基因型分析
Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD)Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD) by (DNA KAFFE)RAPD analysis has been successfully used in mapping and fingerprinting applications. RAPD can efficiently identify differences that constitute a significant fraction of a genome. This is a very nice protocol describing in great detail the background knowledge, method and trouble shooting. ......阅读全文
基因型、表现型和环境条件的关系
表现型是一定环境条件下,特定基因型生物个体所表现出的性状特征,所以表现型=基因型+环境条件。因此,基因型控制着生物个体的表现型,是表现型的决定性因素,但不是唯一的决定性因素,它与生物个体所处的特定的环境条件同时发挥作用,使得表现型呈现出多样性。正是因为这样,在基因型相同的情况下,表现型可以不同。例如
基因型指导华法林给药剂量并无益处
从一项随机双盲临床试验中发现，美国不支持基因分型患者调整华法林治疗的目的。 最佳抗凝治疗通过遗传学试验得到了证实。除临床变量或者通过仅基于临床变量的控制协议以外，试验分别以给药第5天和基因型为指导，对1015名美国成年人被随机分配接受华法林治疗。基因组数据在华法林首剂量之前对45%参加者有效，第
冬小麦基因型、环境、年份及其互作对品种面筋指数影响
为明确各影响因素对面筋指数的作用,对其进行方差分析。结果表明,年份、环境、基因型及各因子互作对小麦的面筋指数均有极显著(P
－美国癌症中心筛选失败药物用于治疗特殊基因型患者群体
去年美国国家癌症研究中心(National Cancer Institute， NCI)宣布开始一项研究旨在重新分析过去十年中在临床试验中未能对大多数患者产生疗效的抗癌药物以用于治疗一些特殊基因型的癌症患者。纽约的 Memorial Sloan-Kettering Cancer Cent
我国形成水稻无融合生殖体系并实现杂合基因型固定
1月4日， Nature Biotechnology 杂志在线发表了水稻研究所王克剑团队题为Clonal seeds from hybrid rice by simultaneous genome engineering of meiosis and fertilisation genes 的研
我国科学家破解小麦遗传转化中基因型依赖难题
近日，中国农业科学院作物科学研究所作物转基因及基因编辑技术与应用创新团队鉴定了一个与小麦植株再生相关的基因TaWOX5，并利用TaWOX5基因克服了小麦遗传转化中的基因型依赖难题。此外，研究团队还依托该基因建立了栽培一粒小麦、黑麦和六倍体小黑麦的遗传转化体系。相关研究结果在线发表于《自然·植物》
基因检测临床应用中的难题：基因型与表型信息关联
新一代测序技术的出现，使得基因组数据以及新基因突变的发现呈现爆炸式增长。基因组学研究所面临的挑战不再是单纯的数据产生，而是数据的解读。基因组学的信息如果不能和临床、表型的数据关联，就不能很好地解释复杂的基因变异以及生物学相关问题。 与大多数研究不同，临床表型信息的收集，必须考虑临床医疗环境的约
基因型与表型相互作用的可观察特征之间的关系
显示的是与替代mRNA 3'UTR长度相关的遗传变异。从T等位基因到C等位基因的改变导致测量的3'UTR的延长 2021年6月1日-一项新的研究分析了个体遗传(基因型)和遗传和环境相互作用(表型)导致的可观察特征之间的关联，为理解人类复杂性状和疾病提供了新的知识。 这项研究
Science特刊论述如何利用单细胞等技术解析基因型与表型
人类细胞内的DNA，即我们熟知的基因型，为指导一系列机体的构建过程提供了蓝图。虽然我们常常认为人类基因组是稳定的，但不同个体之间仍存在着诸多差异。人类可观察到的表型由多个性状组成，这些性状则由单基因组中的许多遗传变异所引起。毛发、瞳孔及皮肤颜色，身高，体型和行为都代表着这些多基因性状。但许多这些
