如何利用BankIt向NCBI在线提交序列
相关专题向NCBI提交序列常用的方法有两种，其一是在线提交的BankIt，其二是用软件Sequin。在此结合网络牛人实际操作经验来总结下如何通过BankIt在线提交DNA 或RNA序列，供参考。1.整理序列信息：包括病原采集地、病原的寄主、寄主症状、采集人等基本信息;还有序列分析结果，包括序列全长大小，开放阅读框(ORF)的长度、位置及特定ORF序列翻译的氨基酸 序列等基因水平的信息，这对于接下来的快速准确提交序列及提交成功后为全世界其他作者准确全面分享此类信息很重要;2.登陆BackIt站点，注意到页面右边的“Sign in to use BankIt”标签，点击登录进入。如果没有账号就注册一个(注意，此账号与ncbi 账号不通用)。附 注册账号步骤，需要填写的项目为：Title：你的职位或头衔First name：名last name：姓login：登陆名Affiliation：所属机构地址，一般填写自己......阅读全文
如何利用BankIt向NCBI在线提交序列
向NCBI提交序列常用的方法有两种，其一是在线提交的BankIt，其二是用软件Sequin。在此结合网络牛人实际操作经验来总结下如何通过BankIt在线提交DNA 或RNA序列，供参考。1.整理序列信息：包括病原采集地、病原的寄主、寄主症状、采集人等基本信息;还有序列分析结果，包括序列全长大小，开放
如何利用BankIt向NCBI在线提交序列
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如何在NCBI上查找引物序列
在NCBI中BLAST引物（注意选择BLAST的数据库），然后再Blast结果中找寻符合要求的序列。后面会列出很多链接，直接就能看到NCBI号 进入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/Blast.cgi?PAGE=Nucleotides&PROGRAM=blastn&
如何在NCBI上查找引物序列
在NCBI中BLAST引物（注意选择BLAST的数据库），然后再Blast结果中找寻符合要求的序列。后面会列出很多链接，直接就能看到NCBI号 进入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/Blast.cgi?PAGE=Nucleotides&PROGRAM=blastn&
NCBI使用方法之二：如何查找连续的mRNA、cDNA、蛋白序列
1、进入NCBI主页在search后面选择Gene，在for后面填写需要查找的基因的名字。点击“Go”，出现了很多基因序列，在每个序列的右边还有“Order cDNA clone” 的链接，这些序列中有些序列是跟你的目的基因同名的，有些是别名（Other Aliases）与你的目的基因一致，根据每个
NCBI－GenBank数据库的起源、功能和常遇问题及解答
GenBank数据库功能为一、提交获取的基因序列；二、查找已知基因的序列生物学特性信息，例如编码区，科学命名等。那么Genebank ID 和Gene cluster ID又是什么呢？ GenBank数据库起源 GenBank数据库是1982年由美国国立生物技术信息中心(NCBI)建
NCBI使用方法之一：Map－viewer查找基因序列，RNA，启动子
下面以人的IL6（白细胞介素6）为例讲述一下具体的操作步骤 一、打开Map viewer页面，网址为 在search的下拉菜单里选择物种，for后面填写你的目的基因。 二、点击“GO”： 三、在步骤二图示的右下角有一个Quick Filter,下面是让你选择的几个复选框，在Gene前面的小方框
NCBI使用方法之一：Map－viewer查找基因序列，RNA，启动子
下面以人的IL6（白细胞介素6）为例讲述一下具体的操作步骤一、打开Map viewer页面，网址为在search的下拉菜单里选择物种，for后面填写你的目的基因。二、点击“GO”：三、在步骤二图示的右下角有一个Quick Filter,下面是让你选择的几个复选框，在Gene前面的小方框里打勾，然后点
GenBank数据库概述（一）
1. GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织，包括EMBL和DDBJ。是NIH遗传序列数据库，一个所有可以公开获得的DNA序列的注释过的收集。GenBank同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。唯一人类基因序列集合（UniGene），人类基因组基因图
如何快速查找LncRNA序列
查找LncRNA序列的网站有很多，包括Genebank，Ensembl，RefSeq，UCSC数据库等。今天，小编就给大家讲讲如何通过LncRNA ID号查找LncRNA的序列。 一．根据LncRNA来源数据库，进入相应链接。 1. Genebank：https://www.ncb
如何快速查找LncRNA序列？
查找LncRNA序列的网站有很多，包括Genebank，Ensembl，RefSeq，UCSC数据库等。今天，小编就给大家讲讲如何通过LncRNA ID号查找LncRNA的序列。一．根据LncRNA来源数据库，进入相应链接。 Genebank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov
新研究利用DNA序列追溯植物演化关键事件
来自北美、欧洲和中国的科学家最新研究揭示了地球植物演化过程中的重要过渡细节，该研究成果于2014年10月27日发表在《美国科学院院刊》上。 从外来藻类植物、苔藓植物、蕨类植物、生长在潮湿热带雨林中的花草树木、人们食用的谷子、蔬菜到家中的观赏植物，地球上的现生植物共同经历了长达十亿多年的历史。
使用NCBI设计引物的教程
