一维固相pH梯度等电聚焦(IEFwithIPG)——IPGIEFpH梯度的选择
实验材料胶条实验步骤对一新样品，常最先使用宽范围、线性PH3.5-10梯度 但对大多数样品，这样做会丧失 pH4-7 区域的分辦率，许多蛋白质的 pI 值在该区域。利用非线性 pH3.5-10 IPG IEF 胶在一定程度缓解这个问题。 PH3.5-10 非线性胶条在 pH4-7 区域的梯度要比 pH7-10 更为平坦，保证大部分碱性蛋白质都能得到分离的前提下， pH4-7 区域得到更好的分离（图 3.2) 但用 pH4-7 的 IPG IEF 胶则能在该范围得到更好的分离效果（图 J,J) 这些 pH 范围的胶条目前已经商品化, 实验室自制 pH4-9 的 IPG 胶也能覆盖来自许多不同种类样品的大多数蛋白质。这些梯度的 IPG 胶与加样杯上杆或胶内泡胀兼容，仕 Muhipho, 和 IPG phor系统都工作良好 均适用于分析胶（上样量 50-100μg) 或微量制备胶（上样量至 1mg ）典型运行条件如表 3.1 和 3.......阅读全文
一维固相pH梯度等电聚焦－(IEF－with－IPG)——IPG－IEF－pH－梯度的选择
实验材料胶条实验步骤对一新样品，常最先使用宽范围、线性PH3.5-10梯度 但对大多数样品，这样做会丧失 pH4-7 区域的分辦率，许多蛋白质的 pI 值在该区域。利用非线性 pH3.5-10 IPG IEF 胶在一定程度缓解这个问题。 PH3.5-10 非线性胶条在 pH4-7 区域的梯度要比 p
一维固相－pH－梯度等电聚焦－(IEF－with－IPG)
基本方案 胶条处理 加样 IPG IEF pH 梯度的选择 聚焦时间的优化 实验方法原理 IPG
一维固相－pH－梯度等电聚焦－(IEF－with－IPG)
实验方法原理 IPG IEF 胶用 Immobilines制备。 lmmobilines 是拥有 结构的8 种丙烯酰胺衍生物系列，其中 R 包含羧基或叔氨基团，它们构成了分布在 pH3-10 不同值的缓冲体系。根据公布的配方估算后，将适宜的 IPG 试剂添加至混合物中用于凝胶聚合，在聚合
一维固相－pH－梯度等电聚焦－(IEF－with－IPG)——加样
实验材料蛋白样品实验步骤样品通常是加在放置在 IPG 胶阳极区或阴极区的硅橡胶框内或特殊加样杯内（图3. lg, h), 对不同类型的样品，最好的加样位置由经验值确定。最初电压卫限制在150V 、 30min, 从而使尽队多的样品进入加样杯，然后逐渐增加电压至3500 V 。运行时间决定了几个不同的
一维固相－pH－梯度等电聚焦－(IEF－with－IPG)——胶条处理
实验材料胶条实验步骤用于2-DE 时，胶条应该散于重泡胀池（图 3, ld) 中在含 5mol/L 尿素的溶液（或2mol/L 硫脲和 5mol/L 尿素）中泡胀。溶液其成分为 0,5% 到 4% 非离子（NP-40,Triton X-100) 或两性 (CHAPS) 去污剂、 15mmol/LDT
一维固相－pH－梯度等电聚焦－(IEF－with－IPG)——基本方案
实验方法原理IPG IEF 胶用 Immobilines制备。 lmmobilines 是拥有 结构的8 种丙烯酰胺衍生物系列，其中 R 包含羧基或叔氨基团，它们构成了分布在 pH3-10 不同值的缓冲体系。根据公布的配方估算后，将适宜的 IPG 试剂添加至混合物中用于凝胶聚合，在聚合中，缓冲基团通
一维固相－pH－梯度等电聚焦－(IEF－with－IPG)——聚焦时间的优化
实验材料蛋白样品实验步骤理论上讲，要获得最好的图谱质量和重复性所需最佳时间是 IEF 分离达到稳定态所需的时间 。 若聚焦时间太短，会导致水平和垂直条纹，但要避免过度聚焦 。 虽然与经典 O'Farrell 法相比，不会导致蛋白质向阴极的迁移（阴极漂移），但却会因为活性水转运而导致过多水在
植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验（二）
2. 在平板仪器上进行 IPG-IEF ( Multiphor ll Unit)满足下列条件时，水化后的 IPG 胶条可以直接放在 IEF 仪器的冷却板上：① 如果运行时间不超过 12 h ( 经常发生在宽的或中等 pH 范 围 IPG，如 IPG 3~10 或 4~7 ) 。② 如果 pH 梯
