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SELDI蛋白质纯化鉴定

实验目标针对血清、血浆、体液、组织、真菌、细菌、细胞培养物以及植物等样本的差异蛋白质组研究,以蛋白质芯片为载体,通过对目标疾病样本组及对照组之间进行鉴定,以期找到能够区分不同组别的差异峰,并通过对差异峰进行蛋白质鉴定找到与目标疾病密切关联的基因/蛋白。 实施方案 一、目标蛋白1.利用SELDI-TOF-MS蛋白芯片系统寻找出蛋白表达谱中有意义的差异蛋白。2.筛选符合p<0.05为统计学有显著性差异蛋白或由BPS聚类软件计算得出的诊断模型组成蛋白。二、目标蛋白的分离纯化1.利用白蛋白/IgG去除试剂盒去除样本中高丰度蛋白。2.利用分子筛K30-100去除样本中的分子量大于30-100Kda的蛋白。3.利用与先前SELDI蛋白表达谱所用的蛋白质芯片相一致的纳米磁珠吸附包含目标蛋白在内的一类蛋白(如SELDI表达谱所用WCX2芯片则选用WCX磁珠)。4.蛋白浓缩......阅读全文

蛋白质组学概念的起源和发展

  蛋白质组学的诞生和发展,离不开多学科和技术的逐渐交叉融合。这些学科技术包括(但不限于)基因组学、生物化学、分析化学、自动化、基于电磁场的精密质谱仪、信号处理、数理统计和计算机科学。近年来,分子医学、大数据技术和人工智能的发展,进一步加速推动了蛋白质组学的成长,使之在精准医疗领域展示出越来越大的应

蛋白质微阵列技术

微阵列技术在单个实验中能同时分析数千个参数。捕获分子微点在固体支持物上固定成行列并暴露在含相应结合分子的样品中。基于荧光、化学发光、质谱、放射性或电化学的读出系统能检测每个微点形成的复合物。这些微小化和平行的结合分析高度灵敏,方法的分析能力又能被微阵列基因表达分析所放大。在这些系统中,检测固定的DN

蛋白质谱分析方法特点及其在蛋白组学研究领域中的应用

褚福亮,王福生, 中国人民解放军第302医院全军艾滋病与病毒性肝炎重点实验室 北京市 100039项目负责人 王福生, 100039 ,北京市丰台路26号, 中国人民解放军第302医院全军艾滋病与病毒性肝炎重点实验室. fswang@public.b

赛尔迪(SELDI)蛋白指纹技术的临床应用与前景

  蛋白质组学(Proteomics)是近年来生物学领域中发展起来的一门新兴学科,它是研究蛋白质的起源、特征、表达功能以及它与生命发生、发展关系等的一门学科。在医学领域中,通过对蛋白质组学的研究,对了解人类生命的起源、疾病的发生发展规律、疾病的诊断与治疗以及疾病的预防有着重要的意义。随着该

赛尔迪(SELDI)蛋白指纹技术的临床应用与前景

蛋白质组学(Proteomics)是近年来生物学领域中发展起来的一门新兴学科,它是研究蛋白质的起源、特征、表达功能以及它与生命发生、发展关系等的一门学科。在医学领域中,通过对蛋白质组学的研究,对了解人类生命的起源、疾病的发生发展规律、疾病的诊断与治疗以及疾病的预防有着重要的意义。随着该学科的迅速发展

SELDI蛋白芯片技术在肿瘤早期诊断中研究进展

人类基因组序列草图完成后,生命科学进入了“后基因组时代”,研究的重点转向了对复杂的蛋白质功能的研究。蛋白质是基因表达的最终产物,器官组织的生理状态变化会引起血清蛋白质组的改变,因此对蛋白质和蛋白质组学进行研究可以直接获取疾病的特征性标志。由于人血清是一个蛋白质相当丰富并不断变化的系统,单一的血清肿瘤

第二届质谱论坛:质谱在生物医药中的应用

  质谱论坛学术报告 赛默飞世尔科技色谱质谱部应用工程师 刘婷   来自赛默飞世尔科技的应用工程师刘婷 为大家作了题为《高分辨质谱提高代谢物鉴定的数量和可靠性》的报告。   代谢

植物蛋白质组学和糖基化实验

实验材料链霉亲和素-过氧化物酶                                       &

植物蛋白质组学和糖基化实验2

3. 糖基释放后的蛋白质分析1 ) 糖基释放的化学处理方法还原性氨化反可应选择性的解离糖蛋白上的 O-糖苷(见注释 10) 。去糖基化的蛋白用 1D SDS-PAGE 分析,将其迁移情况与其糖基化形式的蛋白进行比较,电泳迁移率的增加是 O-连糖苷出现在蛋白上的证据(见注释 11)。( 1 ) 将 1