引物设计是PCR实验的关键步骤之一。正确的引物设计能有效提高实验的成功率。NCBI提供了一些强大的工具来辅助引物设计，本文将详细介绍如何使用NCBI工具设计引物。一、了解NCBI标记类别在NCBI中，常见的标记符号通常以两个字母开头，后接一组数字。这些符号表示不同类型的序列，对于选择正确的模板序列至
生物信息学应用：序列分析，电子克隆等初探
生物信息学可指利用信息技术管理和分析生物学数据。这就意味着生物信息学所涉及的范围相当广泛，从人工智能、机器人一直到基因组(genome)分析。就基因组分析这一角度来看，生物信息学主要是指核酸和蛋白质序列数据的计算机处理和分析。近年来，蛋白质结构数据的快速增长，使蛋白质三维结构的处理分析也归入到生物信
核酸序列分析的一般流程
1.1 核酸序列的检索 http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide 1.2 核酸序列的同源性分析 1.2.1 基于NCBI/Blast软件的核酸序列同源性分析 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/b
核酸序列的一般分析流程
1.1 核酸序列的检索 http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide 1.2 核酸序列的同源性分析 1.2.1 基于NCBI/Blast软件的核酸序列同源性分析 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/b
核酸序列的一般分析流程
核酸序列的一般分析流程1.1 核酸序列的检索http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide 1.2 核酸序列的同源性分析 1.2.1 基于NCBI/Blast软件的核酸序列同源性分析 http://www.nc
如何获取漂亮的ClustalX序列比对图片
发表论文当然需要一些质量高的图片，那么如何将ClustalX序列比对的结果转化成比较漂亮的图片呢？小编在此搜集了一个还不错的教程，分享给大家。多序列比对在分子生物学中是一个基本方法，用来发现特征序列，进行蛋白分类，证明序列间的同源性，帮助预测新序列二级结构与三级结构，确定PCR 引物，以及在分子进化
如何设计基因cds序列的pcr引物
提取细胞总RNA然后用试剂盒反转录成cDNA，用cDNA作为模板扩增基因的CDS区，然后想要转染进细胞中。比如MYOD1基因，首先在NCBI找到它的mRNA序列，然后找到它的CDS序列，全部复制下来，在primer5.0中。正向引物直接从CDS的第一个核酸开始（比如18bp），反向引物从CDS最后一
如何获取漂亮的ClustalX序列比对图片
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NCBI－BLAST软件比对结果详细分析
NCBI BLAST比对结果报告分析:BLAST是NCBI开发的一款序列相似搜索程，常用在线的BLAST比对工具进行序列比对分析和引物设计。写在解读报告之前的，首先就使用Blast最终的目的是什么达成一致，Blast是通过两两比对，找到数据库中与输入序列最相似的序列，或者说是最相似的序列片段。那么我
A－Collection－of－PlantSpecific－Genomic－Data－and－Resources－at－NCBI
The National Center for Biotechnology Information (NCBI) provides a data-rich environment in support of genomic research by collecting the biologi
NCBI的使用指南之Map－viewer
Map viewer是NCBI 网站上提供的一个非常有用的寻找基因的工具，通过Map viewer你可以了解你感兴趣基因在基因组中所处的位置、基因序列、内含子及外显子的排列、基因的细胞遗传学图、EST.SNP等等许多有用的信息。进入Map viewer的方法如下：点击NCBI首页的Map viewe
NCBI－BLAST比对结果详细分析
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NCBI－BLAST比对结果详细分析
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如何查找质粒图谱
方法一：使用Vector NT 软件 做分子实验，经常和不同的质粒打交道，了解各种质粒的图谱信息是必需的，invitrogen公司的这款软件绝对是分子生物学虫子们的福音，要想对质粒图谱了解更直观，安装这款软件是非常必要的。这款软件的软件包里面会包括invitrogen公司的所有质粒图谱信息和
一步步教你利用Blast分析验证引物序列
引物设计完成之后，需要用软件 进行分析，找到最佳的引物对，采用Blast分析验证引物，可以知道序列的正确性，也能知道引物的特异性状况、引物的具体位置以及PCR产物的大小。先找到需要设计引物的目标基因的在有引物序列的mRNA序列，可以通过全文（如最先发现该基因的文章），全文中有时可以找到大鼠c-jun
一步步教你利用Blast分析验证引物序列
引物设计完成之后，需要用软件 进行分析，找到最佳的引物对，采用Blast分析验证引物，可以知道序列的正确性，也能知道引物的特异性状况、引物的具体位置以及PCR产物的大小。先找到需要设计引物的目标基因的在有引物序列的mRNA序列，可以通过全文（如最先发现该基因的文章），全文中有时可以找到大鼠c-jun
如何检测干细胞向肝细胞分化
用携带CTLA4Ig基因的重组腺病毒感染大鼠骨髓间充质干细胞(bone marrow mesenchymal stemcells,BMMSCs),体外向肝细胞诱导分化,并检测其免疫抑制功能.用含有HGF等细胞因子培养液诱导重组腺病毒Ad-CTLA4Ig感染大鼠BMMSCs向肝细胞分化.诱导后的细胞可