昆明动物所生物多样性快速监测法研究获进展
生物多样性测量在解决我国环境问题的工作中受到了越来越多的关注，例如对具有丰富及特有生物多样性的地区进行调查和监测、病害虫及环境污染的监控、生态保护项目(如人工橡胶林种植)的管理与监督等。然而，传统的生物多样性测量既耗时又费钱，尤其需要很多分类学家的加入。不同于普通的管理问题， “分类学障碍”已成为了人们对生物多样性研究的绊脚石。 近期，中科院昆明动物研究所生态学与环境保护中心(ECEC)的研究人员结合metabarcoding、生态学、生物信息学和统计学方法，建立了一套环境科学研究的“生态-信息学(eco-informatic)”全新模式。Douglas研究员及其团队利用马氏网诱捕节肢动物，对整个混合样本DNA的COI基因扩增后进行高通量测序，并结合生物信息学手段进行分析，整个过程被称为metabarcoding。该团队人为建立了7个节肢动物的群落(主要为昆虫)，并证明了metabarcoding方法对群落组成成分......阅读全文
生态学专家共话亚洲生物多样性保护
2010年是联合国国际生物多样性年，在日前的“国际生物多样性日”，300余名来自中、日、韩的专家、官员和居民齐聚丽江，共同探讨生物多样性的未来发展方向，加强亚洲生物多样性保护的合作交流。 各国生态学家们展开了热烈的讨论与交流。中科院昆明植物研究所研究员裴盛基谈了民族文化传承与生物多样性保
“听”来的生物多样性－音景生态学大起底
今年早些时候，音景生态学家Bryan Pijanowski在婆罗洲的一个研究塔上安装绒毛状的麦克风。图片来源：KRISTOFFER AHLM Michael Scherer-Lorenzen是向德国科学基金会申请资金的80多位科学家中的一员。去年11月，他在波茨坦市召开的一次评审会议上
生物信息学教程
Sequence - Evolution - FunctionComputational Approaches in Comparative GenomicsbyEugene V. KooninNational Center for Biotechnology Information, Bethes
分子生态学词汇基因多样性指数
中文名称：基因多样性指数英文名称：gene diversity index定 义：一个种群中每个位点上平均期望杂合度。一般用符号“H”表示。应用学科：生态学（一级学科），分子生态学（二级学科）
分子生态学词汇遗传多样性指数
中文名称：遗传多样性指数英文名称：genetic diversity index定 义：度量遗传多样性水平的一种测度。应用学科：生态学（一级学科），分子生态学（二级学科）
水生所揭示中国淡水生物多样性保护的生态学机制
近日，中国科学院水生生物研究所关于中国淡水生物多样性保护的生态学机制的论文“Challenges to saving China’s freshwater biodiversity: fishery exploitation and landscape pressures”在环境生态类综合期刊A
生物芯片用于生物信息学研究
人类基因组计划是人类为了认识自己而进行的一项伟大而影响深远的研究计划。目前的问题是面对大量的基因或基因片断序列如何研究其功能，只有知道其功能才能真正体现HGP计划的价值--破译人类基因这部天书。后基因组计划、蛋白组计划、疾病基因组计划等概念就是为实现这一目标而提出的。生物信息学将在其中扮演至关重要的
生物信息学新进展
计算机技术和人类基因组计划的发展，应运而生了一门新兴的学科——生物信息学，该学科包含了两个交叉领域的工作：用于建立现代生物学所需信息系统框架（支持生物学的信息管理系统、分析工具和通讯网络）的研究开发工作，即传统意义上的生物信息学（bioinformatics）；旨在理解基本生物学问题的基于计算的研究
生物信息学技术的原理
生物信息学在生命科学研究中起着越来越重要的作用。利用生物信息学对蛋白质组的各种数据进行处理和分析，也是蛋白质组研究的重要内容。生物信息学是蛋白质组学研究中不可缺少的一部分。生物信息学的发展，已不仅是单纯的对基因组、蛋白质组数据的分析，而且可以对已知的或新的基因产物进行全面分析。在蛋白质组数据库中储存
