Cell封面：非洲狩猎者的全基因组
在非洲人类的多样性远胜过世界上任何其他的地方。不同的食物来源、地理、疾病和气候为自然选择提供了许多的目标，对非洲人施加强大的压力以改变和适应当地的环境。适应最好的个体最有可能复制和传递他们的基因组给后代。 遗传的历史就书写在现代非洲人的DNA中，但还需要一些调查工作来对其进行注释。在即将出现在8月3号《细胞》(Cell)杂志封面上的一篇报道中，宾夕法尼亚大学的遗传学家们和他们的同事对分属三个不同狩猎者(hunter-gatherer)群体的15个非洲人的完全测序基因组进行了分析，并破解了一些必定涉及人类多样性和进化的遗传密码的信息。 领导这一研究的是任职于宾夕法尼亚大学艺术与科学学院生物系和佩雷尔曼医学院遗传系的Sarah Tishkoff教授。 该研究讲述了几个故事。它鉴别了从前在人类中未知的数百万个遗传突变。它发现的证据表明现代人类的直系祖先有可能与未知古人类祖先群的成员发生了交配。它表明了不同的群体明......阅读全文
有史以来最大人类家谱建成
科技日报北京2月24日电 （记者张梦然）英国牛津大学大数据研究所研究人员在绘制人类之间的全部遗传关系图方面迈出了重要的一步：一个单一的家谱，可追溯我们所有人的祖先。该研究24日发表在《科学》杂志上。这个人类遗传多样性的新家谱网络，以前所未有的细节揭示了世界各地的个体如何相互关联。该研究预测了人类共同
有史以来最大人类家谱建成
科技日报北京2月24日电 （记者张梦然）英国牛津大学大数据研究所研究人员在绘制人类之间的全部遗传关系图方面迈出了重要的一步：一个单一的家谱，可追溯我们所有人的祖先。该研究24日发表在《科学》杂志上。这个人类遗传多样性的新家谱网络，以前所未有的细节揭示了世界各地的个体如何相互关联。该研究预测了人类共同
动物全物种基因组测序仍有很大空白
近日，美国华盛顿州立大学领导的一项研究发现，目前对动物基因组进行的测序多数集中在与人类相似的动物上，研究人员警告称，该现状可能会忽视大量的生物多样性和机会。相关研究结果发表于美国《国家科学院院刊》。 研究人员分析发现，近3300种动物的基因组已被测序。虽然动物物种测序工作一直在进行，但与世界
研究团队揭示海洋无脊椎动物RNA病毒的遗传多样性
5月6日，《中国科学：生命科学》（SCIENCE CHINA Life Sciences）在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所研究员崔杰课题组题为Virome in Marine Ecosystems Reveal Remarkable Invertebrate RNA virus Divers
抗疟药物耐药性成隐忧
在针对整个非洲大陆的首个疟原虫基因组研究中，来自赞比亚、加纳、肯尼亚、美国、英国、埃塞俄比亚、马达加斯加、坦桑尼亚、喀麦隆、德国、科特迪瓦、加蓬、尼日利亚和马里的研究人员发现了栖息在这个大陆不同地区的恶性疟原虫的遗传特征，包括赋予抗疟疾药物耐药性的遗传因子。这揭示了耐药性在不同地区出现以及通过非
最新发现：华南虎后代仍保持适度遗传多样性
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498794.shtm4月18日，《BMC生物学》（BMC Biology）上发表的一项研究发现，虽然华南虎已在野外灭绝，但其圈养后代仍保持着适度水平的遗传多样性。这项研究揭示出，未来在华南虎繁育中，有望借
GenomeBiology发布基因组测序重要成果
Genome Biology杂志发布了远东豹（Far Eastern Amur leopard）的首个全基因组序列，为人们揭示了肉食对基因多样性和种群规模的影响。“我们将远东豹基因组与其它哺乳动物基因组进行比较，发现肉食似乎是很强的选择压力。这种现象在杂食动物和食草动物中并不明显。举例来说，牛吃肉对
中澳科学家对高粱进行全基因组测序分析
由澳大利亚昆士兰大学、华大基因等单位的科学家对高粱进行了全基因组测序及分析，发现高粱基因组中存在大量的遗传变异，为高粱及其它粮食作物的育种改良提供了宝贵的遗传资源。8月28日，最新研究结果在《自然·通讯》杂志上发表。 中澳两国的科学家通过对44株不同来源的高粱样本，包括地方品种、改良品种和
开放染色质决定玉米多样性特征
