Cell封面：非洲狩猎者的全基因组
在非洲人类的多样性远胜过世界上任何其他的地方。不同的食物来源、地理、疾病和气候为自然选择提供了许多的目标，对非洲人施加强大的压力以改变和适应当地的环境。适应最好的个体最有可能复制和传递他们的基因组给后代。 遗传的历史就书写在现代非洲人的DNA中，但还需要一些调查工作来对其进行注释。在即将出现在8月3号《细胞》(Cell)杂志封面上的一篇报道中，宾夕法尼亚大学的遗传学家们和他们的同事对分属三个不同狩猎者(hunter-gatherer)群体的15个非洲人的完全测序基因组进行了分析，并破解了一些必定涉及人类多样性和进化的遗传密码的信息。 领导这一研究的是任职于宾夕法尼亚大学艺术与科学学院生物系和佩雷尔曼医学院遗传系的Sarah Tishkoff教授。 该研究讲述了几个故事。它鉴别了从前在人类中未知的数百万个遗传突变。它发现的证据表明现代人类的直系祖先有可能与未知古人类祖先群的成员发生了交配。它表明了不同的群体明......阅读全文
Science发表超深度线粒体RNA测序
蒙特利尔大学的一项新研究显示，线粒体遗传物质在个体内和个体间具有显著的多样性，而线粒体RNA上的修饰影响着我们每个人的身体健康。 线粒体基因组中的突变与多种疾病和生物学过程有关，然而此前人们还不了解线粒体转录组中的序列多样性。这项研究通过超深度线粒体RNA测序，首次为人们展示了线粒体RNA
《自然—植物》报道鹅掌楸演化“密码”被破译
12月18日，《自然—植物》在线发表了南京林业大学教授施季森团队最新研究成果，再次证明生物学教科书上关于木兰类植物“古老身份”的论断——以鹅掌楸为代表的木兰类植物的确形成于单、双子叶植物分化之前。该研究首次完成了木兰类物种中国鹅掌楸的基因组组装，从全基因组水平解析了被子植物的系统演化，确定了木兰
澳大利亚土著是地球上基因最独特的群体
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514548.shtm根据12月13日发表于《自然》上的两项研究，澳大利亚北部和中部地区的土著是地球上基因最独特的群体，他们的基因变异率很高，仅次于非洲人。 ?澳大利亚土著在观看足球比赛 图片
Nature－Genetics：遗传学说你其实更像你老爸
你可能相貌或者行为举止很像你的母亲，不过美国University of North Carolina Health Care（UNC）的研究人员最新调查表明，哺乳动物的基因更像他们的父亲。虽然我们继承了来自父母的等量基因突变，实际上我们“使用”地更多的是从父亲那里继承来的DNA。这篇研究发表在杂
宏基因组测序帮助科学家增加12倍海洋病毒种类
你知道吗？当你在海里游泳时吞下一口海水，就可能吞下了数以亿计的病毒。 尽管海洋中的病毒数量惊人，并且在自然界的碳循环等过程中发挥着关键作用，但自海洋病毒首次被发现以来的几十年里，科学家仍然对其多样性及遗传信息知之甚少。近年来，随着基因组学技术的进步，科学家开始着手分析海洋病毒的功能与多样性，特
近期最热门的基因组测序成果
生物通报道：The scientist杂志对近期最热门的一些基因组测序成果进行了盘点，包括濒临灭绝的几维鸟和极其聪明的章鱼。 种属：甜瓜（Cucumis melo） 西班牙和意大利的研究团队在Molecular Biology and Evolution杂志上率先发布了七个甜瓜品种的基因组分
叶绿体基因组树优化森林大样地群落构建获揭示
群落构建是生态学家广泛关注的核心问题之一。1月2日，记者从中国科学院华南植物园获悉，该园分子生态学团队及其合作者，基于中国森林监测网络（CForBio）平台，揭示了叶绿体基因组树优化我国森林大样地群落构建认知。相关研究发表于《分子生态资源》。 据悉，系统发育群落生
叶绿体基因组树优化森林大样地群落构建获揭示
群落构建是生态学家广泛关注的核心问题之一。1月2日，记者从中国科学院华南植物园获悉，该园分子生态学团队及其合作者，基于中国森林监测网络（CForBio）平台，揭示了叶绿体基因组树优化我国森林大样地群落构建认知。相关研究发表于《分子生态资源》。 据悉，系统发育群落生
研究揭示海洋无脊椎动物RNA病毒的遗传多样性
