ctDNA(羟)甲基化测序案例分享(一)
新型肿瘤标志物筛选利器-----ctDNA(羟)甲基化测序cfDNA(Cell free DNA)是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中降解的DNA小片段,是一种新型的分子标记物。ctDNA(Circulating tumor DNA)特指来源于肿瘤细胞的cfDNA,是液体活检主流方向。最新的报道表明:ctDNA(羟)甲基化不仅可以作为肿瘤分子标志物,还可用于追溯肿瘤细胞的组织来源。在精准医疗大趋势下,ctDNA(羟)甲基化检测既具有极高的科研价值,又具备推进精准医疗临床实践的巨大潜能,为实现肿瘤临床治疗的全病程管理提供强有力的支持。利用ctDNA(羟)甲基化测序,仅凭一管液体就可以进行肿瘤诊断、疗效评估、实时监控、个体化用药、预测复发等,是里程碑式的新型液体活检技术。图1. ctDNA(羟)甲基化来源最具临床应用前景的分子标志物---ctDNA(羟)甲基化图2. ctDNA(羟)甲基化研究应用范围1.癌症早筛利器:ct......阅读全文
饮食诱导非酒精性脂肪肝动物造模案例分享(一)
2020年您是不是奉旨宅家了呢?有没有贴春夏秋冬膘?体检过后突然发现身边一群小伙伴患了肝浸润?也许很多人会认为,只要不饮酒那么自己的肝脏就不会有多大损伤。那当然是No, No, No~脂肪在肝细胞中堆积到一定量时,非酒精性脂肪性肝(NAFLD)就出现了。相对于酒精性肝病来说,NAFLD的发病率正以惊
DNA-甲基化测序常用方法
随着高通量测序技术(NGS)技术的发展,使我们能够从全基因组水平来分析 5’甲基胞嘧啶及组蛋白修饰等事件,由此能够发现很多传统的基因组学研究所不能发现的东西,这就是所谓的“DNA 甲基化测序”!DNA 甲基化测序方法按原理可以分成三大类: 1、重亚硫酸盐测序; 2、基于限制性内切酶的测序; 3、靶向
核磁共振在食品领域部分案例分享
案例一:不同超声波辅助压力处理下鸡肉的水分相态及运动性的变化图1 不同超声波辅助压力处理对鸡肉T2图谱影响注:·J0-J5为不同超声波辅助压力处理;T21为结合水,T22为不易流动水,T23为自由水;·不同超声波压力辅助处理后,自由水向不易流动水转化,鸡肉的持水力增强。案例二:不同种胶体及不同浓度胶
植物育种表型筛选技术方案与案例分享
表型筛选是在植物育种过程中将植物表现的优良性状筛选出来,并最终能够固定在植株上,从而培育出优良的品种。标准的生化检测技术,如分光光度法或高效液相色谱,已被用于植物育种过程中的表型筛选。这些方法结果准确,但它们具有破坏性、耗时、劳动密集且繁琐、成本高,并且不能满足大规模筛选程序的需要。植物育种过程需要
癌症个性化治疗成功的案例分享
一些癌症个性化治疗成功的案例:黑色素瘤患者 Emily Whitehead:她在接受了多次传统治疗后病情仍未得到控制。后来参与了一项 CAR-T 细胞免疫疗法的临床试验,经过治疗后,她的癌症得到了显著缓解,并且多年来一直保持健康,成为了 CAR-T 细胞疗法成功的标志性案例。一位晚期肺癌患者:通过基
免疫共沉淀(coIP)实验案例分享
—— co-IP 检测 Hsp90 与 Cdc37 结合情况1、实验材料SKBR3 细胞,PMSF(Amresco,cat:329-98-6),cocktail(上海晶莱生物),脱脂奶粉(cat:66196131T),β-actin(上海晶莱生物)。Anti-Hsp90(santa,cat:
关于穿破硬脊膜案例的处理分享
椎管内穿刺时麻醉医生常用的操作技能,由于是经验性盲穿技术,故穿破硬脊膜仍是有可能发生,虽然几率为1.5%,但是头痛发生几率却高达52%。正所谓常在河边走,哪有不湿鞋,本人从事麻醉专业将近十年,一直小心翼翼,可最近在一次硬膜外穿刺过程中,还是不小心刺破了。病例回顾患者女性26岁,50kg,因“停经40
分享一些具体的苔藓植物监测大气污染的案例
以下是一些苔藓植物监测大气污染的案例:案例一:城市大气污染监测地点:某工业城市。监测过程:研究人员在城市的不同区域,包括工业区、商业区、居民区和公园等地设置了多个监测点。每个监测点放置了不同种类的苔藓样本,如大灰藓、白发藓等。定期采集苔藓样本,分析苔藓体内的重金属含量(如铅、镉、汞等)、硫含量以及氮
血浆中ctDNA甲基化数字PCR检测攻略Naica数字PCR的应用
基因调控区的DNA甲基化状态的改变可导致多种癌症的发生。这种表观遗传学改变在生物学上是稳定的,并存在于循环肿瘤DNA(ctDNA)中,使其适合于早期检测和无创动态监测肿瘤负荷。数字PCR技术凭借其较高的灵敏度、精准度以及对抑制剂的耐受度,在对低拷贝样品检测时表现出了极大的优势。在转移性和II/III
科学家找到新结直肠癌筛查技术-望实现无创筛查
结直肠癌是我国发病率排名前三的恶性肿瘤,早期筛查已被证实可以降低结直肠癌的发病率和死亡率。 11月11日,从复旦大学附属肿瘤医院获悉,该院大肠外一科蔡国响教授团队近日联合南方医科大学南方医院梁莉教授团队等,成功研发并验证了一种新的ctDNA甲基化单倍型检测手段ColonES,通过二代测序评
