如何证明RNA反转录是否成功?

如何证明RNA反转录是否成功?因为cDNA 是长短不一的 DNA 片断混合物,所以电泳的结果大多是模糊一片的,如果 RNA 丰度较低,电泳也可能是无产物,但是这种情况并不代表 PCR 会无结果。检测 cDNA 可以用定量的方法首先看一下内参有没有扩增出来,内参有结果,cDNA 的质量基本上可以保证。但能扩增出内参,不一定就说明 cDNA 没有问题。因为内参在 cDNA 中丰度高,很容易扩出。如果 cDNA 存在部分降解,从机率的角度讲,就会大大影响低丰度的目的基因的 PCR 结果,而内参因为依然是高丰度,扩增很可能不受影响。有些 GC 含量高,二级结构复杂的 RNA 模板,低温很难将二级结构打开,使用普通的逆转录酶很难奏效,此时可以选择思科捷AG0304,该酶可耐受高至 55℃高温,能够高效反转录多种 RNA 模板,最大限度将 RNA 逆转录成 cDNA 第一链。 ......阅读全文

RNA干扰(转录后基因沉默)实验

RNA干扰             实验方法原理 1. 病毒基因、人工转入基因、转座子等外源性基因随机整合到宿主细胞基因组内,并利用宿主细胞进行转录时,常产生一些dsR

简述信使RNA的转录过程

  分为起始、延长和终止三个阶段。起始包括对双链DNA特定部位的识别、局部(17bp)解链以及在最初两个核苷酸间形成磷酸二酯键。第一个核苷酸掺入的位置称为转录起点。  起始后起始因子离开,核心酶构象改变,沿模板移动,转录生成杂交双链(12bp)。随后DNA互补链取代RNA链,恢复DNA双螺旋结构。延

rna浓度太低能反转录么

要看你的rna浓度有多低,一般20ng/ul。rna浓度太低可能反转不出来或者反转不是目的产物,浓度太低建议不做。

转录组的重编写:RNA编辑

前 言基因的功能探索是生命科学研究的永恒主题。近几年以CRISPR-Cas9技术的发展让直接在高等生物体内进行基因的功能研究成为可能。但除了DNA之外, DNA的转录产物--RNA在生命活动中也发挥着极其重要的作用,且与癌症等多种疾病的发生密切相关。因此,对RNA进行功能研究和错误RNA的纠

rna浓度太低能反转录么

要看你的rna浓度有多低,一般20ng/ul。rna浓度太低可能反转不出来或者反转不是目的产物,浓度太低建议不做。

原核细胞的RNA转录过程

原核细胞的RNA转录:原核细胞的RNA聚合酶全酶(a2Bβ'σ)是由4条多肽链组成的核心酶加σ因子构成转录过程可划分为开始、延伸和终止三个阶段。①开始:σ因子识别DNA分子上的启动子并与之结合,将DNA双链局部解开,RNA合成开始,σ因子与核心酶分离。②延伸:RNA聚合酶沿模板链向前移动,使

体外转录合成单链RNA探针:体外转录法

体外转录法l        体外转录合成单链RNA探针1.      用适当的限制酶消化超螺旋质粒DNA制备5 pmol的线性模板DNA。取一小份消化的DNA(100ng)进行琼脂糖凝胶电泳分析。如有必要,再补加限制性酶进行温育,直至不再残存痕量的未消化DNA。2.      如必须用产生3’突出端

研究证明乙酰化过程与基因转录有重要关联

  最近,一个来自格拉德斯通研究所的科学团队对一个最基本的生物学过程——基因转录有了重要发现。  2013年,Gladstone的高级研究员Melanie Ott博士发现,在哺乳动物等复杂生物体的基因转录过程中,聚合酶的调控尾部也会发生另一种称为乙酰化的修饰。然而,到目前为止,没有人知道乙酰化是做什

“泛转录组”首次用于RNA测序分析

近日发表在《自然·方法》杂志上的一篇新论文中,美国加利福尼亚大学圣克鲁斯分校(UCSC)的研究人员介绍了有史以来第一种使用“泛转录组”分析全基因组RNA测序数据的方法。 分析一个人的基因表达需要将他的RNA图谱映射到一个标准参照物,以深入了解基因在多大程度上“开启”并在体内发挥功能。但当参照物不