《中国科学：生命科学》（SCIENCE CHINA Life Sciences）在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所研究员崔杰课题组题为Virome in Marine Ecosystems Reveal Remarkable Invertebrate RNA virus Diversity的研
基因组所与昆明动物所在家犬起源进化研究中取得新进展
5月14日，中科院北京基因组研究所与中科院昆明动物研究所在家犬起源进化合作研究中取得重要进展，相关论文在最新一期《自然·通讯》在线发表。该研究成果从全基因组层面上阐述了狗的起源进化，并首次将其进化历史和人类的近期演化联系了起来。 在昆明动物所张亚平教授和基因组所吴仲义教授的带领下，昆明动物
全基因组测序揭示喀斯特植物适应性进化机制
中国南方喀斯特起源古老、分布广泛，被认为是生态与进化研究的“天然实验室”。中国科学院华南植物园研究员康明团队等完成了首个喀斯特植物怀集报春苣苔的全基因组测序。相关研究近日在线发表于《新植物学家》。 喀斯特植物是我国植物多样性和特有性的重要组成部分，但迄今为止对喀斯特植物的多样性起源和适应性进
Nature解析癌症遗传多样性
正如没有任何两个人具有相同的遗传构成一样，最近的一项研究表明乳腺癌患者中没有任何两个单一的肿瘤细胞具有相同的基因组。 由德克萨斯大学M.D.安德森癌症中心遗传学系助理教授Nicholas Navin领导的这项研究发现对于乳腺癌的诊断和治疗或许会产生重要的影响。 这一研究还有可能帮助对抗乳腺癌
PNAS：老病毒诉说新故事
逆转录病毒是一类能够跨越物种障碍感染新宿主的重要病毒，但目前对于它们的进化史所知有限。通过绘制内源性逆转录病毒(ERVs，这类逆转录病毒的基因成为了宿主生物体基因组的组成部分)的图谱，瑞典乌普拉萨大学的研究人员现在提供了一些关于逆转录病毒和它们的宿主之间进化关系的独特认识。这些研究结果发表在《美
“人类泛基因组项目”将极大促进疾病防治
科技日报北京4月21日电 （记者刘霞）一个国际科学家联盟在20日出版的《自然》杂志上发表论文称，十多家研究机构正在合作开展“人类泛基因组项目”，该项目旨在创建一个囊括全球各人种遗传多样性的参考基因组。研究人员表示，“这是人类遗传学的未来”，有望应用于疾病预防与治疗等多领域。这项工作由美国国家人类基因
粤籼稻种质资源遗传多样性和育种选择基因获鉴定
近日，广东省农业科学院水稻研究所遗传资源研究团队利用广东籼稻核心种质开展基因组多样性和基因发掘工作，在鉴定广东籼稻种质资源遗传多样性和育种选择基因方面取得新进展。相关研究论文发表于Rice。该研究分析了广东籼稻农家品种和育成品种改良历程中的遗传多样性并鉴定了潜在受育种人工选择的产量、抽穗期、品质等性
我国主导水稻基因国际研究离“设计水稻”更近一步
记者日前从中国农业科学院获悉，由中国科学家主导的“3010份水稻基因组计划”结出硕果，剖析了水稻核心种质资源的基因组遗传多样性，这一研究的重大成果将提升全球水稻基因组研究和分子育种水平，加快优质、广适、绿色、高产水稻新品种培育。 水稻种群的基因有着丰富的多样性和复杂的作用机制，是水稻育种改良的
全基因组检测揭示定安猪纯合片段及肉质性状相关候选基因
定安猪是我国海南地区的特色猪种，以其肉质优良、抗病力强、繁殖性能高和适应性好而闻名。然而，近年来商业化猪种的普及和非洲猪瘟的肆虐，让定安猪的养殖规模不断缩小，面临着严重的种群衰退危机。如果任由这种情况发展，定安猪独特的优良基因资源可能会逐渐消失，不仅会影响地方特色农业的发展，也会使我们失去一笔宝贵的
Genome－Res：全基因组测序追踪耐药细菌传播机制
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）是一种常见的引发院内感染的致病菌，其也是资源不足医院感染的一大负担，此前当资源较好的临床机构运用全基因组测序来追踪MRSA的扩散时，针对有限的感染控制的传播动力学常常并不清楚，近日，来自剑桥大学的研究人员就利用全基因组测序的技术揭示了高传播率的资源受限医院中M
物种多样性与遗传多样性关系研究取得新进展
11月22日，国际权威植物学期刊New Phytologist在线刊出了中科院武汉植物园在物种多样性与遗传多样性关系研究领域的最新成果（Contrasting relationships between species diversity and genetic diversity
如何利用多样性指数评估苔藓物种多样性的恢复速度？
