锌指蛋白ZFP217通过介导m6AmRNA甲基化导致肥胖的原理
过去三十年来，全球肥胖和2型糖尿病的发病率有所上升，而脂肪组织是肥胖相关疾病的重要因素，因此，控制脂肪细胞分化和成熟可能是治疗肥胖相关疾病的一个有希望的策略（1）。为了阐明转录和表观遗传调控在脂肪形成中的作用，并确定一个主要的关键调控因子和途径（1，2），人们做了大量的努力，然而，转录后调控在脂肪形成中的作用尚不清楚。锌指蛋白217（Zfp217，人类同源蛋白ZNF217）是一种在多种人类肿瘤（4，5）中上调的已知致癌蛋白，也是胚胎干细胞分化的关键蛋白（3，7，8）。值得注意的是，Zfp217将基因转录与新生RNA上的m6A修饰紧密结合，提示Zfp217在协调表观遗传和表观转录网络中的关键作用（3，9）。虽然我们之前确定了一个新的角色对于脂肪发生中的Zfp217，详细的Zfp217依赖机制尚未得到很好的描述（10，11）。然而，这些研究增加了Zfp217可能通过调节m6A修饰来加速脂肪生成的可能性。 为了阐明Zfp21......阅读全文
m6A修饰的YTHDF1与介导EIF3C对卵巢癌进展的影响
m6A是真核生物中最常见的一类RNA修饰，能够在多种生物过程中发挥重要作用，例如癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等。2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子的辉煌。2020年1月何川教授团队再次带领m6A登上顶级期刊Science，预示着m6A等RNA修饰
m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点，也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature，cell级别高分文章领域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码，之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究（详细见云序课堂之前往期回顾）。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RNA在
m6A修饰的YTHDF1与介导EIF3C对卵巢癌进展的影响（二）
为了全面探索YTHDF1及其靶基因之间的直接相互作用，作者对过表YTHDF1的A2780细胞，进行了eCLIP-seq，并鉴定了2,343个目标转录物，这些转录物大多数是mRNA。将eCLIP seq的结果2,343个基因和上面三组数据交集确定的647个基因取交集，产生175个基因，将其确定
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点，也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature，cell级别高分文章领域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码，之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究（详细见云序课堂之前往期回顾）。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN
Cell：表观遗传新关注点—mRNA修饰
表观遗传学研究关键点是修饰DNA及其蛋白质支架的化学标记，越来越多的研究表明这些化学标记能告诉细胞，哪些基因是表达，哪些是沉默的，因而也决定了个体的表型性状。 mRNA即信使RNA，在中心法则中扮演了重要角色，但此前一些科学家们认为这种RNA只是完成传递的作用，把细胞核中编码的信息传递给蛋白翻
何川、贾桂芳研究组发文：植物mRNA化学修饰m6A去甲基酶
近期，北京大学化学学院的何川、贾桂芳课题组在在高等植物N6-甲基腺嘌呤（m6A）动态可逆调控的研究中取得重要进展，相关工作以“ALKBH10B is An RNA N6-Methyladenosine Demethylase Affecting Arabidopsis Floral Transi
一次RNA甲基化测序的多项成果云序RNA甲基化测序技术...2
（二）云序客户m6A RNA甲基化修饰表达谱，一次测序两篇文章疾病：胃癌样品：胃癌组织vs癌旁组织（6 vs 6）研究方法：m6A-MeRIP-Seq，RNA-seq4. m6A修饰对其修饰基因在胃癌中的异常表达及预后的潜在影响发表杂志：Frontiers in Genetics影响因子：3.258
中国科学家8月参与发表多篇Nature文章
8月中国学者参与的多项研究在Nature杂志及其重要子刊上发表，其中包括m6A修饰在T细胞介导的病理机制中的体内生物学功能，beta2肾上腺素受体复合物结构，以及SPOP基因突变对药物耐药性发展的影响。 在分子生物学的中心法则中，遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可
SMAD2/3与TGFβ通路协同影响转录因子发生m6A－RNA甲基化调...
