Nature:新研究让mRNA转录本上的m6A标记不再神秘

在一项新的研究中,来自美国康奈尔大学和密歇根大学的研究人员发现在一些mRNA转录本上出现的化学修饰可能在一定程度上有助于细胞在遭受损伤后进行自我修复,并且也可能是了解重要的人类疾病的关键。相关研究结果近期发表在Nature期刊上,论文标题为“m6A enhances the phase separation potential of mRNA”。 这类称为N6-甲基腺苷(N6–methyladenosine, m6A标记)的化学修饰是在某些条件下由酶作用于一些人体基因的mRNA转录本上产生的,但是这些标记的功能在很大程度上是未知的。在这项新的研究中,这些研究人员发现m6A标记可导致含有m6A的mRNA储存在细胞的特殊液滴状区室(droplet-like compartment)中。在正常情形下,这些mRNA会被细胞中的蛋白制造工厂---核糖体---翻译为蛋白,但是它们在液滴状区室中的隔离有效地阻断了蛋白产生。他们发现的证据......阅读全文

Nature:新研究让mRNA转录本上的m6A标记不再神秘

  在一项新的研究中,来自美国康奈尔大学和密歇根大学的研究人员发现在一些mRNA转录本上出现的化学修饰可能在一定程度上有助于细胞在遭受损伤后进行自我修复,并且也可能是了解重要的人类疾病的关键。相关研究结果近期发表在Nature期刊上,论文标题为“m6A enhances the phase sepa

北京基因组所RNA-m6A甲基化调控mRNA剪切研究获进展

  6-甲基腺嘌呤【N6-methyl-adenosine(m6A)】是高等生物mRNA中含量最为丰富的甲基化修饰形式之一,发生于保守序列RRACH(R=G ,A; H=A,C or U)中,富集在mRNA的外显子编码区及3’-非编码区。类似于DNA甲基化修饰,RNA的m6A甲基化修饰也是可逆的,由

何川、贾桂芳研究组发文:植物mRNA化学修饰m6A去甲基酶

  近期,北京大学化学学院的何川、贾桂芳课题组在在高等植物N6-甲基腺嘌呤(m6A)动态可逆调控的研究中取得重要进展,相关工作以“ALKBH10B is An RNA N6-Methyladenosine Demethylase Affecting Arabidopsis Floral Transi

何川教授最新Nature文章:基因调控新领域的最新发现

  N6-methyladenosine(m6A)是真核生物mRNA上最常见的一种转录后修饰,介导了超过80%的RNA碱基甲基化。这种可逆的mRNA甲基化修饰非常普遍,出现频率大约是3-5个残基/mRNA。m6A的研究发现开辟了真核生物转录后基因调控的新领域。  芝加哥大学的何川(Chuan He)

锌指蛋白ZFP217通过介导m6A-mRNA甲基化导致肥胖的原理

过去三十年来,全球肥胖和2型糖尿病的发病率有所上升,而脂肪组织是肥胖相关疾病的重要因素,因此,控制脂肪细胞分化和成熟可能是治疗肥胖相关疾病的一个有希望的策略(1)。为了阐明转录和表观遗传调控在脂肪形成中的作用,并确定一个主要的关键调控因子和途径(1,2),人们做了大量的努力,然而,转录后调控在脂肪形

5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据

文章导读2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。m6A甲基化与mRNA关联分析案例一:非洲爪蟾睾丸组织中m6A甲基化图谱发表

RNA甲基化整体水平鉴定的方法汇总

RNA甲基化(RNA methylation)是一类表观遗传修饰,在已经发现的超过100种不同的RNA化学修饰中,主要有6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)、5-甲基胞嘧啶(C5-methylcytidine, m5C)和1-甲基腺嘌呤(N1-methylad

5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据得高分

2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。 云序生物是国内最早提供m6A测序的科研平台,也是客户发表文章最多的RNA甲基化测

