浙大郭国骥团队绘制世界首个人类细胞图谱

近日,世界首个人类细胞图谱在浙大绘制成功。 北京时间2020年3月26日,浙江大学医学院郭国骥教授团队的这项研究成果在线发表于《自然》。 而在两年前,该研究团队在《细胞》上发表了世界首个小鼠细胞图谱。 “这项工作概括地说就是人体细胞数字化。”郭国骥表示,“我们能用数字矩阵描述每一个细胞的特征,并对它们进行系统性的分类。发现了一些特殊的表达模式,并定义了30多种新细胞种类。” 郭国骥介绍,该成果主要是源于团队及合作者30多人近两年来夜以继日的奋斗。 郭国骥(前排)与团队成员 该论文建立了人类细胞图谱的基本框架;发现成人非免疫细胞的广泛免疫激活;提出体内干细胞和祖细胞的分化过程是一个细胞基因表达从混乱到有序的过程;并认为基因组中的调节子预先决定了分化终端的稳定状态。 谈及谱图对医学的临床应用,郭国骥告诉《中国科学报》记者,“我们现在建立的是正常细胞的单细胞转录组的数据库,可以用于再生医学种子细胞的鉴定。未来如推广到......阅读全文

光滑双脐螺免疫细胞基因组图谱完成

  科技日报北京12月20日电 (记者张梦然)施普林格自然出版社旗下《免疫遗传学》杂志近日公布了世界上第一份曼氏血吸虫中间宿主免疫细胞的单细胞RNA测序(scRNA-seq)的比较基因组学和转录组学科学成果,该成果是由中国北部湾大学和加拿大阿尔伯塔大学共同主持。  光滑双脐螺是世界上排名第二的最重大

花生茎秆单细胞基因表达图谱构建成功

  广东省农业科学院作物研究所花生遗传育种团队在国家重点研发计划、国家自然科学基金等项目的资助下,成功攻克了花生茎秆单细胞基因表达图谱构建的技术难题。近日,相关成果在线发表于《植物生物技术杂志》(Plant Biotechnology Journal)。花生茎秆单细胞基因表达图谱构建。研究团队供图 

猕猴大脑皮层单细胞空间分布图谱发布

  由860亿个神经元组成的人类大脑,就像一座结构精巧的迷宫。为了绘制出这座迷宫的地图,脑科学家们将目光聚焦在猕猴——这种与人类最接近的灵长类模式动物上,它的大脑包含超过60亿个神经元。  7月12日23时,由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心(神经科学研究所)联合华大生命科学研究院、临港实验室

科学家绘迄今最全的人脑细胞图谱

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510321.shtm

Nature-immunoloy:新冠肺炎患者的单细胞免疫图谱

  研究人员应用单细胞测序技术全面揭示了轻中型、重型新冠肺炎患者及其从发病期到康复期机体整体免疫学变化特征、机制和规律。   今年年初,新冠肺炎疫情在世界范围内快速暴发。根据世界卫生组织最新统计数据显示,截止到2020年8月11日,新冠肺炎在全球已导致累计近2000万确诊病例和超过73万死亡病例,平

杨树次生木质部单细胞转录组图谱建立

  近日,北京林业大学教授张德强团队在《植物生物技术杂志》发表研究论文。该研究以杨树为研究模式,利用单细胞测序技术、基因组分析、RNA原位杂交、愈伤组织遗传转化等技术建立了杨树次生木质部的单细胞转录组图谱,重构了完整的杨树次生木质部细胞类群,鉴定了调控木质部发育过程的关键转录因子,系统解答了次生木质

疟疾细胞图谱,极大加快疟疾研究和疗法开发

  疟原虫是疟疾的致病因子,是具有不同形态发育阶段的单细胞生物,每个阶段都专门生活在极其不同的环境和宿主细胞类型中。这种形态多样性的基础是对它的紧凑基因组的严格调控,不过大约40%基因的功能仍然未知,这阻碍了有效药物和疫苗开发的速度。单细胞RNA测序(scRNA-seq)允许构建发育过程、细胞多样性

科学家绘制迄今最全人脑细胞图谱

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/515807.shtm (图片来源:Utthapon wiratepsuponShutterstock)10月13日,刊发在美国《科学》《科学进展》和《科学-转化医学》杂志上的21篇论文公布并阐释了

图谱揭示细胞周期与胰腺命运之间的联系

  在多细胞生物胚胎发育过程中,一个前体细胞最终可以产生一种或多种类型的成熟功能细胞。明确原始胚层中每一个前体细胞产生的所有子代细胞类型及其发育路径和轨迹,以单细胞分辨率洞悉细胞从原始胚层到各个组织器官发育成熟的“来龙去脉”,一直是发育生物学的基本问题和长期以来的研究目标,也是进一步深入理解细胞命运

