ctDNA(羟)甲基化测序案例分享(一)
新型肿瘤标志物筛选利器-----ctDNA(羟)甲基化测序cfDNA(Cell free DNA)是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中降解的DNA小片段,是一种新型的分子标记物。ctDNA(Circulating tumor DNA)特指来源于肿瘤细胞的cfDNA,是液体活检主流方向。最新的报道表明:ctDNA(羟)甲基化不仅可以作为肿瘤分子标志物,还可用于追溯肿瘤细胞的组织来源。在精准医疗大趋势下,ctDNA(羟)甲基化检测既具有极高的科研价值,又具备推进精准医疗临床实践的巨大潜能,为实现肿瘤临床治疗的全病程管理提供强有力的支持。利用ctDNA(羟)甲基化测序,仅凭一管液体就可以进行肿瘤诊断、疗效评估、实时监控、个体化用药、预测复发等,是里程碑式的新型液体活检技术。图1. ctDNA(羟)甲基化来源最具临床应用前景的分子标志物---ctDNA(羟)甲基化图2. ctDNA(羟)甲基化研究应用范围1.癌症早筛利器:ct......阅读全文
-循环肿瘤DNA“液体活检”或将颠覆癌症治疗
循环DNA是一种无细胞状态的胞外DNA,存在于血液、滑膜液和脑脊液等体液中,其主要是由单链或双链DNA以及单链与双链DNA的混合物组成,以DNA蛋白质复合物或游离DNA两种形式存在。早在1947年Mandel和Metais就发现了循环核酸;30年后Leon等人的研究表明肿瘤患者外周血清DNA水平
循环肿瘤DNA“液体活检”或将颠覆癌症治疗
循环DNA是一种无细胞状态的胞外DNA,存在于血液、滑膜液和脑脊液等体液中,其主要是由单链或双链DNA以及单链与双链DNA的混合物组成,以DNA蛋白质复合物或游离DNA两种形式存在。早在1947年Mandel和Metais就发现了循环核酸;30年后Leon等人的研究表明肿瘤患者外周血清DNA水平
VACV2型包装透氧仪器检测改性淀粉膜案例分享
VAC-V2型包装透氧仪器,执行GB/T 1038-2000(塑料薄膜和薄片气体透过性试验方法 压差法)、ASTM D1434(测定塑料薄膜和薄片透气性能的测试方法)、ISO 2556、ISO 15105-2、YBB 00082003等标准,适用于塑料薄膜、复合膜、高阻隔材料、片材、金属箔片、橡胶、
应用案例分享-|-安捷伦-8700-LDIR-红外成像快速检测婴儿配方奶粉微塑料
微塑料是指粒径低于 5mm 的塑料颗粒。科研人员已经在海鲜、饮用水、水果、蔬菜、日常调味品、以及饮料和婴儿配方奶粉中都检测到微塑料的身影。在 2022 年发表的一项研究中表明每克婴儿配方奶粉中检出约 17.3 个微塑料,其中聚氨酯和聚酰胺占检出微塑料总数的 67%。日前,安捷伦公司利用 8700 L
VACV2型包装透氧仪器检测改性淀粉膜案例分享
Labthink兰光VAC-V2型包装透氧仪器,执行GB/T 1038-2000(塑料薄膜和薄片气体透过性试验方法 压差法)、ASTM D1434(测定塑料薄膜和薄片透气性能的测试方法)、ISO 2556、ISO 15105-2、YBB 00082003等标准,适用于塑料薄膜、复合膜、高阻隔材料、片
靶向捕获让ctDNA无处遁形
循环肿瘤DNA(ctDNA)是一类具备广泛应用前景的肿瘤标志物,可用于肿瘤发展及预后状态的无创测定。现有的ctDNA检测方法要根据每位癌症患者的情况来制定繁琐的检测步骤,且敏感度低,难以适用于广泛的临床应用。近期在Nature Medicine上发表的一篇文章中1,研究人员介绍了一种全新的ctDNA
PCB失效分析案例及方法(一)
一.前言PCB作为各种元器件的载体与电路信号传输的枢纽已经成为电子信息产品的最为重要而关键的部分,广泛的应用于各行各业。近年来,由于PCB失效案例越来越多且部分失效危害极大。2016年4月通过的《装备制造业与标准化和质量提升规划》与《中国制造2025》坚持“创新驱动、质量为先、绿色发展、结构优化、人
基因测序技术(一)
什么是基因测序 基因组携带了个体的全部遗传信息,基因测序能够加深对疾病尤其是恶性肿瘤的分子机制理解,在诊断与治疗方面都发挥着重要作用。从1953年沃森和克里克发现DNA分子双螺旋结构到2001年首个人类基因组图谱的绘制完成,越来越多的人们意识到基因测序在生物医学中的重要作用。 所谓基因测
芯片与测序(一)
在高通量检测这个领域里,基因芯片和二代测序这对相爱相杀的cp,原本均是了解基因组结构和功能的绝佳高手,如今为了一争高下,又是闹的不开交。这不,基因芯片仗着自己老大哥的身份,手持一个二维的DNA探针阵列所形成的三维地图,以数以万计的探针做方向标,能按图索骥的找到基因组的特定位置,且结合完整成熟的指控分
亚硫酸氢盐修饰后测序法甲基化检测
第一部分 基因组DNA的提取这一步没有悬念,完全可以购买供细胞或组织使用的DNA提取试剂盒,如果实验室条件成熟,自己配试剂提取完全可以。DNA比较稳定,只要在操作中不要使用暴力,提出的基因组DNA应该是完整的。此步重点在于DNA的纯度,即减少或避免RNA、蛋白的污染很重要。因此在提取过程中需使用蛋白
亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化
实验方法原理重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,用PCR扩增(引物设计时尽量避免有CpG,以免受甲基化因素的影响)所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。最后对PCR产物进行测序,并且与未经处理的序列比较,判断是否CpG位点的甲基化状态。实验材料DNA
Nature子刊:突破性测序技术绘制甲基化图谱
通过一种新的DNA测序技术,研究人员首次绘制了致病菌全基因组甲基化标记图谱。通过比较相关菌株之间的甲基化模式,他们发现了称作噬菌体的病毒感染细菌显著改变宿主的一种方式。 布莱根妇女医院(Brigham and Women"s Hospital)、霍华德休斯医学研究所研究员Matthew K
亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化
实验材料 DNA试剂、试剂盒 NaOH苯二酚(氢醌)亚硫酸氢钠石蜡油仪器、耗材 离心管恒温水浴锅铝箔纸实验步骤 1.将约2ugDNA于1.5mlEP管中使用DDW稀释至50ul; 2.加5.5ul新鲜配制的3M NaOH; 3. 42℃水浴30min; 水浴期间配制: 4.10mM对苯二酚(氢醌)
亚硫酸氢盐测序法检测DNA的甲基化
亚硫酸氢盐测序法(Bisulfite sequencing PCR,BSP)用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,则未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变。随后设计BSP引物进行PCR,在扩增过程中尿嘧啶全部转化为胸腺嘧啶,最后对PCR产物进行测序就可以判断CpG位点是否发生甲基化称为BS
亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化
DNA甲基化 实验方法原理 重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,用PCR扩增(引物设计时尽量避免有CpG,以
亚硫酸氢盐测序法检测甲基化的介绍
用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,则未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变。随后设计BSP引物进行PCR,在扩增过程中尿嘧啶全部转化为胸腺嘧啶,最后对PCR产物进行测序就可以判断CpG位点是否发生甲基化称为BSP-直接测序方法。将PCR产物克隆至载体后进行测序,可以提高测序成功率,
关于甲基化的亚硫酸氢盐测序法介绍
用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,则未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变。随后设计BSP引物进行PCR,在扩增过程中尿嘧啶全部转化为胸腺嘧啶,最后对PCR产物进行测序就可以判断CpG位点是否发生甲基化称为BSP-直接测序方法。将PCR产物克隆至载体后进行测序,可以提高测序成功率,
甲基化测序捕捉三阴性乳腺癌表观遗传特性
近日,一篇刊登在国际杂志Nature Communications上的研究报告中,来自澳大利亚悉尼加文医学研究所(Garvan Institute of Medical Research)的科学家们通过将乳腺癌患者机体的乳腺癌甲基化组同健康个体进行比较从而绘制出了一种新型的基因组图谱,其可以帮助
a一羟丁酸脱氢酶偏高
你好朋友别担心,这种情况a羟丁酸脱氢酶偏高是需要采取药物控制就可以了
临床质谱检测:诊断领域中的-另一个“基因测序”
今天小编与您从临床治疗领域中分享质谱更多的应用。3年前,70多岁的老人李华(化名)进行了食道癌手术切除肿瘤,并一直进行肿瘤复发监测。去年4月,虽然CEA、AFP等肿瘤标志物检测结果正常,影像复查却在他肺部发现两处阴影。疑似是肿瘤复发,是否需要再次治疗呢?恰巧,飞行时间临床质谱系统基因检测不仅给出了答
临床质谱检测:诊断领域中的-另一个“基因测序”
今天小编与您从临床治疗领域中分享质谱更多的应用。3年前,70多岁的老人李华(化名)进行了食道癌手术切除肿瘤,并一直进行肿瘤复发监测。去年4月,虽然CEA、AFP等肿瘤标志物检测结果正常,影像复查却在他肺部发现两处阴影。疑似是肿瘤复发,是否需要再次治疗呢?恰巧,飞行时间临床质谱系统基因检测不仅给出了答
ctDNA结合CTCs检测结果与早期化疗癌症患者的预-...