Nature-Genetics-|-何川团队绘制淋巴母细胞样细胞系QTL图谱

  N6-甲基腺苷(m6A)在调节信使RNA加工中起重要作用。尽管在该领域取得了快速进展,但对m6A修饰的遗传决定因素及其在常见疾病中的作用了解甚少。  2020年6月29日,芝加哥大学何川等团队在Nature Genetics 在线发表题为“Genetic analyses support the

5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据得高分

  文章导读   2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。   云序生物是国内最早提供m6A测序的科研平台,也是客户发表

基因组所肥胖调控机制合作研究获重要进展

  肥胖相关基因FTO主要作用底物是RNA中的6甲基腺嘌呤  近日,中国科学院北京基因组研究所“百人计划”研究员杨运桂与美国芝加哥大学何川教授合作,发现了肥胖相关基因FTO(Fat mass and obesity-associated protein)主要作用底物是RNA中的6甲基

何川教授新发Nature综述:mRNA修饰介导的基因调控

  在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以调控基因的表达,并由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现,mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。  N6-methyladenosine(m6A)是真

小白必看!RNA甲基化整体水平鉴定的方法汇总

  RNA甲基化(RNA methylation)是一类表观遗传修饰,在已经发现的超过100种不同的RNA化学修饰中,主要有6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)、5-甲基胞嘧啶(C5-methylcytidine, m5C)和1-甲基腺嘌呤(N1-methyladenos

一文了解RNA甲基化机制

  1. 什么是RNA甲基化修饰?  我们知道DNA的甲基化修饰是发生在胞嘧啶(C)上的,而最常见的RNA的甲基化修饰是m6A(N6-methyladenosine,6-甲基腺嘌呤)和尿苷化修饰(uridylation,U-tail)。  m6A修饰在70年代就发现了,是可以发生在mRNA、lncR

揭示:AML中相分离形成的nYACs的重要功能

  RNA表观修饰是表观遗传学研究领域的前沿方向。截止目前,已经有超过100种RNA的化学修饰被鉴定出来,而作为真核生物mRNA内部丰度最高的RNA修饰,m6A的功能研究备受关注。m6A可以被甲基转移酶复合体(writer)复合体写入mRNA, 被去甲基化酶(eraser)去除,处于动态平衡当中。细

一次RNA甲基化测序的多项成果云序RNA甲基化测序技术...2

(二)云序客户m6A RNA甲基化修饰表达谱,一次测序两篇文章疾病:胃癌样品:胃癌组织vs癌旁组织(6 vs 6)研究方法:m6A-MeRIP-Seq,RNA-seq4. m6A修饰对其修饰基因在胃癌中的异常表达及预后的潜在影响发表杂志:Frontiers in Genetics影响因子:3.258

植物所解析RNA甲基化调控果实成熟的作用机制

  DNA甲基化(5mC)和RNA甲基化(m6A)是两种重要的核酸修饰,在基因表达调控中发挥重要作用并参与诸多生物学过程。然而,这两种核酸修饰之间是否存在内在关联性却不清楚。近日,中国科学院植物研究所秦国政研究组和田世平研究组合作,揭示了DNA甲基化可通过调节m6A去甲基化酶基因表达的方式影响番茄果

何川、贾桂芳Nature子刊发布表观遗传学新成果

  来自芝加哥大学、北京大学的研究人员在新研究中,揭示出了拟南芥m6A甲基化组(methylome)的独特特征。他们的研究结果发表在11月28日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。  芝加哥大学的何川(Chuan He)教授、Joy Bergelson教授以及北京大学

Nature发表表观遗传学重要发现决定性别的RNA甲基化

N6-methyladenosine(m6A)是真核生物mRNA和长非编码RNA上最普遍的一种RNA修饰,介导了超过80%的RNA碱基甲基化。人们已经陆续鉴定了m6A所需的“读”、“写”和“擦除”蛋白,但对其生物学功能还知之甚少。伯明翰大学的科学家们在Nature杂志上发表文章,揭示了m6A在Sxl