植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验（一）
试剂、试剂盒 尿素裂解溶液IPG 干胶条水化液IPG 胶条平衡液SDS 凝胶缓冲液电极缓冲液储液丙烯酰胺 甲叉双丙烯酰胺溶液过硫酸铵溶液琼脂糖溶液仪器、耗材 等电聚焦仪 IPGphor多重垂直 SDS 电泳仪实验步骤 3.1 第一向：在 IPG 胶条中进行等电聚焦（ IPG-IEF)采用 IPG (
植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验
试剂、试剂盒尿素裂解溶液 IPG 干胶条水化液
植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验
试剂、试剂盒尿素裂解溶液IPG 干胶条水化液IPG 胶条平衡液SDS 凝胶缓冲液电极缓冲液储液丙烯酰胺 甲叉双丙烯酰胺溶液过硫酸铵溶液琼脂糖溶液仪器、耗材等电聚焦仪IPGphor多重垂直 SDS 电泳仪实验步骤3.1 第一向：在 IPG 胶条中进行等电聚焦（ IPG-IEF)采用 IPG ( IPG
固相化－pH－梯度双向凝胶电泳实验5
方案5 第一向：蛋白质的等电聚焦电泳实验实验方法原理这里所描述的分离蛋白质的两种方法都是基于蛋白质所带净电荷的多少，使用固相化的 pH 梯度凝胶进行的 IEF 技术。这些方法作为双向凝胶分离的第一向，除了利用传统的水平电泳仪进行 IPG 凝胶的等电聚焦外（方案 5 方法 A)，还能在自带的电泳槽里使
植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验（三）
使用 IPGphor 进行 IEF 的典型工作条件见表13-2和 表 13-3 。正如前文指出的那样 ，为了使高分子质量的蛋白质更好地进入聚丙烯酰胺胶内，水化时应在胶条两端加低电压（30~50 V ) ，否则将给水化上样造成困难[ 15，28] 。然后电压逐步升高至 8000 V。如果 IP
双向电泳
蛋白质组研究的发展以双向电泳技术作为核心. 双向电泳由O’Farrell’s于1975年首次建立并成功地分离约1 000个E.coli蛋白，并表明蛋白质谱不是稳定的，而是随环境而变化. 双向电泳原理简明，第一向进行等电聚焦，蛋白质沿pH梯度分离，至各自的等电点；随后，再沿垂直的方向进行分子量
固相pH梯度等电聚焦实验——pH－梯度的测定
试剂、试剂盒丙烯酰胺单体贮液过硫酸铵贮液实验步骤由于固相 pH 梯度凝胶的导电性很低，不可能用表面电极测定凝胶表面的 pH。但对于宽范围的固相 pH 梯度可以用等电点蛋白标准来测定，方法同载体两性电解质等电聚焦。但目前还没有合适的市售蛋白标准可用于测定窄范围的固相 pH 梯度。灌制凝胶时，pH 梯度
蛋白质组技术的研究进展（一）
大规模基因组测序计划的实施已改变生命科学的重心，在相当短的时期内，一些原核生物和某些低等真核生物的基因组序列已被测定. 1995年，流感嗜血杆菌基因组序列首次被破译，在此后不到两年的时间，近50个细菌的基因组序列已被完成. 然而，这仅仅是理解有机物功能的一个起点. 在基因组时代，许多DNA序列信
实质等同性（蛋白质组学）实验（二）
3.2 等电聚焦（IEF)各种长度（如 7 cm、13 cm、18 cm、24 cm ) 和不同 pH 范围的固定化 pH 梯度 ( IPG ) 胶条可供使用。IPG 胶条常在 20℃ 下（温度低于 20℃ 可导致尿素结晶）于适量水化液中水化过夜（16 h ) 。这可在溶胀托盘 （ re-s
概述PH梯度溶液的形成
在离子交换层析中，PH梯度溶液的形成是靠梯度混合仪实现的。例如，当使用阴离子 剂进行层析时，制备PH由高到低呈线性变化的梯度溶液的方法是，在梯度仪的混合室（这层析柱者）中装高PH溶液，而在另一室装低PH极限溶液，然后打开层析柱的下端出口，让洗脱液连续不断地流过柱体。这时从柱的上部到下部溶液的PH
PH梯度萃取法的原理
pH梯度萃取法的原理是由于溶剂系统pH变化改变了存在状态（游离型或解离型），从而改变了在溶剂系统中的分配系数。正是因为pH的差异而实现了各生物碱的分离，氯仿为亲脂性有机溶剂，总生物碱皆可溶解于氯仿，这里利用溶解度不能达到分离的效果。样品水溶液用pH3的有机溶剂提取，此时酸性物质多呈非解离状态，因而溶
ph梯度萃取法的步骤
