Nature：通过玩Foldit游戏首次成功地从头设计出全新蛋白
在一项新的研究中，一组研究人员将他们的专业知识编码到计算机游戏Foldit中，从而使得公民科学家（citizen scientist）首次成功地设计出合成蛋白。相关研究结果近期发表在Nature期刊上，论文标题为“De novo protein design by citizen scientists”。图片来自Nature, 2019, doi:10.1038/s41586-019-1274-4 论文通讯作者、美国华盛顿大学医学院生物化学教授、蛋白设计研究所主任David Baker说道，“宇宙中可能存在的蛋白比原子还多。想到如今任何人都能够协助探索这片广阔的可能性空间，我感到很兴奋。” 论文第一作者、华盛顿大学蛋白设计研究所博士后研究员Brian Koepnick说道，“这些游戏玩家提出的分子多样性令人惊讶。这些新蛋白绝不逊色于拥有博士头衔的科学家所能制造出的东西。” Foldit是在2008年设计出来的，旨在让蛋......阅读全文
Nature：通过玩Foldit游戏首次成功地从头设计出全新蛋白
在一项新的研究中，一组研究人员将他们的专业知识编码到计算机游戏Foldit中，从而使得公民科学家（citizen scientist）首次成功地设计出合成蛋白。相关研究结果近期发表在Nature期刊上，论文标题为“De novo protein design by citizen scienti
《科学》：奇才David－Baker设计蛋白可对抗新冠病毒
本周，素有“科学界奥斯卡”之称的“科学突破奖”（Breakthrough Prize）公布了一年一度的获奖名单。其中，华盛顿大学（University of Washington）蛋白质设计研究所的David Baker教授成为生命科学奖项的四位获奖人之一。David Baker教授（图片来源：HH
Nature：全新抑癌基因网络
来自美国冷泉港实验室，加拿大麦吉尔大学等多处研究机构的研究人员发表了题为“A tumour suppressor network relying on the polyamineChypusine axis”的文章，报道了一种基于多胺hypusine轴(polyamineChypusine
一种设计淀粉样聚集肽的阻断器的研究方法介绍
许多蛋白质含有仅在自缔合或与相互作用伙伴结合时才变得有序的片段，例如淀粉样蛋白Aβ42、tau蛋白、血清淀粉样蛋白A1等蛋白质中发现的淀粉样蛋白生成序列。这些区域可通过链-链相互作用聚集形成淀粉样原纤维，并与中枢神经系统疾病相关。针对这些淀粉样蛋白生成片段设计结合剂可用作诊断、治疗和研究工具。尽管已
Nature：中科大团队建立全新的蛋白质从头设计方法
中国科学技术大学刘海燕教授、陈泉副教授团队基于数据驱动原理，开辟出一条全新的蛋白质从头设计路线，在蛋白质设计这一前沿科技领域实现了关键核心技术的原始创新，为工业酶、生物材料、生物医药蛋白等功能蛋白的设计奠定了坚实的基础。相关成果北京时间2月10日发表于《Nature》。研究团队部分成员在实验室
Nature子刊文章：Wnt途径全新修饰模式
来自挪威卑尔根大学、上海中医药大学，以及第二军医大学的研究人员发表了题为“Small molecule promotes β-catenin citrullination and inhibits Wnt signaling in cancer”的文章，报道了一种化学小分子药物硝唑尼特(Nita
Nature：打破传统认知，揭示重要细胞全新功能
来自约翰霍普金斯大学的研究人员称他们发现长期以来被认为在神经元“触发”信号时仅对它们起绝缘作用的中枢神经系统少突胶质细胞出乎意料对神经元的存活也至关重要。损害这些绝缘体似乎促成了诸如肌萎缩侧索硬化症(ALS)等神经退行性疾病中的脑损伤。相关研究发现发布在7月11日的《自然》(Nature)杂志上
