Nature:新研究让mRNA转录本上的m6A标记不再神秘
在一项新的研究中,来自美国康奈尔大学和密歇根大学的研究人员发现在一些mRNA转录本上出现的化学修饰可能在一定程度上有助于细胞在遭受损伤后进行自我修复,并且也可能是了解重要的人类疾病的关键。相关研究结果近期发表在Nature期刊上,论文标题为“m6A enhances the phase separation potential of mRNA”。 这类称为N6-甲基腺苷(N6–methyladenosine, m6A标记)的化学修饰是在某些条件下由酶作用于一些人体基因的mRNA转录本上产生的,但是这些标记的功能在很大程度上是未知的。在这项新的研究中,这些研究人员发现m6A标记可导致含有m6A的mRNA储存在细胞的特殊液滴状区室(droplet-like compartment)中。在正常情形下,这些mRNA会被细胞中的蛋白制造工厂---核糖体---翻译为蛋白,但是它们在液滴状区室中的隔离有效地阻断了蛋白产生。他们发现的证据......阅读全文
Cell-Research-肠道菌群调控宿主RNA甲基化和基因表达新机制
肠道菌群微生物组学是近年来研究热点,肠道菌群在维持宿主生理平衡和健康中发挥着重要作用,在人和动物疾病治疗方面具有极大的应用前景。研究表明,肠道菌群及其代谢产物可调节宿主基因表达。随着研究的深入, 肠道菌群和宿主之间的相互作用机理也越来越多被发现,特别是通过表观遗传影响宿主的基因表达。如最新研究发
Nature发表表观遗传学重要发现-决定性别的RNA甲基化
N6-methyladenosine(m6A)是真核生物mRNA和长非编码RNA上最普遍的一种RNA修饰,介导了超过80%的RNA碱基甲基化。人们已经陆续鉴定了m6A所需的“读”、“写”和“擦除”蛋白,但对其生物学功能还知之甚少。 伯明翰大学的科学家们在Nature杂志上发表文章,揭示了m6A
云序RNA修饰技术余义勋课题组植物m1A修饰调控机制的运用
导读 RNA甲基化修饰在调控生物生长发育的过程中起重要作用,m6A和m5C在植物体内的产生机制和生物学功能已有较多研究论文发表,然而RNA m1A(N1-甲基腺嘌呤)修饰在植物中的研究还非常少。 近日,Plant Physiology 在线发表了华南农业大学余义勋课题组题为“The
中大学子与学术牛人解析RNA修饰与癌症干细胞
N6-methyladenosine(m6A)是真核生物mRNA上最常见的一种转录后修饰,这种可逆的RNA甲基化修饰与人类疾病有关。研究者们已经陆续定位了哺乳动物转录组中的m6A,鉴定了这种动态修饰所需的“读”、“写”和“擦除”蛋白。不过,人们还对m6A起到的具体作用还知之甚少。 约翰霍普金斯
Nature报道表观遗传学新发现
日前,芝加哥大学的科学家们在Nature上发表最新的研究成果。这项研究揭示了N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)调控RNA-蛋白质相互作用的一个未知机制。 RNA结合蛋白通过与单链RNA结合基序(RNA binding motif,RBMs)1、2、3的结合来控制细胞
m6A(N6甲基腺嘌呤)修饰在动脉粥样硬化中的作用
动脉粥样硬化(atherosclerosis)是心血管系统最常见的疾病之一,对人类健康有严重危害。内皮细胞炎症反应作为动脉粥样硬化的第一步,会导致内皮细胞的通透性增加、屏障功能受损以及粘附分子的表达,促使单核细胞迁移并粘附于血管内皮表面,进而引发动脉粥样硬化的发生和发展。 N6-甲基腺嘌呤(m6A)
科学家揭示生物钟调控代谢新方式
近日,南京农业大学动物科技学院教授王恬团队与芝加哥大学合作在《细胞—报告》上在线发表研究论文,揭示了生物钟调控代谢的新方式,拓展了人们对生物钟、m6ARNA甲基化修饰和代谢相互关系的认识。 N6-甲基腺嘌呤(m6A)是真核生物RNA上最丰富的一种转录后修饰,在基因表达、RNA剪切、mRNA运输
不得了,大牛告诉你lncRNA甲基化如何研究
lncRNA分子通过海绵机制结合microRNA发挥生物学功能,这个ceRNA机制已经让大家心生厌倦了。可大牛就是大牛,引入甲基化就能轻松的变废为宝,竟然能让lncRNA的ceRNA思路变得瞬间高大上发表10分以上的文章,你一定和小编我一样很好奇他是怎么做到的。 RNA甲基化,作为最新的国