ph梯度萃取法的步骤：分离碱性强弱不同的游离生物碱，可用pH由高至低的酸性缓冲溶液顺次萃取，使碱性由强到弱的生物碱分别萃取出来。据不同物质在不同PH下析出沉淀的原理来提纯所需物质。如混合黄酮苷元，由于结构中酚羟基的数目和位置不同，各自所呈酸性强弱不同，使溶于有机相，依次用5％碳酸氢钠，5％碳酸钠、4
等电聚焦和二维凝胶电泳实验（一）
试剂、试剂盒 样品缓冲液羟乙基二硫化物细胞裂解缓冲液SDS-PAGE 现成溶液二硫苏糖醇碘乙酰胺仪器、耗材 等电聚焦电泳系统二维SDS-PAGE 多凝胶系统恒温循环器IPG 干胶条溶胀盘上样杯旋转摇动混合器实验步骤 一、等电聚焦的基本原理等电聚焦 (IEF) 是一种能根据分子内的质子接受点的 p
ZOOM®－IPGRunner™系统：简化的双向电泳（2D－gel－eletrophoresis）
摘要双向电泳（Two-dimensional（2D） gel electrophoresis）是一项基于蛋白的两种不同特性：电荷和质量来分离蛋白的技术。首先基于蛋白固有电荷，通过等电聚焦（isoelectric focusing IEF）进行第一向蛋白分离，然后根据蛋白的质量，在第二向中通过SDS-
双向电泳(twodimensional－electrophoresis,2DE)4
由于合成载体两性电解质（synthetic carrier ampholyte SCA）是通过复杂的合成过程得到的，其重复性很难控制，由此不同批次之间会存在很大的变化，同一蛋白质在不同批 图-1. 等电聚焦的“聚焦效应” 次等电聚焦中所出现的位置有所偏差，这样作为双向电泳中的一向时就限
蛋白质技术——双向电泳
实验概要蛋白质组研究的发展以双向电泳技术作为核心. 双向电泳由O’Farrell’s于1975年首次建立并成功地分离约1000个E.coli蛋白，并表明蛋白质谱不是稳定的，而是随环境而变化. 双向电泳原理简明，第一向进行等电聚焦，蛋白质沿pH梯度分离，至各自的等电点；随后，再沿垂直的方向进行分子
2－Dimensional－Gel－Electrophoretic－Analysis－for－Chicken－Egg
Overview This protocol is a detail description of the procedure in performing 2D gel electrophoresis for illustrating the protein profile of the w
双向电泳的新进展和新工具
随着蛋白质组学概念的提出，双向电泳(2D gel electrophoresis)一度曾变得很流行。近几年，因质谱技术的快速发展，LC-MS的热度似乎更高。然而，在某些应用上，双向电泳更有优势。 双向电泳提供了整个样品的鸟瞰图，而这是质谱无法比拟的。它可以对样品中复杂的蛋白质进行整体性
什么叫PH梯度萃取分离
PH梯度萃取分离就是根据不同物质在不同PH下析出沉淀的原理来提纯所需物质pH梯度萃取法是分离酸性、碱性、两性成分常用的手段。其原理是由于溶剂系统 pH变化改变了它们的存在状态（游离型或解离型），从而改变了它们在溶剂系统中的分配系数。如混合黄酮苷元，由于结构中酚羟基的数目和位置不同，各自所呈酸性强弱不
双向电泳仪的研究方向
随着技术的飞速发展，已能分离出10 000个斑点（spot）。 当双向电泳斑点的全面分析成为现实的时候，蛋白质组的分析变得可行。样品制备（sample prepareation）和溶解同样事关2-DE的成效，目标是尽可能扩大其溶解度和解聚，以提高分辨率。用化学法和机械裂解法破碎以尽可能溶解和解聚蛋白
ph梯度萃取可用于哪些成分
适用于：三类化合物做初步分离：蒽醌（例如：大黄）、黄酮（例如：槐角）和生物碱（例如：苦参）。当然，具体的pH梯度和萃取使用的溶剂需要选择一下。ph梯度萃取法是分离酸性、碱性、两性成分常用的手段。ph变化改变了它们的存在状态（游离型或解离型），从而改变了它们在溶剂系统中的分配系数。大体上有三类化合物使
双向电泳常见问题解答
随着人类基因组草图完成，蛋白质组研究全面展开。作为经典蛋白质组学分离技术，双向电泳越来越被科研人员所熟知。但要想得到漂亮的双向电泳谱图，却并不那么容易。我们将针对双向电泳过程中常出现的问题进行总结，希望能给您的实验带来帮助。 本期我们重点关注双向电泳图谱中常出现的水平条纹。双向电泳水平条纹的产生主要