昆明动物所生物多样性快速监测法研究获进展
生物多样性测量在解决我国环境问题的工作中受到了越来越多的关注，例如对具有丰富及特有生物多样性的地区进行调查和监测、病害虫及环境污染的监控、生态保护项目(如人工橡胶林种植)的管理与监督等。然而，传统的生物多样性测量既耗时又费钱，尤其需要很多分类学家的加入。不同于普通的管理问题， “分类学障碍”
生物芯片技术用于生物信息学研究
人类基因组计划是人类为了认识自己而进行的一项伟大而影响深远的研究计划。目前的问题是面对大量的基因或基因片断序列如何研究其功能，只有知道其功能才能真正体现HGP计划的价值--破译人类基因这部天书。后基因组计划、蛋白组计划、疾病基因组计划等概念就是为实现这一目标而提出的。生物信息学将在其中扮演至关重要的
生物芯片技术用于生物信息学研究
人类基因组计划是人类为了认识自己而进行的一项伟大而影响深远的研究计划。目前的问题是面对大量的基因或基因片断序列如何研究其功能，只有知道其功能才能真正体现HGP计划的价值--破译人类基因这部天书。后基因组计划、蛋白组计划、疾病基因组计划等概念就是为实现这一目标而提出的。生物信息学将在其中扮演至关重要的
成都生物所开发新型生物信息学软件
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/1/472859.shtm 近年来，随着测序技术的快速发展，动物（尤其是非模式动物）全基因组数据（WGS）获取变得简单、便宜，这使得数据库中全基因组数据量呈指数态势增长。全基因组测序数据往往同时包含
生物信息学—促动BT与IT双赢
无论是与结构基因组学对应的“基因时代”，还是与功能基因组学、蛋白质组学相应的“后基因时代”；无论你称呼21世纪是“信息时代”、“后信息时代”，还是“生物时代”，所有这一切，都将BT(生物技术)与IT(信息技术)紧密结合起来。而这其中，无疑“生物信息学”占据了天时地利、出尽了风头，虽然它自身及其相
生物信息学技术的技术原理
生物信息学在生命科学研究中起着越来越重要的作用。利用生物信息学对蛋白质组的各种数据进行处理和分析，也是蛋白质组研究的重要内容。生物信息学是蛋白质组学研究中不可缺少的一部分。生物信息学的发展，已不仅是单纯的对基因组、蛋白质组数据的分析，而且可以对已知的或新的基因产物进行全面分析。在蛋白质组数据库中储存
生物芯片技术应用与生物信息学研究
人类基因组计划是人类为了认识自己而进行的一项伟大而影响深远的研究计划。目前的问题是面对大量的基因或基因片断序列如何研究其功能，只有知道其功能才能真正体现HGP计划的价值--破译人类基因这部天书。后基因组计划、蛋白组计划、疾病基因组计划等概念就是为实现这一目标而提出的。生物信息学将在其中扮演至关重要的
Cystatin基因家族的生物信息学分析
实验概要半胱氨酸蛋白酶抑制剂(cystatin)基因广泛存在于植物物种中。该类基因能够起到抑制某些病原微生物和昆虫体内半耽氨酸蛋白酶的作用，在植物的防卫体系中起到重要作用。我们利用已经分离出植物cystatin基因的cystatin结构域为检索序列在基因组水平上对拟南芥和水稻中的cystatin基因
生物信息学中的HSP的含义
热休克蛋白（英文：heat shock protein ）又称应激蛋白，是机体细胞在一些理化因素刺激后高效表达的一组蛋白质，因最先发现于果蝇唾液腺的热应激反应中而得名，此后的研究表明，热休克蛋白广泛存在于人、动物、微生物和植物的细胞中，是一类在遗传上高度保守的分子，能保护细胞并促进细胞对各种刺激所造
Science：生物信息学，神秘的新职业
今天的生物信息学家迎来了好时候。由于各个部门生成了几乎无穷无尽的生物数据，因此形成了对于生物、统计学和计算机科学交叉领域中有经验的专业人才的高度需求。科学家如果能够分析大量信息并将其清晰地展示给决策制定者，就会发现自己的工作和职业生涯前途无量，尤其是在大型制药和生物技术部门。 “在大数据时代，
国际生物多样性日：保护生物多样性全球在行动