美国研究人员最近发现，仅占玉米基因组1％左右的开放染色质，决定着将近一半的玉米多样性特征。这一发现使科学家能够更容易地开展转基因玉米研究，开发出更耐旱或更高产的玉米品种，从而缓解人类面临的粮食压力。相关研究成果发表在《美国国家科学院院刊》上。 大多数基因组中的DNA链都紧紧盘绕在细胞核内，如果
CRISPR序列帮助理解噬菌体宿主相互作用的演变历史
近日，一项刊登在国际杂志The ISME Journal上的研究报告中，来自美国能源部联合基因组研究所的研究人员利用来自北加州铁山公司的宏基因组数据库和专门的工具，在CRISPRs的帮助下成功地在生态系统研究中将宿主和噬菌体进行了连接。未经培养的微生物和其噬菌体之间的相互作用可以影响局部生态系统
中国科学家PNAS发布辣椒全基因组测序
辣椒(Capsicum annuum)是一种重要的经济作物，它在满足人们口腹之欲的同时，还是世界上广为使用的药物。辣椒富含维生素和营养，可以用来生产许多药物、天然染色剂和化妆品。 为了更好的理解辣椒属的进化、驯化和特化，四川农业大学玉米研究所、遵义农科院辣椒研究所、华南农业大学园艺学院
美培育遗传多样性新型实验鼠
据《自然》网络版近日消息，具有遗传多样性的新型实验鼠品种即将培育成功。 科学家们曾花费近一个世纪的时间才完成对第一批实验鼠的饲养。早期实验鼠只携带部分野生老鼠遗传多样性片段，如今实验鼠的品种已达成百上千种，但它们具备人类遗传特征的性状却非常少，对引发人类疾病基因的研究有很大局限性。为改变这
Nature子刊：新测序技术揭示细菌多样性
斯坦福大学的研究人员首次将一种新测序技术用于人类肠道微生物组，揭示了惊人的细菌多样性。这项研究发表在十二月十四日的Nature Biotechnology杂志上。 “这些细菌在遗传学上比我们想象的更加多样化，”文章资深作者Michael Snyder教授说。人类个体之间只有千分之一的基因组序列
父母年龄越大－子女自发性遗传突变发生率越高
英国《自然》杂志近日在线发表的一篇遗传学论文，报告了迄今为止最大规模的人类自发性基因突变研究。该研究同时显示，父母年龄越大，尤其是父亲年龄越大，子女的自发性遗传突变（DNM）发生率越高。这项对人类基因组序列多样性突变过程的分析，对未来医学研究至关重要。 基因突变可以是自发的，也可以是诱发的，这
最新研究告诉你－癌症个性化治疗的必要性
最近，一个西奈山医学院伊坎研究所的试点项目结果显示在许多临床实验室中，多维的个性化基因组分析对于病人的治疗来说比特定基因的筛查面板更加有效。该西奈山科研团队的科学家们使用了一套完整的基因组分析方法完成了其个性化癌症治疗技术的开发与测试。 随着NGS技术运行成本的逐渐降低，临床实验室快速配备了针
从“人畜共患病项目”看人类基因组的独特之美
从两克重的大黄蜂蝙蝠（世界上最小的哺乳动物）到重达数吨的鲸鱼，包括人类在内的地球上6000多种哺乳动物差异很大。在过去的1亿年里，它们几乎适应了地球上的每一个环境。现在，“人畜共患病项目”已对现存240种哺乳动物的基因组多样性进行了编目。项目团队在最新一期《科学》杂志特刊上发表的11篇论文，可帮
Science：揭示两栖动物真菌杀手很可能起源自东亚地区
一种致命性的称为蛙壶菌（Batrachochytrium dendrobatidis, Bd）的真菌长期以来就被认为是导致几大洲的青蛙、蟾蜍、蝾螈和其他的两栖类动物种减少和灭绝的原因。蛙壶菌分布在世界各地，但是迄今为止人们还不清楚这种病原菌最初出现在哪里。这种真菌会引起一种叫做壶菌病（chytr
Nature扩展教科书，基因功能研究的新层面
就像一个管弦乐队中的音乐家们，他们拥有相同的乐谱，却在不同的间隔时间内开始和结束演奏。细胞也拥有相同的基因，却在基因组中的不同位点启动和完成对它们的转录。来自欧洲分子生物学实验室(EMBL)的研究人员，第一次描述了由于这样的起点和终点变化所导致的信使RNAs (mRNAs)惊人的多样性。他们
科学家发表苔藓多样性、系统发育和适应性综述
近日，中国科学院植物研究所科研人员与合作者在《实验植物学杂志》上发表了基于基因组和转录组数据针对苔藓植物的多样性、系统发育和适应性研究的综述，该综述对目前已经发布的14个苔藓植物的基因组和151个苔藓植物的转录组进行了总结和梳理。 苔藓植物包括苔、藓和角苔三大分支，是现存最早的陆生植物，为
中科院通过研究发现高剂量放化疗对肿瘤或起反作用
