酵母遗传学方法8:酵母活体染色
酵母活体染色1)核DNA和线粒体DNA1.当细胞培养到约107细胞/ml时,离心(5秒)收集细胞,再悬浮在70%乙醇中。2.固定5分钟或5分钟以上,用水洗2次。3.将细胞悬浮在含有50ng/ml的4,6-二脒基-2苯基吲哚的封固剂中。1mg/ml的4,6-二脒基-2苯基吲哚母液可在-20℃下贮存。4.用紫外滤片观察。 2)线粒体1.在生长培养基中培养细胞达到约107细胞/ml时,加入100ng/ml 3,3’-二已基噁羰花青碘化物(DiOC6,Sigma D3652或Molecular Probes)用乙醇把1mg/ml母液稀释到1/104。2.培养5分钟或5分钟以上,用荧光素滤片观察。 3)液泡1.当细胞生长到约107细胞/ml时,离心收集细胞(5秒),悬浮在含有50mmol/L柠檬酸钠(pH4.0)的YPD中。2.加CDCFDA(羧基-2’,7’-二氯-荧光素双乙酸盐)到终浓度为10μmol/L。3.保温......阅读全文
酵母遗传学方法8:酵母活体染色
酵母活体染色1)核DNA和线粒体DNA1.当细胞培养到约107细胞/ml时,离心(5秒)收集细胞,再悬浮在70%乙醇中。2.固定5分钟或5分钟以上,用水洗2次。3.将细胞悬浮在含有50ng/ml的4,6-二脒基-2苯基吲哚的封固剂中。1mg/ml的4,6-二脒基-2苯基吲哚母液可在-20℃下贮存。4
酵母遗传学方法12:酵母菌落PCR方法
酵母菌落PCR方法1.在冰上配制反应混合液:2μl 10×菌落PCR缓冲液1.2μl 25mmol/L MgCl20.4μl 10mmol/L dNTPs10pmol 引物
酵母遗传学方法9:酵母免疫荧光
酵母免疫荧光1)细胞制备1.培养5ml酵母至对数生长早期(106~107细胞/ml)。2.直接加1/10体积的甲醛到培养基里固定细胞(加入的甲醛终浓度为3.7%,标准母液是37%)。3.细胞在甲醛中培养至少1小时。4.离心收集细胞,用0.1mol/L磷酸钾(pH7.5)洗一次。5.把细胞悬浮在1ml
酵母遗传学技术
Genome-wide Gene Expression Analysis (Richard Young Research Group,Whitehead Institute for Biomedical Research)A genoe-wide gene expression analysis u
酵母遗传学方法1:DNA分离
酵母DNA分离1)酵母DNA微量制备(40ml)1.在125ml三角瓶中用40ml YPD培养液在30℃条件下培养细胞达最大生长量(过夜)。2.将上述培养物移入螺盖离心管,用医用离心机或Sorvall SS-34转头以5000r/min离心5分钟,弃去上清液。3.将细胞悬浮在3ml的0.9mol/L
酵母遗传学方法5:酵母β-半乳糖苷酶的测定
酵母β-半乳糖苷酶的测定1) 粗提取物测定1.在适当温度下(通常30℃),用适当培养液将5ml细胞培养物培养到浓度为1×107~2×107细胞/ml。如果自主复制质粒的杂合基因表达,可使用一种适当培养基对存在质粒的菌株进行筛选。2.在冰上冷却细胞,离心收集。注意:以下步骤保持细胞在冰上。3.弃上清
酵母活细胞染色
实验步骤展
酵母遗传学方法10:固定化细胞的肌动蛋白染色
固定化细胞的肌动蛋白染色1.培养细胞到对数生长期(约107细胞/ml)。2.直接取0.1ml甲醛加到含有1ml培养物的离心管中固定细胞(甲醛浓度为3.7%;标准母液是37%)。3.在甲醛中培养细胞30分钟或稍长时间。4.用PBS洗两次,离心5分钟收集细胞。5.用50μl的PBS悬浮细胞,加5个单位的
酵母染色体沉淀分析方法
ABSTRACTThis protocol describes a method for the detection of proteins bound to specific regions of chromatin in yeast. There are many variations of t
酵母遗传学方法3:RNA的分离