《自然》:全球首个非人灵长动物全细胞图谱发布

 4月13日,由深圳华大生命科学研究院主导,多国科研团队共同参与的首个非人灵长类动物(猕猴)全身器官细胞图谱发表于《自然》。据介绍,该图谱将被用于物种进化、人类疾病以及药物评价和筛选相关的研究,有望为生物医学的发展提供基础性的资源和工具,为疾病诊疗、靶向药物开发提供助力,为人类更好地探究生命的进化提

猕猴大脑皮层单细胞空间分布图谱发布

  由860亿个神经元组成的人类大脑,就像一座结构精巧的迷宫。为了绘制出这座迷宫的地图,脑科学家们将目光聚焦在猕猴——这种与人类最接近的灵长类模式动物上,它的大脑包含超过60亿个神经元。  7月12日23时,由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心(神经科学研究所)联合华大生命科学研究院、临港实验室

《Cell》第一张灵长类视网膜细胞图谱

  几十年来,科学家一直把普通实验鼠的视网膜作为研究模型来理解神经元如何连接到大脑中形成回路,但是作为视觉和视觉相关疾病模型,鼠类不可谓称职。  分子和细胞生物学教授、脑科学中心主任Joshua Sanes说,问题在于它们缺乏中央凹(fovea)——视网膜中一个很小的专门区域,形成清晰的中央视觉。在

单细胞染色质图谱|揭示转录因子网络和细胞谱系关系

  2019年10月8日,美国圣地亚哥的Salk研究所的Geoffrey Wahl团队在Cell Reports杂志上发表文章“Single-Cell Chromatin Analysis of Mammary Gland Development Reveals Cell-State Transcr

完整的大脑免疫细胞图谱-揭示了巨噬细胞惊人的多样性

  大脑中含有多种免疫细胞,它们对大脑功能起着重要作用。VUB的VIB炎症研究中心的Kiavash Movahedi教授领导的一个研究小组已经开发了一个完整的大脑免疫细胞图谱。这不仅揭示了巨噬细胞惊人的多样性,也揭示了小胶质细胞的存在。值得注意的是,这些以前不为人知的小胶质细胞与通常与阿尔茨海默氏症

构建出人类肝脏的完整细胞图谱,鉴定出新的肝细胞亚型

  肝脏是人体最大、功能最广泛的器官之一。它将我们食物中的糖、蛋白和脂肪转化为对身体有用的物质,并将它们释放到细胞中。肝脏除了在人体新陈代谢中发挥作用外,还是一种免疫器官,对血液的排毒是必不可少的。最引人注目的是,当仅为原始质量的25%时,肝脏是唯一能够恢复到原来大小的内脏器官。  肝病是世界上最大

我国学者发表基于单细胞转录组测序数据的小鼠细胞图谱

  在国家自然科学基金项目(项目编号:31722027)等资助下,浙江大学医学院干细胞与再生医学中心郭国骥教授团队在单细胞组学技术及哺乳动物全细胞表达谱系分析研究中取得突破性进展。相关成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”(利用微孔板测序

我国学者发表基于单细胞转录组测序数据的小鼠细胞图谱

  在国家自然科学基金项目(项目编号:31722027)等资助下,浙江大学医学院干细胞与再生医学中心郭国骥教授团队在单细胞组学技术及哺乳动物全细胞表达谱系分析研究中取得突破性进展。相关成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”(利用微孔板测序

Nature-Genetics-|-何川团队绘制淋巴母细胞样细胞系QTL图谱

  N6-甲基腺苷(m6A)在调节信使RNA加工中起重要作用。尽管在该领域取得了快速进展,但对m6A修饰的遗传决定因素及其在常见疾病中的作用了解甚少。  2020年6月29日,芝加哥大学何川等团队在Nature Genetics 在线发表题为“Genetic analyses support the

暨南大学报道-造血干细胞发育单细胞lncRNA动态表达图谱

   来自暨南大学基础医学院兰雨课题组、中国医学科学院基础医学研究所余佳课题组、军事医学科学院附属医院(现为解放军总医院第五医学中心)刘兵课题组合作发表研究论文“Combined Single-Cell Profiling of lncRNAs and Functional Screening Re

重编程再生造血干细胞样细胞,中科院有新图谱

中国科学院广州生物医药与健康研究院王金勇课题组研究实现在体重编程再生造血干细胞样细胞。相关研究近日在线发表于Cell Proliferation。中国科学院广州生物医药与健康研究院博士生黄德浩和中山大学医学院副研究员赵乾皓为该论文共同第一作者,博士后胡房晓和王金勇研究员为共同通讯作者。该研究获得实验

