中山大学Blood封面文章:circRNA对翻译进程的正调控作用
2012年以前,经典教科书和主流观点里,RNA还是线性的,主要有这3类RNA:mRNA、tRNA和rRNA,但随着时间的推进,研究的深入,越来越多的RNA被发现,除了本世纪初备受关注的miRNAs,snRNA,siRNA,LncRNA,还有近年来研究最火热的环状RNA(circRNA),与其它传统线性RNA都不同,circRNA具有闭合环状结构,那么它具有哪些功能呢? 近日,中山大学生命科学学院陈月琴教授课题组在血液学知名杂志Blood上发表题为“CircMYBL2, a circRNA from MYBL2, Regulates FLT3 Translation by Recruiting PTBP1 to Promote FLT3-ITD AML Progression”的研究论文,并被主编推荐为杂志封面文章。生命科学学院陈月琴教授为该论文的通讯作者,博士后孙雨蒙、专职科研副研究员王文涛为该论文的共同第一作者,附属第......阅读全文
circRNA_104075在促进肝癌发生和进展的机制研究
在全球范围内原发性肝癌是造成癌症相关死亡的三大原因之一。肝细胞癌(HCC)是最常见的原发性肝脏癌症。由于缺乏高特异性和敏感性的早期诊断生物标志物,HCC患者往往得不到及时有效的治疗。相比于长链非编码RNA和miRNA,circRNA作为一种新型环状RNA,具有共价闭合环状结构,在组织和血液中具有
circRNA在胃癌海绵调控机制的应用(三)
6. 体内实验验证hsa_circ_0004872抑制肿瘤发生和转移通过皮下注射过表达hsa_circ_0004872的BGC-823细胞和对照组BGC-823细胞发现,过表达hsa_circ_0004872组生成的肿瘤明显小于对照组,并且肿瘤中Smad4和p21表达升高。尾静脉注射实验也发现过表达
circRNA_104075在促进肝癌发生和进展的机制研究(一)
文章导读:在全球范围内原发性肝癌是造成癌症相关死亡的三大原因之一。肝细胞癌(HCC)是最常见的原发性肝脏癌症。由于缺乏高特异性和敏感性的早期诊断生物标志物,HCC患者往往得不到及时有效的治疗。相比于长链非编码RNA和miRNA,circRNA作为一种新型环状RNA,具有共价闭合环状结构,在组织和血液
外泌体环状RNA作为结肠ai分子标志物的实例应用
文章导读如今想要短平快靠单纯测序+验证发表一篇5分左右文章,光靠一个热点环状RNA还不够,环状RNA+外泌体,环状RNA+m6A,环状RNA+环状DNA等方向都是可以去尝试的。小编今 天以云序用户以环状RNA+外泌体作为研究方向的案例进行解析。2020年6月18日云序用户山大二院在Frontiers
教你轻松玩转环状RNA测序加机制研究(一)
从表达谱至海绵机制完美进阶,教你轻松玩转环状RNA测序加机制研究文章导读:禽白血病病毒J亚群(ALV-J)属于逆转录病毒属,慢病毒亚科的家族成员,可引起禽类多种肿瘤性疾病,如骨髓细胞瘤、肉瘤、血管瘤、肾肿瘤和成红细胞增多症,以及禽类骨髓白血病,导致受感染鸡的高死亡很率。该分散的ALV-J菌株分布广泛
IGF2BP3的蛋白诱饵,调控MYC和SNAIL的表达,抑制胃癌的转移
胃癌(Gastric cancer, GC)仍是我国最常见的胃肠道恶性肿瘤,肿瘤转移是预后不良的主要原因。环状rna (circrna)是一种具有重要调控作用的有趣的非编码rna。然而,circrna在胃癌转移中的作用尚未完全阐明。在这里,作者报道了与匹配的非癌组织相比,在103对GC组织中ci
circRNA在胃癌海绵调控机制的应用(一)
环状RNA (circRNA)作为新型非编码RNA,具有比线性RNA更加稳定的环状结构,可通过多种机制调控靶基因。近年来,circRNA被发现在多种肿瘤组织和细胞中异常表达,作为肿瘤的诊断生物标志物或治疗靶点,具有巨大的价值,受到广泛的关注。癌症新的证据表明,circRNAs在癌症的发生发展中起
外泌体circRNA-PDE8A促进胰腺导管癌细胞侵袭研究
第三军医大学西南医院李晓武教授团队长期从事肝胆外科研究,近期,其实验室对利用Arraystar circRNA芯片研究发现了在胰腺导管癌细胞中高表达的circ-PDE8A可以通过miR-338调控MACC/MET/ERK通路,促进癌细胞侵袭。进一步研究发现,病人血浆外泌体中circ-PDE8A显著高
从表达谱至海绵机制完美进阶-环状RNA测序加机制研究!