以下是利用多样性指数评估苔藓物种多样性恢复速度的一般步骤：选择合适的多样性指数常见的用于评估物种多样性的指数包括香农 - 威纳指数（Shannon-Wiener Index）、辛普森指数（Simpson Index）、皮卢均匀度指数（Pielou's Evenness Index）等。香农
RFLP（扩增片段长度多样性）研究遗传多样性的介绍
基于RFLP（限制性酶切片段多样性） 和PCR技术发展起来的一种用来研究分类的技术.原理是：不同物种的DNA序列不同，那么用同种限制性内切酶酶切会得到不同的片段，这些不同的片段中，有很多长度也会有不同.通过同样两种限制性内切酶消化后，根据酶切位点序列设计互补序列并额外添加一段特异性序列，用T4连
如何利用多样性指数评估苔藓物种多样性的恢复速度？
以下是利用多样性指数评估苔藓物种多样性恢复速度的一般步骤：选择合适的多样性指数常见的用于评估物种多样性的指数包括香农 - 威纳指数（Shannon-Wiener Index）、辛普森指数（Simpson Index）、皮卢均匀度指数（Pielou's Evenness Index）等。香农
Nature－Genetics－|－中国农大等单位合作通过泛基因组分析揭示苹果属（Malus）的进化与多样性
近日，Nature Genetics在线发表中国农业大学等团队合作的题为“Pan-genome analysis reveals the evolution and diversity of Malus”的研究论文，该论文首次对30个苹果属物种（涵盖二倍体与多倍体）进行高质量基因组测序与组装，构
研究揭示公共场所抗生素耐药性与人体健康风险
近日，华南师范大学环境学院教授应光国团队的抗生素耐药性研究小组白红、何良英、高方舟等人研究揭示了新冠流行期间火车站空气抗生素耐药性与人体健康风险。相关研究发表于Environment International。该研究旨在提高“后疫情时代”人们对抗生素耐药性的警惕性，增强对公共场所空气生物污染的意识
Science：15万数据汇总！科学家绘制出人类基因组新图谱
众所周知，世界上没有两个完全相同的有机体，每个人都是独一无二的，而造成人类DNA多样性的机制有两种：基因重组和新突变，或新的非遗传基因变异。随着利用全基因组序列数据开发的新基因图谱，安进基因研究子公司deCODE Genetics的科学家们发现了这两个过程的模式，为未来的医学研究提供了新的见解
Cell惊人发现：DNA复制方案因人而异
人类细胞每次分裂的时候，都得复制六十亿DNA碱基，一个一个来显然是不现实的。事实上，DNA复制机器会同时介入多个起始点，进行分工合作。 哈佛大学医学院、Broad研究所和MIT的科学家们发现，人与人之间的DNA复制方案并不相同。他们鉴定了首个调控DNA复制时序（Replication timi
Science发表基因组研究重要成果
科学家们日前发现，人类基因组的遗传学差异主要来自于拷贝数变异（CNV）。在此之前人们对CNV的了解并不多，因为CNV一直是基因组测序的一大挑战。 华盛顿大学的遗传学家Evan Eichler领导研究团队克服了这一困难。他们对来自全球125个族群的人进行了深度基因组测序，全面分析了基因组中的SN
德国助力测序受忽视生物体
近日，德国的一个州为那些希望解密那些不太受关注的生物体基因的生物学家提供了一个大帮助。黑森州日前宣布为当地研究机构提供1760万欧元经费。这个为期7年的项目前一半将主要测序植物、动物和真菌。该项目还包括高通量测序约700种生物体，以及部分或重新测序数千种生物。 “德国科学家正在向了解生命的基因
大型海豚DNA研究
弗林德斯大学的综合研究呼吁更多的保护和政策努力来保存适应性DNA多样性，并协助这些海豚群体之间的连接。这将支持长期的基因流动和适应不断变化的栖息地——包括受气候变化和人类企业影响的海洋条件。弗林德斯大学的研究人员安Andrea Barceló——该研究的第一作者，刚刚发表在BMC Ecology a
Sci－Rep提出令人惊讶的新观点：鸟枪法测序的重大缺陷
研究人员指出，通常被认为是优选技术的鸟枪测序方法可能存在重大缺陷，在进行宏基因组分析中会大大低估环境中的多样性。 美国自然历史博物馆（AMNH）的一组研究人员发现，通常用于宏基因组学分析的两种测序方法在进行了解相对较少的微生物群落序列分析时，会出现不同的结果。这项研究表明一般被认为是表征微生物