动植物基因变异表型关联知识库(GWASAtlas)正式上线发表
近日，由中国科学院北京基因组研究所开发的国际上首个动植物基因组变异-表型关联知识库(GWAS Atlas)正式上线发表，该项研究成果以GWAS Atlas: a curated resource of genome-wide variant-trait associations in plants and animals 为题在国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表。 全基因组关联分析(GWAS)，即指在全基因组范围内找出存在的序列变异，从中筛选出与疾病、表型性状等相关联的遗传位点，是挖掘生物复杂性状遗传基础的关键技术。随着高通量测序技术的快速发展，多个物种产生了越来越多的高质量基因型数据，并已解析了与许多动植物复杂性状相关联的遗传位点。但这些知识信息都分散在不同文献中，不利于知识整合、挖掘与再利用。为此国家基因组科学数据中心的科研人员通过关键词检索、人工审编、词条比对注释等技术手......阅读全文
动植物基因变异表型关联知识库(GWAS－Atlas)正式上线发表
近日，由中国科学院北京基因组研究所开发的国际上首个动植物基因组变异-表型关联知识库(GWAS Atlas)正式上线发表，该项研究成果以GWAS Atlas: a curated resource of genome-wide variant-trait associations in plant
基因组所发布全转录组关联研究知识库
近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心（NGDC）开发的全转录组关联研究知识库正式上线。该研究成果以“TWAS Atlas: a curated knowledgebase of transcriptome-wide association studies”为题在
科学家发现动植物关联性重要证据
通过打跑瓢虫，蚂蚁为植食性昆虫撑起了一张保护伞。图片来源：Joshua Grinath 在美国科罗拉多州的高山草甸中，生态学家无意中发现了自然界动植物之间令人惊异的关联性的又一个例证。通过吃掉蚂蚁，黑熊能够帮助草甸中的一种主要植物茁壮成长。 并未参与该项研究的盖恩斯维尔市佛罗里达大学生态学
动植物的基因沉寂现象介绍
基因沉默现象首先在转基因植物中发现，接着和线虫、真菌、昆虫、原生动物以及才鼠中陆续发现。大量的研究表明，环境因子、发育因子、DNA修饰、组蛋白乙酰化程度、基因拷贝数、位置效应、生物的保护性限制修饰以及基因的过度转录等都与基因沉默有关。但总的看来，基因沉默发生在两种水平上，一种是由于DNA甲基化、
北京基因组所发布脑疾病知识库BrainBase
近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心开发的脑疾病知识库BrainBase正式上线。相关研究成果以BrainBase: a curated knowledgebase for brain diseases为题，在线发表在Nucleic Acids Resear
转基因技术的发展与转基因动植物
1.转基因技术的发展 自从人类学会蓄养动物、耕作植物以来，我们的祖先就从未停止过对物种的遗传改良。过去的几千年里改良物种的主要方式：针对自然环境造成的突变或无意的人为因素所产生的优良基因和重组个体进行选育和利用，从而通过随机和自然的积累优化基因。然而这种极低几率且无人类控制性的被动模式大大
转基因技术的发展与转基因动植物
1.转基因技术的发展 自从人类学会蓄养动物、耕作植物以来，我们的祖先就从未停止过对物种的遗传改良。过去的几千年里改良物种的主要方式：针对自然环境造成的突变或无意的人为因素所产生的优良基因和重组个体进行选育和利用，从而通过随机和自然的积累优化基因。然而这种极低几率且无人类控制性的被动模式大大
动植物的基因编辑，在争议中前行
早在公元前12000年，人们就开始种植农作物。他们逐渐开始懂得挑选最好的那一株，这标志着农作物改良的开始。农作物改良，从来都是一个漫长而繁琐的过程，而如今，科学家能够快速轻松地实现。 这多亏了一种被誉为“基因剪刀”的CRISPR技术。它是一种灵活高效的基因组编辑工具，能够对几乎任何物种的基因组
北京基因组所的脑疾病知识库BrainBase正式上线
