用PCR来制备编码随机肽的双链DNA文库实验

试剂、试剂盒 限制性内切酶和缓冲液灭菌双蒸水Tris-HCl生物素标记的 PCR 引物仪器、耗材 链霉抗生物素蛋白磁性珠琼脂糖凝胶电泳所需的试剂和设备实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂灭菌双蒸水(ddH20)10 mmol/LTris-HCl,pH8.02. 酶和酶缓冲液限制性内切酶和缓冲液(见第 9 步)10XVent 缓冲液VentDNA 聚合酶3. 核酸和寡核苷酸生物素标记的 PCR 引物,长度至少 15bp,5'末端进行了生物素修饰(见图 26-1)。编码 12 个氨基酸的 NNK 库。库的设计如图 26-1(a) 所示。合成的链含有一个随机多肽库,它们的 3'末端和 5‘末端都加了一个特定的侧翼序列,作为引物结合的位点,并且含有限制性内切酶的识别位点,以方便将文库 DNA 克隆进合适的载体系统。侧翼序列长度至少应该有 15bp,并且设计时应该有 3 个标准:......阅读全文

用-PCR-来制备编码随机肽的双链-DNA-文库实验

使用合成的寡核苷酸构建文库时,PCR 有两个重要的作用。第一,用与特定侧翼序列退火的引物来扩增文库,仅用少量的不同模板,就可以得到大量的 PCR 产物。第二,若要产生文库 DNA 的复杂互补链,PCR 合成法是有效的方法。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒限制

用-PCR-来制备编码随机肽的双链-DNA-文库实验

试剂、试剂盒 限制性内切酶和缓冲液灭菌双蒸水Tris-HCl生物素标记的 PCR 引物仪器、耗材 链霉抗生物素蛋白磁性珠琼脂糖凝胶电泳所需的试剂和设备实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂灭菌双蒸水(ddH20)10 mmol/LTris-HCl,pH8.02. 酶和酶缓冲液限制性内切酶和缓冲液

用-PCR-来制备编码随机肽的双链-DNA-文库实验

            试剂、试剂盒 限制性内切酶和缓冲液 灭菌双蒸水 Tris-HCl 生物素标记的 PCR 引物 仪器、耗材

用-PCR-对一个随机多肽-DNA-文库的质量进行控制实验

该方案中,用 PCR 分析由质粒载体编码的随机多肽文库。该文库是由连接反应的产物转化细菌后得到的,方案 2 已经介绍过,然后再用标准的程序对质粒进行扩增和纯化。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒ddH20Vent 缓冲液Vent DNA 聚合酶dNTP引物质粒

用-PCR-对一个随机多肽-DNA-文库的质量进行控制实验

试剂、试剂盒 ddH20Vent 缓冲液Vent DNA 聚合酶dNTP引物质粒 DNA仪器、耗材 琼脂糖凝胶电泳所需的试剂和设备热循环仪实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂ddH202. 酶和酶缓冲液10X Vent 缓冲液Vent DNA 聚合酶3. 核酸和寡核苷酸dNTP,各 20 mm

用-PCR-对一个随机多肽-DNA-文库的质量进行控制实验

            试剂、试剂盒 ddH20 Vent 缓冲液 Vent DNA 聚合酶 dNTP 引物 质粒 DNA

建立随机重叠DNA插入文库实验

            试剂、试剂盒 乙酸铵 ATP 乙醇 甘油 蒸馏水 IPTG MgCl2 NaCl 酚

建立随机重叠DNA插入文库实验

下面的方案描述了鸟枪法测序的起始步骤,从靶 DNA 的剪切到用 M13 噬菌体载体构建 DNA 片段文库,也包括断裂靶 DNA 的两种方法--超声法和喷雾法,以及用 DNA 聚合酶修复片段末端的技术要点。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W.拉塞尔。试剂、

