体发育的不同时期及不同组织中有不同的表达模式,都表明了其在发育和分化中起有重大的调控作用。迄今为此,对miRNA 的检测方法主要有Northern B

miRNA-qPCR-Detection-Primer-Set(miRNA检测试剂盒)实验说明

  一、概述   1、介绍   microRNA(miRNA)是一类有大约22 个核苷酸组成的非编码小分子RNA,其广泛存在于真核生物中。miRNA 在个体发育的不同时期及不同组织中有不同的表达模式,都表明了其在发育和分化中起有重大的调控作用。迄今为此,对miRNA 的检测方法主要有Northe

miRNA研究之RNA标记

RNA标记RNA标记是将标记物(如放射性同位素、荧光素或酶)共价地连接到RNA,通过检测标记物,进而实现对RNA鉴别和检测的目的。RNA标记在分子探针领域应用广泛,在疾病诊断方面也很有前景。 理想的RNA标记方法应符合以下要求:1.  操作简单,灵敏度高2.  不影响碱基配对的特异性3.  不影响R

micro-RNA(miRNA)综述1

RNA一度被认为仅仅是DNA和蛋白质之间的“过渡”,但越来越多的证据清楚的表明,RNA在生命的进程中扮演的角色远比RNA我们早前设想的更为重要。RNA干扰(RNA interference)的发现使得人们对RNA调控基因表达的功能有了全新的认识,更因为可以简化替代基因敲除而成为研究基因功能的

micro-RNA(miRNA)综述3

未来要解决的问题miRNAs在多个物种中广泛被发现,而且在进化上高度保守。这些“小玩意儿”留给我们一大堆谜团:miRNA的确切功能是什么?它的目标靶是什么?作用机制是什么?也许需要对植物或者线虫的基因组进行miRNAs突变株的筛选,在果蝇中可以用targeted- disruption缺失miR

micro-RNA(miRNA)综述2

miRNA的作用方式最早被发现的两个miRNAs――lin-4 and let-7被认为是通过不完全互补结合到目标靶mRNA3'非编码区端,以一种未知方式诱发蛋白质翻译抑制,进而抑制蛋白质合成,阻断mRNA的翻译。多个果蝇miRNAs也被发现和他们的目标靶mRNAs的3'非编码区

miRNA引物设计流程介绍

  MiRNA的命名原则可以大致归纳如下:   一个系统命名包含三部分内容,即物种,microRNA类别,序号。三者间用短线连接。物种一般用三个小写字母表示,如hsa,mmu和rno分别代表人,小鼠和大鼠。MicroRNA类别是指所命名的microRNA是pre-miRNA还是mature miR

小分子RNA(miRNA)简介

一、什么是小分子RNA( MicroRNA)?    MicroRNA (miRNA) 是一类长度约为20-24个核苷酸长度的具有调控功能的非编码RNA。 miRNA 主要参与基因转录后水平的调控。这些miRNA基因首先在细胞核内转录成原始miRNA转录本(primary transcrip

Isolation-of-microRNA-(miRNA)

实验概要        This protocol utilizes the powerful guanidine isothiocyanate–phenol:chloroform extraction method which allows the rapid isolation of t

miRNA引物设计流程介绍

MiRNA的命名原则可以大致归纳如下:一个系统命名包含三部分内容,即物种,microRNA类别,序号。三者间用短线连接。物种一般用三个小写字母表示,如hsa,mmu和rno分别代表人,小鼠和大鼠。MicroRNA类别是指所命名的microRNA是pre-miRNA还是mature miRNA。pre

植物内源激素油菜素内酯负调控miRNA靶基因的翻译抑制

  植物体内非常重要的小分子非编码RNA——miRNA在翻译水平介导的靶标基因抑制是一种非常保守的基因沉默机制。在模式植物拟南芥中,miRNA被装载到其效应分子ARGONAUTE1(AGO1)蛋白上,以碱基互补配对的方式与其靶标mRNA结合,最终诱导细胞质中靶基因mRNA的切割,或者在内质网中抑制靶

汪阳明组“miRNA与sgRNA联姻”打造基因编辑体系控制新平台

  miRNA是一类长度约22个碱基的核糖核酸分子,广泛表达于植物,动物以及病毒中。miRNA通过与Argonaute (AGO)等蛋白形成RNA诱导沉默复合物(RNA Induced Silencing Complex,RISC),在转录后水平抑制基因表达【1,2】。其表达谱呈现细胞特异性【3】,

BMC-Plant-Biology测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因

  野生大豆(Glycine soja)是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆,野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱,碱,盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究,将有助于栽培大豆的遗传改良。近日,华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代高通

二代测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因

  野生大豆(Glycine soja)是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆,野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱,碱,盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究,将有助于栽培大豆的遗传改良。近日,华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代