于洋博士等发现基因组长片段DNA插入的新机制
我们身体中每个细胞的基因组DNA每天都会面临成千上万次的损伤。所幸的是，细胞中有一套能够修复各种类型损伤的机器来保证基因组的完整性（genome integrity）。修复DNA损伤的机器在从酵母到人所有的真核生物中都是非常保守的，因此酵母作为模式生物被广泛应用于DNA修复（DNA repair）方面的研究。在所有类型的DNA损伤中，DNA双链断裂（DNA double-strand breaks，DSBs）是最严重的。DNA双链断裂如果得不到正确的修复往往会引发癌症。对DNA双链断裂修复机制进行研究不仅关系到人类健康，还有助于对一些基本的生物学问题如基因组的突变、重组和进化的理解。DNA双链断裂主要通过两种途径进行修复：同源重组（homologous recombination, HR）和非同源末端连接（nonhomologous end-joining, NHEJ）。同源重组依赖于完整的同源序列进行修复，因此保真性高。而......阅读全文
基因组DNA的定义
中文名称基因组DNA英文名称genomic DNA定 义组成生物基因组的所有DNA。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
基因组DNA的提取
第一节 概 述DNA的提取通常用于构建文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用DNA较长的特性，可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇，的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中，可用玻棒将其取出，而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部，
基因组DNA的提取
基因组DNA的提取概 述 基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出，而小分
脉冲场凝胶中DNA片段的直接回收
低熔点琼脂糖制备规模的 PFGE 经常被用于 DNA 片段的分离。不同大小的 DNA 可以用限制酶酶切产生高分辨率酶切图谱或产生用于插入噬菌体或质粒载体的片段。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理低熔点琼脂糖制备规模的 PFGE 经常被用于 DNA 片段的分离。不同大小的 D
大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ－Klenow片段实验
标记DNA的3‘末端 修复突出的3’或5‘末端 随即寡核苷酸引物介导 实验方法原理 选用本方法可产生用于放射自显影的32P末端标记分子量
凋亡细胞核DNA片段检测方法进展（一）
摘 要：当今生物学领域的研究一个热点之一是细胞凋亡。开展对细胞凋亡的研究，首先要解决是方法学问题。作者从凋亡细胞的特征性核DNA片段检测着手，阐述了多种凋亡细胞核DNA片段检测方法以及近年来的一些新进展。细胞凋亡（apoptosis）又称细胞凋谢或称程序性细胞死亡（Programmed cell
凋亡细胞核DNA片段检测方法进展（二）
2.3 凋亡细胞的TUNEL和ISNT鉴定的流式细胞仪分析[16]对于培养的细胞，可以将TUNEL或ISNT鉴定同流式细胞仪结合起来分析其发生凋亡的情况。待检细胞与含有TdT或DNA聚合酶I或Klenow片段及生物素标记的dUTP反应液共孵育一段时间后，加入荧光素（常用FITC）标记的链霉抗生物
DNA片段能预知寿命：端粒长度决定生物寿命
西班牙、英国研究人员最近发现，提取血液中的细胞，测试细胞中端粒的长度，可推断一个人的寿命有多长。这种检测方法将于2011年年底在英国上市，由此引来争议与关注 端粒长度 决定生物寿命 西班牙马德里国立癌症研究中心的玛莉亚・比拉斯科博士是这项商业端粒检测方法的发明者，她说这是一种非常简单、快捷
大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ－Klenow片段实验