包涵体的纯化和复性总结

关于包涵体的纯化是一个令人头疼的问题,包涵体的复性已经成为生物制药的瓶颈,关于包涵体的处理一般包括这么几步:菌体的破碎、包涵体的洗涤、溶解、复性以及纯化,内容比较庞杂 一、菌体的裂解 1、怎样裂解细菌?  细胞的破碎方法  1.高速组织捣碎

核酸分离与纯化的设计与原则

细胞内的核酸包括DNA与RNA两种分子,均与蛋白质结合成核蛋白(nucleoprotein)。DNA与蛋白质结合成脱氧核糖核蛋白(deoxyribonucleoprotein,DNP),RNA与蛋白质结合成核糖核蛋白(ribonucleoprotein,RNP)。其中真核生物的DNA又有染色体DNA

多肽物质分离与分析方法研究进展

  摘 要 综述了近几年来多肽类物质的提取分离与分析方法,主要包括高效液相色法、电泳、质谱及核磁共振等方法在肽类物质研究中的最新应用进展。  多肽类化合物广泛存在于自然界中,其中对具有一定生物活性的多肽的研究,一直是药物开发的一个主要方向。生物体内已知的活性多肽主要是从内分泌腺组织器官、分泌细胞和体

蛋白质、多肽提取分离

1 分离方法   采取何种分离纯化方法要由所提取的组织材料、所要提取物质的性质决定。对蛋白质、多肽提取分离常用的方法包括:盐析法、超滤法、凝胶过滤法、等电点沉淀法、离子交换层析、亲和层析、吸附层析、逆流分溶、酶解法等。这些方法常常组合到一起对特定的物质进行分离纯化,同时上述这些方法也是蛋白

蛋白质与多肽激素的放射免疫分析-2

(二)乳过氧化物酶法(LPO)  本法反应温和,对抗原、抗体免疫活性影响小,已被广泛应用。缺点是标记率较低,一般为20~40%。  1.原理此法是利用乳过氧化物酶(Lactoperoxidase)有促进微量过氧化氢对125I-的氧化作用,生成125I+,并标记在多肽、蛋白质酪氨酸分子上。  2.方法

赛默飞世尔科技:为蛋白质组学提供深层次解决方案

  定量蛋白试剂盒  在蛋白分析相关的试剂消耗品方面,Thermo Fisher Scientific都是直接在仪器上开发的。由于试剂和仪器时配套的,从而能够提高分析效率。例如细胞培养氨基酸稳定同位素标记技术(SILAC)和串联质谱标签(tandem mass tag)试剂盒。  细胞培养氨基酸稳定

包涵体的纯化-2

1.2.7重组融合蛋白的纯化 PrP-pET-32a(+)转化表达菌E.coli BL21(DE3),TB培养基中,25℃,AMP 200 ug/ml,摇床(250 r/min)培养至OD600约为1.5,更换等体积新鲜TB培养基,加入IPTG至终浓度1 mM,AMP 200 ug/ml,

包涵体的纯化和复性总结-2

8、包涵体复性液配方 对于包涵体复性,一般在尿素浓度4M左右时复性过程开始,到2M 左右时结束。对于盐酸胍而言,可以从4M开始,到1.5M 时复性过程已经结束。TRIS系统和PBS系统都没有明确的规定,这些需要你在实验过程中不断试验,确定合适的缓冲系统;不过复性过程主要

别人家的实验室:植物园里的逆境生物学研究中心

  ——走进上海中科院植物逆境生物学研究中心   分析测试百科网讯 中国科学院上海植物逆境生物学研究中心坐落于风景优美的上海辰山植物园内,由中央“千人计划”顶尖人才、美国科学院院士朱健康教授领衔,是在中国科学院、上海市和国家有关部委联合支持下,依托中国科学院上海生命科学研究院研究平台,与上

用于蛋白质表达和纯化的pET-32α(+)载体的构建

表达载体的构建是生物技术和所需蛋白质产生的基本工具,本文总结了pET-32α(+)载体技术的构建,该技术通常用于研究实验室。该方法包括获得用于构建载体的外源DNA片段,将DNA片段亚克隆到pET-32α(+)表达载体中,在大肠杆菌 BL21(DE3)中进行蛋白质表达以及在大肠杆菌中在天然条件下进

分子生物学常用实验技术(page 1)

