ctDNA(羟)甲基化测序案例分享(一)
新型肿瘤标志物筛选利器-----ctDNA(羟)甲基化测序cfDNA(Cell free DNA)是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中降解的DNA小片段,是一种新型的分子标记物。ctDNA(Circulating tumor DNA)特指来源于肿瘤细胞的cfDNA,是液体活检主流方向。最新的报道表明:ctDNA(羟)甲基化不仅可以作为肿瘤分子标志物,还可用于追溯肿瘤细胞的组织来源。在精准医疗大趋势下,ctDNA(羟)甲基化检测既具有极高的科研价值,又具备推进精准医疗临床实践的巨大潜能,为实现肿瘤临床治疗的全病程管理提供强有力的支持。利用ctDNA(羟)甲基化测序,仅凭一管液体就可以进行肿瘤诊断、疗效评估、实时监控、个体化用药、预测复发等,是里程碑式的新型液体活检技术。图1. ctDNA(羟)甲基化来源最具临床应用前景的分子标志物---ctDNA(羟)甲基化图2. ctDNA(羟)甲基化研究应用范围1.癌症早筛利器:ct......阅读全文
案例分享:-Agilent-miRNA芯片在各类样本中的应用
1.新鲜组织样本 新鲜组织一般包括以人类疾病诊断及治疗为目的,经患者或健康人同意后,从患者的机体中切取的未经特殊化学试剂处理的病变组织或相邻健康组织,或者健康人的相同部位的对照组织。这些人类疾病相关的新鲜组织样本的整理、保存、研究对于提高疾病的诊断质量、促进临床工作、探讨及研究疾病的发病机
生态环境智慧监测创新应用市级典型案例分享
2023年3月30日,生态环境智慧监测创新应用技术指导委员会在深圳组织召开生态环境智慧监测技术专题研讨会(以下简称研讨会)。在研讨会上,部分试点单位分别结合各自工作实际,介绍了智慧监测优秀案例,分享了先进经验。今天我们一起了解雄安新区、常州市、杭州市、济南市、长沙市的试点建设经验。雄安新区雄安新区为
肿瘤早筛领域新突破!抽血可检测早期胃癌
近日,中国科学院合肥物质科学研究院肿瘤医院研究员王宏志、聂金福、洪波课题组与山西省肿瘤医院生物样本库团队在肿瘤早筛领域取得新进展,开发了基于血液循环肿瘤DNA(ctDNA)甲基化和人工智能识别技术的胃癌早期无创检测技术。相关研究成果日前在线发表于《癌症科学》。聂金福向《中国科学报》介绍,“这项研究强
肿瘤早筛领域新突破!抽血可检测早期胃癌
近日,中国科学院合肥肿瘤医院研究员王宏志、聂金福、洪波课题组与山西省肿瘤医院生物样本库团队在肿瘤早筛领域取得新进展,开发了基于血液循环肿瘤DNA(ctDNA)甲基化和人工智能识别技术的胃癌早期无创检测技术。相关研究成果日前在线发表于《癌症科学》。聂金福向《中国科学报》介绍,“这项研究强调了ctDNA
单细胞测序技术的应用案例有哪些?
以下是一些单细胞测序技术的应用案例: 1. 肿瘤研究: - 描绘肿瘤细胞的异质性,识别不同的肿瘤细胞亚型,了解肿瘤的发生、发展和转移机制。 - 发现肿瘤微环境中的免疫细胞组成和状态,为免疫治疗提供靶点和策略。 2. 神经科学: - 解析大脑中不同类型神经元的基因表达
壳聚糖絮凝剂处理印染废水的实际案例分享
以下是一个壳聚糖絮凝剂处理印染废水的实际案例:某印染厂每天产生大量印染废水,其水质复杂,含有多种染料、助剂和高浓度的有机物,色度深,化学需氧量(COD)和生化需氧量(BOD)均较高。在处理过程中,首先对废水的水质进行了详细分析,确定了主要污染物的种类和浓度。然后进行了壳聚糖絮凝剂处理的小试实验,以确
反应釜在环氧树脂乳化中的应用案例分享
LR1000反应釜应用案例分享用户国内知名特种纤维复合材料研发生产企业环氧树脂环氧树脂是泛指分子中含有两个或两个以上活泼的环氧基团的高分子化合物,可与多种类型的固化剂发生交联反应而形成不溶的具有三向网状结构的高聚物。固化后的环氧树脂具有良好的物理、化学性能,它对金属和非金属材料的表面具有优异的粘接强
透气率测试仪VACVBS的检测案例分享
Labthink兰光VAC-VBS透气率测试仪基于压差法的测试原理,是一款专业用于薄膜试样的气体透过率测试仪,适用于薄膜、片材、高阻隔材料、金属箔片等材料气体透过率的测定。透气率测试仪的别名:压差法气体渗透仪、透气性测试仪、压差法透气仪、气体透过率测试仪、气体透过性能测试仪、透气性能检测仪等。
甲基化的基因组直接测序法
基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理,并以连接介导的PCR来放大信号强度,然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解,故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解
m5C-RNA甲基化测序介绍
