细菌Argonaute蛋白生成和加载DNA引导链的分子机制
近期，《分子细胞》（Molecular Cell）杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所王艳丽课题组及其合作者关于细菌Argonaute（Ago）蛋白独立生成和加载DNA引导链的最新研究成果，题为Autonomous Generation and Loading of DNA Guides by Bacterial Argonaute。 真核生物的Ago蛋白是RNA干扰通路的重要组分，它们利用小的RNA引导链靶向互补配对的RNA分子。RNA引导链的成熟和加载是通过不同的酶来完成的一系列催化反应。Ago蛋白也存在于原核生物中，它们参与抵抗外源入侵的DNA。与真核Ago蛋白利用RNA引导链靶向RNA分子不同，大量研究表明原核Ago蛋白利用DNA引导链靶向DNA分子。但是小干扰DNA（small interfering DNA， siDNA）引导链如何产生并加载到原核Ago蛋白的分子机制依然有待研究。 嗜热菌（Thermust......阅读全文
RNA干扰相关知识Argonaute（AGO）
Argonaute（AGO）：一类庞大的蛋白质家族，是组成RISCs复合物的主要成员。AGO蛋白质主要包含两个结构域：PAZ和PIWI两个结构域，但具体功能尚不清楚。研究表明，PAZ结构域结合到siRNA 的3’的二核苷酸突出端；一些AGO蛋白质的PIWI结构域赋予slicer以内切酶的活性。PAZ
Argonaute（AGO）蛋白的结构和功能
Argonaute（AGO）：一类庞大的蛋白质家族，是组成RISCs复合物的主要成员。AGO蛋白质主要包含两个结构域：PAZ和PIWI两个结构域，但具体功能尚不清楚。研究表明，PAZ结构域结合到siRNA 的3’的二核苷酸突出端；一些AGO蛋白质的PIWI结构域赋予slicer以内切酶的活性。PAZ
关于AGO蛋白质的基本介绍
Argonaute（AGO）：一类庞大的蛋白质家族，是组成RISCs复合物的主要成员。AGO蛋白质主要包含两个结构域：PAZ和PIWI两个结构域，但具体功能尚不清楚。研究表明，PAZ结构域结合到siRNA 的3’的二核苷酸突出端；一些AGO蛋白质的PIWI结构域赋予slicer以内切酶的活性。P
什么是Argonaute（AGO）？
Argonaute（AGO）：一类庞大的蛋白质家族，是组成RISCs复合物的主要成员。AGO蛋白质主要包含两个结构域：PAZ和PIWI两个结构域，但具体功能尚不清楚。研究表明，PAZ结构域结合到siRNA 的3’的二核苷酸突出端；一些AGO蛋白质的PIWI结构域赋予slicer以内切酶的活性。PAZ
科学家揭示外源核酸诱导的原核生物短Ago蛋白系统发挥功能的分子机理
RNA介导的转录后基因调控在生命个体抵御外源入侵的过程中起到重要作用。Argonaute（Ago）蛋白是存在于古菌、细菌和真核生物中的一种蛋白。它为非编码小RNA提供锚位点，达到降解靶基因或者抑制翻译的目的。对比真核生物的Ago，原核生物的Ago展现出多样性，分为三个家族——长A型、长B型和短Ago
Nature：外源核酸诱导的原核生物短Ago蛋白系统发挥功能的分子机理
RNA介导的转录后基因调控在生命个体抵御外源入侵的过程中起到重要作用。Argonaute（Ago）蛋白是存在于古菌、细菌和真核生物中的一种蛋白。它为非编码小RNA提供锚位点，达到降解靶基因或者抑制翻译的目的。对比真核生物的Ago，原核生物的Ago展现出多样性，分为三个家族——长A型、长B型和短A
我国学者揭示Agos蛋白指导导向DNA链切割靶标DNA链机制
近日，《Proceedings of the National Academy of the Sciences of the United States of America，PNAS》杂志在线发表题为“Two symmetric arginine residues play distinct
上海生科院发明一种高效安全的新型RNAi载体
10月12日，国际学术期刊Nature Communications 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所国家蛋白质科学中心（上海）吴立刚研究组的最新研究成果：Ribozyme-enhanced single-stranded Ago2-processed inter
细菌Argonaute蛋白生成和加载DNA引导链的分子机制