酵母RNA的分离1)总酵母RNA的分离1.在每毫升培养物中加入50μg环乙酰亚胺,在30℃下振荡15分钟。此步亦可省略,但是有人认为环乙酰亚胺可防止mRNA凝集在多核糖体上。2.迅速冷冻收集细胞,在大离心管中加入约一半体积的碎冰,将培养物倒入,振荡,在4℃下以5000r/min离心5分钟。3.加入1
酵母遗传学方法7:随机孢子分析
随机孢子分析1)孢子形成1.挑已形成孢子的二倍体单菌落接种在YPD平板上,尽可能把细胞涂薄一些,在30℃下培养12~16小时,超过16小时将明显降低孢子的形成率。2.上午,用一个无菌壳板钉取相当一火柴头量的细胞,转到含有2.5ml产孢培养基试管中,在25℃下旋转振荡培养。3.用光学显微镜检测孢子形成
酵母人工染色体
· Easy YAC Preparation Method (Andrew Davies,Shaw lab)· Screening YAC libraries (Donis Keller Lab)This is a method for screening YAC l
酵母人工染色体的标记方法
YAC 载体的选择标记主要采用营养缺陷型基因,如色氨酸、亮氨酸和组氨酸合成缺陷型基因 trp 1、 leu 2和 his 3、尿嘧啶合成缺陷型基因 ura3 等,以及赭石突变抑制基因 sup4 。与 YAC 载体配套工作的宿主酵母菌(如AB1380)的胸腺嘧啶合成基因带有一个赭石突变ade 2-1。
酵母遗传学方法实验指南——技术和方案
技术和方案6 酵母 RNA 的分离试剂、试剂盒环乙酰亚胺苯酚LETS缓冲液LiCl乙醇SDS乙酸钠AE 缓冲液仪器、耗材大离心瓶玻璃珠离心管oligo (dT) 柱实验步骤大量 RNA 分离程序酵母总 RNA 的分离1.在每毫升培养物中加入 50ug 环乙酰亚胺,在 30°C 下摇晃 15 min。
白假丝酵母菌的染色方法
白假丝酵母菌的染色方法如下:1、菌液准备将各种假丝酵母菌标准菌株及临床分离株分别接种沙保弱琼脂,35℃培养48h,挑取菌落,混匀2ml无菌蒸馏水中,在浊度仪上调整菌液浓度为4个麦氏单位(约8×108/m1)。2、选择适合假丝酵母菌生长繁殖的液体沙保弱培养基(100ml蒸馏水中含葡萄糖5g,蛋白胨10
Nature:构造酵母染色体
合成生物学的目标之一就是构建那些复杂的人工合成有机体。目前,在酵母细胞中已经取得了阶段性的进展——采用分段式方法,研究者已经可以将整个酵母染色体转化成为合成序列了。 生物细胞其实很像是一台计算机——基因组可以比作软件,它负责对细胞的构成进行编码,细胞器则犹如计算机的硬件,负责读取并运行软件的
酵母遗传学方法实验指南——技术和方案2
技术和方案2 快速粗放的酵母菌落质粒转化法实验步骤展
酵母遗传学方法实验指南——技术和方案1
技术和方案1 酵母的高效转化实验步骤展开
酵母遗传学方法11:PCR介导基因破坏法
PCR介导基因破坏法1.反应混合物:5μl 10×Taq缓冲液5μl 25mmol/L MgCl22μl 10mmol/L dNTPs10~100ng 模板DNA25pmols 引物(每种引物)
酵母遗传学方法实验指南——技术和方案3
技术和方案3 酵母 DNA 分离实验材料质粒DNA玻璃珠试剂、试剂盒YPD消解酶 100TTris-HClSDS乙酸钾TE 缓冲液RNaseA 溶液山梨醇无水异丙醇裂解缓冲液仪器、耗材三角瓶离心管实验步骤一、酵母 DNA 微量制备(40 ml)1.在 125 ml 三角瓶中用 40 mlYPD 培养
酵母遗传学方法4:质粒DNA的羟基突变
质粒DNA的羟基突变1.临用之前制备羟胺溶液,置冰上待用。2.将用氯化铯纯化的10μg质粒DNA加到含500μl羟胺溶液的微型离心管。3.在37℃下培养20小时。4.加入10μl的5mol/L NaCl、50μg 1mg/ml的牛血清蛋白(BSA)和1ml无水乙醇终止反应,置-70℃沉淀DNA10分
酵母遗传学方法实验指南——技术和方案7
技术和方案7 质粒 DNA 的羟胺突变试剂、试剂盒羟胺溶液氯化铯纯化的质粒DNANaCl牛血清白蛋白无水乙醇TE 缓冲液实验步骤1.临用之前制备羟胺溶液,置冰上待用。2.将用 CsCl 纯化的 10 埤质粒 DNA 加到含 500ul 羟胺溶液的微量离心管中。3.在 37°C 下温育 20 h。4.