创新ctDNA高通量测序技术让临床不再“盲人摸象”
安可济(AccuraGen)公司联合创始人兼科研总监赵奇志(Grace Zhao)博士 在3月6日-11日举行的旧金山分子医学三方会议(The Molecular Medicine Tri-Conference)上,安可济(AccuraGen)公司的联合创始人兼科研总监赵奇志(Grace Zh
手机壳气密性检测设备使用案例分享
随着防水手机的流行,手机做气密性检测成为手机包装出厂前的必备流程。为保证手机的防水性能能达到很好的标准,手机厂家必须要对手机的各个部件先进行气密性检测。手机壳作为手机内部电子元件的保护壳,对手机壳的使用手机壳气密性检测设备进行防水检测成为检测的重点过程。传统的手机壳气密防水性检测是通过水压密
订书肽的合成方法与成功案例分享
生物体内的多种生命进程调节都是通过蛋白质与蛋白质之间的相互作用来实现的。例如病毒的自组装,细胞的生长,分裂,分化等过程。而通常蛋白-蛋白相互作用的界面太大,从而使小分子药物很难对其进行靶向定位,达到高效特异性地阻断这种相互作用,展现良好的治疗效果。蛋白类药物因为很难顺利通过细胞膜所以也达不到直接
羊驼VHH-SingleB®纳米抗体快速发现案例分享
纳米抗体(nanobody, Nb),即重链抗体VHH(variable domain of heavy chain of heavy-chain antibody)——骆驼体内存在着天然缺失轻链的重链抗体(heavy-chain antibody, HCAb),克隆其可变区而得到的只由一个重链可变
订书肽的合成方法与成功案例分享
生物体内的多种生命进程调节都是通过蛋白质与蛋白质之间的相互作用来实现的。例如病毒的自组装,细胞的生长,分裂,分化等过程。而通常蛋白-蛋白相互作用的界面太大,从而使小分子药物很难对其进行靶向定位,达到高效特异性地阻断这种相互作用,展现良好的治疗效果。蛋白类药物因为很难顺利通过细胞膜所以也达不到直接
容易发生误诊的孕期腹痛多种案例分享
大夫:我肚子疼............. 每每有孕期腹痛的就诊,我们第一考虑是先兆流产或先兆早产。但是今天想和大家分享一下孕期腹痛的其它案例。比如孕期阑尾炎,孕期子宫肌瘤红色变性,孕期肾积水或泌尿系结石,孕期卵巢囊肿破裂或卵巢囊肿蒂扭转,孕期肠管痉挛,中晚孕期瘢痕子宫破裂,胎盘早剥,它们分别有什
分享一些基于植物指示生物的定量监测模型构建的实际案例
基于植物指示生物的定量监测模型构建的实际案例:案例一:利用紫花苜蓿监测土壤中的重金属研究人员选取了紫花苜蓿作为指示植物,在多个已知重金属污染程度不同的土壤区域进行种植。他们测量了紫花苜蓿的生物量、叶片中的重金属含量以及一些生理生化指标,如叶绿素含量、抗氧化酶活性等。通过多元线性回归分析,建立了以紫花
甲基化测序要躲哪些坑?甲基化检测的局限性剖析
表观组学研究滞后于基因组学是可以理解的。一方面,在分析碱基修饰或染色体活性之前,我们需要知道基因组的确切序列,即得到基因组的参考序列,在这个基础之上基因组的表观调控研究才能得以进行;另一方面,造成表观组学研究发展相对缓慢的一个重要原因,是目前支撑表观组学研究的技术手段都或多或少存在一定的局限性,限制
长链非编码-RNA-测序案例分析
背景:人类寿命的延长伴随着神经退行性疾病的发病几率的增加,因而价格不贵的血液诊断的发展迫在眉睫。通过 RNA-seq 分析血液细胞的转录本是发现新的生物标志物的非常高效的途径。 目的:利用 Illumina 测序平台对帕金森病人白血球中 lncRNAs 进行分析,探讨其对 mRNA 选择性剪接的
DNA甲基化与癌症之NGS检测篇
摘要 DNA甲基化是哺乳动物中研究最为深入的表观遗传修饰之一。正常细胞中,DNA 甲基化有效的调控基因表达水平。某些抑癌基因的失活是由于启动子区域的高甲基化,大量实验研究表明,在多种类型癌症中,DNA甲基化导致了大范围的基因沉默。除了启动子区域和DNA重复序列中的甲基化水平改变外,甲基化还与非
血液ctDNA检测
日前,美国约翰霍普金斯癌症中心及墨尔本大学的科学家在《Science Translational Medicine》杂志上表明,通过检测癌症相关的血液循环DNA可准确预测部分早期结肠癌患者的癌症复发。 血液中存在ctDNA,癌症复发的可能性更大 在该研究中,科学家对澳大利亚13家医院的
ctDNA是什么
ctDNA是肿瘤患者血液中游离的来自肿瘤的DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)在非小细胞肺癌中的应用在过去十年中,对非小细胞肺癌(NSCLC)的理解发生了重要的变化。现在证实,NSCLC具有不同的分子亚型。现在医生认为,针对NSCLC的个性化治疗,应该是利用这些分子亚型匹
甲基化测序能否突破肿瘤难关?WGBS、杂交捕获了解一下?