近期，《分子细胞》（Molecular Cell）杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所王艳丽课题组及其合作者关于细菌Argonaute（Ago）蛋白独立生成和加载DNA引导链的最新研究成果，题为Autonomous Generation and Loading of DNA Guides by
研究揭示Agos蛋白指导导向DNA链切割靶标DNA链的机制
2018年12月27日，《美国国家科学院院刊》（PNAS）杂志在线发表题为Two symmetric arginine residues play distinct roles in Thermus thermophilus Argonaute DNA guide strand-mediated
细菌Argonaute蛋白生成和加载DNA引导链的分子机制被发现
3月2日，《分子细胞》（Molecular Cell）杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所王艳丽课题组及其合作者关于细菌Argonaute（Ago）蛋白独立生成和加载DNA引导链的最新研究成果，题为Autonomous Generation and Loading of DNA Guides
浙大：RNA编辑阻止RISC识别靶标mRNA
MicroRNAs（miRNAs）结合Ago形成RNA诱导沉默复合体，通过沉默靶mRNA调控基因表达。miRNA的RNA编辑可能影响miRNA的加工，Ago复合物的组装，以及靶mRNA的结合。然而，组装进Ago复合物的被编辑的miRNA的功能，还没有被深入研究过。 浙江大学生命科学学院章晓波教
植物内源激素油菜素内酯负调控miRNA靶基因的翻译抑制
植物体内非常重要的小分子非编码RNA——miRNA在翻译水平介导的靶标基因抑制是一种非常保守的基因沉默机制。在模式植物拟南芥中，miRNA被装载到其效应分子ARGONAUTE1（AGO1）蛋白上，以碱基互补配对的方式与其靶标mRNA结合，最终诱导细胞质中靶基因mRNA的切割，或者在内质网中抑制靶
上海交大Hepatology文章解析癌转移新机制
来自上海交通大学医学院、上海人类基因组研究中心的研究人员在新研究中证实，Argonaute2通过上调黏着斑激酶(focal adhesion kinase，FAK)的表达，促进了肝癌转移。相关研究论文发表在4月22日国际著名肝脏疾病杂志Hepatology(最新影响因子11.665)上。
Cell－Rep：KRAS可以被“沉默”
大约三分之一的人类癌症中存在HRAS、KRAS或NRAS原癌基因突变。其中KRAS突变最为常见，其突变导致人类很多致命癌症的发生，包括胰腺癌和肺癌等。一直以来，科研工作者都致力于找到药物能抑制KRAS本身或KRAS信号通路中的关键分子。但到目前来看，这个问题仍没有得到有效地解决。 最近在Cel
原核生物和真核生物Argonaute酶的主要区别
Argonaute蛋白（Ago）是一类庞大的蛋白质家族，是组成RISC复合物的主要成员。在进化过程中演变出了各种亚科蛋白。这些亚科蛋白可以识别各种不同类型的小RNA分子，从而在各种小RNA沉默途径中发挥作用。 酶有明确的活性位点，与底物分子复杂地结合。这通常伴随催化反应发生前的酶构象变化。对A
环状RNA结合功能蛋白
环状RNA作为研究持续火热的明星分子，不同于对其丰富的表达谱研究，环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制，部分circRNA可竞争性结合miRNA，解除miRNA对靶基因的抑制作用，上调靶基因的表达。其实，环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白，分别在转录前
在生物学中RITS和RISC的含义
RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing（RITS）：是一种组织染色质变型的复合物。RITS复合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白质，通过结合到异染色质的基因池上来促使异染色质上基因的沉默。RNA-induced
LACEseq——一种RNA结合蛋白靶标研究的新方法
在真核细胞中，RNA可以“形单影只”，也可以与蛋白质“珠联璧合”。后者被称为RNA结合蛋白，它拥有着强大的基因调节能力。 RNA究竟与那些蛋白结合？将怎样作用于人类的发育、疾病？这都是悬而未解的难题。 6月10日，中国科学院生物物理研究所研究员薛愿超团队与合作者开发了可在微量细胞中鉴定RNA
