Primer3在线引物设计攻略
开始之前：其实非常简单，不需要你下载任何软件，但是你得有一台电脑能上网。当然，最重要的是，你要很清楚用于做引物的模板序列，至于怎么找模板序列，不再本次讨论范围。另外，要先对PCR目的序列的长度有个大致估计，好了，马上开始吧：第一步：找到Primer3的站点。 你不用记住这个站点，但是要记住“Primer3”这个词，然后打开GOOGLE首页，输入Primer3，跳出来的第一个项目就是了“Primer3 Input 0.4.0 ” 。第二步：贴上模板序列。 进入Primer3站点，可以看到一个引物设计的界面。（如下图）在“Paste source sequence below (5'->3'…”下面的大空框里面把你的模板序列粘帖进去。注意是5'->3'方向的，数字或者空格都没关系，软件会自动过滤的。第三步：重要参数设定。 首先是“ Product Size Ranges ”，如果......阅读全文
primer－primer5怎么设计引物
首先打开软件左上角来操作file——new——dna sequence这一项可以把你复制的序列粘贴进去当然，你也可以选择另一个file——open——dna sequence去open一个新的文件。在接下来的界面里复制你的序列，于是就将序列导入了点击search进入下图界面开始设计引物在此图中有6个
Primer－Premier－引物设计
Primer Premier4.0是由加拿大的Premier公司开发的专业用于PCR或测序引物以及杂交探针的设计，评估的软件，和Plasmid Premier2.02一起是该公司推出的最新的软件产品。其主要界面同样也是分为序列编辑窗口（Genetank），引物设计窗口（Primer Design），
TaqMan－Primer－and－Probe－Design
Adapted from TaqMan® One-Step RT-PCR Master Mix Reagents Kit InstructionDesign of Probes Keep the G-C content in the 20 to 80% range.Avoid runs of an
PCR－Primer－Design（一）
Molecular Biology Today 2001. 2(2): 27-32. Vinay K. Singh and Anil Kumar Bioinformatics Sub-centr
PCR－Primer－Design（三）
References Albert, J., and Fenyo, E.M. 1990. Simple, sensitive and specific detection of human immunodeficiency virus type 1 in clinical speci
PCR－Primer－Design（二）
Terminal Nucleotides Make a Difference Both the terminals of the primer are of vital importance for a successful amplification. The 3'-end
Primer－引物设计原则
概念 引物，是一小段单链DNA或RNA，作为DNA复制的起始点，在核酸合成反应时，作为每个多核苷酸链进行延伸的出发点而起作用的多核苷酸链，在引物的3′-OH上，核苷酸以二酯链形式进行合成，因此引物的3′-OH，必须是游离的。类型 存在有自然中生物的DNA复制引物（RNA引物）和聚合酶链式反应(
Primer3Plus
Oligonucleotide primers are widely used in various molecular biology techniques like DNA sequencing and the polymerase chain reaction (PCR). Since a p
Real－Time－PCR－Primer－Sets
Real Time PCR Primer SetsNOW OVER 300 PRIMER SETS!!!UPDATED: NOVEMBER 10th, 2003Quantitative RT-PCR is an important step for the validation of express
PCR－PRIMER－DESIGN－AND－REACTION－OPTIMISATION
ContentsFactors Affecting the PCR Nested Primer PCRPrimer LengthDegenerate PrimersElongation Temperature and TimeReaction BufferCycle NumberDenaturin
annealing－temp－for－degenerated－primer－－PCR－problem
PCR primers should be free of significant complementarily at their 3'-termini as this favours formation of primer-dimer which reduce product yield
引物延伸分析（primer－extension－analysis）
引物延伸分析（primer extension analysis）主要用于mRNA 5′端作图。poly（A）+RNA首先与过量5′端标记的且与靶RNA互补的单链寡核苷酸引物杂交，然后用反转录酶延伸这个引物。产生的cDNA与RNA模板互补且长度与引物5′端和RNA 5′端之间的距离相等。该法在mRN
Single－Primer－(SemiRandom)－PCR
DescriptionSingle primer PCR allows amplification from known to unknown regions in chromosomes, phage, plasmids, large PCR products and other sources
Primer－Premier中文使用说明
Primer Premier 4.10Primer Premier4.0是由加拿大的Premier公司开发的专业用于PCR或测序引物以及杂交探针的设计，评估的软件，和Plasmid Premier2.02一起是该公司推出的最新的软件产品。其主要界面同样也是分为序列编辑窗口（Genetank），引物设