m5C RNA甲基化简介通过分析近几年的国自然立项,可以发现RNA甲基化这两年的基金项目呈指数级增长的趋势:特别是从2015年的5项到2017年的25项,项目增长尤为显著。仅2018年1月的RNA甲基化文献就达到25篇,可以说RNA甲基化的发展已经到了井喷阶段,多篇文章荣登CNS级别期刊。RNA甲基
我是“神药”——二甲双胍抑癌机制研究
上海交通大学附属第一人民医院张箴波团队以题为“Metformin sensitizes endometrial cancer cells to chemotherapy through IDH1-induced Nrf2 expression via an epigenetic mechanis
亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化——DNA甲基化
亚硫酸氢盐修饰后测序法主要可用来检测甲基化。基化实验方法原理重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,用PCR扩增(引物设计时尽量避免有CpG,以免受甲基化因素的影响)所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。最后对PCR产物进行测序,并且与未经处理的序列比较
全基因组及转录组测序案例分析
案例:应用全基因组测序和 RNA 测序来描绘常见的变异型免疫缺陷综合症(CVIDs)的基因图谱 背景:常见的变异型免疫缺陷综合症(CVIDs)是机体免疫应答反应中不能产生抗体的最主要原因。CVIDs 变异度很高,大概 5% 的病人是由基因改变引起的。 目的:利用 Illumina HiSeq25
高钙血症疑难案例分析(一)
案例介绍: 患者为中年女性,55岁,于2019年5月14日,因反复全身痛1年,乏力伴恶心呕吐1月入院。患者“高血压病”5年,口服“硝苯地平控释片 30mg qd”降压;“2型糖尿病”5年,口服“二甲双胍 500mg bid”降糖;“干燥综合征”3月,口服“白芍总苷胶囊 2粒 bid”治疗,无
科学家分享基因测序技术研发成果
临床类 杜克大学分子遗传学教授David Goldstein David Goldstein提出运用精准医学治疗神经系统疾病。Goldstein专注于几个癫痫患者大规模研究的课题,其中包括一项对超过350个患病的儿童及其父母进行测序来发现新突变的项目。尽管许多发现的突变属罕见突变,但是它
血检如何捕捉肿瘤的踪迹?
近日,在芝加哥召开的“2016美国临床肿瘤学会年会”发布的一项研究称,大规模基因组分析表明,利用血液检测筛查癌症、监测癌症发展演变可达到与传统组织活检同样的效果。这项技术有助医生更好地确立诊疗方案,有望成为常规活检的一种可靠替代选项。 癌症血液检测是通过分析血液中的游离肿瘤脱氧核糖核酸(ctD
血检替代活检,路有多远?
近日,在芝加哥召开的“2016美国临床肿瘤学会年会”发布的一项研究称,大规模基因组分析表明,利用血液检测筛查癌症、监测癌症发展演变可达到与传统组织活检同样的效果。这项技术有助医生更好地确立诊疗方案,有望成为常规活检的一种可靠替代选项。 癌症血液检测是通过分析血液中的游离肿瘤脱氧核糖核酸(ct
使用血液进行基因检测如何减少假阴性
基因检测-入门攻略什么是基因检测?肿瘤基因检测是通过特定检测设备对被检测者细胞中的DNA分子信息作检测,分析它所含有的各种基因突变情况,从而能针对性地为每位患者“量身定制”一套最合适的治疗方案。它是肿瘤精准医疗的基础。选择什么样本最合适?做基因检测,是检测肿瘤细胞的突变,因此需要获取肿瘤细胞。临床上
PCB设计宝典分享(一)
画板是门硬武艺,不练就不成功,就算你能记下MOS管的所有特性曲线,也终究是不入流。 一般PCB基本设计流程如下: 前期准备-》PCB结构设计-》PCB布局-》布线-》布线优化和丝印-》网络和DRC检查和结构检查-》制版。 1前期准备 这包括准备元件库和原理图。“工欲善其事,必先利
BioTechniques:从外周血中分离cfDNA的高通量方法
传统的ctDNA纯化方法首先要通过离心,从全血中分离出血浆,这一步妨碍了自动化的实施。为此,加拿大迈克•史密斯基因组科学中心的研究人员开发出一种方法,能够高通量地分离ctDNA。 在液体活检中,人们通常需要对游离的循环肿瘤DNA(ctDNA)进行分析。传统的ctDNA纯化方法首先要通过离心,从
基于循环肿瘤DNA甲基化特征的结外NK/T细胞淋巴瘤诊断预测模型
结外NK/T细胞淋巴瘤(ENKTL)是非霍奇金淋巴瘤的一种少见亚型,多数病例发生在鼻腔和咽喉部以上部位,又称鼻型NK/T细胞淋巴瘤。ENKTL的诊断依赖于病理学检查,然而坏死组织的存在以及发病部位的解剖学复杂性为病理采样带来了挑战。目前临床使用Ann Arbor分期标准和NK/T细胞淋巴瘤预后指
cfDNA甲基化检测在乳腺癌诊断方面甚至超过乳腺钼靶?