DNA甲基化是哺乳动物中研究最为深入的表观遗传修饰之一。正常细胞中,DNA 甲基化有效的调控基因表达水平。某些抑癌基因的失活是由于启动子区域的高甲基化,大量实验研究表明,在多种类型癌症中,DNA甲基化导致了大范围的基因沉默。除了启动子区域和DNA重复序列中的甲基化水平改变外,甲基化还与非编码RN
分享一些成功控制黑曲霉絮凝剂投加量的实际案例
以下是为您找到的一些可能成功控制黑曲霉絮凝剂投加量的实际案例:案例一:某城市污水处理厂在处理生活污水时,引入了黑曲霉絮凝剂。在前期,通过大量的实验室小试和中试,确定了针对该厂污水水质的最佳投加量范围。然后,选用高精度的计量泵进行投加,并配备了在线浊度监测仪。根据实时监测的浊度数据,结合预设的算法,由
分享一些苔藓监测系统评估土壤污染的标准流程的成功案例
以下为您分享一些苔藓监测系统评估土壤污染的成功案例:案例一:某矿区周边土壤污染评估研究区域:某金属矿区周边的土壤苔藓选择:选用了当地常见且对重金属具有较高积累能力的白发藓。采样设计:在矿区及周边不同距离和方位设置了 20 个采样点,每个采样点采集 5 份苔藓样本。采样时间:选择在生长旺季的夏季进行采
分享一些关于微生物絮凝剂反应条件优化实验的案例
以下为您分享两个关于微生物絮凝剂反应条件优化实验的案例:案例一:研究目的:优化某微生物絮凝剂对印染废水的处理反应条件因素选择:微生物絮凝剂投加量、废水 pH 值、反应温度水平设置:投加量:20 - 60 mg/L(低、中、高)pH 值:5 - 9温度:20 - 40 °C实验设计:采用中心复合设计(
抽管血,揪出癌症“指纹”
该技术仅需抽取人体外周血,通过捕获这些微量ctDNA中的甲基化位点改变,即可精确检测到肝癌、乳腺癌、结直肠癌、肺癌等高发癌症的早期信号。 肿瘤在人体内如同器官一样,不断地有细胞生长和死亡。而在肿瘤细胞坏死或凋亡过程中会释放自身DNA并进入血液循环。这些在人体内不断流动的肿瘤DNA碎片,就是循环
最新DNA甲基化测序技术比较研究
在不同疾病中,DNA甲基化具有不同的模式。DNA甲基化的具体模式通常与诸如疾病亚型、疾病预后以及药物反应等临床信息具有一一对应的联系。在多种癌症的治疗过程中,DNA甲基化生物标志物可以帮助临床医生选择恰当的治疗方式。 对于拥有成千上万个样本的大量病人来说,全基因组映射与DNA甲基化分析是非常合
小麦面包粉中呕吐毒素超标真实案例分享(二)
六、上海飞测小麦中呕吐毒素荧光定量快速检测系统上海飞测生物基于全球领先的荧光定量FPOCT技术平台,开发了呕吐毒素荧光定量快速检测系统,该系统结合了胶体金快速、酶联免疫定量以及色谱法准确的特点,可在8min内快速准确定量的测定出大麦、小麦、面粉中的呕吐毒素的含量,样品前处理简单(仅需7min),操作
案例分享:-Agilent-miRNA芯片在各类样本中的应用
1.新鲜组织样本 新鲜组织一般包括以人类疾病诊断及治疗为目的,经患者或健康人同意后,从患者的机体中切取的未经特殊化学试剂处理的病变组织或相邻健康组织,或者健康人的相同部位的对照组织。这些人类疾病相关的新鲜组织样本的整理、保存、研究对于提高疾病的诊断质量、促进临床工作、探讨及研究疾病的发病机