实验方法原理 选用本方法可产生用于放射自显影的32P末端标记分子量标志物。放射自显影带的强度与片段长度无关，标记DNA可稳定数月之久。 实验材料 DNA试剂、试剂盒 dNTP仪器、耗材 水浴锅实验步骤 1. 在20 μl 反应体积中，用可产生5’突出端的限制性内切酶消化0.1~0.4 μg DNA
脉冲场凝胶中DNA片段的直接回收
实验方法原理 低熔点琼脂糖制备规模的 PFGE 经常被用于 DNA 片段的分离。不同大小的 DNA 可以用限制酶酶切产生高分辨率酶切图谱或产生用于插入噬菌体或质粒载体的片段。实验材料 DNA 大小标准基因组 DNA试剂、试剂盒 溴化乙锭酚：氯仿仪器、耗材 水浴实验步骤 一、材料1. 缓冲液和溶液溴化
DNA片段探针的应用实验——水溶液中杂交
实验材料DNA试剂、试剂盒杂交液洗膜液仪器、耗材培养箱实验步骤1. 除了于65℃在杂交液Ⅰ中温育的条件外，预杂交按甲酰胺法进行。 2. 按甲酰胺法制备探针并用2 ml 杂交液Ⅰ稀释。3. 滤膜在65℃杂交过夜，然后移去杂交液，用低严紧性洗膜液Ⅰ洗膜2次。4. 用高严紧性洗膜液Ⅰ在65℃迅速洗
脉冲场凝胶中DNA片段的直接回收
实验方法原理 低熔点琼脂糖制备规模的 PFGE 经常被用于 DNA 片段的分离。不同大小的 DNA 可以用限制酶酶切产生高分辨率酶切图谱或产生用于插入噬菌体或质粒载体的片段。 实验材料
分子克隆实验DNA片段与载体连接方法介绍
DNA分子与载体分子连接是克隆过程中的重要环节之一，方法有：①粘性末端连接，DNA片段两端的互补碱基顺序称之为粘性末端，用同一种限制性内切酶消化DNA可产生相同的粘性末端。在连接酶的作用下可恢复原样，有些限制性内切酶虽然识别不同顺序，却能产生相同末端。②平头末端连接，用物理方法制备的DNA往往是平头
纯化DNA实验_基因组DNA的快速纯化
试剂、试剂盒尾部缓冲液蛋白酶 K仪器、耗材离心管玻璃棒实验步骤第 1 天1. 大约 1.5 cm 长的尾部活检样品放在一个 1.5 ml 盛有 0.7 ml 尾部缓冲液的小离心管中，加 35 ul 10 mg/ml 蛋白酶 K，在 55℃ 振摇温育过夜。尾部缓冲液（配 25 ml）50 mmol/L
长读长测序显优势－基因组复杂结构变异检测实现新突破
基因组结构变异是很多癌症、遗传病等疾病的重要诱因。目前基于二代测序技术检测基因组结构变异存在很大的局限性，而三代测序存在错误率较高等多种问题，尤其针对复杂结构变异大多软件识别能力较差。针对这一问题，近日，在Nature Methods发表的一项最新研究中，研究人员开发了基因组比对工具NGMLR和
大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ－Klenow片段实验——标记DNA的3‘末端
实验方法原理选用本方法可产生用于放射自显影的32P末端标记分子量标志物。放射自显影带的强度与片段长度无关，标记DNA可稳定数月之久。 实验材料DNA试剂、试剂盒dNTP仪器、耗材水浴锅实验步骤1. 在20 μl 反应体积中，用可产生5’突出端的限制性内切酶消化0.1~0.4 μg DNA。 2.
血基因组DNA提取实验——血基因组DNA－试剂盒提取法
血基因组DNA提取可用于：（1）从冻全血、血浆、血清、骨髓、其他体液、淋巴细胞、培养细胞、病毒和线粒体中提取DNA；（2）用于后续测序、遗传信息学等研究。实验方法原理采用特殊的细胞裂解和蛋白去除液（包括蛋白酶K 裂解）从抗凝全血中得到基因组DNA。实验材料抗凝全血试剂、试剂盒血基因组DNA 试剂盒仪
外源DNA片段在质粒载体中的克隆实
实验方法原理 限制性内切酶可识别特定位点并切割DNA产生粘性末端或平端的外源片段，经DNA的纯化处理后用于连接反应；选择克隆载体pUC18多克隆位点上相应的限制性内切酶切割，并用碱性磷酸酶处理防止载体自连；在连接酶的作用下将外源片段连接到载体上，实现外源片段的克隆。实验材料 DNA片段PUC18试剂
PCR扩增分离目的DNA片段实验原理、材料和步骤
PCR扩增法实验材料 DNA 模板 试剂、试剂盒 电泳缓冲液 加样缓冲液 溴化乙锭溶液 琼脂糖 TaqDNA 多聚酶 5′反应缓冲液