SMAD2/3与TGF-β通路协同影响转录因子发生m6A RNA甲基化调控干细胞发育文章导读：胚胎干细胞作为一种全能性细胞，通过增殖和分化，产生动物体所有组织和器官的细胞。已有研究表明，胚胎干细胞发生m6A RNA甲基化，大多与细胞增殖[1-2]，免疫应答[4]关系密切。然而，对于m6A修饰在胚
Nature－|－m6A－RNA甲基化识别蛋白YTHDF1参与记忆的形成
目前来说，调控m6A修饰过程的阅读蛋白共有9种功能，今天不会大家一一来讲，而是主要讲参与蛋白编码过程的YTHDF1蛋白，它主要通过与mRNA的m6A位点结合，在脑神经发育[1]，多巴胺分泌[2]和突触形成[3]等过程中起重要作用。 文章导读： 2018年10月31日，美国芝加哥大学何
m6A－RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用
最近小编检索了关于m6A修饰的文章发表情况，发现目前2020年发表的关于m6A修饰的文章已经达到309篇，已经追平2019年整年度发表篇数，可以预见m6A RNA修饰下半年年发表文章会呈现出爆炸式增长。 图1. 近6年m6A RNA修饰相关文章发表情况（ data from PubMe
植物所解析RNA甲基化调控果实成熟的作用机制
DNA甲基化（5mC）和RNA甲基化（m6A）是两种重要的核酸修饰，在基因表达调控中发挥重要作用并参与诸多生物学过程。然而，这两种核酸修饰之间是否存在内在关联性却不清楚。近日，中国科学院植物研究所秦国政研究组和田世平研究组合作，揭示了DNA甲基化可通过调节m6A去甲基化酶基因表达的方式影响番茄果
Nature遗传学综述：何川教授详解RNA甲基化
在分子生物学的中心法则中，遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰，这些修饰可调控基因的表达，并由此决定细胞的状态，影响细胞的分化和发育。近年来人们发现， mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。 RNA在生物学系统中有着举足轻重的作用，它
何川、贾桂芳Nature子刊发布表观遗传学新成果
来自芝加哥大学、北京大学的研究人员在新研究中，揭示出了拟南芥m6A甲基化组（methylome）的独特特征。他们的研究结果发表在11月28日的《自然通讯》（Nature Communications）杂志上。 芝加哥大学的何川（Chuan He）教授、Joy Bergelson教授以及北京大学
人类组织中m6A修饰的动态变化和进化（一）
文章导读m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰，通过多种机制，比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异，m6A位点在转录本上的位置分布，以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响，近期Nucleic Aci
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用（二）
4.ALKBH5抑 制胰腺ai细胞生长和转移将过表达ALKBH5的ai细胞移植到裸鼠体内，发现过表达ALKBH5的ai细胞生成的肿 瘤体积明显小于对照组，并且细胞生长的指示分子Ki-67的表达也明显降低。染色显示过表达ALKBH5的组织中侵袭和转移的指示分子MMP-2和MMP-9表达降低，敲
研究发现FTO是抗AML药物作用的潜在靶点
4月15日，中国科学院上海药物研究所杨财广课题组与美国陈建军课题组和钱志坚课题组合作研究，在化学干预RNA甲基化（m6A）修饰方向上取得新进展。研究成果“Small-molecule Targeting of Oncogenic RNA Demethylase FTO in Acute Myel
一文速览丨2019年曹雪涛团队在Science，PNAS发表成果盘点
2019年，曹雪涛团队在Science，Nature Immunology，PNAS 等杂志上发表了13篇重要研究成果，在免疫学领域取得重大进展，iNature系统盘点一下曹雪涛团队的研究成果： 【1】干扰素-γ（IFN-γ）对于细胞内细菌固有的免疫反应至关重要。 非编码RNA和RNA结合蛋白
揭示：AML中相分离形成的nYACs的重要功能
RNA表观修饰是表观遗传学研究领域的前沿方向。截止目前，已经有超过100种RNA的化学修饰被鉴定出来，而作为真核生物mRNA内部丰度最高的RNA修饰，m6A的功能研究备受关注。m6A可以被甲基转移酶复合体（writer）复合体写入mRNA， 被去甲基化酶（eraser）去除，处于动态平衡当中。细