曹雪涛Nature子刊再发文-揭示m6A修饰促进树突状细胞活化

  近日,曹雪涛院士在Nature子刊再发文章,首次揭示了m6A修饰通过改变mRNA翻译水平调节DC的功能活化,对于深入理解RNA表观修饰调控免疫基因表达的机制,进一步阐明m6A修饰在免疫应答及炎症反应中的功能具有重要意义。  免疫应答的表观调控机制是近年来免疫学研究的前沿热点。RNA的N6-甲基腺

上海药物所小分子调控核酸去甲基化研究取得阶段进展

  中科院上海药物研究所杨财广课题组与蒋华良课题组合作,基于mRNA中N6位甲基化修饰的腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)去甲基化酶FTO结构开展小分子调控研究,首次获得了对核酸去甲基化酶,例如FTO具有酶活和细胞活性的小分子抑制剂。论文于10月11日在线发表于《美国化学会

Cancer-Letters:中山大学学者发现治疗肝细胞癌的潜在靶点

  在真核细胞内,m6A是mRNA的最常见修饰之一,m6A甲基转移酶和去甲基酶在多种癌症类型中发挥重要作用。但是m6A结合蛋白在癌症中的作用仍然不是特别清楚。最近来自中山大学的研究人员在国际学术期刊Cancer Letters上发表了一项最新研究进展,他们发现一种mRNA m6A修饰结合蛋白能够对H

中国学者发表RNA甲基化重要成果

  基因组DNA和组蛋白上存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以调控基因的表达,由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现,mRNA和其他RNA也存在类似的表观遗传学调控,比如m6A(N6-methyladenosine)。  西北农林科技大学、中科院上海植物逆境生物学研究中心和美国普

m6A修饰的长链非编码RNA调控神经元的发育及机制

  近日,Cell Reports在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)鲍岚研究组的最新研究进展(m6A-modified lincRNA Dubr is required for neuronal development by stabilizing YTHDF

Science:隐藏的基因控制层影响着从癌症到记忆的一切

  基因上的化学标签可以在不改变DNA序列的情况下影响它们的表达,这一观点曾经令人惊讶,但是现在已经成为教科书上的内容。这种现象,即表观遗传学,现在已经出现在信使RNA (mRNA)上。信使RNA是一种分子,它将基因信息从DNA传递到细胞的蛋白质制造工厂。在上个月的一次会议上,研究人员讨论了RNA表

上海生科院发现RNA-m6A修饰和果蝇性别决定新因子

  3月19日,中国科学院上海生命科学研究院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所严冬研究组,与美国哈佛大学Norbert Perrimon研究组合作,以Xio is a component of the Drosophila sex determination pathway and RNA

中国学者发表RNA甲基化重要成果

  基因组DNA和组蛋白上存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以调控基因的表达,由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现,mRNA和其他RNA也存在类似的表观遗传学调控,比如m6A(N6-methyladenosine)。  西北农林科技大学、中科院上海植物逆境生物学研究中心和美国普

北京基因组所发表RNA甲基化新发现

  在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA最后流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以在不改变DNA序列的基础上调控基因的表达,并由此决定细胞的分化和发育情况。实际上,mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。  N6-methyladenosine(m

RNA修饰技术在华南农大余义勋组植物m1A-调控机制的运用

  RNA甲基化修饰在调控生物生长发育的过程中起重要作用,m6A和m5C在植物体内的产生机制和生物学功能已有较多研究论文发表,然而RNA m1A(N1-甲基腺嘌呤)修饰在植物中的研究还非常少。   近日,Plant Physiology 在线发表了华南农业大学余义勋课题组题为“The N1-met

人类组织中m6A修饰的动态变化和进化(一)

文章导读m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucleic Aci