双链DNA探针随机引物合成法

  随机引物合成双链探针是使寡核苷酸引物与DNA模板结合,在Klenow酶的作用下,合成DNA探针。合成产物的大小、产量、比活性依赖于反应中模板、引物、dNTP和酶的量。通常,产物平均长度为400-600个核苷酸。利用随机引物进行反应的优点是:(1)Klenow片段没有5'→3'外切

用-PCR-控制基因组-DNA-文库的质量实验

在该方案中,用限制性内切酶的混合物处理人类基因组 DNA(内切酶混合物的识别位点为 4bp),产生大概 50〜500bp 的片段。最终使用这一类型的表达文库,是通过利用表型的和生化的筛选方法,分离编码功能多肽或蛋白片段的基因片段。用KlenowDNA 聚合酶处理后,基因组 DNA 片段成为平末端,然

用-PCR-控制基因组-DNA-文库的质量实验

试剂、试剂盒 ddH20Vent 缓冲液Vent DNA 聚合酶 dNTP质粒 DNAPCR 引物仪器、耗材 琼脂糖凝胶电泳所需的试剂和设备热循环仪实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂ddH202. 酶和酶缓冲液10X Vent 缓冲液Vent DNA 聚合酶3. 核酸和寡核苷酸dNTP,各

用-PCR-控制基因组-DNA-文库的质量实验

            试剂、试剂盒 ddH20 Vent 缓冲液 Vent DNA 聚合酶 dNTP 质粒 DNA PCR 引物

单链DNA文库的SELEX筛选实验

实验方法原理 SELEX 技术除了可以使用 RNA 文库以外,还可以使用单链 DNA 文库进行筛选。单链 DNA 形成高级结构的丰富性也足够用于对许多靶分子的筛选,而且 DNA 文库具有更好的稳定性,操作也相对简便。实验材料 3' 引物链亲和素磁珠仪器、耗材 电泳仪PCR 仪离心机凝胶成像仪

单链DNA文库的SELEX筛选实验

单链DNA文库的SELEX筛选实验可用于:(1)体外诊断;(2)体内治疗等。实验方法原理SELEX 技术除了可以使用 RNA 文库以外,还可以使用单链 DNA 文库进行筛选。单链 DNA 形成高级结构的丰富性也足够用于对许多靶分子的筛选,而且 DNA 文库具有更好的稳定性,操作也相对简便。实验材料3

单链DNA文库的SELEX筛选实验

            实验方法原理 SELEX 技术除了可以使用 RNA 文库以外,还可以使用单链 DNA 文库进行筛选。单链 DNA 形成高级结构的丰富性也足够用于对许多靶分子的筛选,而且 DNA 文库具有更好的稳定性,操作也相对简便。

随机引物合成法双链DNA探针标记法

随机引物合成双链探针是使寡核苷酸引物与DNA模板结合,在Klenow酶的作用下,合成DNA探针。合成产物的大小、产量、比活性依赖于反应中模板、引物、dNTP和酶的量。通常,产物平均长度为400-600个核苷酸。利用随机引物进行反应的优点是:(1)Klenow片段没有5'→3'外切酶活

制备DNA测序模板实验——双脱氧测序的双链质粒DNA的碱变性

实验材料DNA试剂、试剂盒NaOHEDTA乙酸钠乙醇仪器、耗材离心管离心机摇床实验步骤1.  加入约0.5 pmol 重组质粒DNA于0.5 ml 微量离心管中,如果体积大于20 μl 应以乙醇沉淀,重溶于20 μl 水。2.  如果体积小于20 μl,用水补足20 μl。3.  加入2 μl 2