近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心开发的脑疾病知识库BrainBase正式上线。相关研究成果以BrainBase: a curated knowledgebase for brain diseases为题，在线发表在Nucleic Acids Resear
北京基因组所阿尔兹海默症基因知识库ALzBase正式上线
阿尔兹海默症（Alzheimer’s disease,AD）是一种在老年人人群中常见的神经退行性疾病，目前无有效治疗手段。人们对AD致病机理方面的研究也没有取得突破性的进展。为了能够更好地助力AD相关的研究，中国科学院北京基因组研究所雷红星研究组通过整合不同来源的数据，以阿尔兹海默症扰动基因为核
转基因技术的发展及其在转基因动植物的应用
自从人类学会蓄养动物、耕作植物以来，我们的祖先就从未停止过对物种的遗传改良。过去的几千年里改良物种的主要方式：针对自然环境造成的突变或无意的人为因素所产生的优良基因和重组个体进行选育和利用，从而通过随机和自然的积累优化基因。然而这种极低几率且无人类控制性的被动模式大大阻碍了农业的发展，迫切地需要
转基因技术的发展及其在转基因动植物的应用
自从人类学会蓄养动物、耕作植物以来，我们的祖先就从未停止过对物种的遗传改良。过去的几千年里改良物种的主要方式：针对自然环境造成的突变或无意的人为因素所产生的优良基因和重组个体进行选育和利用，从而通过随机和自然的积累优化基因。然而这种极低几率且无人类控制性的被动模式大大阻碍了农业的发展，迫切地需要
动植物基因工程对人类的潜在危险
基因工程Bt杀虫作物产生的Bt毒蛋白可以从作物根部渗漏到土壤或随作物的叶子进入土壤，其毒性至少可保留7个月。因此被污染的土壤和水很可能对人类造成伤害。21世纪初，德国科学家发现基因工程油菜的转基因已经污染了蜜蜂体内肠道中的微生物；芬兰的研究人员发现，基因工程食物中存在的抗生素抗性基因能转移到人体
动植物基因工程对人类的潜在危险
基因工程Bt杀虫作物产生的Bt毒蛋白可以从作物根部渗漏到土壤或随作物的叶子进入土壤，其毒性至少可保留7个月。因此被污染的土壤和水很可能对人类造成伤害。21世纪初，德国科学家发现基因工程油菜的转基因已经污染了蜜蜂体内肠道中的微生物；芬兰的研究人员发现，基因工程食物中存在的抗生素抗性基因能转移到人体肠道
动植物基因工程对人类的潜在危险
基因工程Bt杀虫作物产生的Bt毒蛋白可以从作物根部渗漏到土壤或随作物的叶子进入土壤，其毒性至少可保留7个月。因此被污染的土壤和水很可能对人类造成伤害。21世纪初，德国科学家发现基因工程油菜的转基因已经污染了蜜蜂体内肠道中的微生物；芬兰的研究人员发现，基因工程食物中存在的抗生素抗性基因能转移到人体肠道
转基因技术的发展及其在转基因动植物的应用（一）
转基因技术的发展自从人类学会蓄养动物、耕作植物以来，我们的祖先就从未停止过对物种的遗传改良。过去的几千年里改良物种的主要方式：针对自然环境造成的突变或无意的人为因素所产生的优良基因和重组个体进行选育和利用，从而通过随机和自然的积累优化基因。然而这种极低几率且无人类控制性的被动模式大大阻碍了农业的发展
转基因技术的发展及其在转基因动植物的应用（二）
体细胞核移植是近些年来新出现的一种转基因技术。该方法是先把外源基因与供体细胞在培养基中培养，使外源基因整合到供体细胞上，然后将供体细胞细胞核移植到受体细胞——去核卵母细胞，构成重建胚，再把其移植到假孕母体，待其妊娠、分娩，便可得到转基因的克隆动物。在这一技术中，外源基因的稳定表达和重建胚的良好发育是
我国将建健康管理知识库
通过一个连接许多监控健康状况的便携式设备，血压、血糖、心跳等很多个人医疗数据就会进入数据库，经由知识库的科学分析后给予相应的评测结果以及关于食物、运动等生活方式的指导建议。东软集团董事长刘积仁为记者描绘了一幅蓝图。 与此同时，中国健康促进基金会、中华医学会健康管理学分会和东软集团在京
动植物基因工程对自然环境的污染
1976年，美国国家卫生研究院制定并公布了“重组DNA研究准则”，其目的就是为了保证基因工程的安全性。该准则除了规定禁止若干类型的重组DNA 实验以外，还就实验安全防护等制订了若干具体规定。将实验室的物理防护分为P1—P4 四个等级，生物防护分为EK1—EK3 三个等级。为了申请ZL或争夺市场等