瓶中基因联盟将于明年初发布参考材料－首发基因型
作为一个致力于研究人类基因组测序参考材料的团体，瓶中基因联盟(Genome in a Bottle Consortium)计划于明年初发布其首个试点参考材料、高度表征的HapMap样本以及一组高度可信的基因组检测。 该团体最近发布了一组基于公开提供的测序数据之分析进行的高度可信的基因组
基因检测临床应用中的难题：基因型表型关联重要性
新一代测序技术的出现，使得基因组数据以及新基因突变的发现呈现爆炸式增长。基因组学研究所面临的挑战不再是单纯的数据产生，而是数据的解读。基因组学的信息如果不能和临床、表型的数据关联，就不能很好地解释复杂的基因变异以及生物学相关问题。 与大多数研究不同，临床表型信息的收集，必须考虑临床医疗环境的约
使用面筋指数仪测试小麦面筋指数的基因型及环境差异
1、面筋指数的基因型和环境差异及显著性分析。从表2可知,面筋指数基因型间存在差异。从面筋指数仪的测试结果来看，不同品种冬小麦面筋指数以PH1521最高,是面筋指数最低的PH988-2的1.49倍。其中优麦2号和济麦20无显著差异;其他品种间均达显著或极显著差异。从表2还可以看出,多数品种地点间变异不
不依赖基因型的青花菜高效遗传转化体系建成
近日，《植物科学前沿》（Frontiers in Plant Science）分别在线发表了中国农业科学院蔬菜花卉研究所甘蓝青花菜课题组的两项科研成果。 一项研究最终获得了普适性受体纯合材料（19B42），使得根癌农杆菌介导的青花菜转基因和基因编辑（CRISPR/cas9）效率提升至26.92
肝癌患者血清HBV基因型外膜大蛋白定量检测的临床意义
摘要:目的 探讨血清乙型肝炎病毒（HBV）基因型及HBV外膜大蛋白（LHBs）水平与肝细胞癌的关系.方法 对61例肝癌、65例慢性活动性乙型肝炎患者及10例HBV携带者的血清HBV基因型、HBV LHBs进行检测.结果 136例中,B基因型56例（41.0%）,C基因型76例（55.9%）,B、C混
供体细胞类型和基因型对小鼠体细胞克隆效率的影响
实验概要虽然普遍认为供体细胞的类型和基因型影响体细胞克隆的效率，但是对于这个假设的验证研究却很少。目前有人从供体细胞类型、供体细胞基因型、供体细胞的类型与基因型三个方面研究了对小鼠体细胞克隆效率的影响。本试验是研究小鼠克隆效率是否与供体细胞类型、供体细胞基因型、供体细胞类型及基因型有关。实验步骤1.
动力蛋白2基因型中央核肌病患者剖宫产麻醉处理
患者，女，35岁，59kg，停经37+2周，入院待产。既往史：患者于1995年我院神经内科确诊为中央核肌病（centronuclear myopathy，CNM），2017年于华大基因检测中心确定其致病基因为动力蛋白2基因（DNM2），慢性乙型肝炎病史。查体：T36.5℃，HR99次/分，RR20次
东北地理所明确我国大豆主要生育期的优势基因型组合
中国科学院东北地理与农业生态研究所大豆分子育种重点实验室在成功地完成了大豆生育期基因E1、E2、E3及E4基因克隆的基础上，选择了180个具有代表性的大豆品种，同时在全国主要大豆生态区的六个试点对大豆的开花期（R1）与成熟期（R7或R8）进行了表型观察，对四个主要生育期基因进行了基因型鉴定，其中
科学家揭示基因型保守的结核分枝杆菌表型差异遗传基础
结核病已连续两年超过HIV成为全球第一大传染病。据WHO结核年报报道，2015年全球新增结核病例1040万，死亡180万。另外，目前全球约有三分之一人口(约20亿)为结核菌携带者，感染者中约1/10的人最终会发展为活动性结核。结核分枝杆菌复合群（MTBC）是引发结核病的元凶，其成员在基因组序列上
新研究：基因型与环境互作显著影响马尾松生长性状
近日，《森林生态与管理》在线发表中国林业科学研究院亚热带林业研究所林木遗传育种和培育创新团队最新论文。该成果发现，基因型与环境互作效应影响了马尾松家系的生长性状。马尾松 中国林科院供图 基因型与环境互作（G×E）是指基因型的相对表现在不同环境下缺乏稳定性，表现为不同环境下基因型秩尺效应或尺度效
稳准快！基因型和表型双定位的抗生素敏感性测试方法