研究发现全新“蛋白磷脂”离子孔道
机械力信号参与介导多种感知觉的形成。这些机械力信号的感知与传导主要通过机械力敏感离子通道来完成。机械力信号能够激活这些通道，进而允许离子通过，将机械力信号转化为电化学信号，通过下游信号传导介导多种生理活动。目前，OSCA/TMEM63家族是已知的最大的一类机械力敏感离子通道家族，在植物和动物界中均承
最新Nature报道一种全新抗生素平台
来自哈佛大学的Andrew Myers等人设计了一种可以从简单化学组件中合成新型大环内酯类抗生素的新方法，利用这种方法，他们合成了超过300种新型抗生素候选物，其中几种能有效对抗目前所知的最顽固的耐药性菌株。这一研究成果公布在5月18日的Nature杂志上。 虽然大环内酯类抗生素听上去挺陌生，
Nature提出全新观点：不同以往的骨骼生长机制
瑞典卡罗林斯卡医学院研究人员领导的一个国际研究小组报告称，小鼠骨骼生长的机理与在血液，皮肤和其他组织中不断产生新细胞的机理相同，这与之前的观点相悖，之前认为骨骼生长依赖于有限数量的祖细胞。如果这一新发现也适用于人体，那么就可以为生长障碍儿童的治疗提出新的治疗思路了。 这一研究成果公布在2月28
Nature子刊：鉴定增强子全新方法
增强子是能够加强特定基因表达的DNA序列。日期，劳伦斯伯克利国家实验室(Berkeley Lab)的研究团队，开发了一个能在人类和其他哺乳动物基因组中鉴定基因增强子的新技术。文章于三月二十三日发表在Nature Methods杂志的网站上。 这一技术被称为SIF-seq(site-sp
Nature子刊介绍全新MRI技术－克服现有技术缺点
由著名纳米研究科学家Jinwoo Cheon教授领导的一个研究组研发出了一种新型MRI技术：Nano MRI Lamp，这种技术平台能现有MRI造影剂的局限性问题，仅在靶标疾病存在的情况下才会显现磁共振成像信号。 这一研究成果公布在2月6日的Nature Materials杂志上，文章的通讯作
全新微蛋白结构设计出炉
来自英国布里斯托大学的研究团队在5月22日出版的《自然·化学生物》杂志发表论文称，他们设计出一种比天然蛋白小很多的微蛋白，借此可以对蛋白质形成折叠结构并保持稳定的分子作用力“一探究竟”，为设计生物医药所需的微小蛋白和微小分子等基本结构开辟了全新路径。 天然蛋白质具有一系列至关重要的生物功能，比
研究发现全新蛋白质修饰类型
细胞代谢为生命过程提供能量。同时，代谢物可共价修饰蛋白质来发挥信号传导功能。虽然许多代谢物在代谢通路中的作用广为人知，但它们介导细胞信号调控的功能有待探索。酮体（包括丙酮、乙酰乙酸和β-羟基丁酸）为脂质代谢产物。在葡萄糖缺乏的状态下，肝脏产生的酮体可用作多种组织的替代能源，且与多种病理生理状态密
Nature－Medicine提出全新角度：运动为何能预防心脏病
我们都知道，定期运动可通过降低胆固醇和血压等危险因素来保护心血管系统。但来自哈佛医学院系统生物学中心的医学博士Matthias Nahrendorf博士说：“我们认为，某些心血管疾病的危险因素尚未得到充分理解。” Nahrendorf和他的团队希望更好地了解慢性炎症的作用，这种炎症有助于形成称为
Nature子刊：发现全新表观遗传学基因调节机制
一个由KAUST领导的国际团队在研究成年人基因组及其所处环境相互作用的过程中发现了一种调节基因活性的表观遗传学机制。 来自KAUST的Valerio Orlando实验室一直在研究Ezh1的作用，该基因在成熟组织中的功能研究在近25年来毫无进展。和它的姊妹基因Ezh2一样，Ezh1及其伴侣蛋白
全新合成蛋白质只对癌细胞下手
对于癌细胞的特异性鉴定和消融，是医学研究中长期存在的问题，直至目前也尚未完全被解决。癌细胞为什么如此难以被攻克？原因可以归结于它们不受控制的增殖和存活能力。目前，用于癌症治疗的靶向药物能够及时抑制癌细胞信号传导，但这些药物也会受到毒副作用的限制，可能对癌症患者造成多重伤害。Michael Z.