华大基因完成肠道微生物基因组关联分析
从物种、功能及生态群落上展示肠道微生物与结直肠腺瘤及结直肠癌的关联特征，这是深圳华大基因研究院、奥地利因斯布鲁克医科大学、奥本多夫医院、丹麦哥本哈根大学、华南理工大学等多家单位最新的联合取得的科研进展。3月11日，国际学术期刊《自然通讯》杂志发表了这项研究成果。该研究对结直肠腺瘤、结直肠癌的早期
Nat－Genetics：大数据揭示疾病的基因关联
想象一下，雨水落在人行道上的场景。虽然雨滴落地似乎是随机发生的，但随着时间的推移，人行道仍然会有一片区域保持干燥。这个类比类似于犹他大学健康研究所的研究人员设计的一种新方法。他们探索了超过100,000名健康人，以确定我们不容易改变的基因区域。他们认为，这些“受限制”区域的DNA突变可能会导致严
Nature：从基因到功能，红细胞全基因组关联研究
一项新研究正揭示机体如何生成红血细胞，以及随时调控红细胞中血红蛋白(haemoglobin)量的机制。利用全基因组分析技术，研究人员将有可能与红细胞形成相关的遗传区域数量增加了一倍，随后的果蝇研究获得了关于这些区域功能的一些新认识。相关成果发表在《自然》(Nature)杂志上。 血红蛋白是
动植物基因工程对自然环境的污染研究
1976年，美国国家卫生研究院制定并公布了“重组DNA研究准则”，其目的就是为了保证基因工程的安全性。该准则除了规定禁止若干类型的重组DNA 实验以外，还就实验安全防护等制订了若干具体规定。将实验室的物理防护分为P1—P4 四个等级，生物防护分为EK1—EK3 三个等级。为了申请ZL或争夺市场等原因
“千种动植物基因组计划”一期完成
记者近日从深圳华大基因研究院获悉，由该院发起的“千种动植物基因组计划”一期在重要物种基因组学研究领域和巨型基因组数据库构建上取得阶段性进展。 于2010年1月正式启动的“千种动植物基因组计划”（简称“千种”计划）预计在未来两年内将破译千种具有重要经济和科研价值的动植物物种基因
动植物基因工程对自然环境的污染分析
1976年，美国国家卫生研究院制定并公布了“重组DNA研究准则”，其目的就是为了保证基因工程的安全性。该准则除了规定禁止若干类型的重组DNA 实验以外，还就实验安全防护等制订了若干具体规定。将实验室的物理防护分为P1—P4 四个等级，生物防护分为EK1—EK3 三个等级。为了申请ZL或争夺市场等原因
人类不同祖先的全基因组关联分析
一项由埃克塞特大学领导的发表在《Nature Genetics》上的研究扩大了人类不同祖先的全基因组关联分析，并最终受益于全球患者护理。到目前为止，近87%的这种类型的基因组研究是在欧洲人身上进行的。 Lundquist研究所翻译基因组学和人口科学研究所研究员和所长，加州大学洛杉矶分校Geff
芝麻大规模全基因组关联分析完成
由中国农科院油料所张秀荣研究员领衔的芝麻与特色油料遗传育种创新团队，与中科院国家基因研究中心等单位合作，在国际上率先完成了芝麻高密度单倍型图谱构建、主要农艺性状大规模全基因组关联分析。10月19日，国际知名期刊《自然·通讯》杂志在线发表了上述研究成果。 该研究得到973、国家自然科学基金、中国
日本将研究基因异常与男性不育的关联
共同社8月28日报道说，日本东北大学等机构计划研究男性不育是否与特定基因异常存在关联。这一研究可能有助于寻找诊断和治疗男性不育的新方法。 在利用体外受精治疗男性不育的时候，医生会选择运动能力强的精子与卵子结合，但即使这样，许多情况下还是不能成功。科学家怀疑其中有未知的原因在发挥作用。 据报道，日本研
遗传发育所开发水稻分子育种整合组学知识库
10月18日，中国科学院遗传与发育生物学研究所植物基因组学国家重点实验室梁承志研究组开发的分子育种整合组学知识库水稻子库在线发表于学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）。文章题目为MBKbase for rice: an integrated omics knowl
基因检测临床应用中的难题：基因型与表型信息关联
新一代测序技术的出现，使得基因组数据以及新基因突变的发现呈现爆炸式增长。基因组学研究所面临的挑战不再是单纯的数据产生，而是数据的解读。基因组学的信息如果不能和临床、表型的数据关联，就不能很好地解释复杂的基因变异以及生物学相关问题。 与大多数研究不同，临床表型信息的收集，必须考虑临床医疗环境的约