Primer－3－在线引物设计攻略
开始之前：其实非常简单，不需要你下载任何软件，但是你得有一台电脑能上网。当然，最重要的是，你要很清楚用于做引物的模板序列，至于怎么找模板序列，不再本次讨论范围。另外，要先对PCR目的序列的长度有个大致估计，好了，马上开始吧：第一步：找到Primer3的站点。 你不用记住这个站点，但是要记住“Prim
引物设计（Primer－Design）的原则
首先引物要跟模板紧密结合，其次引物与引物之间不能有稳定的二聚体或发夹结构存在，再次引物不能在别的非目的位点引起DNA聚合反应（即错配）。围绕这几条基本原则，设计引物需要考虑诸多因素，如引物长度（primer length）、产物长度（product length）、序列Tm值（melting t
引物延伸分析（primer－extension－analysis）
引物延伸分析（primer extension analysis）主要用于mRNA 5′端作图。poly（A）+RNA首先与过量5′端标记的且与靶RNA互补的单链寡核苷酸引物杂交，然后用反转录酶延伸这个引物。产生的cDNA与RNA模板互补且长度与引物5′端和RNA 5′端之间的距离相等。该法在mR
primer－3－设计引物怎么知道产物大小
如果你要扩展的基因已经测序完成，你在网上找到序列，输入primer5，然后点primer就可以了，然后你可以手动或自动更改，知道达到的你的要求。如果你扩增的基因还未测序完成，你只能通过别人克隆出来的相关基因设计引物，方法同上
使用Primer－Premier－4.10引物设计方法
Primer Premier 4.10Primer Premier4.0是由加拿大的Premier公司开发的专业用于PCR或测序引物以及杂交探针的设计，评估的软件，和Plasmid Premier2.02一起是该公司推出的最新的软件产品。其主要界面同样也是分为序列编辑窗口（Genetank），引物设
引物设计原则（Principle－of－realtime－quantiation－PCR－primer－）
1、引物的长度一般为15-30bp，常用的是18-27bp，但不应大于38，因为过长会导致其延伸温度大于74°C，不适于Taq DNA聚合酶进行反应。2、引物序列在模板内应当没有相似性较高，尤其是3’端相似性较高的序列，否则容易导致错配。引物3’端出现3个以上的连续碱基，如GGG或CCC，也会使错误
primer5和Oligo结合设计引物步骤及心得
一、引物设计step by step1、在NCBI上搜索到目的基因，找到该基因的mRNA，在CDS选项中，找到编码区所在位置，在下面的origin中，Copy该编码序列作为软件查询序列的候选对象。2、用Primer Premier5搜索引物①打开Primer Premier5，点击File-New-
primer5和Oligo结合设计引物步骤及心得
一、引物设计step by step1、在NCBI上搜索到目的基因，找到该基因的mRNA，在CDS选项中，找到编码区所在位置，在下面的origin中，Copy该编码序列作为软件查询序列的候选对象。2、用Primer Premier5搜索引物①打开Primer Premier5，点击File-New-
miRNA－qPCR－Detection－Primer－Set（miRNA检测试剂盒）实验说明
一、概述1、介绍microRNA(miRNA)是一类有大约22 个核苷酸组成的非编码小分子RNA，其广泛存在于真核生物中。miRNA 在个体发育的不同时期及不同组织中有不同的表达模式，都表明了其在发育和分化中起有重大的调控作用。迄今为此，对miRNA 的检测方法主要有Northern B
miRNA－qPCR－Detection－Primer－Set（miRNA检测试剂盒）实验说明
一、概述 1、介绍 microRNA(miRNA)是一类有大约22 个核苷酸组成的非编码小分子RNA，其广泛存在于真核生物中。miRNA 在个体发育的不同时期及不同组织中有不同的表达模式，都表明了其在发育和分化中起有重大的调控作用。迄今为此，对miRNA 的检测方法主要有Northe
引物延伸反应
Primer extension analysis is used to determine the location and quantitate the amount of the 5´-end of specific RNAs. An end-labeled oligonucleotide i
PCR－Primers－For－Gene－Expression－Detection－or－Quantification
Why PrimerBank?PrimerBank is a public resource for PCR primers. These primers are designed for gene expression detection or quantification (real-time
PCR引物
PCR Primer Design and Reaction Optimization (Molecular Biology Techniques Manual) PCR Primer Design (Newman Lab) PCR Primer Design (Eppendorf)Detail
PCR引物
PCR Primer Design and Reaction Optimization (Molecular Biology Techniques Manual) PCR Primer Design (Newman Lab) PCR Primer Design (Eppendorf)Detail
PCR的几个实用小技巧
增加PCR的特异性：1. primers design这是zui重要的一步。理想的，只同目的序列两侧的单一序列而非其它序列退火的primer要符合下面的 一些条件1) 足够长,18-24bp,以保证特异性.当然不是说越长越好,太长的primer同样会降低特异性,并且降低产量2) GC% 40%~60
PCR实用小技巧
增加PCR的特异性：1. primers design这是最重要的一步。理想的，只同目的序列两侧的单一序列而非其它序列退火的primer要符合下面的 一些条件1) 足够长,18-24bp,以保证特异性.当然不是说越长越好,太长的primer同样会降低特异性,并且降低产量2) GC% 40%~60%3