酵母遗传学方法实验指南——技术和方案5
技术和方案5 TAP纯化方法试剂、试剂盒NP-40缓冲液TEV C 缓冲溶液钙调蛋白结合缓冲液(CBB)钙调蛋白洗脱缓冲液(CEB)实验步骤1.培养 3~6L 细胞至浓度为 2X107~3X107 个/ml(OD50=1.0~1.3)。2.离心收集细胞,并用冰预冷的水洗一次。3.用冰预冷的 NP-4
酵母遗传学方法实验指南——技术和方案4
技术和方案4 酵母蛋白质的抽提试剂、试剂盒NaOHPAGE 样品缓冲液Tris-HCl甘油β-巯基乙醇溴酚蓝实验步骤1.从液体培养物中或用细菌接种环在平板表面刮菌,收集大约 2.5 OD的细胞量(大约 2.3 mg 湿重)。将细胞重悬于 100ul 蒸馏水中,加入 100ul O.2mol/L Na
酵母人工染色体的应用
实验方法原理 直到 20 世纪 80 年代中期,尚无技术可用于基因组 DNA 黏性大片段的分离、扩增和分析。在此之前,如果要对某一 DNA 片段进行详细的物理和功能研究,该 DNA 的长度应能够装入 λ 噬菌体颗粒或黏粒载体。实验材料 酿酒酵母试剂、试剂盒 甘油仪器、耗材 脉冲场凝胶电泳仪选择性培养
酵母人工染色体的应用
实验方法原理 直到 20 世纪 80 年代中期,尚无技术可用于基因组 DNA 黏性大片段的分离、扩增和分析。在此之前,如果要对某一 DNA 片段进行详细的物理和功能研究,该 DNA 的长度应能够装入 λ 噬菌体颗粒或黏粒载体。
酵母人工染色体的应用
直到 20 世纪 80 年代中期,尚无技术可用于基因组 DNA 黏性大片段的分离、扩增和分析。在此之前,如果要对某一 DNA 片段进行详细的物理和功能研究,该 DNA 的长度应能够装入 λ 噬菌体颗粒或黏粒载体。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理直到 20 世纪 80 年代
酵母人工染色体的简介
酵母人工染色体(Yeast artificial chromosomes,简称YAC),是一种能够克隆长达400Kb的DNA片段的载体,含有酵母细胞中必需的端粒、着丝点和复制起始序列,是细胞内具有遗传性质的物体,易被碱性染料染成深色,所以叫染色体(染色质)。其本质是脱氧核苷酸,是细胞核内由核蛋白
酵母遗传学方法6:羧肽酶Y的平板鉴定
羧肽酶Y的平板鉴定1.在YPD平板上培养菌落和菌苔(通常菌落长3天,菌苔长1天即可)。2.小心把涂盖液加在平板的表面使之完全覆盖细胞。3.待琼脂凝固5~10分钟后,小心用新鲜Fast Garnet GBC溶液冲刷表面。4.显色5分钟,野生型菌株将变红,而羧肽酶Y-菌株将呈现黄色或粉红色。5.倒出Fa
酵母遗传学方法2:蛋白质的抽提
酵母蛋白质的抽提此法抽提的酵母蛋白适用于SDS凝胶电泳和Western印迹分析。1.从OD600=2的细胞培养物中抽提酵母蛋白质。培养物的一种简单制备方法是将细胞接种到5ml YPD中,过夜培养后获得指数培养物(OD600=0.5~2.0)。2.在水浴上把OD600=2的细胞培养物转到含有2ml的5