第一章质粒DNA 的分离、纯化和鉴定 第二章DNA 酶切及凝胶电泳 第三章大肠杆菌感受态细胞的制备和转化 第四章RNA 的提取和cDNA 合成 第五章重组质粒的连接、转化及筛选 第六章基因组DNA 的提取 第七章RFLP 和RAPD 技术 第八章聚合酶链式反应(PCR)扩增和扩增产物克隆 第九章分

杆状病毒-昆虫细胞表达系统

实验步骤 一、杆状病毒表达载体 最简单的经典杆状病毒表达载体是一个重组的杆状病毒,其基因组含有一段外源核酸序列,通常为编码目标蛋白质的dDNA,在多角体蛋白启动子控制下进行转录。这个嵌合的基因由多角体蛋白启动子和外源蛋白编码序列组成

沃特世:同中国科学家深度合作共促糖组学创新

  分析测试百科网讯 如果说基因是生命的起点,那么糖蛋白的表现很大程度上就是研究生命功能的终点。人类蛋白中有50%以上都发生了糖基化的修饰,在病理和生理过程中糖蛋白发挥了至关重要的作用,在生物制药中最亮眼的单抗药100%都是糖蛋白药物。对糖蛋白和糖蛋白质组学的研究是贯穿生物制药、疾病与临床研究生生不

2010匹兹堡大会生命科学产品回顾

  2010匹兹堡大会共有16836位参会者,其中40%是参展商   2010年3月1日到3月4日,美国佛罗里达州奥兰多市举行了一年一度的“Pittcon 2010”大会,吸引了16836位参会者,其中约40%为参展商。与往年一样,这次大会推出了许多与生命科学研究应用领域相关的新产品新技术。  

包涵体的纯化-4

9、什么叫复性成功 复性效果的检测: 根据具体的蛋白性质和需要,可以从生化、免疫、物理性质等方面对蛋白质的复性效率进行检测。 1,凝胶电泳:一般可以用非变性的聚丙烯酰胺凝胶电泳可以检测变性和天然状态的蛋白质,或用非还原的聚丙烯酰胺电泳检测有二硫键的蛋白复性后二硫键的配对

多项仪器研发项目列入863计划和2014备选项目

  一、前沿生物技术主题  1.蛋白质测序新技术新装备及配套试剂国产化  (1)阵列毛细管柱蛋白质分离-阵列点样装置  研制二维阵列毛细管分离新装置,第一维分离柱可分离48个馏分,第二维维阵列毛细管分离柱可同时分离48个流份;开发阵列紫外检测器; 研制多柱点样头并行点样器和流份收集器;开发

应用末端截切、进化、再延长技术提高酶稳定性

应用末端截切、进化、再延长技术提高酶稳定性的方法             实验材料 质粒

核酸分离与纯化的设计与原则(二)

(四)核酸的浓缩、沉淀与洗涤随着核酸提取试剂的逐步加入,以及去除污染物过程中核酸分子不可避免的丢失,样品中核酸的浓度会逐渐下降,及至影响到后面的实验操作或不能满足后继研究与应用的需要时,需要对核酸进行浓缩。沉淀是核酸浓缩最常用的方法,其优点在于核酸沉淀后,可以很容易地改变溶解缓冲液和调整核酸溶液至所

细菌克隆的溶解实验

细菌克隆的溶解实验可以用于:(1)从表达特定融合蛋白质的重组噬菌体构建噬菌体溶源菌;(2)从该溶源菌诱导合成并纯化出融合的目的蛋白质。实验方法原理具有原噬菌体的细菌称为溶原性细菌。噬菌体分为烈性噬菌体和溶原性噬菌体,在感染于寄主细菌细胞时,前者往往在菌体内增殖并将菌体裂解。实验材料大肠杆菌噬菌体试剂

国家药监局印发食品安全检验机构技术装备等基本标准

关于印发餐饮服务食品安全检验机构技术装备基本标准和现场快速检测设备配备基本标准的通知 国食药监食[2011]130号 各省、自治区、直辖市及新疆生产建设兵团食品药品监督管理局:   为贯彻落实《食品安全法》、《食品安全法实施条例》以及《餐饮服务食品安全监督管理办法》,逐步建立

质谱沙龙第二十二期活动报道

  2009年8月29日下午,质谱沙龙第二十二期活动在第二炮兵总医院制剂楼举行。除了来自发酵研究院、二炮总医院、空军总医院、北大人民医院的老朋友外,还有来自中国农科院、PerkinElmer公司、北京伯奥克生物技术公司的新朋友。    第二十二期质谱沙龙活动现场     生物元素检