基于单细胞RNA测序绘制人类大脑高分辨率免疫细胞图谱

  近日,在德国弗赖堡大学医学中心科学家的指导下,一个联合研究团队利用单细胞RNA测序技术绘制了首个人类大脑高分辨率免疫细胞图谱!有史以来第一次证明大脑中的小胶质细胞(即吞噬细胞)具有相同的核心特征,并会根据大脑功能需求进行适应性表达,揭示了小胶质细胞的时间和空间异质性。2月14日,相关研究成果发表

科学家绘制出脑前额叶发育单细胞图谱

  近日,中科院生物物理所王晓群课题组、北京大学未来基因诊断高精尖创新中心汤富酬课题组、北京大学第三医院乔杰课题组和首都医科大学附属安贞医院张军课题组合作,绘制出人脑前额叶胚胎发育过程的单细胞转录组图谱,并对其中关键的细胞类型进行了系统功能研究,为绘制完整的人脑细胞图谱奠定重要基础。相关研究成果已发

研究人员绘制七鳃鳗单细胞转录组图谱

雷氏七鳃鳗作为现存的无颌脊椎动物代表,是一种由无脊椎动物向脊椎动物进化的过渡类型,被视为研究脊椎动物演化的重要模式生物。近日,华大生命科学研究院联合辽宁师范大学七鳃鳗研究中心等单位在《自然—通讯》发表最新研究成果,团队基于华大自主研发的DNBelab C4和 DNBSEQ测序平台,采用单细胞RNA测

首次绘制紫外辐射诱导的细胞应答遗传互作图谱

  美国加利福尼亚大学圣地亚哥医学院的研究人员,与荷兰和英国的合作者一起,首次绘制了紫外辐射诱导的细胞应答反应背后的详细的遗传互作图谱。这项研究成果将在12月26日的Cell Reports杂志上刊出。   加利福尼亚大学圣地亚哥医学院的研究人员,与荷兰、英国的合作者一起,首次绘制了紫外(UV

迄今最完整植物单细胞图谱问世,揭开叶片衰老“密码”

  植物的衰老往往伴随着新生,在衰老的过程中,叶片并非简单地枯萎掉落,而是悄悄进行一场资源大转移,将自己积累的碳、氮等营养物质分解,转运给花朵、果实,甚至根部,用“牺牲”自己,换来果实的茁壮成长。  在叶片衰老的过程中,植物细胞如何进行时空协调?哪些关键基因参与了调控?4月11日,一项发表于《细胞》

北京生科院建立单细胞环形RNA分析技术及表达图谱

  环形RNA是一类在真核细胞中广泛存在的内源性非编码RNA分子,在生物体发育过程中发挥重要作用。之前研究已在不同物种中鉴定出数百万个环形RNA分子,并产生了大量用于揭示生物体组织表达模式的环形RNA数据资源。然而,由于大多数环形RNA表达量较低,传统的转录组测序方法无法表征单个细胞环形RNA表达谱

科学家描绘出骨骼肌细胞衰老图谱

  近日,香港中文大学(简称“港中文”)医学院的研究团队在《自然—通讯》发表最新研究成果。他们提出了人类骨骼肌细胞衰老图谱,成功运用单细胞多组学技术及衰老评分算法,揭示了人类骨骼肌细胞衰老特征及调控机制,并发现小分子药物马拉维若(Maraviroc)可有效延缓肌肉衰老,有望开创崭新的抗衰老药物疗法,

科学家绘制水稻幼苗根叶单细胞转录图谱

  水稻幼苗叶和根的单细胞转录组二维UMAP图与组织解剖图 图片来源:钱文峰等  中国科学院遗传与发育生物学研究所钱文峰研究组应用单细胞转录组测序技术,获得了水稻幼苗叶和根超过20万个单细胞的转录组信息,利用细胞类型标记基因和原位杂交技术,对每个细胞的身份进行了鉴定,构建了水稻幼苗叶和根的单细胞转录

Cell:绘制人类单细胞染色质可及性图谱

  在人类细胞中,总长约2米的基因组DNA通过与组蛋白缠绕形成核小体,并经过螺旋折叠等方式盘绕形成染色体进而团聚于直径10微米的细胞核中。在细胞内的DNA需要进行转录等活动的时候,DNA才会从组蛋白中释放出来,裸露出需要与转录因子结合的位点从而便于转录,染色质的这种特性叫做染色质可及性,暴露的区域被

西工大今年首篇《科学》:建立鹿角再生细胞图谱

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494497.shtm 2023年2月24日(北京时间),Science(《科学》)杂志在线发表了西北工业大学生态环境学院与国内外多家单位共同完成的题为“A population of stem cel