用PCR进行基因分型2

质谱法原则上,添加到引物末端的核苷能够直接依据质量,利用通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectroscopy,MALDI-TOFMS)直接检测出来,这是一种不需标记的方法。单碱基延伸产物质谱结果能够显示所添加的核苷。MALDI-TOFMS需要大型设备,但因为高度多路技术和高通量分析,这种方法的成本只为0.03美元/单突变,只是备的成本限制了其普及。MALDI-TOFMS还能实现利用非常少量的DNA的超高通量分析。最主要的MALDI-TOFMS平台是Sequenom的MassArray 基因分型系统。忠告一次基因分型分析所能够检测的遗传突变的数量正在快速增长,比如能进行全基因组联合研究的微点隈杂交(Hybridization to microarrays)。虽然实验过程比较简单,但对于有多个旁系......阅读全文

乙肝HBV基因分型检测原理

1、全面型别分析    采用Sanger测序法对乙肝病毒进行分型基因检测。通过提取慢性乙型肝炎患者血液中的病毒DNA,利用特异性引物对HBVDNA中的基因进行PCR扩增。通过对扩增后的目的基因进行测序,将测序信息与NCBI中标准株的序列信息进行比对,可一次性检出慢性乙型肝炎病毒A、B、C、D

HPV分型基因检测的简介

  HPV分型基因检测指的是检测多种基因型HPV的同时可以对HPV阳性结果进行基因分型的检测技术。其利用包括PCR-荧光探针法或其他分子生物学方法在内的核酸检测技术,以特定高危型HPV核酸(包括DNA和RNA)序列为检测目的,对人宫颈样本(如人宫颈脱落上皮细胞或分泌物等)进行体外定性检测的试剂,以确

丙型肝炎病毒的基因分型

  HCV基因分型还无统一标准,因用于基因分型的部位和采用的技术方法不同,出现了各种基因分型结果,但各种基因型分类方法之间有一定的对应关系,兹举几种基因型分类法供参考。  HCV基因型各种分型之间的对应关系  现知欧美国家多数HCV-Ⅰ型感染,而亚洲国家以Ⅱ型为主,Ⅲ型次之。Okomoto报告日本慢

HPV分型基因检测的意义

  近年来,人类乳头状瘤病毒(HPV)的发现及分型为宫颈癌筛查提供了一个全新途径。1976 年,Zur Hausen H 首次提出人类乳头状瘤病毒(HPV)与宫颈癌的发病密切相关。随后大量流行病学资料及研究已明确显示 HPV 持续感染是宫颈癌发病的首要条件。绝大多数宫颈癌样本都可检出HPV,HPV阴

用缺失定位法进行基因定位

缺失定位法一个细胞中的两个同源染色体中的一个上有一个突变基因,另一染色体上有一小段已知范围的缺失,如果这一突变基因的位置在缺失范围内,便不可能通过重组而得到野生型重组体;如果突变基因不在缺失范围内,那么就可以得到野生型重组体。利用一系列已知缺失位置和范围的缺失突变型,便能测定突变型基因的位置。

用共缺失法进行基因定位

共缺失法缺失带来和基因突变相同的表型。由一次缺失所造成的突变只涉及相邻接的基因,因此可以从缺失所带来的基因突变的分析来测定一些基因的相对位置,这一方法被广泛应用于酵母菌的线粒体基因的定位(见染色体外遗传)。根据基因行为的定位  基因的某些行为可以反映它们的位置。在细菌接合过程中“雄性”细菌的染色体基

用标记获救法进行基因定位

标记获救法这是一种结合物理图谱制作和遗传学分析的基因定位方法,它适用于病毒等基因组较小的生物。以大肠杆菌噬菌体ΦX174为例,把野生型噬菌体的双链复制型DNA分子用限制性内切酶HindⅡ切为13个片段,把每种片段和突变型 amg的DNA单链在使DNA分子变性并复性的条件下混合保温,然后用各个样品分别

使用引物延伸荧光偏振探测法的高通量基因分型实验2

 四重 PCR 的引物延伸法实验材料目的基因组DNA试剂、试剂盒10XPCR扩增缓冲液Taq DNA 聚合酶4dNTP 混合液PCR 引物混合液AcydoTerminator混合液仪器、耗材384孔透明 PCR 板和黑色 PCR 板多管移液器或液体操作工作站384孔 PCR 板封口垫带加热盖的热循环

什么是基因分型定量检测系统?