禽白血病病毒J亚群(ALV-J)属于逆转录病毒属,慢病毒亚科的家族成员,可引起禽类多种肿瘤性疾病,如骨髓细胞瘤、肉瘤、血管瘤、肾肿瘤和成红细胞增多症,以及禽类骨髓白血病,导致受感染鸡的高死亡很率。该分散的ALV-J菌株分布广泛,既能水平传播又能垂直传播,往往造成禽类养殖领域的巨大经济损失。目前我
【客户成果】外泌体circRNA-PDE8A促进胰腺导管癌细胞侵袭
第三军医大学西南医院李晓武教授团队长期从事肝胆外科研究,近期,其实验室对利用Arraystar circRNA芯片研究发现了在胰腺导管癌细胞中高表达的circ-PDE8A可以通过miR-338调控MACC/MET/ERK通路,促进癌细胞侵袭。进一步研究发现,病人血浆外泌体中circ-PDE8A
外泌体circRNA-PDE8A促进胰腺导管癌细胞侵袭
第三军医大学西南医院李晓武教授团队长期从事肝胆外科研究,近期,其实验室对利用Arraystar circRNA芯片研究发现了在胰腺导管癌细胞中高表达的circ-PDE8A可以通过miR-338调控MACC/MET/ERK通路,促进癌细胞侵袭。进一步研究发现,病人血浆外泌体中circ-PDE8A
筛选或验证RNA修饰直接靶点,研究RNA修饰靶基因的调控...
筛选或验证RNA修饰直接靶点,研究RNA修饰靶基因的调控机制技术简介用体外转录法标记生物素RNA探针,然后与胞浆蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合,从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后,通过Western Blot检测特定的RNA结合蛋白是否与R
circRNA研究新成果
研究背景放射治疗是肝癌治疗的有效手段之一,然而放射性肝纤维化是肝癌放射治疗的常见并发症,制约肝癌放疗效果。放射性肝纤维化的发病机制仍未明晰,有待进一步研究。环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类广泛参与多种生物学进程的非编码RNA,在人类多种疾病的发生和发展中发挥重要作
学者首次发现植物环状RNA编码蛋白
华南农业大学植物保护学院周国辉教授/杨新副研究员团队在国家自然科学基金等项目的资助下,首次发现植物环状RNA编码多肽的功能,并揭示该多肽赋予水稻对多种病原物的广谱抗性。2月25日,相关成果发表于《新植物学家》(New Phytologist)。水稻条纹花叶病毒的感染促进水稻植株中circ-WRKY9
云序环状RNA研究策略在环状RNA研究的应用(二)
4.对年龄相关性白内障circRNA的分析显示,circZNF292可以通过海绵机制调节miR-23b-3p功能发表期刊:Aging-us影响因子:4.831发表时间:2020.9.10研究方法:全转录组测序、qRT-PCR、RIP、RNA pull down、双荧光素酶实验等云序提供文章链接:Pr
circRNA_104075在促进肝癌发生和进展的机制研究(二)
5. circ_104075可以结合miR-582-3p作者首先想到circRNA通过海绵作用吸附miRNA,直接调控靶蛋白的表达,作者利用miRanda数据库预测了circ_104075最有可能结合的5个miRNA,接着通过RNA pull down技术(云序生物提供此项实验)捕获复合物后RT-q
环状RNA在预测II/III期结肠癌患者复发风险预测的重要作用
结肠癌是常见的发生于结肠部位的消化道恶性肿瘤,发病率占胃肠道肿瘤的第3位。约60%患者初次诊断时已发展为局部晚期(II/III期),即使手术顺利切除后仍有20-30%的复发风险。因此,对II/III期结肠癌患者的精确风险分层是术后治疗策略的关键所在。目前的分期方法在预测II/III期结肠癌患者的
Circ-Res:阻断整合素β3只能暂时抑制肿瘤
根据东安格利亚大学(UEA)的一项最新研究,在过去20年里一直被视为癌症药物设计中心的一种蛋白——整合素β 3(β 3-integrin),不应该被放弃用于治疗。 在治疗恶性脑肿瘤的临床试验中,最先进版本的整合素β 3拮抗剂的实验失败。 但是,最近发表在美国心脏协会的《Circu
Circ-Res:阻断整合素β3抑制肿瘤生长和血管生成
近20年来,αvβ3-整合素一直是癌症药物设计的重点关注靶点蛋白质,现在,东安格利亚大学(UEA)的一项新研究证实不应该放弃利用αvβ3-整合素继续开发癌症治疗药物。 在一项脑癌临床试验中,αvβ3-整合素蛋白拮抗剂实验结果失败。但在美国心脏协会的Circulation Researc
