新型全转录组单碱基分辨率N6甲基腺苷(m6A)检测方法
在已知的100多种RNA化学修饰中,N6-甲基腺苷(m6A)是真核细胞mRNA中最丰富的形式之一,占所有腺苷的0.1%~0.4%。m6A修饰可影响mRNA代谢的不同阶段以及长非编码RNA和microRNA产生,是RNA和表观修饰领域的重要研究方向。已有研究表明,m6A能够影响多种生物学过程,包括神经元发育、细胞命运转变、免疫反应、DNA损伤反应和肿瘤发生等。因此精准定检测m6A对了解其与人类发育和常见疾病的广泛联系有着重要意义。 由于m6A的化学性质与腺苷类似,所以难以通过化学反应进行鉴别。为准确鉴定m6A,科学家开发了多种检测方法。甲基化RNA免疫共沉淀测序(merip-seq或m6A-seq)已被广泛用于m6A分析,但其精确度较低。虽然也有很多检测方法在分辨率方面进行了改进,例如PA-m6A-seq、miCLIP和m6A-CLIP,但这些方法都依赖于m6A特异性抗体。由于抗体存在亲和力变化和批次效应等问题,难以准确量化......阅读全文
新型全转录组单碱基分辨率N6甲基腺苷(m6A)检测方法
在已知的100多种RNA化学修饰中,N6-甲基腺苷(m6A)是真核细胞mRNA中最丰富的形式之一,占所有腺苷的0.1%~0.4%。m6A修饰可影响mRNA代谢的不同阶段以及长非编码RNA和microRNA产生,是RNA和表观修饰领域的重要研究方向。已有研究表明,m6A能够影响多种生物学过程,包括
全套病毒RNA-m6A甲基化修饰研究工具的使用(一)
如果新冠病毒SARS-CoV-2的大流行对我们有任何启发的话,那么要数对RNA修饰的研究了,此时研究病毒RNA以及其甲基化修饰等功能,显得比以往任何时候都更加重要。 而这是否意味着要研究病毒RNA本身不同的各种突变体或者表观遗传变化如何使这些病毒更灵活和感染力?还是研究从细胞和
RNA-m6A甲基化修饰研究相关研究的应用
如果新冠病毒SARS-CoV-2的大流行对我们有任何启发的话,那么要数对RNA修饰的研究了,此时研究病毒RNA以及其甲基化修饰等功能,显得比以往任何时候都更加重要。 而这是否意味着要研究病毒RNA本身不同的各种突变体或者表观遗传变化如何使这些病毒更灵活和感染力?还是研究从细胞和组织中收集的R
研究发现N6甲基腺苷调节人体细胞RNA:DNA杂交的稳定性
近日,英国诺丁汉大学等科研机构的研究人员在Nature Genetics上发表了题为“N6-methyladenosine regulates the stability of RNA:DNA hybrids in human cells”的文章,发现N6-甲基腺苷可以调节人体细胞RNA:DNA
何川、贾桂芳Nature子刊发布表观遗传学新成果
来自芝加哥大学、北京大学的研究人员在新研究中,揭示出了拟南芥m6A甲基化组(methylome)的独特特征。他们的研究结果发表在11月28日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。 芝加哥大学的何川(Chuan He)教授、Joy Bergelson教授以及北京大学
表观遗传研究热点:RNA-甲基化(m6A)研究
随着表观遗传学研究的不断深入,组蛋白修饰(甲基化,乙酰化,磷酸化…)和 DNA 甲基化修饰相关的高水平研究成果如雨后春笋般涌现,遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊杂志。在分子生物学的中心法则中,遗传信息从 DNA、RNA 流向蛋白。基因组 DNA 和组蛋白上都存
表观遗传研究热点:RNA-甲基化(m6A)研究
随着表观遗传学研究的不断深入,组蛋白修饰(甲基化,乙酰化,磷酸化…)和 DNA 甲基化修饰相关的高水平研究成果如雨后春笋般涌现,遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊杂志。在分子生物学的中心法则中,遗传信息从 DNA、RNA 流向蛋白。基因组 DNA 和组蛋白上都存在可逆的表观遗
新研究发现运动抗焦虑的表观遗传机制
暨南大学粤港澳中枢神经再生研究院张力课题组在苏国辉院士的支持下,阐述了运动后肝脏代谢产物通过增强脑内突触相关转录本RNA甲基化修饰,调控前额叶皮质突触活动性,从而预防焦虑样表型发生的生物学机制。相关研究于6月1日发表于《尖端科学》(Advanced Science)。
新研究发现运动抗焦虑的表观遗传机制