Nature遗传学综述:何川教授详解RNA甲基化
在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可调控基因的表达,并由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现, mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。 RNA在生物学系统中有着举足轻重的作用,它
我国学者发现果蝇性别决定新因子
中科院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所严冬研究组和美国哈佛大学Norbert Perrimon研究组合作研究,发现并鉴定了RNA m6A甲基转移酶复合物的新成员Xio,并且该基因也是果蝇性别决定信号途径新的组分。相关研究成果近日在线发表于美国《国家科学院院刊》。 N6-methyl
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN
NCB-|-这一次,FTO是snRNA的m6Am去甲基化酶
RNA的m6A修饰是RNA表观遗传学研究领域的大热门,近年来相关研究多次登上高分杂志。从胚胎发育到疾病进程,从RNA的稳定性到可变剪接和翻译效率,m6A的功能几乎无处不在(图1)。图1 由于m6A是一种RNA修饰,若想知道它在某一体系(发育阶段或癌症)中的作用,目前大部分研究都是基于影响m6A
m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RNA在
Hepatology:m6A-RNA甲基化酶METTL3促肝癌发展新玄机
近年来,m6A RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一,不断有CNS的文章问世,m6A RNA修饰的催化、去除以及识别的分子机理研究越来越清晰,而人们更关心的似乎是m6A RNA修饰与重大疾病例如肿瘤之间的相关性。表观遗传的改变极大得促进了人类癌症的发展,近期Hepat
云序RNA修饰技术在华南农大余义勋课题组植物m1A修饰...2
2. m6A甲基转移酶METTL3的泛素化调节其功能 发表期刊:Nucleic Acids Research影响因子:11.147发表日期:2018.06.01实验方法: m6A-seq,RNA-seq,MeRIP-PCR,RIP等(云序提供) 上海交通大学医学院余健秀组在著名期刊《核酸研究》发
云序RNA修饰技术在华南农大余义勋课题组植物m1A修饰...3
5. m6A修饰调控新生小鼠β细胞的成熟 发表期刊:Diabetes影响因子:7.2发表日期:2020.05.13实验方法:m6A-seq、mRNA-seq、MeRIP-PCR、整体m6A修饰水平等(云序提供) 近期Diabetes杂志(IF=7.2)发表了m6A修饰调控新生小鼠β细胞的成熟机制相关
m6A-RNA甲基化酶METTL3促肝癌发展新玄机
导读近年来,m6A RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一,不断有CNS的文章问世,m6A RNA修饰的催化、去除以及识别的分子机理研究越来越清晰,而人们更关心的似乎是m6A RNA修饰与重大疾病例如肿瘤之间的相关性。表观遗传的改变极大得促进了人类癌症的发展,近期Hepat
我国学者在植物甲基腺嘌呤动态可逆调控研究取得进展
在国家自然科学基金项目(项目编号:21432002,21372022,21210003)等资助下,北京大学化学与分子工程学院何川/贾桂芳课题组在高等植物N6-甲基腺嘌呤(m6A)动态可逆调控的研究中取得重要进展。N6-甲基腺嘌呤去甲基酶ALKBH10B通过m6A介导调控拟南芥开花转化机理 研究
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN
中国农大JBC解析RNA去甲基化酶晶体结构
