酵母双杂交实验常见疑难解答

问:如果诱饵蛋白对酵母细胞是有毒的,该怎么办?答:在有些情况下,在液体培养基中培养不好的菌珠可以在固体培养基上生长得很好。重悬克隆于1ml的SD/–Trp,接着将重悬液平铺于5 个100-mm的SD/–Trp平板。在30℃下温浴,直至平板上的克隆互相粘在一起。用5ml 0.5X YPDA刮下每块板上的克隆,并收集到一管中。接着就使用这个细胞重悬液进行正常的杂交反应。问:我的诱饵蛋白能直接激活报告基因的表达,该如何处理?答:该蛋白很可能有转录激活域,是个转录因子。这可以通过基因重组切掉转录激活域,然后重新检测其是否自激活。但重组也有可能破坏蛋白之间的互作。问:转化效率太低,怎么办?答:1. 检测一下DNA的纯度,如果可以的话,重新用乙醇纯化。2. DNA-BD/诱饵蛋白很可能是有毒的。3. 不适当的培养基,重新配制培养基,并做对照转化。4. 检测pGBT9对照载体的转化效率,放置于SD/–Trp平板上,转化效率应该在1 x 105......阅读全文

酵母功能互补实验

实验概要本实验将在构建了大蒜重金属抗性基因表达载体并转入大肠杆菌DH5α的基础上,选择鉴定准确的质粒转化酵母细胞,对转化子进行了PCR鉴定和RT-PCR分析,及重金属抗性实验。主要试剂YPD培养基,醋酸锂,PEG(50%),乙醇,少量酵母菌总RNA快速抽提试剂盒主要设备摇床,离心机,水浴锅,PCR仪

现有技术水平蛋白质水平上研究基因功能的技术有哪些

  随着分子生物学技术的开展,对生物基因组中包含的全部基因及其所翻译的蛋白质的功用加以解读和描绘,特别是大量未知基因的功用及其相应蛋白质产物的功用停止研讨成了基因工程研讨的热点方向。而在蛋白质程度上定量、动态、整体性研讨生物体的蛋白质组学,将在后基因组时期大大促进我们对基因功用的了解。酵母双杂交实验

双杂交和其他双成分系统实验(二)

第二阶段  筛选一个相互作用子材料缓冲液和溶液将贮存液稀释至适当的浓度二甲基亚砜(DMSO)乙醇可选择,请参见步骤 9。冻存转化体用的无菌甘油溶液65% 无菌甘油0.1mol/LMgS0425 mmol/L Tris-Cl(pH8.0)TE(pH7.5)(无菌)TE(pH7.5),含 0.1mol/

双杂交和其他双成分系统实验(二)

方法诱饵-LexA 融合蛋白的构建1.将编码诱饵蛋白的靶 DNA 克隆到 LexA 融合载体(如,pMW101 或 pMW103) 的多聚接头处,以合成一种框架内的 LexA 融合基因。确定诱饵序列的羧基端存在翻译终止序列。形成的质粒作为 pBait。2. 采用下列 LexA 融合基因和报道质粒的组

双杂交和其他双成分系统实验(三)

第三阶段  阳性相互作用的再次确定材料缓冲液和溶液乙酸铵(7.5 ml/L)氯仿乙醇异丙醇裂解液酶解酶 100T 以 2~5 mg/ml 溶解于拯救缓冲液中或β-葡糖醛酸酶 100000 单位/ml(Sigma)按 1:50 稀释于拯救缓冲液中每次使用均需配置新鲜的溶液。酚(早衡至 pH8.0)拯救

双杂交和其他双成分系统实验(三)

方法转化文库1. 挑选一个在第一阶段的原始对照试验中状态最好的表达诱饵蛋白和 lexAop-lacZ 报道子的酵母菌落,接种于 20 ml CM(Glu)-Ura-His 液体培养基中,30°C 摇动过夜培养。重要:应该在用文库重新转化之前 7~10d 内,将诱饵蛋白和 lexAop-lacZ 报道

双杂交和其他双成分系统实验(五)

离心机和转子Sorvall RT6000 离心机,H1000B MPC 和 H6000A MPC 转子(离心微量滴定板用)专用设备玻璃珠(直径 0.45 mm, 无菌;Sigma)微量滴定板(24 孔或 96 孔 [可选])重复用移液管可选,请参见步骤 1。附加试剂此方案的步骤 2 需要第 1 章方

双杂交和其他双成分系统实验(一)

实验材料 载体和酵母菌试剂、试剂盒 缓冲液和溶液SDS 凝胶上样缓冲液SDS 聚丙烯酰胺凝胶核酸和寡核苷酸抗体培养基仪器、耗材 专用设备实验步骤 第一阶段  诱饵-LexA 融合蛋白的鉴定材料缓冲液和溶液将贮存液稀释到适当浓度。2XSDS 凝胶上样缓冲液100 mmol/L Tris-Cl(pH6.

