“垃圾DNA”不“垃圾”

就像从电影中删掉的片段一样,生物基因中的一些序列最终也会被剪掉,细胞不会利用它们制造蛋白质。现在,两项研究发现,这些被称为内含子的片段有助于酵母在艰难时期存活。这项研究揭示了DNA的另一种可能的功能,科学家曾认为这种功能是无用的。 未参与该研究的美国加州旧金山州立大学进化分子生物学家Scott Roy说:“这些结果非常令人信服,也非常令人兴奋。”这项研究开启了了解“内含子作用的全新范式”。 加州大学洛杉矶分校酵母微生物学家Guillaume Chanfreau说,这也回答了一个长期存在的问题:为什么酵母保留了以前被认为是“垃圾DNA”的东西。 内含子普遍存在于植物和真菌中,也存在于人类和其他动物体内——在大约2万个基因中,每个基因平均携带8个内含子。在最初将它们视为垃圾之后,研究人员最近开始确定内含子的某些功能。例如,一些基因中的内含子可能有助于控制细胞制造多少相应的蛋白质。 为了确定剥夺内含子的影响,加拿大谢布鲁......阅读全文

人肌肉基因首次插入面包酵母DNA

荷兰研究人员成功将人类肌肉基因插入面包酵母的DNA中,这是科学家首次将如此重要的人类特征植入酵母细胞,得到的人源化酵母模型,可作为药物筛选和癌症研究工具。相关论文发表于《细胞报告》杂志。 代尔夫特理工大学研究团队添加到酵母细胞中的特征由一组十个基因控制,人类没有这些基因就无法生存。这组基因包含了

酵母基因组DNA简易高效提取方案

1. 10ml菌液过夜培养至饱和(OD600值为2-3) 2. 离心沉降细胞(Sorvall中以2000rpm的速度),然后以冷的、等体积的无菌蒸馏水洗涤 3. 将细胞沉淀在200μl 裂解缓冲液中重悬浮,然后加入约300μl 玻璃珠和200μl的1:1苯酚:氯仿混和液 4. 漩涡摇匀1-2min 

酵母基因组DNA的玻珠制备法

实验概要本实验利用玻珠制备法制备了酵母基因组DNA。主要试剂无菌水,裂解缓冲液,5mol/L NaCl,苯酚,氯仿:已戊醇(24:1),乙醇,TE缓冲液,EDTA-Sark,蛋白酶K,5mol/L醋酸铵主要设备摇床,玻璃离心管,台式离心机,玻珠,振荡器,P-1000移液器,1.5ml离心管实验步骤1

酵母菌基因组DNA的提取实验

实验材料 酵母菌试剂、试剂盒 SE缓冲液山梨醇EDTA溶菌酶PVP蛋白酶K缓冲液 Tris仪器、耗材 高速冷冻离心机台式离心机恒温水浴低温冰箱冷冻真空干燥器取液器电泳仪水平电泳槽紫外观测仪实验步骤 1.  1.5 ml  对数生长期细菌细胞。2.  离心,12 000 rpm,1-2 min。3.

酵母菌基因组DNA的提取实验

基本方案             实验材料 酵母菌 试剂、试剂盒

克隆化酵母DNA的操作实验——基因置换技术

实验材料酵母实验步骤一、整合性破坏1.  将基因的内部片段亚克隆到YIP载体。2.  在此内部片段中将质粒线性化。3.  继续整合性转化步骤3(见基本方案1)。二、基因破坏一步法1.  将合适的选择性基因亚克隆到目的基因上,必要时,可在亚克隆的同时引入一个缺失。2.  采用合适的限制性位点,从步骤1

酵母DNA微量制备

实验概要本实验介绍了分别从40ml和5ml酵母培养液中制备酵母DNA的操作流程。实验步骤1. 酵母DNA微量制备(40ml)   1) 在125ml三角瓶中用40ml YPD培养液在30℃条件下培养细胞达最大生长量(过夜)。   2) 将上述培养物移入螺盖离心管,用医用离心机或Sorvall SS-

方法三:酵母菌基因组DNA的提取

方法三:酵母菌基因组DNA的提取一:仪器:同方法一二:试剂:SE缓冲液(1M山梨醇,0.1MEDTA pH7.5);溶菌酶(50mg/ml);20%PVP;蛋白酶K缓冲液(10mM Tris pH7.6  0.5% SDS 1mM EDTA);其余同前三:操作 1.5ml  对数生长期细菌细胞   