教你轻松玩转环状RNA测序加机制研究(二)
3.gga-miR-373 通过与YAP1的3’UTR区结合负调控YAP1的表达,并且过表达gga-miR-375可减弱EMT生信预测揭示YAP1是gga-miR-375的潜在靶基因,进一步的双荧光素酶报告基因证实了gga-miR-375可通过结合YAP1的3’UTR区抑制YAP1的表达;在体外细胞
结直肠癌的新型生物标志物和治疗靶点
环状RNA(circRNA)等非编码RNA在人体内大量存在,影响着各种疾病的发生和发展。然而,circRNAs在结直肠癌(CRC)中的生物学功能在很大程度上是未知的。 2021年6月1日,徐州医科大学宋军及王人颢共同通讯在Molecular Cancer(IF=15.30) 在线发表题为“Th
前列腺癌circRNA研究
circRNA研究是现在科研领域的大红人,作为热点领域,circRNA的研究成果犹如雨后春笋,层出不穷。我们也可以看到,虽然circRNA很热,但是目前对circRNA的理解还处于社会主义初级阶段,有大把大把的空间值得探索。伯豪作为国内第一批科研服务公司,在circRNA领域也是紧随时代潮流,致力于
全转录组测序的“一箭三雕”:circRNA,lncRNA,mRNA
1. 文章主题:环状RNA通过靶向miRNA调控的信号传导促进结直肠癌的转移发表期刊:Journal of pathology影响因子:5.942发表时间:201906实验方法:全转录组测序实验样本:结直肠癌组织肝转移是结直肠癌(CRC)患者的主要死亡原因。作者使用全转录组测序在CRC肝转移的小鼠模
Circ-Res-新研究揭秘对淋巴系统发育至关重要的蛋白
由淋巴管组成的淋巴循环系统在控制组织液含量中发挥重要作用,也是免疫系统发现并靶向威胁的重要场所。当淋巴系统功能异常时,组织液会富集在组织中,造成水肿。这可能是致命的,如肺水肿会造成呼吸停止。但是迄今为止淋巴系统发育背后的分子学机制还没有研究清楚,尤其是涉及淋巴系统发育后期,初级淋巴系统重塑形成成
环状RNA通过与蛋白PDK1和Akt互作促进心肌修复
作者所在课题组主要从事microRNA和circRNA在心脏疾病发生发展过程中的分子机制研究。近期,其实验室用Arraystar circRNA芯片对不同年龄段的心肌病组织样本进行筛查,发现在新生儿心肌病组织中高表达的circ-Amotl1通过与蛋白PDK1和Akt的互作在心肌修复过程中发挥积极作用
ciRS7是肾细胞癌的预后生物标志物和潜在的基因治疗靶点
环状rna是一类新的非编码rna,在肾细胞癌(RCC)的发生发展中发挥重要作用。但ciRS-7在RCC中的作用机制及治疗作用尚不清楚。通过实时荧光定量PCR、CCK-8、创面愈合、transwell、菌落形成、Edu、肿瘤异种移植和肺转移等一系列体内外实验,探讨了ciRS-7在NSG小鼠中的作用
circRNA在胃癌海绵调控机制的应用(二)
3. hsa_circ_0004872作为分子海绵吸附miR-224作者首先通过FISH实验观测到hsa_circ_0004872主要分布在细胞质。然后通过RIP-qPCR验证到hsa_circ_0004872与AGO2蛋白结合,pull down实验显示hsa_circ_0004872与miR-2
RNA干扰技术(RNA-interference,RNAi)
1995年,康乃尔大学的Su Guo博士在试图阻断秀丽新小杆线虫(C. elegans)中的par-1基因时,发现了一个意想不到的现象。她们本是利用反义RNA技术特异性地阻断上述基因的表达,而同时在对照实验中给线虫注射正义RNA(sense RNA)以期观察到基因表达的增强。但得到的结果
RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(2)
早期的 RNAi 技术可用在研究与胚胎发育相关基因的功能上,但是由于细胞分裂造成 dsRNA 的稀释,使得这种方法在研究成体的基因功能时有一定的局限性。为弥补早期 RNAi 技术的不足,Tavernarakis 等将 RNAi 技术做了一些改进及更动,将目的基因之标的序列以反向重复的方式,由
RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(1)
基因沉默(gene silencing)是生物体内特定基因由于种种原因不表达的遗传现象。一方面,基因沉默是生物遗传操作创造新的遗传修饰生物(genetically modified organisms)的障碍,另一方面,它又是植物抵抗外来核酸入侵(如病毒)的一种反应,为植物抗病毒的遗传育