“泛转录组”首次用于RNA测序分析

  近日发表在《自然·方法》杂志上的一篇新论文中,美国加利福尼亚大学圣克鲁斯分校(UCSC)的研究人员介绍了有史以来第一种使用“泛转录组”分析全基因组RNA测序数据的方法。  分析一个人的基因表达需要将他的RNA图谱映射到一个标准参照物,以深入了解基因在多大程度上“开启”并在体内发挥功能。但当参照物

RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子

RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子转录因子分子量(kD)功能TBP30与TATA盒结合TFⅡ-B33介导RNA聚合酶Ⅱ的结合TFⅡ-F30,74解旋酶TFⅡ-E34,37ATP酶TFⅡ-H62,89解旋酶TFⅡ-A12,19,35稳定TFⅡ-D的结合TFⅡ-I120促进TFⅡ-D的结合

RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子

RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子转录因子分子量(kD)功能TBP30与TATA盒结合TFⅡ-B33介导RNA聚合酶Ⅱ的结合TFⅡ-F30,74解旋酶TFⅡ-E34,37ATP酶TFⅡ-H62,89解旋酶TFⅡ-A12,19,35稳定TFⅡ-D的结合TFⅡ-I120促进TFⅡ-D的结合

体外转录合成单链RNA探针

实验方法原理 制备特异性的单链 RNA 探针不仅比 DNA 探针更容易,在杂交反应中一般也比具相同比活性的 DNA 探针产生更强的信号,这可能是由于含有 RNA 的杂合链固有的更高稳定性的缘故(Casey and Davidson 1977)。虽然 DNA 探针仍普遍地应用于 Norther

RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子

RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子转录因子分子量(kD)功能TBP30与TATA盒结合TFⅡ-B33介导RNA聚合酶Ⅱ的结合TFⅡ-F30,74解旋酶TFⅡ-E34,37ATP酶TFⅡ-H62,89解旋酶TFⅡ-A12,19,35稳定TFⅡ-D的结合TFⅡ-I120促进TFⅡ-D的结合

RNA测序解析白血病转录组

  巴塞罗那基因组调控中心Dr. Roderic Guigó领导研究团队,对慢性淋巴细胞白血病进行了转录组分析,获得了CLL相关基因和突变的功能图谱。这项工作发表在Genome Research杂志上。   这一项目是西班牙慢性淋巴细胞白血病基因组联盟的最新成果,该联盟曾鉴定了涉及CLL发展的

RNA聚合酶转录终止子

中文名终止子外文名terminator T定义终止子(terminator T)是给予RNA聚合酶转录终止信号的DNA序列。在一个操纵元中至少在结构基因群最后一个基因的后面有一个终止子。作    用转录终止信号

体外转录合成单链RNA探针

            实验方法原理 制备特异性的单链 RNA 探针不仅比 DNA 探针更容易,在杂交反应中一般也比具相同比活性的 DNA 探针产生更强的信号,这可能是由于含有 RNA 的杂合链固有的更高稳定性的缘故(Casey and Davidson 197

研究人员首次证明RNA也可以被写回DNA

  人们知道,细胞可以将DNA复制成一组新的DNA,然后进入一个新形成的细胞。其中,涉及一类被称为聚合酶的细胞“机器”,它们也可以构建RNA信息,这些从DNA中心库复制的信息可以被更有效地“解读”为蛋白质。但聚合酶被认为只沿着DNA到DNA或DNA到RNA的方向起作用,从而防止RNA信息被重写回DN

RNA干扰(RNAi)实验成功要素

基因和siRNA选择RNAi实验的通量可从沉默单个感兴趣的基因,到少量相关基因或同一个通路上的基因,到全基因组高通量筛选,取决于需要解决的生物学问题。siRNA的设计至关重要。转染优化用于RNAi实验的细胞应当有效转染siRNA。转染必须经过优化确保siRNA的浓度是最低的有效浓度以避免非特异性效应

通过记录RNA聚合酶观察早期RNA转录动力学

  科学家们通过记录RNA聚合酶在何时何地通过与DNA序列结合启动转录,观察了早期RNA转录动力学。  生命的活动是通过蛋白质的制造而发生的,蛋白质赋予我们的细胞结构和功能。细胞蛋白质从DNA编码的基因指令中获得行进顺序,他们的序列首先被复制并在一个叫做转录的多步骤过程中被制造成RNA。  科罗拉多

如何诊断胃食管反流?