基因分型定量检测系统是采用的基因芯片技术,用来检测HPV\HSV等DNA病毒的系统。该系统广泛应用于传染病流行病学中,如性传播疾病(尖锐湿疣、生殖器疱疹)、慢病(肿瘤、高血压)等。

PYRO测序用于SNP基因分型原理

其实是一种段片段焦磷酸测序技术,在测序引物的引导下,完成段片段(含snp)的测序,从而实现基因分型。缺点:不能检测长片段,对于重复序列没有办法。原理简介1.测序引物与单链,PCR扩增的DNA模板相结合。然后将其与DNA聚合酶、ATP硫酸化酶、荧光素酶和三磷酸腺苷双磷酸酶,以及底物APS和荧光素一起孵

基因分型定量检测技术的定义

基因分型定量检测系统是国际上在传染病流行病学应用中最广泛的检测诊断系统。主要通过基因芯片对HPV、HSV等DNA病毒进行检测,分析基因表达的类型,了解基因功能,从而指导疾病的诊断、预后、病理分析、治疗等各种研究。基因芯片主要用于DNA 突变分析、基因谱差异分析、基因诊断分析和大规模基因类型分析。 基

HPV分型基因检测的应用前景

  近年来 HPVDNA 检测逐步取代原有的宫颈癌筛查手段,其筛查CIN2+ 病变的敏感度明显高于细胞学检查。[7]HPV 检测检出宫颈高级别病变的敏感性较单独细胞学检测更好,几乎等同于联合筛查。高危型HPV检测作为宫颈癌初筛策略具有较好的成本效能,随着价值医学理念的深入,单独 HPV 检测作为初筛

乙肝病毒的基因分型

HBV根据抗原决定簇的差异可划分为4个不同的血清型和9个血清亚型, 通过对HBV全基因序列比较后发现,血清亚型的区分并不能反应HBV基因组的差异。根据HBV全基因核苷酸序列异源性≥ 8.0% 或者S基因区核苷酸序列异源性≥4.0% , 将不同病毒株分为A-H 8个基因型。    HBV基

免提取DNA,轻松搞定基因分型

基因分型是通过使用生物学试验检查个体的DNA序列的过程,也是将目标序列与另一个体的序列或参考序列进行比较来确定个体的遗传构成(基因型)差异的过程。PCR 是一种常见的基因分型方法,用于对样本的基因型进行扩增和鉴定。但由于基因分型通常需要检测成百上千份样品,样品处理、提取基因组DNA、PCR扩增目的基

基因分型定量检测技术的原理

基因分型定量检测系统的核心是基因芯片技术,基因芯片技术是一种大规模集成的固相杂交,其技术要点主要包括芯片的制备、样品的制备及标记、分子杂交与检测、生物信息学分析四个方面。基本原理是核酸分子杂交,即应用显微光蚀刻技术把大量的DNA片段以可寻址的方式,高密度地固定到一小块载玻片上,利用核酸碱基之间的配对

乙肝HBV基因分型检测定义

乙肝HBV基因分型检测是基因扩增检测实验室(PCR实验室)进行的一项检查,是通过取自患者血液及其他体液、细胞中提取的HBVDNA进行检测的技术。提取出来的HBVDNA经过扩增基因信息后,通过特定设备对乙肝患者细胞中的HBVDNA分字进行分子信息检测,分析它所含有各种基因型的情况,从而使患者了解自己对

关于单基因病的分型介绍

  1.常染色体疾病(显性和隐形)  致病基因为显性并且位于常染色体上。如软骨发育不全、多指(趾)症、基因位于X染色体上:抗维生素D佝偻症等。亲代有一患者,后带发病率一般为50%(如亲代为纯合体、则后带发病率为100%,但这种情况较少)。  2.常染色体隐形遗传病  致病基因为隐性并且位于常染色体上

Affymetrix推出AxiommiRNA靶基因分型芯片

  2012年11月6日,来自加利福尼亚州圣克拉拉的消息――Affymetrix公司(纳斯达克代码:AFFX)推出了 Axiom® miRNA靶基因分型芯片,唯一一款可在全基因组范围评估microRNA(miRNA)靶基因位点的高密度基因分型工具。这些新的芯片将实现全面研究,以阐明miRNA调控

HP分型检测的分型

  幽门螺杆菌(Hp)可以分泌毒素损坏人体细胞,引起炎症、溃疡及肿瘤等。依据其分泌毒素的情况不同,可以将其分为产细胞毒素和非产细胞毒素两大类;能产生毒素的为I型,不能产生毒素的是II型。  不同类型的幽门螺杆菌毒力  Ⅰ型HP由于产生细胞毒素,因此有较强的毒性,与胃十二指肠溃疡、MALT淋巴瘤及胃癌