抗生素与我们的生活密切相关，它就像一把“双刃剑”，昔日是对抗疾病延长生命的“万能神药”，随着高频率滥用，而今抗生素的耐药性问题已成为世界卫生领域的重大难题，并严重威胁人类健康。由此，在临床治疗中，快速检测抗生素敏感性技术将为人类带来新福音。 近日，美国哈佛大学联合麻省理工综合医院的研究人员开
含油量测定仪受环境影响的测定差值
在低海拔、含油量低的试验点，含油量测定仪测定的两个群体两组样品的相关系数是负值,表明在低海拔,高油含量的基因型环境稳定性好,低油含量的基因型波动较大，当环境变化时,含油量的变化也是比较明显，含油量测定仪的相关分析表明,总体趋势是越高含油量的基因型是受环境的影响较小。 油菜含油
我国学者建立信息完整的陆地棉基因型和表型变异数据库
近日，《自然遗传学（Nature Genetics）》在线发表了题为“Resequencing a core collection of upland cotton identifies genomic variation and loci influencing fiber quality a
我国科学家首提“环境型鉴定”概念
近日，中国农业科学院作物科学研究所玉米分子育种创新团队徐云碧博士在国际上首次提出了环境型（envirotype） 和环境型鉴定概念，并对其原理进行了详细阐述。相关论文在线发表于国际知名期刊《理论与应用遗传学》（Theor Appl Genet）。“环境型鉴定”概念的倡导，为作物育种在内的作物科学
戒烟困难？基因或许是原因
那些尝试戒烟却失败的人，或许可以将其归咎于自身的DNA。 上图为DNA的双螺旋结构，它由四种编码单位（A，T，C，G）组成，颜色分别为粉色，橙色，紫色和黄色 来源：美国国立人类基因组研究所（NHGRI） 一项新的研究发现，拥有与大脑奖赏系统相关的特定基因型的人更有可能戒烟成功。与携带其他基因
如何利用大数据理解体重与基因及环境的联系
基因型的环境交互(genotype by environment interaction, GEI)对研究复杂的生物性状是必不可少的。然而，对人类而言，由于环境数据采集的困难以及环境影响效果弱，难以鉴定GEI效应相关的基因型。近日，来自昆士兰大学的研究人员通过对大量样本的分析推导出基因型和表型
分子植物卓越中心等提出“农业精准微生物组”概念
10月7日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心王二涛研究组和深圳华大生命科学院合作，在《自然-通讯》（Nature Communications）上，发表了题为GWAS, MWAS and mGWAS provide insights into precision agriculture bas
基因分型能否指导个体化抗凝用药？
临床中华法林的剂量很难掌握，不同的患者所需剂量可能相差十倍以上。过量有致命性出血风险，而剂量太低则有血栓栓塞风险，因此选择适宜的初始剂量非常关键。目前临床上多通过检测凝血酶原时间，依据国际标准化比值（INR）指导个体化用药。个体对药物的反应差异主要源于外界环境因素改变和机体自身的遗传因素。既往
含油量测定仪分析不同环境甘蓝型油菜量
甘蓝型油菜中的含油量受到的影响比较多，其中环境因素对油菜油量的影响大致上分为两种情况：其中主要的一种就是菜油在形成的过程中不同的基因在表达的时候会受到环境的诱导变化，有些可以通过正常的表达，但是也有部分是在相反的环境下表达，同时由于不同的基因强弱不同所以导致含油量测定仪对它们分别测定的含油量的差
PNAS：从基因到植物微生物群
像人类和动物一样，植物也有微生物群。一个由芝加哥大学领导的研究小组，包括INRAE，研究了一种植物物种内的遗传变异是否控制其叶片微生物群的组成。研究人员在两年多的时间里在四个地点的实验装置中种植了3万多株植物，以分析一株模型植物的200个基因型的叶片微生物群的变异和繁殖成功率(通过种子产量估计)。7
多组学研究助力玉米种质资源创新利用
近日，中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》（英文版）（Science Bulletin）上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径，是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联分析（GWAS）是通过推断