酵母DNA的小量制备

实验方法原理 通过消化细胞壁,然后用 SDS 裂解随之产生的原生质体就可以制备酵母 DNA。用这种方法可重复性地制备若干毫克的酵母 DNA。得到的酵母 DNA 可被限制性内切核酸酶切割,也可用作 PCR 的模板。实验材料 酶解酶 100T酵母细胞试剂、试剂盒 异丙醇醋酸钾SDS醋酸钠山梨糖醇缓冲液T

酵母DNA的快速分离

            实验方法原理 根据该方案制备的酵母 DNA 可以用作 PCR 反应的模板。在 E. coli 和 Saccharomyces cerevisiae 中均能复制的穿梭质粒也可以从酵母中提取,并且可以用于转化 E. coli。

酵母DNA的快速分离

实验方法原理 根据该方案制备的酵母 DNA 可以用作 PCR 反应的模板。在 E. coli 和 Saccharomyces cerevisiae 中均能复制的穿梭质粒也可以从酵母中提取,并且可以用于转化 E. coli。实验材料 酵母细胞试剂、试剂盒 乙醇酚氯仿醋酸钠STES 缓冲液TE仪器、耗材

酵母菌DNA制备

实验材料 酵母试剂、试剂盒 YPD破菌缓冲液酚氯仿异戊醇LB仪器、耗材 玻璃珠试管摇床培养箱离心机实验步骤 1.  注盛于一个13 mm×100 mm 无菌玻璃试管中的2 ml 培养基接种含有带目的基因的质粒的酵母单菌落,在转动或摇动培养箱中30℃过夜培养到静止期。2.  将1.5 ml 的过夜培养

酵母DNA的小量制备

实验方法原理通过消化细胞壁,然后用 SDS 裂解随之产生的原生质体就可以制备酵母 DNA。用这种方法可重复性地制备若干毫克的酵母 DNA。得到的酵母 DNA 可被限制性内切核酸酶切割,也可用作 PCR 的模板。实验材料酶解酶 100T酵母细胞试剂、试剂盒异丙醇醋酸钾SDS醋酸钠山梨糖醇缓冲液TE酵母

酵母DNA的小量制备

            实验方法原理 通过消化细胞壁,然后用 SDS 裂解随之产生的原生质体就可以制备酵母 DNA。用这种方法可重复性地制备若干毫克的酵母 DNA。得到的酵母 DNA 可被限制性内切核酸酶切割,也可用作 PCR 的模板。

快速制备酵母DNA法

实验概要本实验制备了酵母转化质粒,快速从转化酵母菌中分离了用于Southern分析的基因组DNA。主要试剂2% Triton X-100,1%SDS,100mmol/L NaCl,10mmol/L Tris-HCl(pH8),1mmol/L Na2EDTA,苯酚:氯仿:已戊醇(25:24:1),YP

酵母DNA的快速分离

根据该方案制备的酵母 DNA 可以用作 PCR 反应的模板。在 E. coli 和 Saccharomyces cerevisiae 中均能复制的穿梭质粒也可以从酵母中提取,并且可以用于转化 E. coli。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理根据该方案制备的酵母 DNA 可

PNAS破解新物种进化的难题

  经过将近5000亿次的尝试,美国德克萨斯大学(UT)奥斯汀分校的研究人员,见证了一个罕见的事件,也许解决了一个进化的难题:内含子——位于基因中的非编码DNA序列,在基因组中是如何增加的。研究结果发表在《PNAS》杂志上,解决了关于新物种进化的基本问题,并可以增进我们对于“基因表达以及癌

“垃圾DNA”不“垃圾”

   就像从电影中删掉的片段一样,生物基因中的一些序列最终也会被剪掉,细胞不会利用它们制造蛋白质。现在,两项研究发现,这些被称为内含子的片段有助于酵母在艰难时期存活。这项研究揭示了DNA的另一种可能的功能,科学家曾认为这种功能是无用的。  未参与该研究的美国加州旧金山州立大学进化分子生物学家Scot

内含子的重要功能:帮助酵母应对压力下的生存

  内含子(intron)的存在,是真核细胞蛋白质编码基因与原核细胞最大的区别。在真核细胞基因表达的过程中,需要经过RNA剪接反应将其去除。一般来说,内含子的长度远比编码蛋白的外显子序列长,并且执行剪接反应的酶——剪接体高度复杂,由170多个相关蛋白组成。剪接反应需要高度精准,移码错位一个碱基都会导