用共转导法进行基因定位

共转导法公式2每一种转导噬菌体有一定的大小,只能携带一定长度的供体细菌的 DNA。例如大肠杆菌噬菌体PI的头部中只能包装大约分子量为5.8×10的DNA,大肠杆菌的染色体DNA的分子量是2.5×10,所以PI所能包装的 DNA至多相当于大肠杆菌的遗传学图上相距两分钟这样一段DNA分子。如果两个基因能

人工智能分型指导2型糖尿病精准治疗

2型糖尿病是最常见的一种糖尿病类型,因其受遗传因素和环境因素共同作用,通常患者具有较大的异质性,即在2型糖尿病患者中血糖控制难易程度、并发症发生轻重程度因人而异,给临床治疗带来了较大挑战。近年来,新一代口服降糖药——钠-葡萄糖协同转运蛋白2抑制剂(简写:SGLT2i抑制剂),可以抑制肾脏对葡萄糖的重

基因分型定量检测技术的技术特点

基因芯片技术突出特点是集成化、微型化、自动化,代表了未来分子诊断的发展趋势。其优点有以下几个方面:一是高度的灵敏性和准确性;二是快速简便;三是可同时检测多种疾病。因此已广泛应用于DNA序列测定、基因表达谱分析、基因组研究、基因突变检测及多态性分析、疾病的临床诊断和预测、药物研究与开发以及法医鉴定、工

基因分型定量检测技术的应用介绍

【1】传染病的快速诊断及监测:未来的传染病爆发后的检测主要依靠基因芯片的快速初筛及诊断,做到24 h内明确病因,为防疫工作者提供可靠的数据,是指导控制疫情的必要手段。【2】分子流行病学资料分析:对于一些病因机制不清、病原体相关资料缺乏的传染病可以用基因芯片进行研究,为历史上爆发的传染病之间的联系提供

基因分型定量检测技术的操作流程

基因分型定量检测系统的操作流程包括:寡核苷酸探针的合成、固定、杂交和检测等四个步骤。该系统对于疾病的诊断、预后、病理分析、治疗等具有重大意义。

Affymetrix推出AxiomBiobank芯片,用于基因分型研究

  2012年11月1日,来自加利福尼亚州圣克拉拉的消息――Affymetrix公司(纳斯达克代码:AFFX)今日宣布推出 Axiom® Biobank 芯片,一种内容灵活且性价比很高的功能生物学方案,能够经济地对大样品集合进行基因分型,如生物样本库、基因组中心及核心实验室筛查的样品。   A

乙肝HBV基因分型检测临床意义

1、有助于预测慢性乙肝进展、判断乙型肝炎病程及转归    慢性乙型肝炎感染不仅会引发肝纤维化、肝硬化,更加会引发肝细胞癌的发生、发展有着密切的关系。通过HBV基因分型检测技术可精准、精确的检测出HBV的复制情况、患者自身病情恶化程度及病情的恢复状况2、判断乙型肝炎病毒致病性    由于我国慢性乙型肝

基因分型的新方法被研发

    廉价的基因分型方法对现代基因组学至关重要。在最新这篇论文中,研究人员报道了QUILT,它使用低覆盖率的全基因组序列数据执行二倍体基因型填充。QUILT采用吉布斯采样将读数划分为母本和父本集,并使用大型参考面板促进快速单倍体填充。  研究人员证明了这种划分在许多兆碱基上是准确的,能够实现接近理

用SYBR-Green-Ⅰ进行定量PCR实验的最适读板温度

SYBR Green Ⅰ( SG Ⅰ)是一种双链 DNA 结合染料,它在定量 PCR 实验中对核酸的灵敏检测和定量是非常有用的。但采用 SG Ⅰ也有一个潜在的缺点,那就是一些非特异的产物也能和染料结合并产生荧光信号。引物二聚体是最常见的假信号源,而且任何非特异的双链 DNA 的存在都会产生信

用体细胞交换法进行基因定位

体细胞交换法基因定位三点测验和着丝粒距离法中所测定的都是发生在减数分裂中的染色体交换。1936年美国遗传学家C.斯特恩在果蝇中发现体细胞在有丝分裂过程中也可以发生染色体交换(见连锁和交换)。50年代中G.蓬泰科尔沃等在研究构窠曲霉时发展起来一种利用体细胞交换的系统的基因定位方法。在进行有丝分裂的杂合

PCR共分几步

标准的PCR过程分为三步:1.DNA变性  (90℃-96℃):双链DNA模板在热作用下,氢键断裂,形成单链DNA2.退火  (25℃-65℃):系统温度降低,引物与DNA模板结合,形成局部双链.3.延伸  (70℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右,活性最佳)的作用下,以dNTP为原料,从引物的