双杂交和其他双成分系统实验(-一)

实验材料载体和酵母菌试剂、试剂盒缓冲液和溶液SDS 凝胶上样缓冲液SDS 聚丙烯酰胺凝胶核酸和寡核苷酸抗体培养基仪器、耗材专用设备实验步骤第一阶段  诱饵-LexA 融合蛋白的鉴定材料缓冲液和溶液将贮存液稀释到适当浓度。2XSDS 凝胶上样缓冲液100 mmol/L Tris-Cl(pH6.8)20

双杂交和其他双成分系统实验(四)

21. 测定转录活化。这个实验可以利用牙签重新划线培养或利用多支管/蛙形器来进行,在分析大量阳性克隆时,多支管/蛙形器是非常有用的(有关蛙形器的详细情况请参见图 18-10)。1) 通过直接划线培养测定a. 使用一个平头牙签分别在下面的 4 个平板上复制和主板上相同的栅格。使用相同的牙签在四个平板上

酿酒酵母培养条件实验_酵母培养物的储存

实验方法原理酵母在琼脂或液体培养基中的理想培养温度是30℃,培养皿平板应倒置放入塑料盒中,于孵箱或培养室内进行培养。当孵育时间超过2或3天时,塑料盒可防止平板上的琼脂干裂。当使用液体培养基培养时,要使用旋转式或往复式摇床,至少每分钟200转,以保证充分通气;进行大体积液体培养时使用锥形瓶,培养基为瓶

酵母菌培养实验

   今年就开始做这个天然酵种面包,一开始看了好多关于日本和台湾的书籍,关于天然酵种的做法,感觉是很简单的,但是又看到网上很多人都说失败率很高,我也看了好多高手做天然酵种,之前是对天然酵种是有点了解,但没亲身做过,自从德州农民做了天然酵种面包以后,好多人都在做天然酵种面包。我知道日本有很多面包房就用

酿酒酵母培养条件实验

实验材料 YPAD 过夜培养物仪器、耗材 SC 减样选择培养基分光光度计实验步骤 一、分光光度测定法1. YPAD 过夜培养物用水 100 倍稀释,而 SC 减样选择培养基过夜培养物 10 倍稀释。2. 用分光光度计测定 600 nm 处的光密度。3. 记住稀释倍数,计算原始培养物的细胞数。二、血细

酵母细胞破碎实验

实验材料 酵母菌试剂、试剂盒 玻璃珠破菌缓冲液仪器、耗材 玻璃珠拍打器实验步骤 1.  培养并收集酵母菌细胞,在酵母消解酶缓冲液重悬菌体沉淀之前,测定压紧细胞的体积,以下所有步骤均在4℃进行。2.  用1体积的玻璃珠破菌缓冲液重悬细胞。3.  用2体积的玻璃珠破菌缓沖液与细胞混合,加4体积冰冷的酸洗

酿酒酵母培养条件实验

液体培养基中细胞滴度的检测 菌落的影印培养 酵母培养物的储存             实验方法原理 酵母在琼脂或液体培养基中的理想培养温度是30℃,培养皿平板应倒

酵母实验操作方案(2)

附录一 培养基 LB: Tryptone 10g 1% Yeast Extract 5g 0.5% NaCl 5g 0.5% 【Agar】 15g 1.5%(固体培养基另加) dH2O稀释至1L,高压灭菌 YPD: Yeast Extract 10g 1%

酵母实验操作方案(1)

一.质粒酶切及线性化1)用维特洁日常型小量DNA纯化试剂盒抽提9KSF2,可得到较纯的质粒10μg/3ml菌液,终体积80ul。2)线性化质粒使用80μl酶切体系9KSF2质粒 70μl内切酶(SacI, SalI, BglⅡ) 2μl10 x buffer 8μl3)酶切3-16小时,一般3小时即

酿酒酵母培养条件实验

液体培养基中细胞滴度的检测 菌落的影印培养 酵母培养物的储存             实验方法原理 酵母在琼脂或液体培养基中的理想培养温度是30℃,培养皿平板应倒

酵母细胞的观察实验

酵母细胞的直径大约 5 pm,它们的很多重要特征在光学显微镜下都能够观察到。 在实验室中,最好定期在相差显微镜下观察酵母培养物,以掌握细胞的生理状态以及污染情况。很多现代酵母细胞生物学研究采用复杂检测方法,用蛋白质特异抗体或特异结合某些细胞器的荧光染料对酵母细胞染色,近来,开始使用绿色荧光蛋白(GF