酵母菌基因组DNA的提取实验——基本方案

实验材料酵母菌试剂、试剂盒SE缓冲液山梨醇EDTA溶菌酶PVP蛋白酶K缓冲液Tris仪器、耗材高速冷冻离心机台式离心机恒温水浴低温冰箱冷冻真空干燥器取液器电泳仪水平电泳槽紫外观测仪实验步骤1.  1.5 ml  对数生长期细菌细胞。2.  离心,12 000 rpm,1-2 min。3.  沉淀。4

关于第一类内含子的发现和初步研究介绍

  1975年,人们以啤酒酵母菌mt-DNA某些突变为标记进W+XW-杂交,发现W+传递到了代的比例为95%而W-几乎为零,现象上好似发生了单方赂基因转变(unidirectionalgeneconversion)。从W-到W+,由于W+中有内含子ScLDU.1,而W-则无,故人们认为上述现象与该内

两篇Nature发现内含子的新作用:帮助细胞应对压力

  一直以来,科学家们对许多真核蛋白编码基因中散布的没有明显生物学功能的非编码DNA片段到底起什么作用感到困惑。这些被称为内含子的序列通常在转录和翻译的时候,从它们的原始序列剪接出来并在蛋白质产生之前迅速被破坏。  1月16日Nature杂志上发表的两项最新研究意外发现了内含子的新作用(至少在酵母中

CDK12通过抑制内含子多聚腺苷酸化调节DNA修复基因

  11月28日,麻省理工学院科研人员在Nature杂志上发表了题为“CDK12 regulates DNA repair genes by suppressing intronic polyadenylation”的文章,报道了CDK12的功能及其在肿瘤检测和治疗中的应用前景。  减弱同源重组(h

酵母菌DNA制备实验2

实验材料酵母试剂、试剂盒TERNA酶乙酸铵无水乙醇仪器、耗材离心机培养箱玻璃培养管实验步骤1.  在18 mm×150 mm 无菌玻璃培养管或17 mm×100 mm 无菌聚丙烯酰胺管中用10 ml YPD培养基过夜培养酵母菌至静止期。2.  培养物室温下在台式离心机上1 200 g 离心5 min

克隆化酵母DNA的操作实验

实验材料 酵母实验步骤   将待研究的基因亚克隆到YIP质粒。2.  用限制性内切酶在克隆化基因内部切开,使质粒线性化。3.  用1~10 μg DNA加上担体DNA转化适合的菌株,通过质粒上带的标记进行选择,在选择培养基上纯化几个转化子,制备DNA,应用Southern 杂交确证整合是否发生在所期

酵母菌DNA制备实验1

实验材料酵母试剂、试剂盒YPD破菌缓冲液酚氯仿异戊醇LB仪器、耗材玻璃珠试管摇床培养箱离心机实验步骤1.  注盛于一个13 mm×100 mm 无菌玻璃试管中的2 ml 培养基接种含有带目的基因的质粒的酵母单菌落,在转动或摇动培养箱中30℃过夜培养到静止期。 2.  将1.5 ml 的过夜培养物转移

将DNA导入酵母细胞实验

乙酸锂转化 电穿孔转化 单链高分子质量载体DNA的制备             实验方法原理 实验材料

将DNA导入酵母细胞实验

实验方法原理 实验材料 待转化的酵母菌株试剂、试剂盒 YPD培养基YPAD培养基:添加30 mg L腺嘌呤半硫酸的YPD培养基高纯无菌水l0×TE缓冲液pH 7.5无菌10×乙酸锂储液:1 mol L乙酸锂pH 7.5 (用稀乙酸调pH)过滤除菌DNA :高分子质量单链载体DNA和待转化DN

关于基因内含子的基本信息介绍

  基因内含子是阻断基因线性表达的序列。DNA上的内含子会被转录到前体RNA中,但RNA上的基因内含子会在RNA离开细胞核进行转译前被剪除。在成熟mRNA被保留下来的基因部分被称为外显子。基因内含子有时也叫内显子,与外显子相对。真核生物的基因含有外显子和基因内含子,是前者区别原核生物的特征之一。  

Nature惊人发现:RNA,修复损伤的模板

  能够准确地修复自发的错误、氧化或诱变剂导致的DNA损伤对于细胞生存至关重要。这种修复通常是利用完全相同或同源的完整DNA序列来实现。但科学家们现在证实,在一种常见芽殖酵母细胞内RNA可充当模板用来修复破坏性最大的DNA损伤——DNA双链断裂。  尽管较早的研究表明了将RNA寡核苷酸导入到细胞中可