Nature－Genetics－|－何川团队绘制淋巴母细胞样细胞系QTL图谱
N6-甲基腺苷（m6A）在调节信使RNA加工中起重要作用。尽管在该领域取得了快速进展，但对m6A修饰的遗传决定因素及其在常见疾病中的作用了解甚少。 2020年6月29日，芝加哥大学何川等团队在Nature Genetics 在线发表题为“Genetic analyses support the
中山大学杨建华团队发1篇Nature，揭示m6A详细调控机制
2019年3月13日，美国希望之城贝克曼研究所陈建军，芝加哥大学何川，中山大学杨建华及辛辛那提儿童医院黄刚共同通讯在Nature在线发表题为“Histone H3 trimethylation at lysine 36 guides m6A RNA modification co-transcr
Cell－Research－肠道菌群调控宿主RNA甲基化和基因表达新机制
肠道菌群微生物组学是近年来研究热点，肠道菌群在维持宿主生理平衡和健康中发挥着重要作用，在人和动物疾病治疗方面具有极大的应用前景。研究表明，肠道菌群及其代谢产物可调节宿主基因表达。随着研究的深入, 肠道菌群和宿主之间的相互作用机理也越来越多被发现，特别是通过表观遗传影响宿主的基因表达。如最新研究发
RNA甲基化整体水平鉴定的方法汇总
RNA甲基化（RNA methylation）是一类表观遗传修饰，在已经发现的超过100种不同的RNA化学修饰中，主要有6-甲基腺嘌呤（N6-methyladenosine, m6A）、5-甲基胞嘧啶（C5-methylcytidine, m5C）和1-甲基腺嘌呤（N1-methylad
Nature揭示RNA修饰在大脑功能和性别决定中的重要作用
RNA在生物学系统中有着举足轻重的作用，兼具信息分子和调控分子双重功能。据估计RNA上有一百多种化学修饰，但绝大多数修饰的功能还鲜为人知。本期Nature发表的一项研究指出，RNA修饰对果蝇神经系统的功能至关重要，也在性别决定起到了重要作用。 N6-methyladenosine（m6A）是真
小白必看！RNA甲基化整体水平鉴定的方法汇总
RNA甲基化（RNA methylation）是一类表观遗传修饰，在已经发现的超过100种不同的RNA化学修饰中，主要有6-甲基腺嘌呤（N6-methyladenosine, m6A）、5-甲基胞嘧啶（C5-methylcytidine, m5C）和1-甲基腺嘌呤（N1-methyladenos
上海药物所小分子调控核酸去甲基化研究取得阶段进展
中科院上海药物研究所杨财广课题组与蒋华良课题组合作，基于mRNA中N6位甲基化修饰的腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)去甲基化酶FTO结构开展小分子调控研究，首次获得了对核酸去甲基化酶，例如FTO具有酶活和细胞活性的小分子抑制剂。论文于10月11日在线发表于《美国化学会
揭秘m6A修饰新功能－－－－调控染色质状态和转录活性
m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰，能够在多种生物过程中发挥重要作用，包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。 2020年1月17日，美国芝加哥大学何川，中科院北京基因组研究所
最新发现！多代父体肥胖降低子代精子质量
安徽医科大学公共卫生学院教授王华、徐德祥团队和安徽医科大学第一附属医院教授贺小进、曹云霞团队发现，多代父体肥胖通过表观遗传修饰降低子代精子质量。相关研究成果日前发表于《自然-通讯》。据世界卫生组织报道，不孕不育已成为继心血管疾病和肿瘤之后威胁人类健康的第三大疾病。国内外多项大样本调查发现，一般人群中
何川教授Nature，Cell子刊解析表观遗传学
早年毕业于中国科技大学的何川教授现任芝加哥大学生物物理动态研究所主任，以及北京大学合成与功能生物分子中心主任。何川教授研究组主要从事化学生物学、核酸化学和生物学、遗传学等方面的研究，近期在Nature Biotechnology，Molecular Cell杂志上发表新研究成果，解析基因组及
Mettl3介导m6A－RNA甲基化调控骨髓间充质干细胞骨质疏松症
文章导读： 近日，四川大学华西医院的周学东和袁泉研究组，联合中山大学第一附属医院的林水宾团队合作研究共同揭示了Mettl3介导m6A RNA甲基化调控骨髓间充质干细胞和骨质疏松症命运的新机制。该研究成果以Mettl3-mediated m6A RNA methylation regulat