海底蛋白爱“吃光”

组寻找“吃光”蛋白质的科学家,在加利利海海底偶然发现了50年来的第一个新品种。这种蛋白质可帮助植物和微生物从太阳中获取光的细胞成分。这一意想不到的发现可帮助研究人员更好地了解微生物是如何感知光线的,并促进新型光学研究以及数据存储技术的发展。 许多生物利用光敏蛋白质收集太阳的能量,并帮助其生存。它们中一些利用叶绿素通过光合作用转化阳光,其他一些则使用视紫质,这种蛋白质与一种被称为视黄醛的维生素A结合,可以捕获光线。最著名的视紫质嵌在人眼的视杆细胞中,它帮助人们在黑暗中看清东西。但另一种形式的视紫质则帮助小生物(如藻类和细菌)吸收光以制造化学能。 研究人员在收集来自以色列加利利海的DNA样本时,尝试寻找第二种视紫质。回到实验室后,研究人员对DNA样本进行了筛选,寻找编码光反应蛋白的基因。当他们将视黄醛添加到大肠杆菌时,它变成了紫色——这是视紫质可能存在的迹象。《科学》杂志近日报道称,研究小组表示,当他们进一步测试DNA时,发......阅读全文

结合DNA的蛋白质

结构蛋白可与DNA结合,是非专一性DNA-蛋白质交互作用的常见例子。染色体中的结构蛋白与DNA组合成复合物,使DNA组织成紧密结实的染色质构造。对真核生物来说,染色质是由脱DNA与一种称为组织蛋白的小型碱性蛋白质所组合而成;而原核生物体内的此种结构,则掺杂了多种类型的蛋白质。DNA可在组织蛋白的表面

DNA的主要功能结合DNA的蛋白质

结构蛋白可与DNA结合,是非专一性DNA-蛋白质交互作用的常见例子。染色体中的结构蛋白与DNA组合成复合物,使DNA组织成紧密结实的染色质构造。对真核生物来说,染色质是由脱DNA与一种称为组织蛋白的小型碱性蛋白质所组合而成;而原核生物体内的此种结构,则掺杂了多种类型的蛋白质。DNA可在组织蛋白的表面

微生物检测应用DNA探针法

在许多病原微生物的检测上,常用的分离培养方法需要的时间较长,手续也较繁杂,而且病灶和粪便等病料含杂菌较多,阻碍病原微生物的检出,不能快速做出诊断。免疫学方法也有许多不足之处,尤其是在持续性感染和感染潜伏期抗体尚未产生或不易检测出抗体的情况下,即使有抗体存在也难以判断。而应用核酸探针技术,就可以直接确

怎样提取微生物的质粒(DNA)

碱提法:一、试剂准备1.溶液Ⅰ:50mM葡萄糖,25mM Tris-HCl(pH 8.0),10mM EDTA(pH 8.0).1M Tris-HCl(pH 8.0)12.5ml,0.5M EDTA(pH 8.0)10ml,葡萄糖4.730g,加ddH2O至500ml.在10 lbf/in2高压灭菌

肠道微生物DNA的提取方法

实验概要肠道微生物DNA是进行微生物分子生态学研究的前提。能否获得高的DNA提取率和高质量的DNA,从而真实地反映微生物群落的实际情况,是保障研究结果是否可靠的关键。如何获取高质量、较完整的肠道菌群基因组DNA是肠道微生物研究中的关键。本研究采用物理方法,化学方法,酶解法等进行DNA提取,并对其进行

单细胞蛋白质的微生物

  生产单细胞蛋白质的微生物种类很多,有酵母菌、细菌、霉菌和担子菌等。  糖质原料:酵母属和假丝酵母属为主要生产菌。  正烷烃:假丝酵母为最主要利用菌。  甲烷:能利用甲烷作为唯一碳源的微生物,主要是细菌,如甲烷假单胞菌等。  甲醇:主要以细菌为主,放线菌、酵母菌和霉菌次之。甲烷利用菌也为甲醇利用菌

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质

TRIzol试剂适用于从细胞和组织中快速分离RNA。TRIzol试剂有多组分分离作用,与其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚/SDS法、盐酸胍法、硫氰酸胍法等相比,最大特点是可同时分离一个样品的RNA\DNA\蛋白质.TRIzol使样品匀浆化,细胞裂解,溶解细胞内含物,同时因含有RNase抑制剂可保持RNA

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质

TRIzol试剂适用于从细胞和组织中快速分离RNA。TRIzol试剂有多组分分离作用,与其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚/SDS法、盐酸胍法、硫氰酸胍法等相比,最大特点是可同时分离一个样品的RNA\DNA\蛋白质.TRIzol使样品匀浆化,细胞裂解,溶解细胞内含物,同时因含有RNase抑制剂可保持RNA