暨南大学粤港澳中枢神经再生研究院张力课题组在苏国辉院士的支持下,阐述了运动后肝脏代谢产物通过增强脑内突触相关转录本RNA甲基化修饰,调控前额叶皮质突触活动性,从而预防焦虑样表型发生的生物学机制。相关研究于6月1日发表于《尖端科学》(Advanced Science)。
m6A修饰在头颈鳞癌免疫微环境调控中的作用机制
N6-甲基腺苷(m6A)修饰是RNA上丰度最高的修饰方式,属于转录后调控的重要机制,在各种生理和病理条件下发挥着关键作用,也给疾病治疗提供了崭新的靶点。然而,m6A在头颈鳞癌中的修饰状态以及作用模式尚不清楚。2022年4月,张志愿院士/何悦教授团队在肿瘤学权威期刊《分子癌症》(IF=41)在线发表题
Nature-Genetics-|-何川团队绘制淋巴母细胞样细胞系QTL图谱
N6-甲基腺苷(m6A)在调节信使RNA加工中起重要作用。尽管在该领域取得了快速进展,但对m6A修饰的遗传决定因素及其在常见疾病中的作用了解甚少。 2020年6月29日,芝加哥大学何川等团队在Nature Genetics 在线发表题为“Genetic analyses support the
著名华人科学家Nature发布表观遗传重大发现
发表在2月10日《自然》(Nature)杂志上的一项新研究,描绘了可显著促进基因转换为蛋白质的一种小化学修饰。这一研究发现与近期其他的研究结果一起,为分子生物学“中心法则”增添了一个关键的新层面:表观转录组(epitranscriptome)。 论文的资深作者、芝加哥大学化学系教授、霍华德休斯
三个月内搞定5分m6A甲基化谱文章
关于m6A修饰的研究在生物领域持续火热,近年国自然立项和文章发表数目保持指数增长趋势,2020年pubmed收录文章已经高达652篇。云序生物在m6A修饰测序领域具有丰富的经验,近期云序客户又连发了5篇m6A甲基化测序研究的文章,下面小编就带大家一起来分析下这几篇发表文章的研究思路,给想短时间内发表
我国学者在驱动肿瘤发生和转移的表观遗传机制新进展
图 HRAS m6A修饰调控肿瘤细胞命运 在国家自然科学基金项目(82203348、82103230、82025029、82150114)等资助下,东南大学高山教授课题组在驱动肿瘤发生和转移的表观遗传机制研究方面取得进展。研究成果以“N6-甲基腺苷对HRAS的表观转录调控驱动肿瘤进展(Epitra
Cell综述:RNA修饰的新作用
迄今为止,科学家们已经发现了上百种RNA修饰类型,但是其中大多数在mRNA和调控非编码RNAs中还是很罕见的。近期的一些研究发现指出,这些修饰中有至少有一些含量丰富,且保守性强。本期Cell杂志以此为中心,介绍了两种RNA修饰方式的分子机制,和生物学功能。 这两种RNA修饰方式分别是N6-甲基
首个大豆全景定量蛋白质组图谱发布
近日,中国农业科学院生物技术研究所联合多家单位,绘制出大豆全景定量蛋白质组图谱,揭示了RNA甲基化在调控大豆蛋白表达量中的作用,并利用蛋白质组数据挖掘出调控大豆发育的新表观因子MTBa。相关研究成果发表在《细胞—基因组学》(Cell Genomics)上大豆基因组数据尽管可以提供大量信息,但不足以阐
我国学者在植物甲基腺嘌呤动态可逆调控研究取得进展
在国家自然科学基金项目(项目编号:21432002,21372022,21210003)等资助下,北京大学化学与分子工程学院何川/贾桂芳课题组在高等植物N6-甲基腺嘌呤(m6A)动态可逆调控的研究中取得重要进展。N6-甲基腺嘌呤去甲基酶ALKBH10B通过m6A介导调控拟南芥开花转化机理 研究
星形胶质细胞ALKBH5调控抑郁相关行为
近日,南方医科大学基础医学院神经生物学教研室教授曹雄团队研究揭示了星形胶质细胞N6-甲基腺嘌呤(m6A)去甲基化酶AlkB同源蛋白5(ALKBH5)发挥抗抑郁作用的分子机制。相关成果在线发表于《自然-通讯》(Nature Communications)。抑郁症是最常见的神经精神疾病之一,其核心症状包
星形胶质细胞ALKBH5调控抑郁相关行为
近日,南方医科大学基础医学院神经生物学教研室教授曹雄团队研究揭示了星形胶质细胞N6-甲基腺嘌呤(m6A)去甲基化酶AlkB同源蛋白5(ALKBH5)发挥抗抑郁作用的分子机制。相关成果在线发表于《自然-通讯》(Nature Communications)。 抑郁症是最常见的神经精神疾病之一,其核
转录组测序和全转录组测序的区别
全转录组广义上是指细胞在特定状态下所能转录出来的 所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA 。借助高通量测序技术,可以全面获取样本中转录产物信息,结合竞争性内源RNA ( ceRNA)机制, 进行联合分析,深入挖掘转录水平调控网络。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有