酵母转化实验_电穿孔转化

实验材料酵母试剂、试剂盒二硫苏糖醇山梨醇仪器、耗材电穿孔仪器电击池水浴锅实验步骤1.  实验前两天,将转化用酵母菌株的单菌落接种于5 ml YPD培养基中,30℃过夜培养至饱和。 2.  转化前一天晚上,在装有500 ml YPD培养基的2 L 无菌烧瓶中接种适量的过夜培养液,于30℃剧烈摇动培养过

酵母蔗糖酶的制备实验

研磨法             实验方法原理 蔗糖酶( inver tase ) (β-D-呋喃果糖苷果糖水解酶) ( fructofuranosidefructohydrol

酵母菌RNA制备实验

实验材料 酵母菌试剂、试剂盒 TES酸性酚氯仿乙酸钠乙醇仪器、耗材 离心管离心机摇床实验步骤 1.  酵母细胞在10 ml 培养基中生长至指数中期(OD600=1.0)。 2.  将培养液转移到50 ml,离心管,于4℃,1 500 g 离心3 min。 3.  弃上清,菌体沉淀用1 ml 冰冷的水

酵母剪接体分析实验

            实验方法原理 前接体是真核细胞核内剪接 mRNA 前体的大分子核糖核蛋白复合体,它由 5 种 snRNP 和大量的非 snRNP 蛋白组成,每一种 snRNP 由一个 snRNA 和几种蛋白质构成。

酵母剪接体分析实验

前接体是真核细胞核内剪接 mRNA 前体的大分子核糖核蛋白复合体,它由 5 种 snRNP 和大量的非 snRNP 蛋白组成,每一种 snRNP 由一个 snRNA 和几种蛋白质构成。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理前接体是真核细胞核内剪接 mRNA 前体的大分子核糖核蛋

酵母菌的培养实验

实验材料 酵母菌试剂、试剂盒 葡萄糖仪器、耗材 摇床锥形瓶离心机实验步骤 1.  在30℃,氧气充足和以葡萄糖作碳源的条件下,野生型酿酒酵母菌生长得十分良好。当酵母菌在试管中培养时,接种酵母菌贮液后应轻轻振荡培养液以便菌体细胞分散均匀。2.  在作大体积液体培养时,酵母菌在锥形瓶中生长较好,使用瓶底

酵母菌基因克隆实验

实验材料 酵母菌实验步骤 1.  用含LEU 2作为选择标志的酵母菌DNA文库转化lea 2 cdc 101-1酵母菌株,在23℃培养,依据插入片段的大小,筛选2 000~20 000个Leu+转化体。 2.  影印平板转化体,将其转印到预热的选择性平板,并于37℃培养筛选互补温感突变的表型。过

酵母细胞的观察实验

酵母细胞的直径大约 5 pm,它们的很多重要特征在光学显微镜下都能够观察到。在实验室中,最好定期在相差显微镜下观察酵母培养物,以掌握细胞的生理状态以及污染情况。很多现代酵母细胞生物学研究采用复杂检测方法,用蛋白质特异抗体或特异结合某些细胞器的荧光染料对酵母细胞染色,近来,开始使用绿色荧光蛋白(G

酵母转化实验_乙酸锂转化

实验材料酵母试剂、试剂盒YPDYPAD腺嘌呤半硫酸TE乙酸锂仪器、耗材摇床水浴锅转子离心机培养箱实验步骤1.  在开始实验前2天,接种待转化的酵母菌株的单菌落于5 ml YPD培养基中,于30℃恒温摇床,培养过夜。 2.  转化的前一天晚上,往1 L 无菌烧瓶中加入300 ml YPAD培养基,然后

TRAP法端粒酶活性检测实验操作方法及疑难解答

Kim应当不会预测到,他在1994年发明的TRAP会那么受欢迎,被一代又一代的研究者奉为端粒酶 活性检测首选方法。不过,TRAP法虽然灵敏度高,却同样存在瑕疵。下面为大家介绍的是根据TRAP法适当改良的研究专用试剂盒具体情况和使用方法以及常见问题解答。本品与通常的端粒 酶活性测定法相比较,具有以下特

酵母细胞质粒分离实验

实验材料 酵母试剂、试剂盒 YPD仪器、耗材 接种针培养瓶摇床实验步骤 1.  挑取几个含质粒的酵母宿主菌菌落,接种于10 ml 非选择性培养基,于30℃培养过夜。 2.  在非选择性平板上于30℃培养2天以得到单菌落,大多数情况下,可以得到约200~300个单菌落(约每平板100个菌落)。 3.