乳腺钼靶检查是最常用的乳腺癌筛查手段之一,但亚洲女性乳腺腺体致密,严重限制了其发现乳腺癌的灵敏度。血浆游离核酸(cfDNA)甲基化检测有望弥补乳腺钼靶检查的不足。记者10月12日从哈尔滨医科大学附属肿瘤医院获悉,该院庞达教授团队近期在Nature子刊《npj Breast Cancer》上发表了
优化微生物絮凝剂投加量的案例分享
以下是一个优化微生物絮凝剂投加量的案例分享:某污水处理厂需要处理印染废水,以降低废水中的色度、浊度和化学需氧量(COD)。最初,该厂使用某微生物絮凝剂时,采用了一个估计的投加量,但处理效果并不理想。于是,工作人员进行了一系列实验来优化投加量。他们首先设定了投加量的范围,从 10 mg/L 开始,以
纳米碳酸钡喷雾干燥机实验结果案例分享
一.碳酸钡喷雾干燥实验目的: 1.客户物料是纳米碳酸钡,需要制作3种不同规格的成品,3-5微米,40-100微米,大于100微米;已在无锡常州等地寻找厂家,目前没有厂家能够同时满足3种规格。 二.碳酸钡喷雾干燥实验器材: 物料:纳米钛酸钡,LE-10型喷雾干燥机,离心雾化器
分享一些在单细胞测序数据中使用数据增强的研究论文
以下是一些在单细胞测序数据中使用数据增强的研究论文,供参考:"Data Augmentation for Single-Cell RNA Sequencing Data Improves Classification Accuracy""Enhancing Single-Cell Sequencin
6大革命性技术!IVD行业快速前行
微流控芯片,高通量技术,单细胞测序,CTC循环肿瘤细胞,纳米医学,ddPCR技术,单分子免疫阵列技术(SiMoA),ctDNA,质谱检测,大数据,人工智能等等最新技术成果与应用案例纷纷亮相。 01 微流控芯片技术 微流控芯片,又称为芯片实验室(Lab on a Chip),是指在几平方厘米
IVD行业6大技术
微流控芯片,高通量技术,单细胞测序,CTC循环肿瘤细胞,纳米医学,ddPCR技术,单分子免疫阵列技术(SiMoA),ctDNA,质谱检测,大数据,人工智能等等最新技术成果与应用案例纷纷亮相。 01 微流控芯片技术 微流控芯片,又称为芯片实验室(Lab on a Chip),是指在几平方厘米
单分子测序助力细菌甲基化组的分析
New England Biolabs联合Pacific Biosciences的研究人员利用PacBio RS系统对6种细菌基因组进行了重测序,不仅鉴定出细菌基因组中新的胞嘧啶和腺嘌呤甲基化位点,还鉴定出介导这些表观遗传学标志的甲基转移酶。该研究成果近日发表在《Nucleic Acid
焦磷酸测序在甲基化分析中的应用
DNA甲基化是近年来研究的热点,因为越来越多的证据表明,它参与了胚胎发育、基因印迹等过程。同时,它在疾病发展中也起着举足轻重的作用。甲基化状态的改变被认为是引起癌症的一个重要因素,这种变化包括基因组整体甲基化水平的降低和CpG岛局部甲基化水平的异常升高,从而导致基因组的不稳定(如染色体的不稳定、