华中农大80后教授Nature发布表观遗传重要成果
来自华中农业大学、浙江大学和中国科学院武汉物理与数学研究所的研究人员报告称,他们通过解析METTL3–METTL14复合物的晶体结构揭示出了N6-腺苷甲基化的结构基础。这一重要的研究成果发布在5月25日的《自然》(Nature)杂志上。 华中农业大学的“80后”教授殷平(Ping Yin)博士
植物RNA修饰将成为新一代作物改良靶标
近日,上海交通大学生命科学技术学院副教授姜博晨课题组在《生物技术通报(英文)》(aBIOTECH)发表了综述论文。文章系统梳理了植物m6A调控的最新研究进展以及利用m6A修饰进行作物改良的潜在应用策略。 RNA表观修饰是指发生在RNA分子上的化学修饰,广泛存在于动物、植物、真菌等真核生物。N6
植物RNA修饰将成为新一代作物改良靶标
近日,上海交通大学生命科学技术学院副教授姜博晨课题组在《生物技术通报(英文)》(aBIOTECH)发表了综述论文。文章系统梳理了植物m6A调控的最新研究进展以及利用m6A修饰进行作物改良的潜在应用策略。RNA表观修饰是指发生在RNA分子上的化学修饰,广泛存在于动物、植物、真菌等真核生物。N6-甲基腺
广州生物院m6A修饰调控体细胞重编程机理研究获进展
9月8日,中国科学院广州生物医药与健康研究院陈捷凯课题组在Cell Reprots杂志在线发表了题为YTHDF2/3 are required for somatic reprogramming through different RNA deadenylation pathways的文章。该研
我国学者在痕量样品m6A修饰定量检测方面取得进展
图 GLORI 2.0和3.0实现痕量样本全转录检测m6A修饰 在国家自然科学基金项目(批准号:22425071)等资助下,北京大学伊成器团队联合中科院遗传与发育生物研究所王秀杰团队,于2025年5月5日在《自然・方法》 (Nature Methods)期刊上发表了题为“Mild and ultr
中科院、复旦Nature子刊解析RNA甲基化
在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以调控基因的表达,并由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现,mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。 N6-methyladenosine(m6A)是真
PLOS-Genetics:甲基转移酶OsFIP在植物早期孢子发生的作用
N6-甲基腺苷(m6A)RNA甲基化在不同物种的发育过程中起重要作用。然而,单子叶植物中m6A RNA甲基化的知识仍然有限。2019年5月22号,中山大学陈月琴 、张玉婵研究团队等人在PLOS Genetics上在线发表了题为The subunit of RNA N6-methyladenosi
何川教授Nature,Cell子刊解析表观遗传学
早年毕业于中国科技大学的何川教授现任芝加哥大学生物物理动态研究所主任,以及北京大学合成与功能生物分子中心主任。何川教授研究组主要从事化学生物学、核酸化学和生物学、遗传学等方面的研究,近期在Nature Biotechnology,Molecular Cell杂志上发表新研究成果,解析基因组及
20分文章中的RNA甲基化,热度与实力并存
近期华人科学家辛辛那提大学陈建军教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修饰在正常和恶性造血过程中的重要作用,表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信号轴在髓系分化以及白血病发生过程中的作用。该研究于2018年1月发表在干细胞顶级期刊《Cell Steam Cell》(影响因子:23.3
m6A(N6甲基腺嘌呤)修饰在动脉粥样硬化中的作用
动脉粥样硬化(atherosclerosis)是心血管系统最常见的疾病之一,对人类健康有严重危害。内皮细胞炎症反应作为动脉粥样硬化的第一步,会导致内皮细胞的通透性增加、屏障功能受损以及粘附分子的表达,促使单核细胞迁移并粘附于血管内皮表面,进而引发动脉粥样硬化的发生和发展。 N6-甲基腺嘌呤(m6A)