５月２２日，是国际生物多样性日，而今年又是联合国确定的国际生物多样性年。 生物多样性与人类息息相关。如果没有生物多样性，人类难以感受到树林的绿意，还可能失去空气、食物和水。如果没有多姿多彩的其他生命形式，不仅生活会变得索然无味，而且人类可能
分子生态学词汇根井正利基因多样性指数
中文名称：根井正利基因多样性指数英文名称：Nei's gene diversity index定 义：由根井正利(Masatoshi Nei)提出来的测度基因多样性的指数。H=1-(∑Pi2)/N, 这里，Pi是等位基因的频率，N是种群的基因座数。应用学科：生态学（一级学科），分子生态学
分子生态学词汇转基因生物
中文名称：转基因生物外文名称：transgenic Organisms定 义：“转基因生物”一词的最初来源是英语“Transgenic Organisms”，因为在上世纪70年代，重组脱氧核糖核酸技术（rDNA）刚开始应用于动植物育种的时候，常规的做法是将外源目的基因转入生物体内，使其得到
生物专业最强“杀手锏”：如何自学生物信息学？
当下，在部分学习生物专业的学生面临工作难找、科研难做的多重窘境之际，基因产业和个体化用药却在以前所未有的速度蓬勃发展，遗传咨询师行业亦初露头角。传统学习生物专业的学生，可谓是赶上了“最好的时代”，倘若你知道如何解开维系健康的生命密码信息，你将变得无可替代。那么问题来了，如何自学生物信息学？本文是
特征选择在生物信息学中的应用
随着生物信息学的发展，许多模式识别技术无法满足处理大量不相关特征的需求，因此特征选择技术（FS techniques）在生物信息学中的应用就变得越来越重要了。在过去的几年里，应用特征选择技术已经从仅仅作为一个说明性的例子发展到了建立模型所需要的先决条件了。特征选择技术最重要的目的有3点：（1）避免过
生物多样性的特点
全球特点从整个地球范围来看，生物多样性分布明显与纬度有关，南北两极是生物多样性最少的区域。相反，在热带地区则集中了大部分的生物种类。处于这两个典型地带的中间区的温带，其生物多样性少于热带而多于寒带。例如，在国土面积大致相等的委内瑞拉和法国，其哺乳动物的种数相差3倍以上，前者有350种，而后者只有11
生物多样性的概念
生物多样性（biodiversity）是雷蒙德在1968年提出的生态学术语。生物多样性是生物（动物、植物、微生物）与环境形成的生态复合体以及与此相关的各种生态过程的总和，包括生态系统多样性、物种多样性和基因多样性三个层次。生物多样性使地球充满生机，也是人类生存和发展的基础，可通过就地保护和迁地保护等
安捷伦科技生物信息学套装新增整合生物学分析功能
安捷伦科技生物信息学套装新增整合生物学分析功能 GeneSpring 现可实现通路水平的多组学及新一代测序数据分析 2012 年 3 月 27 日，加利福尼亚州圣克拉拉市——安捷伦科技公司(纽约证交所：A)今日发布了其广受欢迎的生物信息学软件的重要扩展版本
德国生物信息学家发现新冠病毒新弱点
近日，德国的生物信息学家通过计算机模型识别出人体中一种对新冠病毒繁殖至关重要的酶，如果抑制这种酶，病毒就会停止繁殖而不影响宿主细胞。该研究有助于找到对抗新冠病毒感染的新方法。 除了疫苗，寻找有效的治疗新冠病毒感染的药物也是战胜疫情的重要手段之一。现在，来自德国感染研究中心和蒂宾根大学的德尔格
上海生科院《Genome－Res》生物信息学新成果
十月十三日，国际基因组研究权威刊物《Genome Research》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所（中国科学院—马普学会计算生物学伙伴研究所）的一项最新研究，题为“A probabilistic method for testing and estimating sele
北京大学PLOS生物信息学新成果
近日，北京大学分子医学研究所李川昀课题组与何爱彬研究员合作，在国际著名遗传学杂志《PLOS Genetics》发表一项重要研究成果，题为“Emergence, Retention and Selection: A Trilogy of Origination for Functional De