基于-PCR-的-DNA-文库筛选实验方法

            试剂、试剂盒 PCR 混合物 PCR 引物寡核苷酸 杂交寡核苷酸 PCR 正对照 PCR 主要混合物 蒸馏水

基于-PCR-的-DNA-文库筛选实验方法

试剂、试剂盒PCR 混合物PCR 引物寡核苷酸杂交寡核苷酸PCR 正对照PCR 主要混合物蒸馏水仪器、耗材琼脂糖凝胶电泳设备实验步骤一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂蒸馏水2. 酶和酶缓冲液PCR 混合物(可以放在一起冰冻),对于 lml 反应,包括:200nmol 的各种 dNTP;1XVent 溶

基于-PCR-的-DNA-文库筛选实验方法

试剂、试剂盒 PCR 混合物PCR 引物寡核苷酸 杂交寡核苷酸PCR 正对照PCR 主要混合物蒸馏水仪器、耗材 琼脂糖凝胶电泳设备实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂蒸馏水2. 酶和酶缓冲液PCR 混合物(可以放在一起冰冻),对于 lml 反应,包括:200nmol 的各种 dNTP;1XVe

随机RNA文库的SELEX筛选实验

随机RNA文库的SELEX筛选实验可用于:(1)体外诊断;(2)体内治疗等。实验方法原理SELEX 技术是一种利用随机寡核苷酸(DNA 或 RNA)文库筛选靶分子的特异性配基的组合化学技术。最常用的是随机 RNA 文库,因为 RNA 分子中除 G-C、A-U 碱基对以外,还有 G-U 等变偶碱基对的

随机RNA文库的SELEX筛选实验

实验方法原理 SELEX 技术是一种利用随机寡核苷酸(DNA 或 RNA)文库筛选靶分子的特异性配基的组合化学技术。最常用的是随机 RNA 文库,因为 RNA 分子中除 G-C、A-U 碱基对以外,还有 G-U 等变偶碱基对的存在,可以形成发夹、假结、凸环、G-四聚体等多种空间结 构,它

随机RNA文库的SELEX筛选实验

            实验方法原理 SELEX 技术是一种利用随机寡核苷酸(DNA 或 RNA)文库筛选靶分子的特异性配基的组合化学技术。最常用的是随机 RNA 文库,因为 RNA 分子中除 G-C、A-U 碱基对以外,还有 G-U 等变偶碱基对的存在,可以形

高通量测序技术SOLiD简介

目前市场上有四种高通量测序仪,分别是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根据测序原理,它们可以被分为两大类:使用合成法测序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用连接法测序(Sequencing by Ligat

新一代高通量测序技术SOLiD简介

   目前市场上有四种高通量测序仪,分别是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根据测序原理,它们可以被分为两大类:使用合成法测序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用连接法测序(Sequencing by Ligation

新一代高通量测序技术SOLiD简介

   目前市场上有四种高通量测序仪,分别是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根据测序原理,它们可以被分为两大类:使用合成法测序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用连接法测序(Sequencing by Ligation

用于-PCR-的模板-DNA-制备实验

酚-氯仿法提取石蜡组织中 DNA 改进的石蜡切片 DNA 提取方法 直接法(DNA 免提法) 冰冻片 含血标本 胸腹水或尿液            

用于-PCR-的模板-DNA-制备实验

实验方法原理 实验步骤 1. 10 mm 厚石蜡切片 10~15 张,置入消毒后的 1.5 ml Eppendorf 管中。2. 脱蜡 二甲苯 1200 μl,9000 r/min,8 min×3。3. 脱水无水乙醇 1200 μl,9000 r/min,5 min×3。4. 打开 Eppendor

核糖体失活展示系统实验

实验材料 RTA 基因试剂、试剂盒 结合(或漂洗)缓冲液生物素琼脂糖洗脱缓冲液仪器、耗材 RNeasy™mini 试剂盒实验步骤 这里介绍的方法概括了表达载体的构建以及筛选功能蛋白的 RIDS 循环系统的构建。3.1 RIDS 表达载体的构建首先,需要准备含编码 T7 启动子、蛋白质文库、连接子

核糖体失活展示系统实验

核糖体失活展示系统             实验材料 RTA 基因 试剂、试剂盒