大部分早期三阴性乳腺癌(TNBC)患者在手术前需要进行新辅助化疗,有助于缩小肿瘤、提高手术的可行性和成功率。其中,大约三分之一患者可以获得病理完全缓解、生存结局较好。不过,其余三分之二患者仍然残留病变、复发风险较高。手术后对外周血液进行循环肿瘤DNA(ctDNA)测序和循环肿瘤细胞(CTCs)计数的
兰光TQDG1透气度仪检测婴幼儿纸尿裤案例分享
Labthink兰光TQD-G1透气度仪,适用于汽车内饰物材料,例如: 聚氨酯发泡、PVC、皮革、纺织品、非织造布等材料的空气透过率与空气阻力的测试。通过测量,达到控制材料物理特性的要求,以满足产品实际应用的需要。另外还可以用于分离膜、海绵、地毯、无纺布、纸张、皮革的透气度测试。该设备具备两种测试方
专家分享有机固废处理成果案例-助力污染防治攻坚战
近日,2019年全国有机固废处理与资源化利用研讨会在安徽合肥召开。 中国环境科学学会秘书长助理姜艳萍在开幕致辞中表示,有机固废的资源化和无害化是今后几年污染防治攻坚战的重点和难点,希望与会专家和产业界代表分享前沿技术,提升我国有机固废处理和利用能力,加速科研成果转化,助力打好污染防治攻坚战。
云序生物为你解密ATACseq研究方案
ATAC-seq最近几年是比较火的一种测序技术。那ATAC-seq技术到底什么呢?ATAC-seq的全称是Assay for Transposase Accessible Chromatin using sequencing, 运用测序手段研究转座酶可接近的染色质的一种技术。该技术通过转座酶对某
认识“精准医疗”时代之下的ctDNA检测
在之前的文章中通通小编已经给大家介绍过液体活检细胞层面的CTC检测技术,接下来通通小将在分子水平上为您阐述液体活检的ctDNA检测技术。 1 什么是ctDNA ctDNA即循环肿瘤DNA(Circulating Tumor DNA)指的是由肿瘤细胞释放到血液循环系统中的DNA,是一种特征性
液体活检技术将迎来全新时代
第十四届全国大肠癌学术会议期间,北京大学首钢医院院长顾晋表示:“目前,ctDNA(循环肿瘤基因)这种检测技术在临床已经开始应用,常常用在检测肿瘤治疗药物反应、监测肿瘤耐药突变、评估手术效果等方面。” 无独有偶,中国医学科学院肿瘤医院内科主任王洁在第一届海峡肺癌国际高峰论坛暨第六届肺癌精准诊
术前术后一管血,众望所归液体活检技术将迎来全新时代
第十四届全国大肠癌学术会议期间,北京大学首钢医院院长顾晋表示:“目前,ctDNA(循环肿瘤基因)这种检测技术在临床已经开始应用,常常用在检测肿瘤治疗药物反应、监测肿瘤耐药突变、评估手术效果等方面。” 无独有偶,中国医学科学院肿瘤医院内科主任王洁在第一届海峡肺癌国际高峰论坛暨第六届肺癌精准诊疗研
RNA甲基化研究深度剖析(一)
一、听说最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣?1、高分文章频现 说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的,就有高达 17 篇。 图:RNA甲基化近期高
表观遗传之DNA甲基化(一)
俗话说,龙生龙,凤生凤,老鼠的儿子会打洞。 这句话什么意思呢?想必很多人有不同的看法~~ 从传统的社会认知角度看,就是“出生决定论”,一个人的出生是什么样的,以后就会有什么样的作为和成就,家庭决定着个人的前途和发展方向。龙凤阶层的人自出生以来便是龙凤,若是草根阶层,也很难上升到龙凤圈层,即使有这样的