克隆在原核载体的DNA片段的快速鉴定
实验方法原理 已转化的重组载体的细菌细胞或 λ 噬菌体颗粒可通过直接从培养皿上挑取菌落或噬菌斑获得，然后直接加入到 PCR 混合液中，这时 PCR 混合液中含有除了未加热稳定 DNA 聚合酶外的所有试剂，其中引物与所要鉴定的已克隆 DNA
DNA片段的胶回收方法和注意事项
DNA片段的胶回收方法电泳洗脱法低熔点琼脂糖凝胶电泳挖块法冻融回收法玻璃奶回收法柱回收法胶回收注意事项将电泳槽用ddH2O反复清洗干净，倒入新鲜配制的灭菌电泳缓冲液；根据点样量制备合适厚度的琼脂糖凝胶板；切胶时尽可能切掉不含DNA片段的凝胶；要尽量减少DNA在紫外下的照射时间以减少对DNA的损伤；熔
DNA片段的胶回收方法和注意事项
DNA片段的胶回收方法电泳洗脱法低熔点琼脂糖凝胶电泳挖块法冻融回收法玻璃奶回收法柱回收法胶回收注意事项将电泳槽用ddH2O反复清洗干净，倒入新鲜配制的灭菌电泳缓冲液；根据点样量制备合适厚度的琼脂糖凝胶板；切胶时尽可能切掉不含DNA片段的凝胶；要尽量减少DNA在紫外下的照射时间以减少对DNA的损伤；熔
聚合酶链式反应（PCR）扩增DNA片段
一、实验目的1．学习PCR基因扩增的基本原理和操作方法。2．理解PCR基因扩增在分子生物实验技术中的重要性。3．了解引物设计的一般要求。二、实验原理多聚酶链式反应(Polymerase Chain Reaction, PCR )：原理类似于DNA的变性和复制过程，即在高温（93-95℃）下，待扩增的
DNA标记的扩增片段长度多态性介绍
AFLP是1995年荷兰科学家Zabeau和Vos等发展起来的一种检测DNA多态性的新方法，文章发表于Nucleic Acids Research。AFLP 是 RFLP 与PCR相结合的产物，其基本原理是先利用限制性内切酶水解基因组 DNA 产生不同大小的 DNA 片段，再使双链人工接头的酶切
从琼脂糖凝胶（Agaros－gel）中回收DNA片段
实验原理限制性内切酶切割后的DNA片断经过电泳后，按分子量大小被分开，排列在琼脂糖凝胶中，可以将特定的某条DNA带所在的凝胶切下来，加热或用特殊的试剂熔解凝胶，使DNA溶回到溶液中，再经过乙醇沉淀或过柱即可获得目的 DNA酶切片段。实验试剂1. 电泳缓冲液2. 荧光染料3. 电泳级琼脂糖粉4. 10
破解人脑独特性的关键DNA片段发现
究竟是什么让人脑与众不同？美国加州大学圣迭戈分校研究团队发现了一个名为HAR123的小型DNA片段，这将是解开人类大脑独特性之谜的关键。相关研究成果发表于新一期《科学进展》杂志。 最新研究表明，HAR123并非普通基因，而是一个精妙的“大脑发育调控器”。它就像一位经验丰富的指挥家，精确指导脑细
从琼脂糖凝胶(Agaros－gel)中回收DNA片段
实验概要学会从琼脂糖凝胶中回收DNA片段的基本技术。实验原理限制性内切酶切割后的DNA片断经过电泳后，按分子量大小被分开，排列在琼脂糖凝胶中，可以将特定的某条DNA带所在的凝胶切下来，加热或用特殊的试剂熔解凝胶，使DNA溶回到溶液中，再经过乙醇沉淀或过柱即可获得目的 DNA酶切片段。主要试剂1. 电
外源DNA片段在质粒载体中的克隆实验
NA重组技术包括载体及外源DNA片段的酶切消化、目的片段的获得及纯化、目的片段与克隆载体的体外连接、重组子的筛选和鉴定等内容。主要用于（1）外源性基因转染；（2）对外源性基因的转化分离。实验方法原理限制性内切酶可识别特定位点并切割DNA产生粘性末端或平端的外源片段，经DNA的纯化处理后用于连接反应；
外源DNA片段在质粒载体中的克隆实验
克隆法 实验方法原理 限制性内切酶可识别特定位点并切割DNA产生粘性末端或平端的外源片段，经DNA的纯化处理后用于连接反应；选择克隆载体pUC18多克隆位点上
克隆在原核载体的DNA片段的快速鉴定
实验方法原理 已转化的重组载体的细菌细胞或 λ 噬菌体颗粒可通过直接从培养皿上挑取菌落或噬菌斑获得，然后直接加入到 PCR 混合液中，这时 PCR 混合液中含有除了未加热稳定 DNA 聚合酶外的所有试剂，其中引物与所要鉴定的已克隆 DNA 片段的侧翼序列互补。实验材料 热稳定 DNA 聚合酶正义和反