微生物是怎样生产蛋白质的

生物学家告诉我们:蛋白质是生命活动的物质基础,一切动植物的体内都有蛋白质。动植物这些显眼的“大生物”含有蛋白质,那些肉眼难见的“小不点儿”微生物,是否也应有蛋白质的成分呢?是的,微生物虽小,也有蛋白质成分。由于微生物大多是很小很小的单细胞生物,因而人们生产出来的蛋白质,叫作“单细胞蛋白”。单细胞蛋白

DNA提取:为微生物研究扫清障碍

  近年来,尽管测序技术在快速发展,但DNA提取方法却鲜有改进。对于宏基因组研究,这是必需的一步。然而,许多微生物无法在实验室中培养,这成为分析大量微生物样品的一个主要瓶颈。参与美国NIH的人类微生物组计划(Human Microbiome Project)以及地球微生物组计划(Earth Mi

单细胞DNA测序揭示微生物“暗物质”

  据《自然》杂志网站7月14日(北京时间7月15日)报道,天文学家们认为,宇宙总物质量的23%由弥漫于其间且肉眼看不见的“暗物质”组成;现在,美国科学家进行了微生物“暗物质”研究,他们用单细胞DNA测序技术对多种微生物的基因组进行测序后发现,微生物远比我们所知道的要丰富多样,研究同时揭示了不同物种

土壤微生物总DNA提取及纯化

实验概要从土壤微生物中提取总DNA并纯化,高质量的DNA可用于后续文库构建。主要试剂TENP缓冲液(50 mmol/L Tris, 20 mmol/L EDTA, 100 mmol/L NaCl, 1% PVP, pH 10.0)PBS缓冲液(137 mmol/L NaCl, 2.7 mmol/L

脱氧核糖核酸DNA结合DNA的蛋白质的介绍

  结构蛋白可与DNA结合,是非专一性DNA-蛋白质交互作用的常见例子。染色体中的结构蛋白与DNA组合成复合物,使DNA组织成紧密结实的染色质构造。对真核生物来说,染色质是由脱DNA与一种称为组织蛋白的小型碱性蛋白质所组合而成;而原核生物体内的此种结构,则掺杂了多种类型的蛋白质。  DNA可在组织蛋

蛋白质如何阻止细胞攻击自己的DNA

病毒通过将其DNA注入宿主细胞来繁殖。一旦进入细胞内液,这种异物就会触发一种称为cGAS-STING途径的防御机制。蛋白质环状GMP-AMP合酶(cGAS)也存在于液体中,它与入侵的DNA结合形成一个新分子。反过来,它与另一种称为干扰素基因刺激物(STING)的蛋白质结合,从而诱导炎症性免疫反应。 

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质4

注意事项:1. DNA在中间层和有机相中时可在2~8℃保存过夜。2.DNA沉淀在75%乙醇中2~8℃可保存几个月。3.DNA在8mM NaOH溶液中4℃可放置过夜,如长期保存需用HEPES调节pH至7~8并且加EDTA至1mM,可置于4℃或-20℃长期保存。常见问题分析:得率低:A.样品匀浆和裂解的

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质3

DNA污染:A. 样品匀浆时加的试剂量太少。B.样品中含有有机溶剂(如乙醇,DMSO等),强缓冲液或碱性溶液。蛋白聚糖和多糖污染:沉淀RNA的过程中作以下改进可去除这些污染,步骤7中,每使用1ml TRIzol在水相中加0.25ml异丙醇和0.25ml高盐溶液(0.8M柠檬酸钠和1.2MNaCl)混

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质(一)

TRIzol试剂适用于从细胞和组织中快速分离RNA。TRIzol试剂有多组分分离作用,与其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚/SDS法、盐酸胍法、硫氰酸胍法等相比,最大特点是可同时分离一个样品的RNA\DNA\蛋白质.TRIzol使样品匀浆化,细胞裂解,溶解细胞内含物,同时因含有RNase抑制剂可保持RNA

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质(二)

DNA的分离准备试剂:乙醇0.1M柠檬酸钠(含10%乙醇)、 75%乙醇、8mM NaOH操作步骤:1. 样品加氯仿分层后,移去上层水相,用乙醇沉淀中间层和有机相中的DNA。每使用1mlTRIzol加0.3ml无水乙醇混匀,室温放置3分钟,2~8℃不超过2000×g离心5分钟。2. 移去上清,(如需

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质2

5. 2-8℃10000×g离心15分钟。样品分为三层:底层为黄色有机相,上层为无色水相和一个中间层。RNA主要在水相中,水相体积约为所用TRIzol试剂的60℅。6. 把水相转移到新管中,如要分离DNA和蛋白质可保留有机相,进一步操作见后。用异丙醇沉淀水相中的RNA。每使用1mlTRIzol加入0