科技日报讯 （记者王怡）为迅速清除肿瘤细胞，医学界通常采用化疗、放疗等杀伤性较强的治疗方法。近日，中国科学院北京基因组研究所与芝加哥大学合作，通过对肝癌的蜂窝式取样和深度基因测序的数据分析发现，肿瘤细胞群体内部的遗传多样性水平远远大于预期。这表明以身体最大承受力为基准的高剂量放化疗，不但会失
中科院通过研究发现高剂量放化疗对肿瘤或起反作用
为迅速清除肿瘤细胞，医学界通常采用化疗、放疗等杀伤性较强的治疗方法。近日，中国科学院北京基因组研究所与芝加哥大学合作，通过对肝癌的蜂窝式取样和深度基因测序的数据分析发现，肿瘤细胞群体内部的遗传多样性水平远远大于预期。这表明以身体最大承受力为基准的高剂量放化疗，不但会失效，甚至会助长抗性克隆的膨胀
中科院通过研究发现高剂量放化疗对肿瘤或起反作用
为迅速清除肿瘤细胞，医学界通常采用化疗、放疗等杀伤性较强的治疗方法。近日，中国科学院北京基因组研究所与芝加哥大学合作，通过对肝癌的蜂窝式取样和深度基因测序的数据分析发现，肿瘤细胞群体内部的遗传多样性水平远远大于预期。这表明以身体最大承受力为基准的高剂量放化疗，不但会失效，甚至会助长抗性克隆的膨胀
科学家解析百余“神奇蘑菇”基因组以培育新品种
科学家收集了几十种“神奇蘑菇”的基因组数据，以了解驯化和培养是如何改变它们的，从而培育新品种蘑菇。相关研究近日发表于《当代生物学》。 裸盖菇的商业品种缺乏遗传多样性，因为它们被驯化为人类使用。而澳大利亚自然蘑菇种群保持了更多的多样性，包括控制蘑菇活性成分裸盖菇素生产的独特基因变异。 “令人惊
PNAS：sRNA测序揭示杂种优势之谜
Illinois大学的功能基因组学副教授Steve Moose及其团队发现了玉米杂种优势的新因素，即20至25个核苷酸长的双链小RNA分子sRNA。文章发表在6月26日的Proceedings of the National Academy of Science杂志上。 “杂种优势
Cell：迄今最大规模HPV16全基因组研究找到保守致癌蛋白
人类乳头瘤病毒HPV16在所有宫颈癌中约占一半，但9月7日在Cell上报道的研究人员发现，并非所有的感染都是平均的。5570例人类细胞和组织样本的HPV16基因组分析显示，该病毒实际上是由成千上万的独特基因组组成，这使得生活在同一地区的感染妇女有不同的HPV16序列和癌症风险。癌前病变或患癌的女
Cell封面：非洲狩猎者的全基因组
在非洲人类的多样性远胜过世界上任何其他的地方。不同的食物来源、地理、疾病和气候为自然选择提供了许多的目标，对非洲人施加强大的压力以改变和适应当地的环境。适应最好的个体最有可能复制和传递他们的基因组给后代。 遗传的历史就书写在现代非洲人的DNA中，但还需要一些调查工作来对其进行注释。在即将出
Nature发布颠覆性成果：近亲婚配会影响什么？
一项重要的国际研究发现，由来自不同遗传背景的父母所生的孩子往往会比其他人更高，且具有更敏锐的思考能力。相关的研究论文发布在7月1日的《自然》(Nature)杂志上。 研究人员分析了来自世界各地100多项研究的健康和遗传信息。其中包括来自城市和乡村35万多人的详细资料。 研究小组发现，更大的遗
研究揭示冰清绢蝶基因组进化与群体演化历史
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514612.shtm生物进化和地球环境演变之间的关系，特别是生物进化和环境适应的分子生物学机制是地球-生命系统研究领域的核心科学问题。近日，安徽师范大学生命科学学院教授郝家胜课题组与中国科学院南京地质古
中国学者连发PNAS等两篇文章－解析病毒基因
来自中国疾病预防控制中心，澳大利亚悉尼大学等处的研究人员发表了题为“A tick-borne segmented RNA virus contains genome segments derived from unsegmented viral ancestors ”的文章，发现了第一个
农科院研究揭示水稻全基因组功能单倍型自然变异特征
近日，中国农业科学院作物科学研究所（以下简称作科所）水稻分子设计技术与应用创新团队构建了一个全基因组基因功能单倍型（gcHap）数据集，全面揭示了亚洲栽培稻基因功能单倍型自然变异特征，提出亚洲栽培稻多起源（驯化）假说，并开发了适用于功能单倍型数据全基因组关联分析和全基因组预测的软件包“HAPS”