2014年3月10日,在百年老牌杂志《生物化学杂志》(Journal of Biological Chemistry)发表的一项最新研究中,中国农业大学、清华大学和多伦多大学的研究人员,报道了RNA去甲基化酶Alkbh5催化核心的5个高分辨率晶体结构。该研究的通讯作者为中国农业大学的陈忠周教
Cell综述:RNA修饰的新作用
迄今为止,科学家们已经发现了上百种RNA修饰类型,但是其中大多数在mRNA和调控非编码RNAs中还是很罕见的。近期的一些研究发现指出,这些修饰中有至少有一些含量丰富,且保守性强。本期Cell杂志以此为中心,介绍了两种RNA修饰方式的分子机制,和生物学功能。 这两种RNA修饰方式分别是N6-甲基
RNA表观修饰在造血干细胞发育中的关键作用
血液是生命的源泉。不断流动的血细胞既可以运输营养物质,又是重要的免疫保护屏障。其中,所有的血细胞都来源于造血干细胞。这群干细胞不仅可以维持血液系统的长期稳定,也是骨髓移植治疗恶性血液疾病的核心组分。目前,造血干细胞来源仍是制约临床恶性血液疾病治疗的瓶颈。因此,造血干细胞的体内发育和体外诱导扩增已
m6A修饰的YTHDF1与介导EIF3C对卵巢癌进展的影响(二)
为了全面探索YTHDF1及其靶基因之间的直接相互作用,作者对过表YTHDF1的A2780细胞,进行了eCLIP-seq,并鉴定了2,343个目标转录物,这些转录物大多数是mRNA。将eCLIP seq的结果2,343个基因和上面三组数据交集确定的647个基因取交集,产生175个基因,将其确定
人类组织中m6A修饰的动态变化和进化
文章导读 m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucle
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用
表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成,还有文章探究过其在急性白血病中的作用,但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在Molecular
华人学者Nature-Methods揭示RNA甲基化的复杂性
在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以调控基因的表达,并由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现,mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。 N6-methyladenosine(m6A)是真
最新云序生物m6A“RNA甲基化”研究汇总—癌症篇
一个月发表30多篇10分以上的文章,到底是何方神圣?答案:RNA甲基化。今天小编先来介绍一下m6A RNA甲基化。 m6A是真核细胞中mRNAs丰度最高的甲基化修饰,在包括组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克以及DNA损伤应答,母本合子(maternal-to-zygotic)转化等多个
何川教授Nature,Cell子刊解析表观遗传学
早年毕业于中国科技大学的何川教授现任芝加哥大学生物物理动态研究所主任,以及北京大学合成与功能生物分子中心主任。何川教授研究组主要从事化学生物学、核酸化学和生物学、遗传学等方面的研究,近期在Nature Biotechnology,Molecular Cell杂志上发表新研究成果,解析基因组及
PLOS-Genetics:甲基转移酶OsFIP在植物早期孢子发生的作用
N6-甲基腺苷(m6A)RNA甲基化在不同物种的发育过程中起重要作用。然而,单子叶植物中m6A RNA甲基化的知识仍然有限。2019年5月22号,中山大学陈月琴 、张玉婵研究团队等人在PLOS Genetics上在线发表了题为The subunit of RNA N6-methyladenosi
甲基化——肿瘤检测治疗的又一靶标?
前言在测序和相关技术不断进步的今天,研究人员不仅能够获得DNA、RNA的碱基序列,更能够获得碱基修饰的复杂信息。目前已经证明DNA甲基化能够导至的肿瘤产生,而Ribomed、基准医疗和鹍远基因等公司作为该领域的先行者,已经开发出相关产品。RNA作为中心法则的下游分子,也有多种多样的修饰,特别是m6A