全新的蛋白质标签实现灵敏且定量的蛋白检测
Promega的科学家近日开发出一种新方法，可对细胞内的蛋白质进行轻松检测。这种称为HiBiT的多肽标签可与任何蛋白质相连接，从而实现高度定量且极其灵敏的生物发光检测。这样无需使用抗体，即可利用生物发光对蛋白进行定量。 HiBiT只有11个氨基酸，因此很容易与CRISPR/Cas9基因编辑技术
Nature揭示新型癌症蛋白家族
来自英国癌症研究院的科学家们在发表于12月1日《自然》(Nature)杂志上的一篇新研究论文中，描述了一个似乎在癌症中发挥重要作用的新型蛋白质家族——谷氨酸膜内蛋白酶(glutamate intramembrane proteases)，并着手解析了这一新家族的结构，该家族的基础成员在将健康
Nature：剖析重要的疾病蛋白
找到某种疾病的致病突变，往往只是理解疾病的第一步。而Rett综合症的情况更加复杂，因为该疾病中的突变基因控制着一系列其他基因。Rett综合症属于孤独症谱系障碍，是主要影响女孩的单基因神经性疾病。 爱丁堡大学的Adrian Bird教授与哈佛医学院的Michael Greenberg教授
Nature头条：教你如何DIY蛋白
蛋白质是一个巨大的分子成果：氨基酸链自发地折叠成一种精确的构象，一次又一次，通过进化优化它们的特异功能。然而鉴于所有氨基酸链有可能有指数数量的弯曲，描述一段将折叠为一种可预测结构的序列是一个艰巨的任务。 现在研究人员报告称他们可以做到了。通过遵循发表在《自然》(Nature)杂志上的一篇论
罗建华Nature子刊：CRISPR新编辑技术开创全新抗癌方法
来自匹兹堡大学健康科学学院的研究人员发现，利用基于CRISPR基因组编辑技术的一种新型基因治疗技术能有效地靶向致癌“融合基因”，而且能改善患有侵袭性肝癌和前列腺癌小鼠模型的存活率。 这一研究成果公布在5月1日的Nature Biotechnology杂志上，文章的通讯作者是匹兹堡大学病理学教授
Nature六年探索－终于发现一种全新炎症机制
科学家们发现了一种可以切断炎症的新型代谢过程，这个被称为“itaconate”的分子是一种来自葡萄糖的分子，是巨噬细胞的一种强有力开关。而巨噬细胞这种免疫系统中的重要细胞，也就是许多炎症性疾病的核心，包括关节炎，炎症性肠病和心脏病等。 这一研究成果公布在3月28日的Nature杂志上，由爱尔兰
PNAS、Nature子刊展现病毒感染的全新一面
许多双链DNA病毒通过注入自己的遗传学物质来感染宿主细胞。那么，包装在病毒衣壳里的坚硬DNA是怎样进入细胞的呢？ Carnegie Mellon大学的生物物理学家Alex Evilevitch，通过两项研究为人们展示了病毒感染的全新一面。研究显示，病毒感染时其DNA会发生相变（phase tr
Nature－Genetics：GWAS和HiC技术解密全新癌症相关基因
睾丸癌是最常见的年轻男性癌症。铂类化疗是较为成功的治疗手段，但仍有少部分男性对其缺乏反应。一般患者的初次确诊年龄在二三十岁，这意味着他们今后的人生不得不忍受长期化疗带来的副作用。 伦敦癌症研究所（ICR）的科学家们调查了3万名男性DNA，发现了19种与睾丸癌有关的新基因变异。结合先前鉴定的遗传
Cell：华丽变身，蛋白质获取全新功能
来自德国拜罗伊特大学研究人员领导一项新研究揭示了一种科学家们曾经认为不可能的机制：蛋白质通过展开(unfold)自身，再折叠形成全新的形状获取了全新的功能。这一研究发现在线发表在7月20日的《细胞》(Cell)杂志上。 这种称作RfaH的蛋白可激活基因，使细菌细胞对它们的宿主发起成功的攻击
全新上市－|－全自动平行毛细管蛋白电泳
新年伊始，蛋白质科学周 PepTalk 2024 在美国圣地亚哥举行，期间，安捷伦科技重磅发布了其在蛋白质分析领域的新产品 Agilent ProteoAnalyzer。 据悉，Agilent ProteoAnalyzer 系统是一种平行毛细管电泳仪器，可自动进行还原型和非还原型蛋白质样品的毛细管电
Nature解析多功能的无序蛋白
精密折叠的结构，给蛋白赋予了多重功能。不过，细胞中也存在不少未折叠的松散蛋白，这些无序蛋白IDP(intrinsically disordered protein)也能执行多种功能。本周的Nature杂志上，Scripps研究所(TSRI)的科学家们，阐述了一个重要IDP实现多重功能的策略，
Nature子刊揭示致癌免疫蛋白
来自美国国立卫生研究院的研究人员，在一项研究中揭示一组与人体自然防御相关的蛋白质，导致了人类DNA的大量突变。研究结果表明，这些自然生成的突变与致癌剂一样可以强有力地导致肿瘤形成。研究论文发表在7月14日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。 这些蛋白质是一组称之为
Nature子刊：阻击ALS毒性蛋白
肌萎缩侧索硬化ALS到目前为止还是一种不治之症。日前，Gladstone研究所和斯坦福大学医学院发现，操纵一个基因能够中止神经细胞中毒性蛋白的累积，为包括ALS在内的多种神经退行性疾病提供了新的治疗策略。该研究发表在十月二十八日Nature Genetics杂志上。 ALS 患者通