单细胞蛋白质的微生物及用途

  微生物  生产单细胞蛋白质的微生物种类很多,有酵母菌、细菌、霉菌和担子菌等。  糖质原料:酵母属和假丝酵母属为主要生产菌。  正烷烃:假丝酵母为最主要利用菌。  甲烷:能利用甲烷作为唯一碳源的微生物,主要是细菌,如甲烷假单胞菌等。  甲醇:主要以细菌为主,放线菌、酵母菌和霉菌次之。甲烷利用菌也为

微生物DNA进行人体识别引发隐私担忧

   研究人员已经发现寄生于人体的微生物的聚集DNA,它又被称为‘gut print’,可以唯一地识别某个人。但这引发了隐私问题。  研究结果于5月11日发表在《美国国家科学院院刊》上,表明它可能识别人体微生物栖息研究方面的匿名参与者。该微生物将会透露个人健康、饮食或种族方面的细节。4月29日发表在

土壤微生物DNA提纯方法及纯度检测

实验概要本实验比较了聚乙烯基吡咯烷酮(PVP)和交联聚乙烯基吡咯烷酮(PVPP)在DNA提取过程中的纯化作用,并利用低电压长时间电泳法及PVP电泳法对纯化的DNA样品进行了检测。主要试剂DNA提取缓冲液(100 mmol/L Tris, 100 mmol/L EDTA, 100 mmol/L Na3

土壤微生物总DNA的提取方法比较

实验概要通过对比不同DNA提取及纯化方法,选择和优化适合于土壤样品不同分子量DNA提取及纯化的技术路线。实验原理土壤是微生物最大的栖息地,20世纪80年代,微生物学家采用免培养(culture-in-dependent)方法,即直接从土壤中提取微生物总DNA的技术,使得在基因水平研究这些未培养微生物

DNA-酶-I-足迹法对-DNA-上的蛋白质结合位点作图实验

实验材料 新鲜组织、培养的细胞、来自细胞或组织的蛋白成分试剂、试剂盒 细胞匀浆缓冲液细胞重悬缓冲液细胞淋洗缓冲液乙醇Ficoll 400甲酰胺染色液MgCl2 CaCl2 溶液NaClNonidetP-40酚:氯仿磷酸盐缓冲液聚乙烯醇终止液组织匀浆液组织重悬缓冲液台盼蓝染料DNA 酶 I

DNA-酶-I-足迹法对-DNA-上的蛋白质结合位点作图实验

DNA 酶 I 足迹法对 DNA 上的蛋白质结合位点作图实验             实验材料 新鲜组织、培养的细胞、来自细胞或组织的蛋白成分

DNA-酶-I-足迹法对-DNA-上的蛋白质结合位点作图实验

本方案介绍在放射性标记的 DNA 片段上确定蛋白质结合位点的作图方法。本方案使用 DNA 酶 I 切割 DNA, 而在替代方案中是用羟自由基断裂 DNA。如果希望得到优化足迹法反应的建议,请参见本方案最后部分的疑难解析以及优化 DNA 酶 I 足迹法反应的栏目。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)

Nature:用于蛋白质分析的单分子DNA技术

  George Church 及同事开发出用于并行蛋白相互作用分析、借助用于蛋白功能分析的单分子DNA方法的一个“单分子相互作用测序”(SMI-seq)技术。  SMI-seq的工作原理是,通过核糖体显示或酶结合将蛋白耦合到DNA识别符或“条码”上。  这些条码化的蛋白然后在水溶液中被一起分析,并

电泳如何在DNA和蛋白质上起作用

电泳在具有静态pH的缓冲溶液中进行。电场施加到包含正端和负端的电泳室。如果被电泳物质的pH值低于周围缓冲液,则会向正极迁移。如果该物质的pH值高于周围的缓冲液,则会向负极迁移。物质以两种不同的速率迁移:粒径和总体电荷。迁移物质的pH值与周围缓冲液的pH值之间的差异越大,物质越能通过凝胶迁移。大分子由

DNA蛋白质印迹法的技术应用

中文名称DNA-蛋白质印迹法英文名称Southwestern blotting定  义将经过电泳分离的蛋白质转移到膜上再与某些特定序列的DNA片段相互作用,是研究蛋白质与DNA特异结合的技术。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

提取的DNA中含有蛋白质和RNA污染

提取的时候饱和酚,氯仿需要定量,这些可以去蛋白。去除RNA污染,RNA酶活性,定量。凝胶电泳,试剂最好是即用型的,因为有些东西放久了会长菌。然后是染料的热稳定性和灵敏度。