  胃食管反流临床表现复杂且缺乏特异性,仅凭临床表现难以区分生理性胃食管反流或病理性胃食管反流。目前必须采用综合诊断技术。凡临床发现不明原因反复呕吐、咽下困难、反复发作的慢性呼吸道感染、难治性哮喘、生长发育迟缓、反复出现窒息、呼吸暂停等症状时都应考虑到胃食管反流存在的可能性,必须针对不同情况,选择必

新RNA转录变体可简化生物线路

  近年来,合成生物学发展迅速,研究人员给微生物设计的功能也越来越复杂,但在细胞行为的可预测性、安全性和高效性方面仍有很多难以解决的问题。据每日科学网站5月30日(北京时间)报道,美国能源部劳伦斯伯克利国家实验室生物学家创造出一种能放大RNA(核糖核酸)转录信号的变体,可大大简化控制细胞行为的生物线

信使RNA反转录的生物学意义

  1.对分子生物学的中心法则进行了修正和补充,修正后的中心法则表示为:  2.在致癌病毒的研究中发现了癌基因,在人类一些癌细胞如膀胱癌、小细胞肺癌等细胞中,也分离出与病毒癌基因相同的碱基序列,称为细胞癌基因或原癌基因。癌基因的发现为肿瘤发病机理的研究提供了很有前途的线索。  3.在实际工作中有助于

捕获早期RNA转录动力学的关键

  生命的活动是通过蛋白质的制造而发生的,蛋白质赋予我们的细胞结构和功能。细胞蛋白质从DNA编码的基因指令中获得行进顺序,他们的序列首先被复制并在一个叫做转录的多步骤过程中被制造成RNA。  科罗拉多州立大学的一个研究合作项目专门研究高分辨率荧光显微镜和计算模型,以实时、精细地可视化和描述这类生命过

Nature:针对RNA转录和剪接的新观点!

  细胞通常产生区室来控制重要的生物功能。细胞核就是一个很好的例子;它被核膜包围着,容纳着基因组。然而,细胞还含有未被膜包围的较为短暂存在的封闭室,就像水中的油滴。在过去两年中,这些称为液滴状“凝聚物(condensates)”的封闭室已越来越多地被认为是控制基因的主要参与者。如今,在一项新的研究中

信使RNA的启动子和转录因子

  一定义:酶识别、结合、开始转录的一段DNA序列。强启动子2秒钟启动一次转录,弱启动子10分钟一次。  二原核生物:大肠杆菌在起点上游约-10碱基对处有保守序列TATAAT,称为pribnow box,有助于局部解链。在其上游还有TTGACA,称为-35序列,提供RNA聚合酶识别的信号。  三真核

RNA干扰的体外转录的相关介绍

  以DNA Oligo为模版,通过体外转录合成siRNAs,成本相对化学合成法而言比较低,而且能够比化学合成法更快的得到siRNAs。不足之处是实验的规模受到限制,虽然一次体外转录合成能提供足够做数百次转染的siRNAs,但是反应规模和量始终有一定的限制。而且和化学合成相比,还是需要占用研究人员相

小干扰RNA转录后基因沉默的介绍

  siRNA诱导的转录后基因沉默始于RNA诱导的沉默复合物(RISC)的组装。该复合物通过切割编码靶基因的mRNA分子来沉默某些基因表达。为了开始该过程,两条siRNA链中的一条(引导链)将被装载到RISC中,而另一条链即过客链被降解。某些Dicer酶可能负责将引导链加载到RISC中。然后,siR

如何判断是否患有肝癌?

核心提示: 早期肝癌会导致肝区疼痛,但并不一定都是肝癌所引起的,也可能是肝炎或肝硬化,大部分患者都会有消化道不适感,影响食欲,吃完饭之后腹部会有饱腹感,还会有持续性发热伴打寒战的症状,这些症状都要引起大家的重视,避免与其他疾病相混淆。   肝癌是严重的恶性肿瘤,如果进入肝癌的晚

如何检测茶叶是否合格?

  根据茶叶中被曝出的问题可以看出,茶叶中经常超标的农药为有机氯农药残留,因此就需要用气相色谱法来检定茶叶中的农残含量。  传统的方法采用填充柱恒温操作,低沸点组分解易重叠,高沸点组分峰易扩展,分离效果不理想。采用电子捕获-气相色谱法(ECD-GC)OV-17中等极性毛细管柱,进行程序升温操作,组分