为什么荧光素酶互补实验结果阴性也有
三大类的非编码RNA（ncRNA），miRNA/lncRNA/circRNA仍然是医学基础研究领域最为火热的研究热点，大部分的研究人员在立项之初，通过查阅文献或二代测序+生物信息学分析，获得了合适的研究对象，但在实验推进的过程中却遇到了重重困难。主要有以下几个原因：1. 找错了转录本；2. ncRN
中科大院士PNAS解析“垃圾”RNA
来自中国科技大学，英国邓迪大学的研究人员围绕一种关键小蛋白：Stc 1的结构和功能展开了研究，从中揭示出了裂殖酵母中RNAi与染色质修饰之间的分子作用机制，指出了非编码RNA的又一重要作用。相关成果公布在《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上。 文章的通讯作者是中国科技大学生命科学学
中科大院士PNAS解析“垃圾”RNA
来自中国科技大学，英国邓迪大学的研究人员围绕一种关键小蛋白：Stc 1的结构和功能展开了研究，从中揭示出了裂殖酵母中RNAi与染色质修饰之间的分子作用机制，指出了非编码RNA的又一重要作用。相关成果公布在《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上。 文章的通讯作者是中国科技大学生命科学学
PNAS：植物病原真菌抑制宿主小RNA跨界干扰增强毒力机制
通过生物活性分子相互作用的生物之间的交流在自然界中很普遍，并且在各种生物过程中发挥着关键作用。小 RNA (sRNA) 可以在宿主植物和丝状病原体之间传播，以触发受体细胞中的跨界 RNA 干扰 (RNAi) 并调节植物防御和病原体毒力。然而，很少有关于真菌病原体如何对抗跨界抗真菌 RNAi 的报
陈大华研究组JCB解析piRNAs发生机制
小分子piRNAs(Piwi-interacting RNAs)在抑制转座子活性和维持基因组稳定性起重要作用，但其发生和调控的分子机制仍不清楚。果蝇生殖细胞为研究这一机制提供了良好的模型。果蝇生殖细胞中piRNAs 的发生包括初级加工和次级加工两个过程，其中piRNAs次级加工途径，又称乒乓循环
首次！黄超兰：单碱基分辨率和单细胞层面的精准鉴定
2021年6月10日，北京大学医学部精准医疗多组学研究中心黄超兰团队，与中国科学院生物物理研究所薛愿超团队、广东省第二人民医院孙青原团队，合作在Nature Cell Biology上发表了题为“Global profiling of RNA-binding protein targetsite
如何预测和鉴定miRNA的靶基因
免疫沉淀当然，确定miRNA与mRNA之间的互作，我们还有更直接的方法，那就是从实验上寻找物理相互作用。我们可以利用RNA诱导沉默复合物（RISC）中的Argonaut（AGO）蛋白的抗体进行免疫共沉淀（co-IP）。目前更先进的方法是通过紫外线照射以交联复合物，然后开展深度测序以鉴定发现的RNA，
动物所揭示小分子piRNAs的发生和调控机制
小分子piRNAs(Piwi-interacting RNAs)在抑制转座子活性和维持基因组稳定性方面起重要作用，但其发生和调控的分子机制仍不清楚。果蝇生殖细胞为研究这一机制提供了良好的模型。果蝇生殖细胞中piRNAs 的发生包括初级加工和次级加工两个过程，其中piRNAs次级加工途径，又称乒乓
－Gene－Dev：研究果蝇提示衰老相关疾病的发病机制
阿尔茨海默氏病和亨廷顿病通常都与老化相关，但她们之间的生物联系一直不甚明了。现在，Rutgers大学研究人员通过学习常见果蝇中小RNA分子，寻求解答上述问题。 Ammar Naqvi博士表示：利用果蝇，我们能够检测特定microRNA模式，当microRNA绑定到特定蛋白质时，会有助于
吴立刚课题组Nature子刊发布RNAi新工具
来自中科院上海生命科学研究院的研究人员报告称，他们设计出了一种替代性的小干扰RNA（small interfering RNA，siRNA）前体，将之命名为saiRNA (single-stranded, Argonaute 2 (Ago2)-processed interfering RNA)
我国科学家解析小RNA的生物合成机制
小RNA是真核生物中重要的基因调控分子，在生长发育、基因沉默、抵御病毒等动植物的各类生理过程中起着至关重要的作用。小RNA的生物合成中，Dicer家族核酸内切酶选择性识别小RNA前体，切割RNA至特定长度，并选择性地将一条链递呈给下游AGO蛋白从而介导下游基因沉默。Dicer如何起到“分子尺”和